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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000202_pilon:227239..235230+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_001652 ID=XLOC_001652|Name=XLOC_001652|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7992bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:227239..235230+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGAATTTTTCATCGTGAAACGTTCAGAAATGATACTTTGAATTTTATCAA
TGAGTTAATCAATCAAAAAGGTTAGTTTCGTGAGTTTCCTAATAATTTGT
GTAAAGTCTCtttcaatataatctgcagcgggACAATAAAATCTGTAACT
ATTGATATAATTGGATTTCTTAGCTTAaccgtgtcggaagaaaatttcta
catccaTTGTCGGATAACCAGCTACGTTGCGTCAGgctgtgggttcgatc
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TGTTTGAAGCTCCTAAATTAGATGCCATATACAGCCTAGAAACTAATAAG
AAGGTCAatttatttgaaacatttttgctCTATGTTCCTTCACTCTAAAT
ATTACTTCATCAGTATTATTTTATCGAACTTTCCCTTTAAAATTTGGATA
CTTCACCAGAAGCATATTAGctgataaatttcttttttcccaatGGTAAA
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tcaaaatttttagacaaTTATTACTATATTTCTTTAGAAAATGTGTATAC
AGTTgtgttgactctctctaattcgatctttaagggacCAAGAATTTCCT
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AGCTAAGGGACCaatatttttgttcgaattacagaaagattggaataata
gagattcgaattacagagagttgactgtattagGCAATACATGGGAAGGA
ATGGGAAAGAAACAAActgaaattctttttcttgtttgtcACCTTCTTGT
CCTTTGTAATTTTCATGTTCGTTTCTAGATTTCAGTTGTAACCATGCTAT
AGTTGTTACATATGAGAATATGCCTGAGTTTGGTGTTTACACATCAAGGA
ATAGCTTCCAAATCGTGCTAGCGTCAGATGGGAAAGTTACCTATGGTCTA
GCTCTCTATTATCGCGTAGACTCTTATGACCGCGCTATGGTTGGCTATGG
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CTCCCCTCCCGGTAGAAGCTTTACATTTCTTAACATCAGTCACTGTGGCA
AAGAAGACTTACAAAAACCGAtttactttttctaatacataatatttttt
atccttttttaatccaaatgtttttgaaataagGTCTAACTTCTTGGATA
CGATAGAATGAATATAAtaacaaaaatgaagaacatTGACGAAATCTTAT
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TGGAGACCTTCTTTACGACAACATTCTTCAAATCTTTACTGCATATCAAT
TTGGGCTATAATAGACTTTTTAACCGATGATTTCCAAAGCAATGTCTGGA
CGAAAAATCCTCGACTATTTTGTAATCTTTGTAGCCTTTTCTAAAGTTTT
GgcaaaagttaaattttttctaataaaataaCATGTTCTTGACGTACCAA
ACCGTTTCTCGCCAGGTTGCACCTCCATCTCAACAACAATTGGACGAGTT
TGGACATCGAGTGAACACAAAGATATTCTTATTGACAAATTCAGTATGTA
AAGCCAAAATTGATAGTAAGTCTATAACAATTTGAAGATCTTTTAATACA
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TCTGGCACGCAACGTcaatctaatgttcacaacgtccatttaacattaga
tgaacgtacCAGAGTAACTTCAAGAAATTGAGTAACTTACACAGTCTCgg
ggaaggggaagggggagggaGTCACTCGATTTAAAAAAGACATTAAAAAT
TAGACATGTACTGTGCAGAGAAAATTAAGCCAAATTCGAGTAAATTTAGG
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TAAGACGCTTTACTCCCTATTAAatccttagagtgcactttctCTCATTT
TAGCAATTACCGTATACTTTAATTGAAAAGCCTGAAAATATACCCCTAAA
GGTCACACCTATGGTAGGTCGCTTAACTTAAGTGCCTCCCCCATGATGCA
TTCGGATGATGCTTGAACAAAACCAATTTAGTACATACACATCATTActc
tgagtatcagaggttaagttttcaaagaatatattaacctctgaagacca
