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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000273_pilon:307204..318008- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_002088 ID=XLOC_002088|Name=XLOC_002088|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10805bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000273_pilon:307204..318008- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAGCTTTCAGAAAACAAGGACAAAAAAGAGATTGTGAAATATGACCA
TAACACCGGAAACATAGACAATAGTGTATCGGAAAGATACGAATCCGGGT
ATACGGGTACTGTTAAATACGGAATTGACCGTAAATTTATTGCCTTGATT
ACCTTTGCTTTTTTATTGCTAATCGTTGGTATTGTCTTGATTATTCTTGC
GAACGTTAACTCGTGTGAGACATCGAGTACTACTGAACTCGTTGACCCAG
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CCACGAAGTTTTCCCGGAAGAGATAGCATGGTCACCGGAAGTAACAGATC
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AAGAAGATTTGGGAAAATGCTGACGCGCTGTTGAACGAATCAATCAATTT
GGTATGTAGGGGCGTTTCGTTTCTACTAATAATAACGCTGTAACCATTTT
GAGTCCCGTCTAACCGCTAAATCAACTAAGTTTACCGTACGAGTTTTAAG
TTTTTGAAACCCTACTTATCTCGTTCGTCATACCTTTATTTTAATCTGAA
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GTATACATGCTTCGCTTTTTGAAAAAAAATTTCTAGAAGCAAATTTCTGC
TTTACAAGCAAAGTTGATTTCGTAGCAGGGTAGAACTGCCTTGCTTTCGG
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TTGATGAGTTAGCAAACGATATCACTCTTATTTAAAACAAAACCTTTAAC
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TTGTCGTGTTATAACCTCGTTGTCATATCAAAGCCTTGTTTTCATGCTAG
AACCTCGTTTTCATGTTATATAGGTATGGTACGAACGCACGTGGAATGTG
TCGCTGGAATCGATGCCATGAAATCTAAGCATCCTAATATCACTGAAAAC
GGCCCTAAAGGTAATTTGTCAACTTAATTTACTTTAAGAGCAGAAAATTT
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CGAAACTTTAACCCTTCTCAGGCAAGAGAAATTGAAGCTACTCATCTCCC
ATCCAGAACGCGTCGTAATCATGAAGGTGGATTGTATCTAGCGGCTCCTT
TTTTTTGGAGGACTACATTCTGTTAAATCTAGCGATAGATTATAGTTTCA
ATCCGGCGTTTATGTAAAAGCTTCGCGCGGGCGTTCTGGATGGGAAATAA
GTGGTTTCATTTCCCATCAGGAGTCTCGCCTCTAGCCCTTCAGGCTTGAA
ACTCAGTGTATGAAACGTGCTTATCACAACCCAGTTGTAGATAAACTCTA
CTCACATTTTCTGTACAGTGGCAAAGCAACTAAACTTTCTTAGAGTCCTA
AATTTTCAACAAAAAAAAACAATTTAAATCATTGTTTATATTTTCAGGCA
TCGTAGGCGAATGGTACGTGCGCCGAATGTATGAGCCGTTATTTTACAAC
AACGTTACGATCAAACTGGATAAGATTTTTGTCAAGAAACATGGTAAAAA
TGTTACGGATTATATTTTGGGATTGATGGAACCAAACATCGGAAAACCAA
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CTCCATCACTTCTAATCAATAGAATGGCTTCGATTTGTTTCAAAGTGAAA
CGGAACCGTTACAACATGATCTTAGTAGACGAGAAGATTTTAAAATAATA
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TTTTTTTTTTTTTTTCGGCTAGAACATACCTGTTATCTCGCAAACCTCAC
