XLOC_001632 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_001632
Unique NameXLOC_001632
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000202_pilon:266927..276548-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001632 ID=XLOC_001632|Name=XLOC_001632|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9622bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:266927..276548- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGCTTCTTAGAATGATATTCTTCTCAATTTTATTTCTCATTGGACT GGTTGGTCACGTGAGTTAGTTTTACCTCTTTCTCTTCTTTTAGTTTAAAG GTTAAAGGTCTTGTTTTTAGATAAAAATGATAGCAGTTTGCTTACTCGTC AATTTTAATTTACAAGCTTTTTGATATTGGATTGACACGGATGTGGAACA AGATTGGTCAGAAAGAGGAAAAGAAAAACATTTTCTTGCTTAGTCAGCAT GATATACCAATAGGCAGACATAAGTGTCTGATATGACACCCCTGTATCAC AGACCCGGTGGAACTTATTTTCCCACCGAGAAGGAAATTTTTGTCAATCT TTCCAGGGGGCTGGGCTCCCAGTGGGTCTATTAAGAATTAAAACATTTAA GTTTTTAATTCTGGGAAAAATAGACCGATTATTTCACCTGATTAAAAGTA TCTATTTATTTACTTCACATTGTATTTGTATATAAAGCTTTCGGGTGGGG AGAAAGTGGACATGAAAACCCAAGTAAAAGGTGTAAAAAATTTAAAGAAG GCTCGCAAAAATATAACTTTGCAAATTCGATGAAAGCCTTTCAGTTTCTT TGTCTATTGATGACGTTATAAATTGTACTGTACCGGGACATCTTCGATTT TGAGACCAGTCAGCCGTCGGCTAAAAGAATGCACTTATTTCATTACAGGC ACATACTCTGAAAGAAGTCACCTTTTTATTTGGAGGATATAGGCATGCAG TAAATGATGAAATTGAATGTGTTGCTCCTCCTTGTAAAGTCTTCATCGAC TTCTTTGCAAATCCGGTGAGTACACGTTTTTTTATAAGAACATCAAAAAA TTTTGAAACCTTTGGAAGTTCTTAACTTTTTTGAGTTTCAAGCCTAAAAA CATTCTTAACATGTTCTTATTTTCATCATTTTTTTAGTATTTTTGTTTAA 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GACGTCATGATTACAATTTCTTTAATAATTAATTTTTAGGTTAATATTTA ATTACGTAACAACCGGGCCCTGAAACTTTAAGGTATAGAGGGGCATACCG GATAAGTGGGATGGGGGAACCTGGGAACCTAAAGTGGGAACCTAAATGAA CACCTGAAAAGTAAGATGGGGGAACCTAAGTGGGAACCTAAATGAACACC TGAAAAGTGGGATGGGGGAACCTAAGTGGGAACCTAAACGACTACCGGAA AAGTGGGATGGGGGAACCTAAGTGGGAACCTAAGTTGTTTAATTATTAAT AGAATTGAAATATTTTTCTTTAAAAACAAATACATAAAGATAAGAAAGAT ATTATATGCAATGAAAGAAAAAACCTTTTATCATAATAAGAACACCAGTT ATTTACTTTTTACATTACGGTTCGCAAACAATAATGTTGAAAATAAAACA AAGGGAATTTATTTAATTAGCTCAAAAAAGCATGTTTATTTATCAGCAGT TTTATAGTGCATCTTTTTGAAAGGTTCTTTTTAGTAAATTGACTTAATTG ACTTAATTGACTTTAAACTTTAAACTTTAAACCGTCATATCTTCAAATCT