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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000273_pilon:45177..53755+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_002125 ID=XLOC_002125|Name=XLOC_002125|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8579bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000273_pilon:45177..53755+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCATCTCGATTGGTTGTGACTGATCCCTTTGCCAAGAGCAAAAAGAC
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ttcattttcatttggtttatcgttaactattttattaattattattattc
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aattgattttggtgagtttcCCCCATGcctaatcaaaatattttattccc
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aaatgtagacaaaagattgaaaatttttctaatttccaccctgaaaattg
tccaaaataaccaaaagacgACCCTGTCAGGTACGAatgttgaaaattag
taaatttgggaccctgtcagaaatctatagagcctaaaaaagggaccctt
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CAAAGACCTGTACTCTTTAATATCGATTTTCCAGCAATTATTCATCCTAC
ACTATTAGCCTTTATTCTAGtcattgtaaatttttgaaagtcagtCTGTt
aataccgtaacttggtctaatatcgacactCCTAagctaattctgacacc
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atattattttgctCTCTGTGACCGCTAAGAAAATATAGTTTCAATTAATA
GCGATTCTGATTTTCCTTTGAATCCAATCTCTAAGGAGGATGTCGGAATG
GAAtgagatgagggatgtcgatattattAGACCAGCTTATTACGGTAGTC
ATTGTAAGTCAACTTGAGGAGGTGTGTCCAGGGTGGGCGGTGAAATCGGG
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ATCGATGAGATCTCCTCATTGTTGGCTAAAGCCAAAAACCCTGCTTTCAA
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AACCTTtcatttattcatgatatgcaccattgcaatgtcttccactcatt
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aatggtgcatatcatgaatactacTAAGACTAAAGGTAGGATACTAAGTG
TATTTAAGTACATCGAGAACCCGATTGTCTGAAGATTGAAAGCAAGCCTT
AGCCAAAAAATGTCCTGGTTTTATTGAAAAGCGTAAACTTTCATTTCATG
GGTGGGAAACATTCTGGTTAGAATGCactgaaaatgatttttgaagaaac
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aatttttccaaaagaaagaaaacattgagAAGATTCTGAACGAGAacgaa
aacttgaaaaatgatgATATTGTGGCAGGTAAATATCATATCCTtttatt
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TTGCTTAATTCATATTAAGTAAGTGATCtgggaaagagaaaaaaacctTA
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tacgaggcaagtgatgttcgtgacgtaatttatgaaaaaggtctataaac
GAGCTTTTAAAAAGACTCAACAATCTCGAAAGCCAAGAACCTCATTGGTA
AGAGTGAAGAAGGCTCGGGGACGGTCACTTTAGCCCAACACAAGATAAAC
GAAACCCTATCTGTAAGATCTCCAATTTTTACCAACtgagcatttttgtt
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ACTCCGATTTATCTGCGCCAGTTTTAGAATCACTCACTCCTGAAAGGTAC
GTTAAtttttttACGTAGTTTTtcataattcaaaatcaaagttCCCTCCG
TTTACATTCAAAATCTTCATAATTCCCAAGCCATTAGCTCCACTAACCTC
TTTTAAAACCCTGGACTAAGCTATATACGCCGGAGTTTTATTGTAGTTTT
TTAAAAGTGGTATCAAACGGCGTTACATCACAAGAATCTAGCGAAAAGTA
CATCTAGCCTTTCAAAAACAaccgatcaaagattttatttGCCGGGACTA
AGAAACTGCGATCCCCAACAAATGACTTGAGACAAAAGAATTCTAAACAT
TTTTACAAGTTAAAATCTGTCCCCCGGACCCCACTTTATCAGTGTTGAGT
CCGGAAATGGCCGAGAACTCAACGCTGACAGTGGGGAAAGGGGGGCCATG
TGAAGTGTCTCAGATATAAATTTGGGAATTGTGGCTCCGATGGTCAGGTC
CTTCTTTGGGTAACTGTTTTGCTGTTTAAATAACAAATATATCTCATTCC