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GAAATTTTGGTTTTATAATTGAAGGATGGAAATTTGAGCGATTACTTTAA
GCTGATTTGGAAAACGTAAATTACCCATAGGTTTTGTAGAATAAACCAAT
GCCATTGAAATATCAAGTGAAAAAAACCCATGTAGAAATGACAATTTTCC
AAGGCTGGTTGGAAAACATGACTTTTTGGGTGGGAAATTTTTATTTTCCA
AACAGTTTGGGAATTGAAAAAAAAGGTCAAAAATCGATCTGAAAAGACTT
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ATCCATGTGGAAATTACATTTTTCTAAGATTGAGACCCTTTCTTGGAAAA
TTAGACTTTTTGGGTTGGAAATTTGTATTTCTCGAAACAGTTTGGAAAAC
GTTAAAAATCCATGTGGAAAATACATTTTTGTGAAATTGAAACTCTTTCG
ATTGGAAAACTAGACTTGTTGGGTTGGAAATTTGTGTTTCTCCAAACAGT
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ACTCTTTCGATTGGAAAACTAGACTTTTTGGTAGCCTAAAAATCCATGTG
GAAACTACGTTTTTCTAACCATTTTCTGCGCATGTCCTTGGGAAAACCAC
AAGCGATTTTTCGCTCAAAACTGTTTTGATGTATAGCTAACCTAGATTTT
AGGCTATAATGTGAGCAGTCAAGCTGTAAGTTTCCATCAGGTGAGGCGTC
TCTTCGGAGCGGCCTCGGTCAATTGCAGTGAGTTCGCACAGTGAAGCACT
TAGAGTACTTGTGTCATAGTTTCAAATCACAGGAAAAAATTCCAAGGTTG
GAAATTCGATATTTTTGGGTTGGAAATTTTGGTTTTATAATTGAAGGTTG
GAAATTTGGGCGATTACTTTAAAGTGATTTGGAAAACGTAAATTACCCAT
AGGTTTTGTAGAATAAACCAATGCGCTTGAAAAATCAAGTGAAAAAAAAC
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GGGTGGGAAATTTTTATTTTCCAAACAGTTTGGAAATTGAAAAAAAAGGT
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AAAACTAGACTTTTTGGGTCGGAAATTGTGTTTCTCCAAACAGTTTGGAA
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GAAAACTAGACTTTTTGGGTTGGAAATTTGTGTTTCTCCAAACAGTTTGG
AAACGTAAAAATCCATGTGGAAATTACGTTTTCTAACCATTTTGCGCATG
CTCCTTTGAGAAAACCACAAGCGATTTTTCGCTCAAAACTGTTTTGATGT
ATAGCTAACCTGGATATTAAACTATAATGTGAGCAGTCAAGCTGTAAGTT
TCCGTCAGGTGAGGCGTCGCTTCGGAGCGGCCTCGGTCAATCGCAGTGAG
TTCGCACAGTGAAGCACATAGGGTACTTGTGTCATAGTTTCAAATAGCGC
CCTGCTGAGCTGTGTGAGTGATCTAAGATCAACCACGTATCTGTGCGAAC
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GTTCACAAAAACAAAAACCTTGTTTAAGATCTCTTTTCCACATCTCTGCC
ATCTTGGATTTTGGCCTTTTTCAACCTGAATTTTAAAAAATTCCAACCTT
GTTAAATTTGGATTTTGGCTTTTTTCAACCTGGATTTACGAAAATTCCAA
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CCAACCTTGTTAAATTTAGATTTTGGCTTTTTCAACCTCGATTTTCGAAA
ATTCCAACCTTGTTTAAGCTTAGATTTTGGCTTTTTTCCAATTGAATTAT
AAAAAATTCCAACCTTGTTAAATTTGGATTTTGGCTTTTTTCAACCTGGA
TTTACGAAAATTCCAACCTTGCTAAATTTGGATTTTGGCTTTTTTCAACC
TGGATTTACGAAAATTCCAAGCCATGGAAAATGCAAAATTTTCAACCTTG
GAGAATGTCCCACATTTTCAGGTTGGATTTTCCATTGGATTTTATCTTTT
TTCCAACTAAGAAAACTTGAAATTTCCAACCTTGGAAATCGAAAATCTTT
TCCTGTGCCTAGTACCAACGCTACCCCCCCCTCCCGAAATATCTGGTATT
TGTTTATAGGACGACTGAAGTTGATATTTTTGCGATATACAGGAGGAGTT
TTATTGATTTAATGAAGAAATTTCTTTAGGAGTTGTTTGAATAAAAACTG