AGAAGGAATTAGAAGTTCGTTCATAGCTCGATGGATAACTTAGAGCCTCT TCTTTCTTTTGCACGGATCTAATTTGCTTGAATACAGAATCTAGTAAAAC ATTATTTACGATCTAGTTTTGTTCACTCTTGATGCAATACACATTGTTTT TTATTGCAGCTCCAATTTTCGGGTCAGGGCTGGGGTCGCTTAGCATTTAA CGGATTCTAGCTCGTTTTTCTTTCTGTACCAACCAAACAGTACAGCGTGT GAATACACTTCATTAATTAAAAATGTTTGATAGTAAAATAGAACATATTG CACGGCTTGCCACGTTTCAATACACATAGACATAGATCCAGGGGGGGGGG CACTCAAGGTAAACGACCTACCGTACGTGCGGCCCTTTTTTCCAAGCTTC CCAAAGTACACTGTAAGGGTGGAAATGAGCAAAAATGAGAATAAGTTCAC TCTAAGGGTTTAAAATTTGGTCAAAGGACTGGCTTTTAGAATTTCATCCG AACAAGTGTCATGTTTTAACACTGGGTAAATTTTGGAACATCAAATATGT CCATCCCTATACATAGCAGGATCTGTTCTAGAACAAGTTGACCAAGAAAA AGATCTAGGAGTGATAATCGATAGTGACCTGACCTTTGAAGCCCATATAT TCAGTAAAATCAAGAAAGCTAACTCTATCGTTGGCTTGATTAGCAGGAGC TTCGAATTTCTCTCACCAGATATGTTTCGAACGCTTTTCATTGCATTTGT CAGACCCCATTTGGAATATGCACATGTAGTATGGTCTCCAAGGCTAATCA AACATATCAAAGCAATTGAGGGCGTCCAACGAAGAGCTACAAGGCTAGTT AGTTGCTATAGAAACTACTCATACGAAGATCGGCTACGACTCATCAATCT ACCTAGCCTAAAGACCAGGCGGCAAGTTGGTGATATGGTGGAAGTTTTCA AGAACCTCCACATTTATGACGAGTCTATAAGATCAGAGAAATTTACTCCT CGAACACGACCACGACGTCAGCATGATTACGAGCTTTCAAAGGAACTTTG TGCTAATGACGGTATGAAGGCTACCAAAGCAACTCTCTTTTTCACAGAAT GTGAAACCTTGGAATGATCTAGAAGAAGATATTGTTGAAGCACCATCCTT ACAAGTCTTCAAAGAGCGTTTGATAAAAGAAAGGGAGAAAAAACTTTATA AAATGTAAAATCAAAAGTTCTGTTTCATAGAGGTCATAGACCTGCGAAAT ATTTGCTATAAAAAAAAAATAATAATAAAAAAAAAAAATAATAAAAATAA AATTTAGGTTCCCACTTTAGGTTCCCCCATCCCACTTTTCCGGTGTTCAT TTAGGTTCCCACTTAGGTTCCCCCATCCCACTTTTCAGGTGTTCATTTAA GTTCCCACTTAGGTTCCCCCATCCCACTTTTCAGGTGTTCATTTAGGTTC CCACTTAGGTTCCCCCATCCCACTTTTCAGGTGTTCATTTAGGTTCCCAC TTTAGGTTCCCGGGTTCCCCCATCCCACTTATCCGGTATGCCGTATAGAG GTACTTTAGAGCCCTAAGTGGAGCTCTGAATCTGGCTGCTATTGGTAGCG AAAACTTAGGGTAAACTGTTAGGTTTTTGAGACTTGCCCTAAGTCACTCG AGAACGATTTGGAAGCGGTCAGGTTGAAAGGGTTAAAGTTTTAACTCTGA GTTTAAACATGAGACTTAAGACTTAGGACCTTAGGATCTGAGGATCCAAA AGTTCAAGAATGGTCCAATAAGTCTCAGACTCTATTAAATTTAACAAACA GCCCAAAAACGACTTTCTCTCCCGAACTTTAAATTGCTAAAAAGAAAGAA TTAACTAAAATTCTCAATATATTTTGACCGGGATTGTATCTCTATTGGGA TTTCAATGGGAATTTTAACGAGGAAAAAATCCGCCAAGGCTGTGAGATAG GTGTAATATGATATTAACCTGCTATTTATCCTGGATAAACCTTGGATAGA CCTGGATAGACCCTTTTAAATCTCAATGACCTTATGAAACCTTGGTGACC