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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000202_pilon:258845..265593- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_001633 ID=XLOC_001633|Name=XLOC_001633|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6749bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:258845..265593- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTATGTACTACACAGCAATTGCCAACAAAACATGTTACATCACCAAAGAT
TTCTCTTCCAACTGCAGTGCCGCACGAAAAGGTCCTTTTTCTTCCTTACT
TTATCCATGGATATATAAAAGCGCGTAATTTTATATATCTATGCTTTATC
CTTACATCATCAAGTTTAATGTTGTATTCCAGTGGTCTTGTTGATCCTTT
ATTGGTAAATTATTACTATGGATTACGTGGGTTTAAGGGCCCATGGTTAA
AATATCAAATCATTTCGGACATAAATCTATTCGGCAAAAACATTGTGGCA
TGAGCAATATATTTTTTAATTAACCAACAACGAGCAATTATTTTATTTTT
TGACGATATATTTCGATCTATTGATCATCTTCAGGTCTAAAATTCAATAA
AAACAAGATTATAAAAATCTCCGATAAAAATGTATATGTTCACATATCTA
CAGTAAAAACAACCATAAGCTTACAGAAAAAAGTGAGAAATGAAAATGCT
ACTGCAAAAAAAAAATATAATATGTAATAAAATTGTTGCTACTAAGGAAA
ATCCCATGTGACAACAAACAATAAAAGAATAAAAAACTACAATTAAAACT
TGACTACTAATGTACGGCTTCTATACTCGTCTTTTGTGTTCAGTTGAGGC
TTTAATTGATTAATAAAAAGTGCCTCTAGTGTCATTAAATGGCTTGCCGA
ACGAGAACTACCTTTCAAAATGGCTACGTCCTCCATTGTTAATGAGTGCT
GGCATGACGTCATGTGAATGGTAACGGGTGCGTTTTTCCTACCGTGCTCC
TTAATTCGGGTGATAAGATGTCGCCGTGTTTGGCCAACATAGCACGAATT
ACATCGTGGACAGGTAATTTTATAAACTACACCACTTTTTAAGGATTTTT
CCACGGAGGACTTCAATGATGGTAGCACTGTTTTTAACTTTTTCAAAGTA
AATATGACACGACAAGGGGCTTTCAACTTTCAAAAATCTGTTGTTATTGG
AATGATTCATCGTATTTTCAGAGCATGTAGCTCTTACAAAACATTCCATG
AGGGTTTAGAGCGTGCTAAAGTAATCCTTAACAGAAATCAATATCCCGAA
CCGCTAGTTGATTCTATCATACGAGATACTTTAAACAAATTGTTTGAAAA
AGAAGAACCTCCTGTGGTGGAAGAAAATGAAGATGAAGAAGATGAGCCGA
AAATGTTTTTTGTTGAATACAGGGGAAAATTATCTGAGGAATTGAAATAT
AACCTTGGAAAGTTGAAAGCCCCTTGTCGTGTCATATTTACTTTGAAAAA
GTTAAAAACAGTGCTACCATCATTGAAGTCCTCCGTGGAAAAATCCTTAA
AAAGTGGTGTAGTTTTATAAATTACCTGTCCACGATGTAATTCGTGCTAT
GTTGGCCAAACACGGCGACATCTTATCACCCGAATTAAGGAGCACGGTAG
GAAAAACGCACCCGTTACCATTCACATGACGTCATGCCAGCACTCATTAA
CAATGGAGGACGTAGCCATTTTGAAAGGTAGTTCTCGTTCGGCAAGCCAT
TTAATGACACTAGAGGCACTTTTTATTAATCAATTAAAGCCTCAACTGAA
CACAAAAGACGAGTATAGAAGCCGTACATTAGTAGTCAAGTTTTAATTGT
AGTTTTTTATTCTTTTATTGTTTGTTGTCACATGGGATTTTCCTTAGTAG
CAACAATTTTATTACATATTATATTTTTTTTTGCAGTAGCATTTTCATTT
CTCACTTTTTTCTGTAAGCTTATGGTTGTTTTTACTGTAGATATGTGAAC
ATATACATTTTTATCGGAGATTTTTATAATCTTGTTTTTATTGAATTTTA
