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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000295_pilon:310150..316226- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_002279 ID=XLOC_002279|Name=XLOC_002279|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6077bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000295_pilon:310150..316226- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATAAATGGTTACGAAGAAGCACGTAAGAAATACAAATCACGTCGACT
GGTTGAAGGCTATTTGTTTTTAAAAAGTCTTTCTTCAAATGAATTTGAAT
CTGGTAATAGTCAGTTGGTAAGTCCTTAATTACTACCTAGAATCGTCTGA
AAAAATTTATCTTTCCAAGAATTTGGAACATATTTAACTCAGGACTTTAT
GGTAGCATCTTTTAATGGTTAAATCTTTTTATCAATTTTTCGACTTTTTA
GGTAGCATCCGCAGTACATCCAAAGCTAGAGGAAAATGCAAGAAATTCGT
CCATTGAGACGCTCCTCTCCAACGTTCCTTTGGACAAGAGGAAACCAGCC
CTTCTACATTCTGTCTCAATAACAGCAGCTGCTAACGTTGACGATGAGAT
TCATCTACAAAAGTATCGTTCAGATGACAACAAAGGTGGTGGAGGGTTTT
TCGAACTAAACACTCCCTCCATGTTGCGTTCCAAGTCTACCATTGAAACA
TCAAAAGACCTTAAAAATCGAATCAAACTAACAACACCGAATCGCATGAA
ACATTTGAATGAAGAAGCTTATGGGAAAAGGTATTTCCGTATGTAGATTT
CAACAAGACGACTTGAAGTCGAAAATTTCGCCTAGAGTTTGAACTACATG
GGAAAAACAAGAAGTAGATGAAGCTAATCTGAAATCTACTTTACATGGAG
CCTTGATGAAACAATTTTACAACAAGAACAATGAGGCTTAAAATCGCTAA
AAAAATAAGACCAATTTAAGAACAATTGCTGTTTAATTTTTAAAAATTCT
CATAAAGTATATGCTTGTAAAAAATTGATATGCTCTTATTGCACGCCATC
CCTTGTTTACTTTGTAAGAACTAAGTACCGAAAGGTATATCACCATCTAT
CAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAAAGTAAATGCTTATATGAAAAATA
AATATGCTCATATTGTGCGCCGTCCCTTGTTTACTTTGTAAGAACTAATT
ACCGGAATGTATATCACCGTCTATCAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATA
AAGTAAATGCTTATAACAAAAATAGATATGCTCATATTGTACCCTAATCC
TTGTTTACCTTGTAAGAACTAATTACCGAAAGGTATATCACCGTCTATCA
AGAGTTATTGATTTGATTCTTATAAAGTAAATGCTTATAACAAAAATAAA
TATGCTCATATTGTGCGCCGTCCCTTGTTTACTTTGTAAGAACTAATTAC
CGAAAGGTATATCACCGTCTATCAAGAGCTATTGATTTGATTCTTATAAA
GTAAATGCTTATAAGAAAAATAAATATGCTCATATTGTGCGCCGTCCCTT
GTTTACTTTGTAAGAACTAATTACCGAAAGGTATATCACCGTCTATCAAG
AGCTATTGATTTGATTCTTATAAAGTAAATGCTTATAAGAAAAATAAATA
TGCTCTTATTTTGCGCCATCCCTTGTTTACTTCGTAAGAACTAATTACCG