ACTCTGTCGTCATATCTAAAATCTAGCTGTATAGCAACCGTAGCATGAAG GTAGACCATCCAGCTACGGTGCGCAAGTTTGTTACCCTGAGTTTCAGAGG TTGAGAACATCTCAACCTCTGAATACCAATAGAAATTTTATCGCGCTTGT GTCAATCTAATCACTATAGAAAAAATTAAAGATGAAGAGCAAATATTACC ATATTGGTAATATTGGTATGTCTAGCAGACTGTATCAGTATGCAGTTTAC TATTTACGAATCCCCAGAAACCTCCAAGTGTAATTGAAATGAGTTTCTTT CAAAAGAAATCATTTACATGATCCCCAAATGTATAACAGTAATTACTAAA CTTTTAATCATGGAAATGTCACTTTATTAATTTCGCTTAGCGAAAGTATT ACGATAGCCTTTCTGCGGCGGCGGCGGGGGAGAATTTTTTTGGGGCGAAG ATTATGGCGTTGGCGTTTGACCCGGGCGTTCTCTGGTTAGTTGGTTCGGT ATACTATGGAGATAATCATAAGTCGCGTTTTTTTTTGCTCGAATATTAAT TCCACAAATTTTAAGCATATAACTGTTTGTTTTTTCATTTATTTTCTTAT AAGCATATACTTTATAAGAATCAAATCAATAACTCTTGATAGAAGGTGAT ATACCTTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACAAAGTGGCGAACAATA TGAGCATATTTATTTTTCTTATAAGCATATACTCTATAAGAATCAACTCA TTAAACTCTTGATAGACGGTGATATACCTTTCGGTAATAGTTTCTTACAA GCAAACAAGGGACAGCAAACAATATGAGCATATTTATTTTTCTTATAAGC ATATACTTTATAAGAATCAACTCAATAACTCTTGATAGACGGTGATATAT CTTTCGGTAATTACTTCTTACAAAGTAAACAAAGGATGGCGAACAATATG AGCATATTTATTTTTCTTATAAGCATATACTTTTTAAAAATCACTCAATA ACTCTTGATAGACGGTGATATACCTTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTA AACAAGGGACAGCAAACAATATGAGCATATTTATTTTTCTTATAAGCTAT CTTTATAATCAACTCAATAACTCTTGATTGACGGTGATATACCTTTCGGT AATTAATTCTTACAAAGTAAACAAGGGATGGTGTAAAGTATGAGCATTTT TACTTTTCTTGTAAGCATATACTTTATAAGAATCAAATAAATAACTCTTG ATAGACGGTGAGATACCTTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACAAGG GACGGCGCACAATGTGAGCATATTTATTTTTTATAAGCATATACTTTGTA AGAGTTCTTAAAAATTAAACAGCAATTGTTCTTAAATTGGTCTTATTTTT TTAGTGATTTTAAGTCTCCTTGTTCTTGTAAAATTGTTTCATCAAGGCTC GATGTAAAGTAGATTTCAGATTAGCTTTAATCTCTACTTCTTCTTTTTCC CATGCAGTTCAAATTCTAGGCGAAATTTTCGACTTCAAGTCGTCTTGTTT GAATCGAAATAATAGACAGACTTTATGTTATGATTCTCTATCACTGACTC TTATTAAAAAGCATTGATGACATATTTTAGTTGCGTTTTCAACGACGGGA ATATAAATATCAACTTTGAACCTCATCCAAGATCTTGAATGGTCGTCATG GTTACTTTTCTCTGTGTTGATTGCGTGCTGAATAGAATCTAGATTGGTCG GCACAGCGTCGATATATGATTTCGACCTGTGCTTTTCACGGTACAAGGTT GTGGGTTCGATCCCCAGCCGGGTCATACCAAAGATTCCCAAAGTGGTACT TGATGCCTCTCTGCTTGATGCTCAGCAACTAAAGAGACGGATCAAGGGTA AGTGGAGAAATCCAGGGAAAGGAGAGGCACCCTCCCCTACCTTCGGGTAG