ataatagaaattttatcgcgcatgtgtcaatctaatcactgtagaaagaa
tcaaagatgaagagcaaatattaccttattaatgtctagcagactgtatc
agtatgcagtttactatttacgaattccccagaaacctccaagtgtaatt
gaagtgagtttcTTCCGAAAGAAATCatttacatgattcccaaatgtata
acagtaattactaaactattaattatggaaatgtcacttttaattgaatc
gaaataatagacagacttttgttatgattctctatcactctttttaaaaa
gcattgatgatattttttagttgtgttttcaacgacgggaataagaatat
caattttgaacttcatccaagatcttggatggtcgtcatggttacttttg
tcttcgttgattgcgcgatgaatagaatctcgattcgtcggcacagcgtc
aatatatgattttgacctgtgcttttcacggtaacaCATCATTGATTGGA
ATACGTTATTTTGAATCATCCGAATGCATCATTCTCGCCTAGCCGCAGCT
TAATTCACATTATAGTTAAGTCTCCATAACTAGAAAACAAAAATGGGGAG
TAACAATTTGCTCGAGTTAATGTTGAGTtagtaaggtttataaagcaTTG
TTAACTAGAGGGTCCATaaagttcgagttaaagaaatattcgagttatag
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AAGTAGGAATTCCTTCTTTTTTCAAGGCGGAATGCTTAGCGCTGTTCAGA
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tttattttccagGCTATTTATATTCATATGGCGAATCAGTTGGTGATCAA
CTTCTGCCGTATGATAGCTTGAACCCTGTTCGTGAATTAGTTGTGGAAGA
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TCATCatgttaatacaccttttcgaccgtagccaccaattgccgcgcggg
cgttTTTGTccaatttaccaccctaaagaaccgtcccagtctttttttcg
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ATaaggtggtaaattaaatagtAAAGTAGCACGCGCTTGAccgtgcgact
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GCGCGCAAGcataaattttgtgaaattcttTTGTTGGTTCTGCTTTGTAA
ACATATCATTGAATGATCCGGAGCTTCTTCTACCAGAGCAACGAGTTTCT
ATCAGAGGCTTCCATTTCCCGTTCGGTTCATAGATAACTGTGGGTCCCGT
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GGATTTTTGAACCTTGGGACAATAAAATTGctttcccattgggatttcaa
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GGACAGTGGTGTTTAAATTACTGATCTAtccatataaaaaatattactcC
CTCTTGTCCGTGTCTGTGTATTTGCATTGGTATTTATATCAATTATGCCT
TCTGAAAAAACAACGTTATAAATGGAAATTTCATTGTAATGCAAGGTCAA
AACTCAATCATGCAGGTcaccttctttaaaaaattacagaaaaatgcTTA
CGCAGctaaaaaacatatctcatcatcCTTGAAGTTCAATATCTCGACAA
GCAGACAATTGGCACATAGCAAGCAATACCATTTTCTGATAGAATTCTTT
CAGAGCTATATAAAAATACCATCTAAtgatcaaaaaaagttttggctTCA
GCAAAAATGCTTAAAAAGGGCCATATCGTTGGTCCAGATGGTCCAACCAA
ACAAACAACCCCGCATTATTTCATCGGCTCAACAAACTGAATCTTGTAAA
GAGACCCTTAACGACGTAATTTTGCCCATTGTGACCCATCATTCCATATG
ATTGGAGTTTGCTAACACCAAAAATTCAATTCTCACATAACATTCGGAAA
CATTTTGCGTACAATTTTTCCGGTAAGCTAATTTTGACCCTCGATATATA
AAACGTTCTTGATTGGTTTGGCTGTAAGGAAGGTTTTGTCGGGGGACGGC
AGCGTAGAAAAGTGGCTTCATAAAATCTGTCGCTTAGAAAGGTCCATTTC
AttaagtttaaagcccgaagggctggaGTAGAAACTCTAATCTTTCCCAT
GCAAGAAAacatgaagccacttatttcccatccagatcGCGCCTAGAATG
CGCCGCAATCACGACGACGAATTGTATCTAGgagttcctttgtttttgag
gattgTTTTAATCTAatgatagattttactttcaatccggcgtttgtgta
aaaaccacgcagAGGCGTTctggatgagaaataagtggctggtgtcgagt
ctagcccttcgaacttggaagtcaatggtccATTCCTGACAATTTATTTA
ACTGTTTAAATAATTATAGATCAGCAAGTATGGTTTTATATCATTACACG
AACCCGCTCAACATTCACTCGTGTGGTTCCCGTATAAATACACTTCAATT
ATATACGGATATCTTACGCTTCTACCCGGTAATGTTTACTACCGGCAAAC