AAAGGTATATCACCGTCTATCAAGAGGTATTGATTTGATTCTTATAAAGT
ATATGCTTATAAGAAAAATAAATATGCTCATATTGTGTGCCGTCCCTTGT
TTACTTTGTAAGAAATAATTACCGGAAGGTAATCACCATCTATCAAGAGT
TATTGATTTGATTCTTATAAAGTAAATACTTATAAGAAAAATAAATATGC
TCATATTGTGCCCCATCCCTTGTTTACTTTGTAAGAACTGATTACCGAAA
GGTATTTCACCGCTTTACAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAAAGTATA
TGCTTATAAGAAAATAAAGAAAAATCAAAACTGTGAAGCTAAAGACACAA
AGATATAATGACGTAATCCAAAGAAAACCTTCCGTGGTTATACGAGCGTG
TAATTTGTAAATTGATTTTAGTGAGTTCGTCCACCGTATCAAGTACTTTC
GTTTTCAAAATTTTCTTCCGATATCGCCGCACCATGCCTATTGTAATACT
TTCGCTAAGGCGAAATTAATAAAACAAATGACTAGAATTAGAATTGTCTA
GTCGCACTTGAGTCGCGATGCAATTGATAAGCTTCTTCTCCCAGATAGAG
AATTATGTTGAGGTTGATTGCAAATTTTATTTATTTTGTTTTTAGATTGG
TGTTAACGAGCAAGCATAAAGCTCCTTACTGCATGTTTTCTGTCATCCCT
TACACCAAGAATAAGCACCAACACAAGTAAACTATTTTTTGATTGCTCAG
CTCGGAGAGATTTTTACGTATTGTTCTACATGTTTTTTTTCCTTCTATAA
AAGCGTAACGTCTATACGCATTTGCAGACCCAGTTTTTGGTACCTGCGAA
TGGCTCTATTGTTTAAGAGGGATAGAATGATGAGCATAATGTGAGCCTGA
TATTGGGGTAGACATCTGCTTATTAGTATCGATGGCACCTGAAGACATTT
ACCAACTTCTATATATATCTGTTCACAGTGAGAAGAACACGTCAGGCCAT
TATCACGCACACCATTCTACGAATCTTATTGATAATGTTGATATTGGGGA
TGGAAAACGAGTAAGCTCTCTTTCTCTACAATATTCTTTTAATAATGATA
GCTGTCGTTTTAGAGATAACGAGACACCTGTTCAATAATGACATCTAATA
ACGGTCTTACTGTATTACCATCGGTTTCAGTTTATTGTTAATTTTCATTC
TCTTGAATTCGACATTTCAGGAAGTTTCTTTTTGGCAATTGCTTGTTCCT
GAAAATTGGAAAAGACAACGGAATCAAGATCATGAAAACGATAAAGGTTT
GTGACTTCAATTGGGATTTTTTTGTTTTCCCAATTATTTATTTTAATTAA
ATGACGTAAAATTCCAATGTGCATGTACCCGTGAACATATAAACGACTGG
ACATCCATCTCCTTTGTATTTTTGAAGTAGAAGATAACACTGCTAGCTTT
GTTGCCGCCTCGTTAAAATCATAAAATGAAACAATAAATTTTGTATAATA
TAGAATTGGTATACTTATTGGGAATACCTAGTACCTAGTGCTAACAGCGT
CAAAACTTCGACAAAAGTCTCTGTTGTTCTACTCAACTCTTCTAAAGTCT
TCTCAAGTCTTTTAGCTTTTAAGTTTGGTCTCAAAAGTATGGAATAATTT
TAGAGAGTATGGGATTCGAATTATGATATTCTATATTCTTATGACACTTT
GTATACTATTTCTTTCGTGTCATAAAAAAAATTATTGGAGTTGACAAAAG
CGATTCAAAAGTAAACACGCACTTGAAATTCTGCATTTCAGCGTTGAAAA
ATGTTGATAAAATATGTTGCAAACTTATGAAAAAAATTACAATAATTCTT
TCGTGAATTACGAATGATCAATGTTCAAGCTCTATCAATCCTTTTACCTA
AGTAATTCCAAGAAATAAAATTGTGACGGAATATTGTCGGATTTTATATA