GACCTGAAGATGATCAATAGATCGAAATATATCGTCAAAAAATAAAATAA
TTGCTCGTTGTTGGTTAATTGAAAAATATAAATCTATTCCCCACAATTTT
TAAAGATACTTTGTTTTTCATCCATTCCACCCCCACTCCACTCGCATCGC
ACCACCATGTCAAATTTGTTGGTCTCAACATGCACAAATAGTGAATAATC
AGGCATCACACCTCAATTCTTTTGCCCTGTCACGCATTGCTGAAAAATCT
TTGGAATTACGAAAAAGTCCTAGTCGTCACGCTAACAGCTGGGAGGGATT
GATAGTCTCTTTGGAATCACTCACTCACTTCCGTAGCTCTAGTTTGGACA
GCCGACTTTCTACCCTGCCTATACTCAATGTTAGAATTGGTAAAATGTTG
GCAGTTGAAATCTTCGCTTGAAAAAGATTGAAATAAGACATCGCATTGAC
GTCAAACGGGAGCAATGTATTGACTTTATACGGCCAACTTTCTGCCCACT
TAAATTCACAATTAGAATAGGCCGGGGTAGCAAGTAAGTCGTTTAAACAA
GAGCTCAAACAAGATCAATTTATTAAATTTTCTTTTCAATACCAGTCCTT
CGTAAAGGAAGAAAAAGAATTGCTGATCGTAATTTCCCTGTTGGTGATTT
TGATCGTTTTCTTGGTTTGTGCAATGATCACTTGCTTTTGTTATCGTAAG
AAAAGGTATCTGTTTTATTTACGGTTTAGGCACTTGCAAGAATTGGGTCT
TGCAAATGTCAAATTTCTCGATTAAACTTGATCAGACACAGGATATTTCG
AAATCCATCCCCCGGGGGATGCAGCCAGGCAATTTTACCGACGGGTATGT
GCGGCGGTTAAGGGTATGTTATTCAAGATACCAAAAATACAAAGTAAGAG
TGGACTTTTGATAAATGGACTGACTGTAAAGGTGAAAATTATAGGAAATC
CAAGAAAAATTCTGATTTCTACTCGAAGAGTTGAAAATTTGTTGAAAATT
TTAAAAAGATTCACTGCAAGGGTACAAATATCACCGATTTTTTGCTGCTC
TGTAAGTGTGCGATTTTAAAAATACATTTTTTCGCTGCACACATACTGTC
AGTTGGTTAACCCACTGCCCCCGGATCCATCCCTCAATTCGATCTTGGAA
AGAGATAGGTTGCTAGCATCAACTATTGGATTAATGCATCTTTTACTACC
TACAGCTTTGTAAGGGTCTTAATAGGATTCTCATCTTCCAGCTCCTAGAA
ATCGATCCATCATCTGTTAATTAGCAATACCATGAACATATAAACGACTG
GACATCTATCTTTTATTGTCTCTTTGAAGCGAGCTTCGTTGCCGCCTGTA
TTTCAAAATTGGTATGAAAAATCCGACAATATTCCGTCATAATTTTATTT
CTTTGAATTATTTAGGCAAAAAGATTGATAGAGCTTGAACATTATTCCTA
ATGTATAAAAAAATTATTTTCGAATTTTTTTACAAGTTTGTAATATATTT
TCTCGACATTTTCAACTCTGAAATGCAGAATTTCAACTGCGTGAATACTT
TTGAATCCCTTTTGTCACTCCAATAATTTTTTTTACGACTTGAAAAAAAT
AACTTGCCAAAGTTTAGAGCCTGTGTAATAAGAATATCGAAATTAGAATG
TGGCACTCTCTAAAATTATTAGACACTTTTAAGTCAAAATTTAGAAATAT
TAGTCGGAGTTTTGACAAGCTGACGATGATTTTGCCTCCGTTATCTTTGT
TATGATATATATAAAAGACTTCAGAAGAGTAGAACAACAGAGACTTTTGT
CAAAGTTTTGACGTTGTTAGTAAGGTATTCCCAAGTGGTATATCATCAAA
ATCTATTGTTTCACTTTATGCTTTCAACGAGGCGGCAACGAAGCTAGCTG
TGTTATCTTCAAAAAGACAAAGGAGATGGATGTCCAGTCGTTTATATGTT
CATGGCAATACCAAAATGTCCTGAATTCAAACTAAGACTATCCATGTAAA
ATTATTATTCATCCTTTCTTTTTAGTGCTCAAAATACAATACCGGCTGAG
GTTAGTTTTCTCACCCCATTTCGAATTAAAAAGAGAACTCTTTCAACCCG
GGGGGGGGGGGGTTCGGGGAGTGCCGTTAGTCAGGGTAACCTTTTTAGGG
CTCTTAAAAGATCCCAAAATTACTAATTTTCAAGACAGAGTCGACTTTTG