TCATTTCATCCATCGAACATTCTTTCGCTTCCTTGTCTGGAGTTGATATT
TTGCGTGGATATCCCAGTAATCCAGGACTTTTGTGGCCAGGTAGCTCAGT
CGGTAGAGCATTCGCCTTACAATCCGAGGGTTGTAGGTTCGATCCCCGGT
CACCTCCAACTCAGCAGATGAATAGCTTAGATTGGGTAATCTGATCTAAG
CAGTAAGTTACTGGGAGTTGAGAGTAGGTGTGGCGGTCCACCTCAGCATT
CGATCTCCCAGGTCTAGCGATAGACTTCCTCATTCCCGGCTCCGTCGACA
GCCACCAGATGAATATACTTACTTACAACTTACTTAGGACTTTTAGGGCA
GTCTTCCGTTCTTCACGGGGTCCGGTCTAGCTGACTCGGCTATCCATAGA
TAGATTGTCGAAATTTTACGTGGATAGCACAGTAATTTAGGACTTTTAGG
CAGTCTTTCGATTGTTTTCACGGGTTCCACATCCAGCCGGTTCTGCTATC
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TTAGACCACTTGGCCATCGCTCCTTATCCATTAGCCTGTACCAGACGACC
ACGGCTTTTTCCTCGACACCGTAGTGATAAAAATCGCGTGTTGGGATAGA
GATAGGCTACTTATCCATGAACTGAGCTAAGTATTGAAAGGAGCGAACAT
TCGAACCCGTTGTCACCGCTCTTTTTTTTTCTAAACGAAGTTAATTTTTG
TTTTGTTTTAAAGATATTTGGAATACGAGCATCTACTTTACTGTCGGCCA
ACTAATGTTGGACCCGCGGGTCTCTCCGCCCTTCCACTCGATTACATCTG
GTACAAAGGTAACAAGACAAATAACCGGACGGATCCCTATTTACCGGACT
GCGGTAGAAGACCAGAATGCCGATTGAACGGTAGCGTAGCGTATGAATTG
ATTTTGGGATATTTTACCACCAAAGATATTCACCCATTGAAAGTCAATGA
GCTTGGTTGGGAAAATTTGTATAAATTATACCCACAGGTAAGCTTGTTAT
CACCATCCTTGAAACACTTATTTTTTTATAAGAATCAGAAAAATTTTCTT
GTTAACGAAAATATTGGATCTTTCCCCTGTTTTTTTTGTGGGCTTACAAG
TAATAATAAATTTTTTACTACACAAACATATAGTGGACTTGGGATTGATC
GACCTATAGTTTGAAGGTACTTTTATACCTACCCTGAGTCTCGATCTTTC
TCTGTAAGTAAGTTACAATAGGAAAGCATAGCTGGAAATGAGAGAAAGTT
TAATTTTCTTACCGTACCTTCAAAAATGCTTTTCAGTTTTTCATATGTAC
TTTTTATAGGTTGAAGAAATTGCCCGTAACGTGACCGGTATTCCAGACAC
GGAAAGAGCTGTGAAGGAATTCCAGAAACGGTTGACTAATCATTCGCTGA
GTTATTTTCATGATCAACCATTGCCAGAGAATGAAACAAAAGGAGATGCA
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TTGGAAAGCTATGATGAAGTGGTTCTCTTTCGCTCAAATGGTGAGTAAAA
ATCTGCGGTAGATTGATGTGACCTATGTATCATCCTTCCGTTATTGTTTG
AGTAATAGACGATATCGGCTTCACATGAAAACTCAGATTTGACCCACGAG
AATTGCCCACAATGTTTTGTGTGGAAAGAATTTCACCGTGAACTTTTTTC
CGCGCAAAGCATTGTAGGCAATTCTCGGGGGTCAAATCTGAGTTTTCACG
TTAAGCCGATATCGTCTATTGTTAATCAATAATTTTAGCAAATTTCGTGA
AAATAATGAAATACAATCATGGACAAAATATTTGAGACAAAGGGGATTTC
CCTGCGAAATTTTAAACACCACAAATGGTTTTAAGCGCGTTAAACTACGG
TTAGAAAGTAGAGTTTTATTTTAGCTTATCCTCGGGGACTCTTTATAGTG
TTGCACCATTTGTGCTGATAAATGGCCTAGTAGTATATTGCATACGTCGT
AACCTTTTGGGCTTTGCCTCAGCACGCTTGAAATGTGAACCACTAGATCC
AGTCCCTTTTTGGAGAAAAATGAACCGAAAACCATGACCAAATTGACCAA
TCATAAACTTTGATCGGGTTTCAGGATATATTTCATTGTTTTGGAGTTTT
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GGTGTTCCTACTGCCCAGATCTTTGACCATTCCGTATTGCTGCCTTTGTG
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TCAAGTACCATTTTGGGAATCTTTGGTATAACCCGGCTAGGGGTTGAACC