CCAATTTTGAAATACAGGCGGCAACGAAGCTCGCTTCAAAGACACAATGG
AAGATAGACGTCCAGTCGTTTATATGTTCATGACGTACCGTAATACTTCG
AATAAACGCCTCCTTCTTTTAAACACCCCCTCAAATAAACACCCCCTCAA
TAAACACCCCTCCTTTGAGGAAATATTTTAAAGAATGCCCCACCCTCAAA
TAAGCACCCCCTTCGAATAAACGCCTCCCCTCCCCCGTTTATTTAAAACA
AGTAGCTGTAAGGAAGCATATAACATAAAAGAAAACTTAGATATATACGA
TAATAATTGTATTCTTTTATTATTCGAACTGATTACCGCCTGTTTCCACA
TCCCTAAATGGACATTTTTTGTACTCAAATAATGAAAAGGCAAAATAAGG
TTCCAATTCACATTATTAAAGTGACCTCGGTTCTAAATTTTTTCTTTGAA
CGCCCCCTTCATTTAAAGCCCCCCCCCCCTCCCCACGGATAAATGCCCCT
CCTAAAAATCAAAAAATTCAATAAATCGAAGTCATACTGTAAGTGAATGT
GAAAGTCGCCTTTTTCAGTATTGCTGACAACAAAATTTGATTTATTTTTT
GTGATTTTTCTGAATACTTTAAGACTTTAACGAATACCATCTTGTGGATT
ACGACCCTATGATGTTGGATGATCCAGAGTTGACATGTGGTAAACATCGC
AAAGTTTTAACTCTAAGCTCATATACTGTAAGTGTATTCCTTGCTCTGTT
ATAACAACTAACAAAAATTGAACTTTCATGATTGCAAATGGATATGAAAA
GTCATTAAGAGGGAGAGGAACCTGCTGCTTGATCGATTGATTCCTACACC
TTTTATTTTCCTTCAAGGTTTCCATCATTCAATATGCAAAGCCATCAGCG
GTAAAGAAAGATATCAATGAACAATTCCGAGAAAAACATCCAAATTTGAC
CATCACTTTAACAAAGTTGAGAAGTCTTAAAGCAGAGATTGTTCAAATCG
CACATAAGGTGGGTTAGGTTAGTCCAGTGCTTAACAGATTTGATCTTTTG
ATGTCTTTACAACTTAACAAAATGCAGTCAATCTATGAAGAAGATTTTCT
GGATGATTAAGCTCACAACGTTTTATTTCTAGATGAATTTAGATATGGCT
GTGATAGCAGGTGCCTTCGTTTATTTTGAGAAAGCGATATTAAAGGTATG
TTAATCTATGTTCGCTAATCTGGAAATTGTACTCAATAATTCGATTTTGA
TGAATCTCCTTCGACCTAAGTATTGTGTGTAAAAAAGTAGTATAAAGGCA
AAACTAATGATTCCATCATATAACGTATGTTTTTCATCCATAGACACGCA
TCCATAAAAACAACAGAAAATGTATCGCTGGTAAGAAATACAGTTATAAT
TTTTAATTTCTTTTTAATTTTATTTTGATGGCAACATGGTTAATTTTGTT
ATTGTTTCTTGGACCTACCTCGGAGGTCATAAAAATAAAGGGCAAAGTTC
TCTAAAAGGTGGCTGAAGCCGTTATTTTCGGAAATTTTTTCTGGCCGTAA
AAATCGGATTTTCTTATTTGGGGAAATTCCATTTTATTATTTTTAGGGAA
AATGAGCATTTCTCGTGATAGATTTAGTTTGTTTTTTTTGTATAATGATG
TAAAATTGTATTGTTTAAAATCTGATGGAACCCGATTTTCGAAAAAACGA
TTTGGGGCAAATTTTGGGCAGAAAAAGTGCCTAAAGATTTACTATTAGAT
TTACTAATATATTTCGAGATATACTTCTTATCTTCAGATTATTCTAAAAC
AAAATATAAAAACAATTTAAAAACAGTATCATACACAAAATAAAAACTTC
ACTCAAAATTTTTGAAAGAACCAATTATTTAGGCAAATTTGGGCCAATTT
CGGATTTGTGGAAGTTGATTCATTAGATTTTGTCTTTAATTAGATAGATT