ACAGCTATACGAAAAGGAAGCCCTACGGGTCACCCTCCACTGCAGTCGCA AATTTACTTACTTAAACTTTAAAAATCTAGCAGTAAAACAAACAAATGTT TTCCATTTTGCAGCTTGAAGTAACCATCCAAGCCAAGTTATATACACTAA CAGCAAAAGAGTCAAAACTTTTTCTGGTTTTGACAAAAAAATTCGTTTTG ACGAAAGAAAATGCTGGTTTAGTCAAGTTGGACACTTTGAGAGAGGAAGG TACACACAGAACAATTGAGCTGGAATACGTGTAAGAAATTTGTGAAGTAA GAGTATTGTATTTAGTGTTTAACGTTTGTACGTTAAAAGAACGTTGAGTT TCAGCTAGGCCTTTAATAAAAATACCAATGGAGATTAGAAACTTTGTTGT GTTCGCGTTGAAAATTCTGTAAAATGATTTAGGACATATGACCGGGACCT AGATTTGCAGGTTCAAGATTATTTTGCCTTTAAGAACGCGAAAACTATAA AAAATTAATATCAAGAATCTCAAATCTACAATTTCAGATCTTAAAGAAAA AAGATCAAAACATTCGTCCTTGTGTAACATAGGCTTTATTAACGTTACTG ATAGACGCCAAAGATTATTTTCCTTTTGGGTTTAACTTACAAAATAATTT GTTCTATCCCTACAGGGTTCTCTGTTCCAAAGGTTCTTCTGGACCATTGC CAAATTGTTCACAGACAACTCCAACAACAACAATAACAAAACATCCCGCA TCATCTACAACATCTAAACTATGTAAGTAACCTTTCCCCTGCGGTCGTTT GAACCATGTTTGAACTACAGTGGGGAGTCTCTATAACTCGAAGACGCACA GGGAGTTCGAATTTGTTCGTGTTAAGGAATTTTGAGTTATTGAGTAAGGT TTGTTAGGCATCGTTAACTGAAGGGACTTATTCGAGTTATAGTAGAGGTT CATGTTAAAGACACTCCGCTGTACAATCAAAGTCGTAATATTTGATAAAA ACGCGTGAATTTCTTTTTTTAAACATCACAAAATTTATTTTTAGTATCAT TTCAAACTAAAAATAACGATGTACCGAATGCAAATGATATCATTATATCT CTCCTAAATGTTCGATCTTTGAGAAAACATGTTTTAGATATAAGGTCTGA CAAGATACTCACAGAAAGTTGTTTGATATGTATGACAGAAACTCAACTAG CGGACCAGTCCCACTGTAATGATATCGAAAATATACTGGATTTGTTTTCC CTAAATTATAATAATGAAGCAAATCAACCTTATTCTAATACTAGGTGCTA GAAACTTTTGAAATGTAGAGTTAACTCTGTGTTTCTAGCATGAGACTTAA GACTAGACAGGGTGTCAGAATCTAAACACTAAAATTTGTTCCAATGTGGC TGAGAGCCTAGAAGCCATCGAAACCCTCTAAAATAGAAATATTGAATGAC AAAGAGTTGAAATGTTGAAATCGCAACTCTCGCTTTAAACTCCGAAAAAC AGAATTCTCAATGTGATTCGAAGTTGATTGTAACACACTACTTGTCATTA AGACAATTTTAATCATTAACTTATTTTTAATGCACTTTATGTCACAACAA ATCTTTGGTCAACAACTACCTTTTAATAAGCTGATTATTTTTTTGCTTTC TTCAACCAATATCCTTCTTGAATTGAACCTAACTTTCTAGAGTTTAAAAT TTTAAAATGCCGGCTCTTACAAACAGTTTTACGTTGAAATCTCATTATTT GTGTCTCTTATTAGTGAGGTTAAGTAAATCGGTATAATTACGACGACGAA CGAAAATTTAACAGGCTAGTGACTTTCAACCTATCAAATTTCGTATTTTC ACTAGCCTATTACATTTTTCGTCCGTCGTCGTGATTATCCTGGTATGCTT AACCTCAGTATTGTTGGATGTCAAAAACTTAAAACTTGACTTTTGAAATA TTAAGGCAAAAGATTTGGAGGTTTTGTTCAGGACCATAGATTGAATTTAC AACCCCAAAGAAAGACCTGAATATCCTCTGGTTATCTCTTTCAGGTCCAC CTGACGAATTCTGCAGCAATCAGAAGGATGGTTGGTACGGAAACCCTTCA GATCTGTCACAATTCTTTTCTTGTTCAAACGGGAAAGCAACACCCTGTCA ACAATGCCCTACAACACTGACT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000202_pilon:266927..276548-