AAATGATACAGCGGAAATCAATGTGTTGTTGGAGAATCTGATTGAAATGA
ACTTGCGAACAACTTTTGACAGTGTTATTATTATAACGTAAGTGTTTGTC
AAACAGATTACGATTTaacttaagagaagaaattttggtactaCAGTTTT
TTATCATGGCATATTTCTATCGAAACAAAAGTCTCAATTTTCAACTATCC
GGAAAAGTGAAATGCAGGAAGTggaatcttataaaaaacgacagTACAac
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TATCATACAGAATCTCGAAATGATCCTGAAGATTCTCACTTGCGTACCAA
CaactttcaaattattttggCAAATCGTCCAGGAAGTCCTGTCTATATTC
GATTCATGTATGAACAttttcatgactttttttcatttttcaaattttcc
aattaacccggtcaaaaaaagaatattaacaaaagaaaatctgtcCTCCA
TtaattttaagtttcttttgtAACCGCTGCTGGCGTCGGTATTTCGTTCT
TTGCTACCCCGCATGTCCCCATTAAATTTCGCAATCGCCTATACAAgatt
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CTTTtacgactttttcgaatgtttcgggCCAAGTTTTTTGGGTTCTAAAC
ATTCgatattttgacgtcattttaaagttttgaagcTATTTTAacgtctt
ctaacattacatcacggagacaacagctgattggttgcaagtgacgtatt
aacTGACTTTACGTCACTTTACAACAAAACTTGCTGTTGGGTCTATGGTG
TGATGTCAAAAACATTGTAGTGatgtatatcatgaatatagAGCATGATC
ATAACATGTGATCAAAAAATAGTATGGTGGGATAGAGAAATGCTAATTTC
ACAAGTATATTTTAAAATTGTACACTTGTTTCCCCACTCAGATATCGTCG
TTTGGACTATATATTTGGAATATCAGGATTCAGCGTTCCAGGTTGTTACC
AAGGTCAGATTGTGGACCCGAGAGCTTCTCATTActtgacagttacatca
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AGGTATAACAAtacacttttctcgagatgcataaatttattgttgtcctc
gttttcaaacagatttcattgctatAAAATTACATGTTCACAATGATAAT
TGTGTTGTTTACACCTCATCAGACATTTTGAATTTCAAGTACTTTATAAT
TTCatagcaatgaaatctgtttgaaaacgaggacaacaataaatttatgc
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AAATCAAGTGTCTTGATAATGTTATAATTTTGCACTCCTATTCTTTATGT
GAGATTGGCCTTTTTTGTTCTATGGAAATATTGACTATTGCTCCGTATGT
GCCTAATCTCAATATCAAAGATAAAAGTCACAGTTAAACTATTGATTTTG
CAAGGCACTCATTTTCAGATTGAACTATTGGTCATGTAAACATCTAATTA
GACTATGCTATATAATCTAaaacaaatcactatctaagaaataagcctac
agccgaagaaaattctcaAACGGATTTTAACCTTgccagtcttttttttc
ttcgcttctttgaaactctcccgccgattatTTTCCCGTCTACCACCATA
GCGGCTGTGAACACCGCGCATAATATGATTTTTCCACTTTTACCACCCCT
GTAACGAACGGTAACATCATGTAGTAAAACAATTAAACCTGTGCTACACT
TTCTTTATATAAcaaccctttctcacagacccggtaggattttttcagcc
agtgtgAGTAAAAATAACAGACCAAAAGtagatggggattgatattccca
tgttttttatgactGTGGATTTGGATTCAATTGTTTtagagccagaaaat
tcagtggggatgacaaaatagcacaatattttgcagtgaggatttacttt
ttgattattttcagtggggaagAATTTAgagaataattttccactgggga
cgatatctTGGCTAATCTTTCCTGTGGGAAAGGGTGGTATATAAAAGCAA
ACTATTTAAAAACCTAagacttaaaaaaattactctTCTCCTTGCTAGTT
GCCCATTTTGGGAGCATAAATTTCCATACCAAgggggggATGGACCAACC
GTTTCACTTCGAAAAAAGATTCTTAGAAACGTGTGCACACCCtgtggaaa
aaaacaaaattcgcaaaagaacccttggaagaattgttttcataacttaa
aGTAAGGGTAGACGAACTGAAATCAGttttttgcccccccctaaatattt
tagaataacttttttccCCTGGAAAATGGTCCTGCTTAACTTTAATGTTA
TCTCTATCACAAACTCAACTTTGTGCAAcgttaatatttttttcctgcac
tgtaaaaCATCTGATATAGACTTAGACTCctactttttcacttttcagca