GTTATTTTGAGCTATTTTTCCAATTTTTCATCTACTTTTAGTCATTTTTG
CCTCGATTTTTAATTTTGCCCCCTTTCAGGGTCAAAATGGGAGAAATTTT
CGATTCATCGTTCTGATAAGATCCCAAATTTACCAAAAATTCATATTTAA
CAGGGTCCACTTTTCAAACTCCACTGACATGTCCCGTCGGCCATTAAGGT
CAGTGACCCTCCCCCCTGGGGTGTTTATGTTATGACCATCTCAGTTTTTG
ATATGAACGTTTATTAAACAAAAAAACAGTGGTTACCACCCCTGTTTCAC
AGACCCAGTAGAATCCTGACTCCATTGGAAAATTTAGTCGAAATTTGTTC
CCCGTTGGGAAAAATACCCTACAATTTCCCCACTGGGAAATTGGTAATAG
AAAATTTCGCACTCAAAAACAAACCCCATTATTCAATCAGAATTATAATA
TGTTGGACGGTGAAAAAGAATGCGGCTAATATATTTTGATTTTTTAGAAT
TATAATATTGAGGTTAAGTAAATCGGCAAAAATCACGACGACGGTCGAAA
ATGTAACAGTCTAGTGAGTTTTAACCAATCAAATTTCGTATTTTCACTAG
CCTATTACATTTTTCGTAGTTTTTCGTCCGTCGTCGTGATTATCCCAGCA
TACTTAACCTCAGTAATAGATATATATTATAATATAATTTTTATCCCTAT
ATCCCCATAAGAATTTCGATGGATTATTTCATCCCCGTAAAAAAAAATTC
GCCATACTGTAATACAGCCCAGCTAGCACACAACGTTGTTTCAACGTTCA
TCTAACGTTATATGAACGTTGTGAACGTTAGATAAACGTTGAAACAACGT
TGTGTGCCAGTTGGGAGAGGTTTACTTTAACTCTGAAAGAAAGCCTTCCT
CGTAACCATAGCACTTCTTAGAATGCCAAAATTTTGTCACTGTTCAAAGA
CTTTTTCTCTTTATTAGGACGCAGGTTTGATTCATTGTGCAAACTCCTCC
TACAGCTCTGTTGAAGAAGATTTTAGTCACATCCGCGTCCCAAACTTTTG
TGATGAAGATGAATTATTCGGAAATGGCGCCCCGTCTAAAAACAAAGGTT
GGGGACTTCATCTCTATCCTTGATATCTGTACTCAGTACCGTACTTATTT
ACCGTATAGTTTTTTAAATCATGTCTCTGGTTCACACTCTGATCTAACCA
ATTCTTCCCTGCATTTGCAAGCCCACCTGATAAACCGACGTGAGCTCTGT
CACTAATCAGAATTTTTAAGTACTCATTTACAAAAAAATTAAAATCAATA
ACTTGTCAATAAAAAGGGTCGGAAACTAACTTTTTTTGCAGTATTCTACT
CTCGATTGGAAAATAAACGTCATTTTGAAGTAAGGGAAAAAATTATTTTC
AGAGACGAGGCTCACCTTAGTGTATTATTGCAGATGGATTTCCCCAACTA
GCTTTGTATATAAGCGTACGATCTCAATCTCCCGCCTTGTGGGCGTTATC
CGAATTAATCAATACTCAATTCTTTTAGTAACGAAAAGCAACTTTCAGCC
GGTTCATTACAAGAGACACGTTGACGAGGACGAGTTGTTCTTGGGGAATC
CCCATTTTCAAGCAACGGAAAAAGGTAACCATAATAACAATGATTGAGAG
ATACCGGGTATGGCAAGAAAACCGTGCTAAAATTCAAAACTAAGCACCAA
ATTTTCAGAATCATTACATACCTTATCGGGGAAAACTTCGTCGGGGAAAA
ATATTCGTCACTTGCTGGTTTTGGTAAACGCATTAAGGCCGGGGAGAATT
TTTGTCGGGGAAAAATATTCGTCACTTGGCCGAAATTTCGTCACTTTTCC
CCGGCGAAGTTTTCCCTGATAAGGTATACATATGCCTTTCTACAAAAAAT
TGCAACAGGAATCCATTTGTAATTTTTGATGTCAGCAGTTTAGAACTTCC
TTAGCTAGAATCAATATTGCTTACACTAATCAGTGTAGATGATGAAAGTC
CAAGGTGTTTATTTATTCTTCCACATTTTAGTGTAGATTTTCCTTAGGCA
TGTTGCCTTGCTAAGTTCTGGCTTTCGAGATGGTGGGGATAGTTTTTCTA
ATAGTCTGGCATATTCCGACACTATTCCGACATTACCTCACTGCAATCAA
TTGTTATATCAATGTTATATCAATGTTATATCAATGTTATATCAATGTTA
TATCAATGTTATATGGGAGTTATTTTGCCGTTTTACACTAGCTGTAAAAT