>XLOC_001632 ID=XLOC_001632|Name=XLOC_001632|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1338bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000202_pilon:266927..276548- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGCTTCTTAGAATGATATTCTTCTCAATTTTATTTCTCATTGGACT
GGTTGGTCACATGATGCTTCTTAGAATGATATTCTTCTCAATTTTATTTC
TCATTGGACTGGTTGGTCACGCACATACTCTGAAAGAAGTCACCTTTTTA
TTTGGAGGATATAGGCATGCAGTAAATGATGAAATTGAATGTGTTGCTCC
TCCTTGTAAAGTCTTCATCGACTTCTTTGCAAATCCGGCACATACTCTGA
AAGAAGTCACCTTTTTATTTGGAGGATATAGGCATGCAGTAAATGATGAA
ATTGAATGTGTTGCTCCTCCTTGTAAAGTCTTCATCGACTTCTTTGCAAA
TCCGGGGTATGGATATAGTACCACAAAGAATGTCCCTGTTGGAGAAGAAG
AAACATTATCAAGCAGCCTCACTTTCACCTTTGCAGATTACGATGGGTAT
GGATATAGTACCACAAAGAATGTCCCTGTTGGAGAAGAAGAAACATTATC
AAGCAGCCTCACTTTCACCTTTGCAGATTACGATCTTGAAGTAACCATCC
AAGCCAAGTTATATACACTAACAGCAAAAGAGTCAAAACTTTTTCTGGTT
TTGACAAAAAAATTCGTTTTGACGAAAGAAAATGCTGGTTTAGTCAAGTT
GGACACTTTGAGAGAGGAAGGTACACACAGAACAATTGAGCTGGAATACG
TCTTGAAGTAACCATCCAAGCCAAGTTATATACACTAACAGCAAAAGAGT
CAAAACTTTTTCTGGTTTTGACAAAAAAATTCGTTTTGACGAAAGAAAAT
GCTGGTTTAGTCAAGTTGGACACTTTGAGAGAGGAAGGTACACACAGAAC
AATTGAGCTGGAATACGTGGTTCTCTGTTCCAAAGGTTCTTCTGGACCAT
TGCCAAATTGTTCACAGACAACTCCAACAACAACAATAACAAAACATCCC
GCATCATCTACAACATCTAAACTATGGTTCTCTGTTCCAAAGGTTCTTCT
GGACCATTGCCAAATTGTTCACAGACAACTCCAACAACAACAATAACAAA
ACATCCCGCATCATCTACAACATCTAAACTATGTCCACCTGACGAATTCT
GCAGCAATCAGAAGGATGGTTGGTACGGAAACCCTTCAGATCTGTCACAA
TTCTTTTCTTGTTCAAACGGGAAAGCAACACCCTGTCAACAATGCCCTAC
AACACTGACTGTCCACCTGACGAATTCTGCAGCAATCAGAAGGATGGTTG
GTACGGAAACCCTTCAGATCTGTCACAATTCTTTTCTTGTTCAAACGGGA
AAGCAACACCCTGTCAACAATGCCCTACAACACTGACT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_001632XLOC_001632-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000202_pilongenomesc0000202_pilon:266927..276548 -
Properties
Property NameValue
Aaloc544-669:127
Aaloc436-540:1507
Aaloc268-432:2060
Aaloc178-267:8157
Aaloc61-177:8925
Aaloc1-60:9623