TATCTTTACAGGAAGGAAATGATTGTTTGATTGTTATGCCCAAAACTTAA
CATGGTTTGATTTCCAAGAAAATATTTTTTGGGCTCCTTACCTCTAAAAC
AACGGATCGCCAGCGAGAAACAAGTTTCAATATGTTTTCAGGCTTACGCT
ATGCTATGCTTTTATCTTTCCTTTTTCGGTAGAACATTTTCATCTTCATT
CAGCATGTTTCCGACTACTCTTTTCAGGTAGGTTCATTCAGCATGTCGCT
AGCTATTTCTGAGCTTATTATTACTTAAAAGCTCTTCATCTCTTCTCTCT
TTCAAGGTGCGAGTTTGCTTCTCTCGATCAAATTTTTCGATGATGTTCAT
GGCAAGAATATCAAAGGATGTATTGAGGTAAAATCACTGTTAACAAGCTA
ACATAATTTCGGAAAAAAGTGAAAAGTGAAAAAGATCTGGTTTAGAATAC
AACTTGAAGCCTTCTTTGATTATCATCTATGCTTTGGTTAATAAACGTTG
TGAAAGAAAGTACAATTTTATTTCTATTTTCAGGCAATCCAAGACCAGTT
ACGAATCAGTCACAAAGAATTATTATCGTGTGAATTGCAATTACTTGTCC
TCCTCGAGTTTGCTTTACAAATACCTGCAAATGAAGTCATTCCAACTTAC
AAACGGCTGGAAAATTCGCTTTCTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000295_pilon:310150..316226- >XLOC_002279 ID=XLOC_002279|Name=XLOC_002279|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2490bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000295_pilon:310150..316226- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATAAATGGTTACGAAGAAGCACGTAAGAAATACAAATCACGTCGACT
GGTTGAAGGCTATTTGTTTTTAAAAAGTCTTTCTTCAAATGAATTTGAAT
CTGGTAATAGTCAGTTGATGATAAATGGTTACGAAGAAGCACGTAAGAAA
TACAAATCACGTCGACTGGTTGAAGGCTATTTGTTTTTAAAAAGTCTTTC
TTCAAATGAATTTGAATCTGGTAATAGTCAGTTGGTAGCATCCGCAGTAC
ATCCAAAGCTAGAGGAAAATGCAAGAAATTCGTCCATTGAGACGCTCCTC
TCCAACGTTCCTTTGGACAAGAGGAAACCAGCCCTTCTACATTCTGTCTC
AATAACAGCAGCTGCTAACGTTGACGATGAGATTCATCTACAAAAGTATC
GTTCAGATGACAACAAAGGTGGTGGAGGGTTTTTCGAACTAAACACTCCC
TCCATGTTGCGTTCCAAGTCTACCATTGAAACATCAAAAGACCTTAAAAA
TCGAATCAAACTAACAACACCGAATCGCATGAAACATTTGAATGAAGAAG
CTTATGGGAAAAGGTAGCATCCGCAGTACATCCAAAGCTAGAGGAAAATG
CAAGAAATTCGTCCATTGAGACGCTCCTCTCCAACGTTCCTTTGGACAAG
AGGAAACCAGCCCTTCTACATTCTGTCTCAATAACAGCAGCTGCTAACGT
TGACGATGAGATTCATCTACAAAAGTATCGTTCAGATGACAACAAAGGTG
GTGGAGGGTTTTTCGAACTAAACACTCCCTCCATGTTGCGTTCCAAGTCT
ACCATTGAAACATCAAAAGACCTTAAAAATCGAATCAAACTAACAACACC
GAATCGCATGAAACATTTGAATGAAGAAGCTTATGGGAAAAGATTGGTGT
TAACGAGCAAGCATAAAGCTCCTTACTGCATGTTTTCTGTCATCCCTTAC
ACCAAGAATAAGCACCAACACAAATTGGTGTTAACGAGCAAGCATAAAGC