tttttaccAAACGGAGCTGTTTGTGGGGACTTGTTTAATTCA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000202_pilon:227239..235230+ >XLOC_001652 ID=XLOC_001652|Name=XLOC_001652|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2058bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:227239..235230+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGAATTTTTCATCGTGAAACGTTCAGAAATGATACTTTGAATTTTATCAA
TGAGTTAATCAATCAAAAAGCGAATTTTTCATCGTGAAACGTTCAGAAAT
GATACTTTGAATTTTATCAATGAGTTAATCAATCAAAAAGATTTCAGTTG
TAACCATGCTATAGTTGTTACATATGAGAATATGCCTGAGTTTGGTGTTT
ACACATCAAGGAATAGCTTCCAAATCGTGCTAGCGTCAGATGGGAAAGTT
ACCTATGGTCTAGCTCTCTATTATCGCGTAGACTCTTATGACCGCGCTAT
GGTTGGCTATGGAGAAGCAACATGTAACACAGGCATTAAGATTTCAGTTG
TAACCATGCTATAGTTGTTACATATGAGAATATGCCTGAGTTTGGTGTTT
ACACATCAAGGAATAGCTTCCAAATCGTGCTAGCGTCAGATGGGAAAGTT
ACCTATGGTCTAGCTCTCTATTATCGCGTAGACTCTTATGACCGCGCTAT
GGTTGGCTATGGAGAAGCAACATGTAACACAGGCATTAAGGTTGCACCTC
CATCTCAACAACAATTGGACGAGTTTGGACATCGAGTGAACACAAAGATA
TTCTTATTGACAAATTCAGTATGTAAAGCCAAAATTGATAGTTGCACCTC
CATCTCAACAACAATTGGACGAGTTTGGACATCGAGTGAACACAAAGATA
TTCTTATTGACAAATTCAGTATGTAAAGCCAAAATTGATAGCTATTTATA
TTCATATGGCGAATCAGTTGGTGATCAACTTCTGCCGTATGATAGCTTGA
ACCCTGTTCGTGAATTAGTTGTGGAAGATCCTTTCCAATATTTTGATAAG
GATGTGTACAAAATATATGCTATTTATATTCATATGGCGAATCAGTTGGT
GATCAACTTCTGCCGTATGATAGCTTGAACCCTGTTCGTGAATTAGTTGT
GGAAGATCCTTTCCAATATTTTGATAAGGATGTGTACAAAATATATATCA
GCAAGTATGGTTTTATATCATTACACGAACCCGCTCAACATTCACTCGTG
TGGTTCCCGTATAAATACACTTCAATTATATACGGATATCTTACGCTTCT
ACCCGGTAATGTTTACTACCGGCAAACAAATGATACAGCGGAAATCAATG
TGTTGTTGGAGAATCTGATTGAAATGAACTTGCGAACAACTTTTGACAGT
GTTATTATTATAACATCAGCAAGTATGGTTTTATATCATTACACGAACCC
GCTCAACATTCACTCGTGTGGTTCCCGTATAAATACACTTCAATTATATA
CGGATATCTTACGCTTCTACCCGGTAATGTTTACTACCGGCAAACAAATG
ATACAGCGGAAATCAATGTGTTGTTGGAGAATCTGATTGAAATGAACTTG
CGAACAACTTTTGACAGTGTTATTATTATAACATATCATACAGAATCTCG
AAATGATCCTGAAGATTCTCACTTGCGTACCAACaactttcaaattattt
tggCAAATCGTCCAGGAAGTCCTGTCTATATTCGATTCATATATCATACA
GAATCTCGAAATGATCCTGAAGATTCTCACTTGCGTACCAACaactttca
aattattttggCAAATCGTCCAGGAAGTCCTGTCTATATTCGATTCATAT
ATCGTCGTTTGGACTATATATTTGGAATATCAGGATTCAGCGTTCCAGGT
TGTTACCAAGGTCAGATTGTGGACCCGAGAGCTTCTCATTActtgacagt
tacatcaaatgGTGAAAGACATTATTTCGGATGGTCAAACTGTAATACTA
AACATACAGATATCGTCGTTTGGACTATATATTTGGAATATCAGGATTCA
GCGTTCCAGGTTGTTACCAAGGTCAGATTGTGGACCCGAGAGCTTCTCAT
TActtgacagttacatcaaatgGTGAAAGACATTATTTCGGATGGTCAAA
CTGTAATACTAAACATACAGcatttttaccAAACGGAGCTGTTTGTGGGG
ACTTGTTTAATTCAcatttttaccAAACGGAGCTGTTTGTGGGGACTTGT
TTAATTCA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000202_pilon | genome | sc0000202_pilon:227239..235230 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 988-1029:7951 |
| Aaloc | 826-984:6393 |
| Aaloc | 718-822:5701 |
| Aaloc | 499-714:5270 |
| Aaloc | 373-498:3365 |
| Aaloc | 271-369:1766 |
| Aaloc | 73-270:1081 |
| Aaloc | 1-69:1 |
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