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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000485_pilon:11565..19706- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_001531 ID=XLOC_001531|Name=XLOC_001531|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8142bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000485_pilon:11565..19706- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCTAACAGTACAATTAGTAAAAAGATGTCTTACAATTTCACTGGAAAAGT
TATACTTGTTACAGGTCTGTACATTTCATTATTTAATTTTTCCTATTTCT
AAACAAACTAGTTACCCTGGACAGACTTCTTTATCACACCCCTGGCTCAC
AGCCCCGATGGAACTTTTTTCTTCAGTGTGGATAAAAACCCCGATCGAAA
TCCCAATAGGGATAGAAATTTTATTGTTCCAAGGTTAAAAAATCCAGGGA
TGGTTTTGGAAAGCAATTTTTAGACATTTGATTTTCGGATGGGGATGAAA
TTCCAGGGTATTTTCCCAATCGGGACCAAATTTTTGCCAAATTTTCCAGT
GGGGATGGGGTCCCAGTGGGTCTGTCACACAGAGGTGTTTTATCCGTTAC
GGAAAAGATAACGAACATATTTATATCCTCACACAACAAAAAAACACAAA
AATAGAGAGGTACCAGGCTATAGTTAACTCTTTCTAATACTAATACTTTA
CAGACGTCAATGCTTGACCAAAAGTGAGTCACTTTACTTTGACATTTGGA
CCTTGACTGAGCCCCCCCCCCCCCAAAGCGGACCTTCCATTCACACAATC
ACGCAAGTGTCTTAACCAAATTCACGCATTCATGCATTTATTTTTTTCTT
TAATTTTTACGCATTCACGTAAGTGAAAAAGCCCATTCAAGCAATCACGC
AAACCGCTGGGGGGGCCTATACTAATAGATTGGGAATATAATCTACAATT
GATGTGTTGCATGGCCTGTGATTAAGTAACTCGTTAATCACGACGAGTCA
GTAACTTGTTAATCACGACGAGTCGATAATGCCAATAAAAAAAATATTTT
TCACTATTATTCATTCAGGAGCAAGTTCTGGTATAGGAGCTGGTACAGCT
GTGTATTTCGCAAAAAATGGTGCTAAAGTTGCCATCACTGGTCGTAATGA
AGACAATTTGAAGAAAATTGCTCAAAAATGTGAAGAAGCAAGTCCTACTA
AAGAAAAGGTACCTATTTATCCAAGTTTTGATAGCCTCGTTCCCTGCGTT
TTATCGGCTTTTTGATGATTACTGATAGCGCTAGATAATTTTCCCTGACG
TCAATCAGCAATGTGAATAACAAGCCAAACATGAGGACGAGGTTGTAGAT
AAGCTTGATAATCCGTTTTTTTTTAGGGCCGACAAAAGGAGAAGAGAAGA
AATAGGGTCAACAAGCACAGAAATTTTTACCAGAAAGATTTTTTTTTAAT
TCTTTCTTCCCGTGTGCAGCCTTAGATTTATTTTGAAATAATGAAGTAGT
AAACTAGGCTAGAGTTAAAGATATATTAATCATTATTCCAGTATAGTACC
ACAAATTATCGCCTATTAATATCACCCAGACTACAGTCTGGTGGTTTATC
AATCAGATCATCGTTAAAAATGTCGAGGGAGGGCAATCATATGGTCCGAC
CAACGGCATGTGCCGCCCTTAAGGGTAGGTTTTTCGAGATCCTCGAAATG
CACTGTACTTTTGATAGAGTGCACTACAAGGGTCTTTTAGCTGGAAACAC
TGTAAGGGTGTGTTTGGGGACTGCTGAATTGCAAGTCTGCCAGTAAAAAT
CTGATGTATCTTTATAGTTTTGACTCGCACCAATTTGGTTTGGTTTTGCA
CATTTTGTCGACATCTAAGTCTCATTTTCAGATGGTTTCAGCAAAATAAG
ATATGAAAACAAACTACACTGTAAGGGTCAGAGACAATCGGTAGAATGCA
CCGTAATGGTACCCTTTCACTACTCGAGGGCTGCACTGTCAGGGGATGTG
TAAGGGTCCGATTCCGAAAGCTATTTTTTTGGTGGTACATGCCATTGTTT
AGAAATCAAGTGCCCCCTCCCCCCCGGTCAAAATGCCATCAAAGAATATA
TGGTATAATTTATATAATATTATTTTTTATAATTTTCTCTTTCTAGCCAC
TTTTAATTGTTGGTGACTTGGCAAAAGAAAGTTATGTTGAAAAAGTTATG
AATGAAATTATAAACCATTTTCAACAACTTGACGTTTTAGTAAGTATATT