TCCTTACTGCATGTTTTCTGTCATCCCTTACACCAAGAATAAGCACCAAC
ACAATGAGAAGAACACGTCAGGCCATTATCACGCACACCATTCTACGAAT
CTTATTGATAATGTTGATATTGGGGATGGAAAACGATGAGAAGAACACGT
CAGGCCATTATCACGCACACCATTCTACGAATCTTATTGATAATGTTGAT
ATTGGGGATGGAAAACGAGAAGTTTCTTTTTGGCAATTGCTTGTTCCTGA
AAATTGGAAAAGACAACGGAATCAAGATCATGAAAACGATAAAGGAAGTT
TCTTTTTGGCAATTGCTTGTTCCTGAAAATTGGAAAAGACAACGGAATCA
AGATCATGAAAACGATAAAGACTTTAACGAATACCATCTTGTGGATTACG
ACCCTATGATGTTGGATGATCCAGAGTTGACATGTGGTAAACATCGCAAA
GTTTTAACTCTAAGCTCATATACTACTTTAACGAATACCATCTTGTGGAT
TACGACCCTATGATGTTGGATGATCCAGAGTTGACATGTGGTAAACATCG
CAAAGTTTTAACTCTAAGCTCATATACTGTTTCCATCATTCAATATGCAA
AGCCATCAGCGGTAAAGAAAGATATCAATGAACAATTCCGAGAAAAACAT
CCAAATTTGACCATCACTTTAACAAAGTTGAGAAGTCTTAAAGCAGAGAT
TGTTCAAATCGCACATAAGGTTTCCATCATTCAATATGCAAAGCCATCAG
CGGTAAAGAAAGATATCAATGAACAATTCCGAGAAAAACATCCAAATTTG
ACCATCACTTTAACAAAGTTGAGAAGTCTTAAAGCAGAGATTGTTCAAAT
CGCACATAAGATGAATTTAGATATGGCTGTGATAGCAGGTGCCTTCGTTT
ATTTTGAGAAAGCGATATTAAAGATGAATTTAGATATGGCTGTGATAGCA
GGTGCCTTCGTTTATTTTGAGAAAGCGATATTAAAGACACGCATCCATAA
AAACAACAGAAAATGTATCGCTGACACGCATCCATAAAAACAACAGAAAA
TGTATCGCTGGTGCGAGTTTGCTTCTCTCGATCAAATTTTTCGATGATGT
TCATGGCAAGAATATCAAAGGATGTATTGAGGTGCGAGTTTGCTTCTCTC
GATCAAATTTTTCGATGATGTTCATGGCAAGAATATCAAAGGATGTATTG
AGGCAATCCAAGACCAGTTACGAATCAGTCACAAAGAATTATTATCGTGT
GAATTGCAATTACTTGTCCTCCTCGAGTTTGCTTTACAAATACCTGCAAA
TGAAGTCATTCCAACTTACAAACGGCTGGAAAATTCGCTTTCTTAAGCAA
TCCAAGACCAGTTACGAATCAGTCACAAAGAATTATTATCGTGTGAATTG
CAATTACTTGTCCTCCTCGAGTTTGCTTTACAAATACCTGCAAATGAAGT
CATTCCAACTTACAAACGGCTGGAAAATTCGCTTTCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000295_pilon | genome | sc0000295_pilon:310150..316226 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1102-1245:145 |
| Aaloc | 1033-1101:370 |
| Aaloc | 994-1029:1285 |
| Aaloc | 931-993:1496 |
| Aaloc | 790-930:1761 |
| Aaloc | 688-789:2003 |
| Aaloc | 610-684:3358 |
| Aaloc | 529-609:3599 |
| Aaloc | 448-525:3932 |
| Aaloc | 118-444:5827 |
| Aaloc | 1-117:6078 |
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