CACAACCTTGCGACCCGTAGCCGTACCTTTACACTGCGGTCTACAATATA
TAAGAATCCATAAAAATCTGTTAATGGTGGTAGGATGTTTTATTTTTGCA
ATGATTTGATATACCTCTGGACATTTCGATCTTCACCCCCTGGACATTTC
GACCTTCACCTCCTGGACATTTCGACCTCCACCTCTCTGGACATTTCGAT
CTTTACCCCCATTTTGATCTTTACCCCCTGGACATTTCGACCTTCACCTC
CTGACATTTCGACCTTCACCTCTCTGGACATTTCGATCTTTACCCCCATT
TCGATCTTTACCCCCATTTCGATCTTTACCCCCTTTACCCCCTGGACATT
TCGACCTTCACCTCCTGGACATTTTGACCTTCACCTCTCTGGACATTTCG
ATTTTCACCCCCTGGACATTTCGACCTTCACCTCCTGGACATTTTGACCT
TCACCTCTCTGGACATTTCGATTTTCACCCCCTGGACATTTCGATTTTCA
CCCCCTGGCAGGGTGGTTTTGCACAGTCTATGTACGTTAATTAATCGTTT
TCTTTTCACAGATTTGGAGAGCCCTTCGTTTGATCGTTGATACCGGTATT
CACTACAAAGGAATGAATCGAACCGAAGCTTTGAGTTTGTTCGAAAAATA
CGCTTGGGATGCTACAGATCTCAGTCAAAAGGAGGTCACTCGTTACCAAA
GTAATTACGGACAAGCTACAGCTTATATGATTGGTCAGTTGGATATTTGG
AAATTACGTAATGATACTGAAGATAGTTTGGGTCATAATTATAGTATCAA
AGAGTTCCATTTACAAGCTCTTTCACAAGGATCATCACCTCTTCAATATT
TGAAAAGCTATATGATGAAATTTATTGATTGTAAAAATGATCCATCTCAA
CAATATTGTGATGTCGTGTTAAATCCCACCAAAGCTTCGAAAACGGGGAG
ACCGTATATCCGGAACAACCGTATGAAATGGCCAACCCATCGACATCACA
TCTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000273_pilon:307204..318008- >XLOC_002088 ID=XLOC_002088|Name=XLOC_002088|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4890bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000273_pilon:307204..318008- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGAGCTTTCAGAAAACAAGGACAAAAAAGAGATTGTGAAATATGACCA TAACACCGGAAACATAGACAATAGTGTATCGGAAAGATACGAATCCGGGT ATACGGGTACTGTTAAATACGGAATTGACCGTAAATTTATTGCCTTGATT ACCTTTGCTTTTTTATTGCTAATCGTTGGTATTGTCTTGATTATTCTTGC GAACGTTAACTCGTGTGAGACATCGAGTACTACTGAACTCGTTGACCCAG ATCAGGGAAAGACTGTTTTAAGTGACGACCTTTGTGACCCATCTGAAGAA GCTAAGCGAGTCAAATTGAATGAATTTTTGATAAAAGTACAAGATGTGTA CCACGAAGTTTTCCCGGAAGAGATAGCATGGTCACCGGAAGTAACAGATC AAATTATAAGGAATAAATTTAAAGCACATGATCCATCTCCAGAGAATTTG AAGAAGATTTGGGAAAATGCTGACGCGCTGTTGAACGAATCAATCAATTT GATGGAGCTTTCAGAAAACAAGGACAAAAAAGAGATTGTGAAATATGACC ATAACACCGGAAACATAGACAATAGTGTATCGGAAAGATACGAATCCGGG TATACGGGTACTGTTAAATACGGAATTGACCGTAAATTTATTGCCTTGAT 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ATGGTACGAACGCACGTGGAATGTGTCGCTGGAATCGATGCCATGAAATC TAAGCATCCTAATATCACTGAAAACGGCCCTAAAGGTATGGTACGAACGC ACGTGGAATGTGTCGCTGGAATCGATGCCATGAAATCTAAGCATCCTAAT ATCACTGAAAACGGCCCTAAAGGCATCGTAGGCGAATGGTACGTGCGCCG AATGTATGAGCCGTTATTTTACAACAACGTTACGATCAAACTGGATAAGA TTTTTGTCAAGAAACATGGTAAAAATGTTACGGATTATATTTTGGGATTG ATGGAACCAAACATCGGAAAACCAATACATGATATGTTACAGCATCGTAG GCGAATGGTACGTGCGCCGAATGTATGAGCCGTTATTTTACAACAACGTT