TTTATTCCCATGAGAAACTCAAAGATAGGTTTTCAAAAGGATTTTCGTTt
gtgtaccttatcggggaaaacttcgtcggggaaaagtgacgaaatttcgg
ccaagatgaatatttttccccgacgaaaattttccccggccttaatgcgt
ttaccaactaccagcaagtgacgaatatttttccccgacgaaaattttcc
acgacgaagtttttcccgataaggtattttagCCTTCTCTATATATCAAT
CTTTAAATGAATAGAATTGTGAATGAGTTTCCCAATTTGGCATTGGCGTT
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ATTTATTACAAGATGGAGAAGATTATGAAGGCATTGACCCTGCTGTAAGT
TGTTATCATCGTTGAGTTTAAAACCCCGGATGAGCCAGAGGCGAAACTCT
AGGGTGGAAAATAAAGTCaattaggcttttccagaaatagttccCCCCTG
TTGaagatatcggatatccagggggttaacgatatttgctcaaaagtgga
tatccaggggttaaaTATCCACAagggagtggatatccagggggtttagt
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TGCTGTAAATTATTACCCCGCAGTGGCGGAGAGTCTTTATTTCCTTTTAA
GGAGTATGGCTTAAAGAAACACTCTCCGTCATTAACTTTGAACCCCTTCA
GATCCATTAGAAGAGAACTTCACTCAACTGAGAATGAGAGCGCTCTAGTT
CACGTATGATAGATTGTGTAATCATCGACAGAGTTGACGTCGGCTGGTGA
ACCATTTTGGCGACTTTCAATACTTCAATACAATAATTTTCAGCTATGTT
AACATTAGCTAGAgtgttctcatttttttttgGCTGGGTTAAGCTTTTAC
CGATAGGACAACATTGAATTTCCACCTTCTGTATATACTTAGCTAAGATT
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TAGTTATGCAGCACCAAAGCACTTAATCTTATAGTTCTAAGTCTCCTGAC
AACCACGTTTATTTGTTATCACTTTTTCAGTACCTAGCACAAGCAGAACT
AATGGCGTCCAACGAAGCTGCTATTCAACagaaccaacaacaacaacaaa
gttcTGCCTCATCTCAACAAAATGCTCAACAGATTTCTGCTGCTGACCTA
GCAAATGCTCTATCCTTTGCTACAATGACACAAGGTAATGGATGGAAAca
gttttttctaaatttccgatcaaagatggtggatatagcttggtagAACT
TGGTAGAacttcacagtcgaaatggaccatgggtaatcaggactgattgc
gccccgATAACGGTTTTTtgttggttagacgcaaaaaaattcaaaactgt
ggaccaatagtaagtcgtcattagcgagcagtggtcctgattactcATTA
TGCTTTGcaactgtgaaatggcctatgtaAAGATCGGTCAGTGATACTAA
CCATGTGAtctttttaaacactttttcttTCATCTGTTGCTCTTATTGTT
GAAACAATCCAGGCTGGGAACTTTTTCACAGTctagattttgatgttttc
atgGATTATTTCTGATTTTCCGTCCGGTGGTCCTGAATCGACTTTGTGTA
TATTGAATTGGGAATTAAGGGCATGATGCGGTTTGTAAATGGATTGTGCG
TACACTCAACAAAAAGCTAACCCTTGGTTTGCAGTTAATAATGAGACCAC
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TTTCAAGCTTCCACATTTTTGGGCATGTTGCTATGTAAAAATCGCTTGAT
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GTAGTTTACCCTTTGGAAGTCCTGGTTCGCAACCCAATCGGCAACCACAA
CCTGATGTAAGAATTGGAATTTCATTATTTGCTTCattaaaaaccataca
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ttgaaaaaatgaaaaaaacaccccctggaCATTTGTCTGGGATAACCCTC
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ATATGATTTCTAGTCTGTCCGATTGGACTGCCACATCTATGCTATTAAAT
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TAAGAGCAATGTTCAtctttatctggcacccagatgcagaaattttcatc
cggcACGCTAAAACTCTGAAGGTCGGGACAATTTTCAatatctggaaggt
ttagattacggaattttgcaagaccgcgtcaaggattttgcagtaGGAgg
cctggtaacccagccctcgttctcggggattggcgggtccaactgaaata
tttttagctttgcGAACAAGggaacccgactggggatgtgGCACATCAAA
GGCTGACCATCATTCTTTTCCGACGGGAAATTgacccgctcctttagagc
tttagcgtgcgCGGCCGCCAATCTGTtattggaatatcagataaccttCT
TCGCAAATTACCGTTTTGCTCGACCCACCCTCCAAAGTAAAGGCTGGTTT
CCACTTACGCGTGCTGCGATTGCACCGTttggcttcaatcatttttgctt
ggaaaaaagattacgtcatagaGATGTAGCGCGCGCTCTTTTCAAAcatt
acgtcagatcgcgccaatggaattgcttcatttttcttttgaccaatagc