CTTTTCTTCATTTAGACAATGATGGTTATGAGACCAGAGTATCTTCGAAT
CGAACGCGACCTGTAAGTTATTCAATGTACTTGACATGTATAAAAAATGT
TATTTTTCAAATAAATTTTGCTCAAGGAACATCAGAAGCAATAAACTCAC
ACCCAATCATATAGTTTTCTTTTTTACGATTCTGATGTCTGATATCTTCA
GTTAGGGAAGGTCCTACCACGTCCAGTAGTGCAAATGAATAACTCTAAGG
TACAAGATTGAACTTGAAATACTGCGCCGTTTTAATGGGATAAGAGTTTA
ATTTAAGACTTGACTTTGGTTAATTATATCTAATAACCATATAATAGATA
AATATTTGAATACTAAATTTTTATTCCTTCACACTTTAGACAACACGCGC
CCCTTCAGAAAACGAAGACCGTAGCAGTTACTCTGGATCCATATCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000202_pilon:258845..265593- >XLOC_001633 ID=XLOC_001633|Name=XLOC_001633|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1098bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:258845..265593- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTATGTACTACACAGCAATTGCCAACAAAACATGTTACATCACCAAAGAT
TTCTCTTCCAACTGCAGTGCCGCACGAAAAGGTATGTACTACACAGCAAT
TGCCAACAAAACATGTTACATCACCAAAGATTTCTCTTCCAACTGCAGTG
CCGCACGAAAAGTCCTTCGTAAAGGAAGAAAAAGAATTGCTGATCGTAAT
TTCCCTGTTGGTGATTTTGATCGTTTTCTTGGTTTGTGCAATGATCACTT
GCTTTTGTTATCGTAAGAAAAGTCCTTCGTAAAGGAAGAAAAAGAATTGC
TGATCGTAATTTCCCTGTTGGTGATTTTGATCGTTTTCTTGGTTTGTGCA
ATGATCACTTGCTTTTGTTATCGTAAGAAAAGTGCTCAAAATACAATACC
GGCTGAGTGCTCAAAATACAATACCGGCTGAGGACGCAGGTTTGATTCAT
TGTGCAAACTCCTCCTACAGCTCTGTTGAAGAAGATTTTAGTCACATCCG
CGTCCCAAACTTTTGTGATGAAGATGAATTATTCGGAAATGGCGCCCCGT
CTAAAAACAAAGGACGCAGGTTTGATTCATTGTGCAAACTCCTCCTACAG
CTCTGTTGAAGAAGATTTTAGTCACATCCGCGTCCCAAACTTTTGTGATG
AAGATGAATTATTCGGAAATGGCGCCCCGTCTAAAAACAAAGTAACGAAA
AGCAACTTTCAGCCGGTTCATTACAAGAGACACGTTGACGAGGACGAGTT
GTTCTTGGGGAATCCCCATTTTCAAGCAACGGAAAAAGTAACGAAAAGCA
ACTTTCAGCCGGTTCATTACAAGAGACACGTTGACGAGGACGAGTTGTTC
TTGGGGAATCCCCATTTTCAAGCAACGGAAAAAGACAATGATGGTTATGA
GACCAGAGTATCTTCGAATCGAACGCGACCTACAATGATGGTTATGAGAC
CAGAGTATCTTCGAATCGAACGCGACCTACAACACGCGCCCCTTCAGAAA
ACGAAGACCGTAGCAGTTACTCTGGATCCATATCTTGAACAACACGCGCC
CCTTCAGAAAACGAAGACCGTAGCAGTTACTCTGGATCCATATCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000202_pilon | genome | sc0000202_pilon:258845..265593 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 490-549:61 |
| Aaloc | 445-489:433 |
| Aaloc | 349-441:1170 |
| Aaloc | 217-345:1733 |
| Aaloc | 193-216:2874 |
| Aaloc | 82-189:4305 |
| Aaloc | 1-81:6750 |
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