XLOC_001654 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_001654
Unique NameXLOC_001654
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000202_pilon:212772..221994+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001654 ID=XLOC_001654|Name=XLOC_001654|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9223bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:212772..221994+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000202_pilon:212772..221994+

>XLOC_001654 ID=XLOC_001654|Name=XLOC_001654|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1482bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:212772..221994+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgattttttcatttttggtactGGTGTTTCTATGCAAGAACAGTAAAGa
tgattttttcatttttggtactGGTGTTTCTATGCAAGAACAGTAAAGGG
GATATATTTTACCCATACGGCTTGACGGAAAACGACACTCTGGTCAAATC
TGACAATTTCTTCACAGTTGCGAGTGGTTTGATCAACCTTGACGTACCTT
ATAAAGGGTATCCACAATTTCACGGGATATATTTTACCCATACGGCTTGA
CGGAAAACGACACTCTGGTCAAATCTGACAATTTCTTCACAGTTGCGAGT
GGTTTGATCAACCTTGACGTACCTTATAAAGGGTATCCACAATTTCACAT
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AAAATGGGTGGATTGTACTATAGACAAGCTAATGACCAGATCTATGACAA
TGGTTACCTGTCAGTCAAACCTTCTACAAGACCGCAACCAAAATCAAAGG
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CACTGATAGTCACCTATTCACAAAAATTCCAGCCATACGACAGTACGTAA
ATGAAACTATACGAATGAGGTTTCCAAAGCACGATCTCATCCCTCAAAAT
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CCATTCTTTTGCACCACCAATCAGCACCTCTAAGCTTCAACATAGTTCCA
ATATAGGTGTAAAAGGAAGATTTGTGTGGAGTTTACATGACATAGATTGT
GATCCGAAAAAAAATTACATTCACAAGGGAATGCATAACGTGAGTATTTT
AAACAAAGGAGACAATGTGGAACAAAAGGTGAATTTGACAAAACCAAAAA
TTACATTCACAAGGGAATGCATAACGTGAGTATTTTAAACAAAGGAGACA
ATGTGGAACAAAAGGTGAATTTGACAAAACCA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_001654XLOC_001654-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000202_pilongenomesc0000202_pilon:212772..221994 +
Properties
Property NameValue
Aaloc658-741:9140
Aaloc418-654:8722
Aaloc316-414:7646
Aaloc175-315:6561
Aaloc52-174:965
Aaloc1-48:1