gtggaagctttacCAGAAAAAGTGCGGTCGCAGcgcgcgcaagtggagac
cggccttaaaagaACTTAAAATGCATtaccttttgttatttttttagttC
ACAGCTGGTATAGAACAAATGAGAACAGAGTTTAATATCTCTGAAGATGT
GGCAAGAAGAGCTCTGGTAATGACCAACGGGAATGTGCAAATGGCTGTTA
ACCTTGTTTTTGACGGATCTGTCAATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000273_pilon:45177..53755+ >XLOC_002125 ID=XLOC_002125|Name=XLOC_002125|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1932bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000273_pilon:45177..53755+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCATCTCGATTGGTTGTGACTGATCCCTTTGCCAAGAGCAAAAAGAC
aattgatgagattgatttAGCATCATCTTTGACCAATTTCAAGAAGTCTG
TCTACGTGGAATTTGGTGTCAAGGTTGAGGACCAAGATGGCATCTCGATT
GGTTGTGACTGATCCCTTTGCCAAGAGCAAAAAGACaattgatgagattg
atttAGCATCATCTTTGACCAATTTCAAGAAGTCTGTCTACGTGGAATTT
GGTGTCAAGGTTGAGGACCAAGAATTGTTGTACCTTGGACAAATTTTGGA
AGACGATGAAAAATCGTTACAATCATATGGAGTGCAAAATGAAACAACAA
TTTATTTGTTTAAAAAGTTGCCTGAGGAAGAGCCTCAAATAAAATTGTTG
TACCTTGGACAAATTTTGGAAGACGATGAAAAATCGTTACAATCATATGG
AGTGCAAAATGAAACAACAATTTATTTGTTTAAAAAGTTGCCTGAGGAAG
AGCCTCAAATAActgAAATGCGACCAACACCGAGCATCGATGAGATCTCC
TCATTGTTGGCTAAAGCCAAAAACCCTGCTTTCAAAACAATGctgAAATG
CGACCAACACCGAGCATCGATGAGATCTCCTCATTGTTGGCTAAAGCCAA
AAACCCTGCTTTCAAAACAATGttaaagaaatttttccaaaagaaagaaa
acattgagAAGATTCTGAACGAGAacgaaaacttgaaaaatgatgATATT
GTGGCAGttaaagaaatttttccaaaagaaagaaaacattgagAAGATTC
TGAACGAGAacgaaaacttgaaaaatgatgATATTGTGGCAGCGTTGTTG
AGAGACTCCGATTTATCTGCGCCAGTTTTAGAATCACTCACTCCTGAAAG
CGTTGTTGAGAGACTCCGATTTATCTGCGCCAGTTTTAGAATCACTCACT
CCTGAAAGAATTGTGAATGAGTTTCCCAATTTGGCATTGGCGTTAAAGTT
GGTTTTATCAAAGTTGAGTGCAACAGATTCCATTGGTCGAAGAGATTTAT
TACAAGATGGAGAAGATTATGAAGGCATTGACCCTGCTAATTGTGAATGA
GTTTCCCAATTTGGCATTGGCGTTAAAGTTGGTTTTATCAAAGTTGAGTG
CAACAGATTCCATTGGTCGAAGAGATTTATTACAAGATGGAGAAGATTAT
GAAGGCATTGACCCTGCTTACCTAGCACAAGCAGAACTAATGGCGTCCAA
CGAAGCTGCTATTCAACagaaccaacaacaacaacaaagttcTGCCTCAT
CTCAACAAAATGCTCAACAGATTTCTGCTGCTGACCTAGCAAATGCTCTA
TCCTTTGCTACAATGACACAAGTACCTAGCACAAGCAGAACTAATGGCGT
CCAACGAAGCTGCTATTCAACagaaccaacaacaacaacaaagttcTGCC
TCATCTCAACAAAATGCTCAACAGATTTCTGCTGCTGACCTAGCAAATGC
TCTATCCTTTGCTACAATGACACAAGATCCTGCTACACCGAGTAGTTTAC
CCTTTGGAAGTCCTGGTTCGCAACCCAATCGGCAACCACAACCTGATATC
CTGCTACACCGAGTAGTTTACCCTTTGGAAGTCCTGGTTCGCAACCCAAT
CGGCAACCACAACCTGATttCACAGCTGGTATAGAACAAATGAGAACAGA
GTTTAATATCTCTGAAGATGTGGCAAGAAGAGCTCTGGTAATGACCAACG
GGAATGTGCAAATGGCTGTTAACCTTGTTTTTGACGGATCTGTCAATTAA
ttCACAGCTGGTATAGAACAAATGAGAACAGAGTTTAATATCTCTGAAGA
TGTGGCAAGAAGAGCTCTGGTAATGACCAACGGGAATGTGCAAATGGCTG
TTAACCTTGTTTTTGACGGATCTGTCAATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000273_pilon | genome | sc0000273_pilon:45177..53755 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 835-966:8448 |
| Aaloc | 766-834:7338 |
| Aaloc | 610-762:6531 |
| Aaloc | 481-609:5616 |
| Aaloc | 424-477:4791 |
| Aaloc | 337-420:4244 |
| Aaloc | 259-336:3530 |
| Aaloc | 139-255:2249 |
| Aaloc | 1-135:1 |
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