ACGATCAAACTGGATAAGATTTTTGTCAAGAAACATGGTAAAAATGTTAC GGATTATATTTTGGGATTGATGGAACCAAACATCGGAAAACCAATACATG ATATGTTACAATATTTGGAATACGAGCATCTACTTTACTGTCGGCCAACT AATGTTGGACCCGCGGGTCTCTCCGCCCTTCCACTCGATTACATCTGGTA CAAAGGTAACAAGACAAATAACCGGACGGATCCCTATTTACCGGACTGCG GTAGAAGACCAGAATGCCGATTGAACGGTAGCGTAGCGTATGAATTGATT TTGGGATATTTTACCACCAAAGATATTCACCCATTGAAAGTCAATGAGCT TGGTTGGGAAAATTTGTATAAATTATACCCACAGATATTTGGAATACGAG CATCTACTTTACTGTCGGCCAACTAATGTTGGACCCGCGGGTCTCTCCGC CCTTCCACTCGATTACATCTGGTACAAAGGTAACAAGACAAATAACCGGA CGGATCCCTATTTACCGGACTGCGGTAGAAGACCAGAATGCCGATTGAAC 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TGATAATAGCGATCCTAATTGCACTTATCCTTGTTTCTACAATATACCAT TCTTTTTGGAAGATTTGGGACCGAAGTTTTCGGAGTATTCAGTAAACGCA CATGAAGCAAGACCAGGCCATCATACACAGGTTCAAGGGTTGACAGAACA TTTCCGTGACAAATGCGGTGGCCCAGAAGGTTGGTTGGATGACAAAACTT TCTACACAGCTTTCACTGAAGGATGGGCCTTATATGCTGAAAATCCTCTT ATTGCTCAAGACACTGACGTGTACAAAGAAAATCTGATGCAGAAATTTGG AATGCTTAAGTGGCAGGTTCAAGGGTTGACAGAACATTTCCGTGACAAAT GCGGTGGCCCAGAAGGTTGGTTGGATGACAAAACTTTCTACACAGCTTTC ACTGAAGGATGGGCCTTATATGCTGAAAATCCTCTTATTGCTCAAGACAC TGACGTGTACAAAGAAAATCTGATGCAGAAATTTGGAATGCTTAAGTGGC AGATTTGGAGAGCCCTTCGTTTGATCGTTGATACCGGTATTCACTACAAA GGAATGAATCGAACCGAAGCTTTGAGTTTGTTCGAAAAATACGCTTGGGA TGCTACAGATCTCAGTCAAAAGGAGGTCACTCGTTACCAAAGTAATTACG GACAAGCTACAGCTTATATGATTGGTCAGTTGGATATTTGGAAATTACGT AATGATACTGAAGATAGTTTGGGTCATAATTATAGTATCAAAGAGTTCCA TTTACAAGCTCTTTCACAAGGATCATCACCTCTTCAATATTTGAAAAGCT ATATGATGAAATTTATTGATTGTAAAAATGATCCATCTCAACAATATTGT GATGTCGTGTTAAATCCCACCAAAGCTTCGAAAACGGGGAGACCGTATAT CCGGAACAACCGTATGAAATGGCCAACCCATCGACATCACATCTAGATTT GGAGAGCCCTTCGTTTGATCGTTGATACCGGTATTCACTACAAAGGAATG AATCGAACCGAAGCTTTGAGTTTGTTCGAAAAATACGCTTGGGATGCTAC AGATCTCAGTCAAAAGGAGGTCACTCGTTACCAAAGTAATTACGGACAAG CTACAGCTTATATGATTGGTCAGTTGGATATTTGGAAATTACGTAATGAT ACTGAAGATAGTTTGGGTCATAATTATAGTATCAAAGAGTTCCATTTACA AGCTCTTTCACAAGGATCATCACCTCTTCAATATTTGAAAAGCTATATGA TGAAATTTATTGATTGTAAAAATGATCCATCTCAACAATATTGTGATGTC GTGTTAAATCCCACCAAAGCTTCGAAAACGGGGAGACCGTATATCCGGAA CAACCGTATGAAATGGCCAACCCATCGACATCACATCTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000273_pilon | genome | sc0000273_pilon:307204..318008 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 2002-2445:445 |
| Aaloc | 1816-2001:1862 |
| Aaloc | 1561-1815:2726 |
| Aaloc | 1330-1560:3697 |
| Aaloc | 1057-1329:4292 |
| Aaloc | 889-1053:7857 |
| Aaloc | 802-885:8881 |
| Aaloc | 502-798:9426 |
| Aaloc | 1-501:10806 |
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