CCATCTCTTACTGATTATTGGTGTTCTCTCATACTTAGTTGAGTTATTTT
GCGAAAATTGTTCATTATATGAAGCTAGCTGACTTAACTTAATTCTGACT
GTTCGACTGAATTCTCTCATTTCCTCATCGGACGTGATTTCGTGCGATAA
CTGAATGACTGATTAAGTCCAAGGTTATACCATATAGCCTTCTAGAATAT
ATATCCGGTCACTACTAAATATTCGTTACTTATTGGAAACCTCGCTATCA
CATATTGTTATTTATATATATGTTATCTACTCAAACAGATTTATTGCATC
CTGGAAAATTTCTCTTTGAATTTCCTAAAATTCCTGTAATTTTGAGATAA
AAAAACAAATCTGCAAGCAGCATATCTGATAAGGGCAGCTAAAACCTATT
ATTGTAGTATTGAAGAAACATTTTTAAATTTTTTTTTTGACTATTTAACA
GGTAAACAATGCTGGTATTTATACTGCTGGAAATTGTCAAAGTTTAACAA
TGGATACTTATGATAAACAGATGAATGTTAATATGCGGTAAAGAGTTTCA
TTAACAATTTTGTGTGTTTCTTTAATCTTACTTAAGGGCTCTGACCACAT
AGTCGGAAATTTGATTTTAGTAGTTGAACATAAAAGTTATATTTTAGGTT
CTTTAACACTTTTAACGAAGAATTGCCTTTATAAATTGCTTTTTAATCAA
ATCCCTTAAGAGTAATTACCTTAAGTGGATAAATTTTGGCGGGGATTAAA
TTTGGCGAATTTGGCGAATTGTGCCAAAATTCGCCAAATTAAATCCTCGC
CAAAATTTCCAAATTTGACAATTCGCCAAATTAAATCCCCGCCAAATTTA
ACAAAAAGAGAATTATGTGAAAAATCACAACTTTTTAGTATATTTTTGAG
TAATTTTTACCCATTTCAGTGTGACAAAATTTCTAATTCGCCAAATTAAA
TCCCCGCCAAATGTTACGAAATTGATGTATCACCAAATTAAATCCCCGCC
AAAAATCGCATTTTGGCCAATCGCCAAATTAAATCCACGCCAAAATTTAT
CCACTTAAGGTAAGAATTTAATGGCAAAAATGACGTTATGAATTTTAAAA
AGACGTTAATAATATGTTGCATCACCTTCTTTTATAAAAAGTGCTAAGTT
TTAATGGGTAATTAACCTTTTTGTTTCGATTTTATTTTAATTATCTGCAA
AAGATTGAACCATCTAAAAATTTTCGGAAAAGTTTTCTAAATTGATGTTT
CAAAAGTTATGACTCTTTTTGTACAACAAATTGGGATGAAAAATTGTTCA
AAAGCCACTATTTTCAAGATTTTGAGACGAAGAAGCTTTTGGAAAAACTT
TCCGAAAAAATAATTTTAGTTCGGTAAAAGATACACCATCTACCGCAAAA
AAAATTTCAAAATGTTTTTTTCTTTGCCAAAAATAAGCTCTTCAAAGTTA
AAATACTCCTCTTCGCAAAAGTCTTCATTCTCTTCTTCATCAAATTTTTT
CATCGTGATTCTGAAATTTTCAGACTCAAGTATAGTTGGCCTAACAGAAT
ATGTATAACATGCCACAGTTTTGTGGGGTACATCAAGTAGAACTTTATAT
TTTGTAAGTGGCCAATATTAAAAATTCACTATGGTCAGAGCCCTTAAAAC
GCAACAGGGGTAAAGAAATGCTTTTCTGTCACTTTTCATTTTTTGATATC
GAGAACTTCTTATCGATTCATTGTATAGGATTCGTTCGAAAATCTTTGTA
TCGAGTTTGAATGTTCTATATTTCTCACTTTTAGTTCTGTGTTTTATTTG
ACAAAACTTGCATGTCCACATCTTATCAAAACTAAAGGTACATTGTATTC
AATTTTATTGTTATAAAATCATGTCCATAGTCTCAACTTCAGTTGAGCTA
TAATCTGAGAATGTCCGTGTGTCTGTGCATCTGTGTCTGTCTATATGCCC
CAAAACTTTGGGGAAGCTTCAAGAGGCCAAAACCTAACCGATTTGTCTAA
AATTGGATACAATTGGGTAATTTATTCAATCTATGTTAGATCACTTTAAT
AGTTTTACCATGATTCTCTATGTACCACTACATATGTGCTTGTAAGTCCC
AAATTAGAAGAATTTCATTAACAAAGAAAAGCAGCATTCCGTATTTAAAA
CTTCGGAACAGTAGAATAACGGTTCCTTGCACACTTGTTCCTTGGGTGAA
TACCTGGGGATGTTTTTTTCATTAAAAAAAATTCAAATCATTTTAAAGCT
ACTGAAGTTGAGCCTTGCAGTACGCACGTTCGACTTCATTAAAATCCTGA
TAACTCGAACACACGATAAGACTATTTCATAGTCCATATTAAAAAGCCGT
GTCCGAGCGGGTGAATTGTATTTGTCGCGCGGGAACAGGAATTTGTCTAA
GTTTCTTTTCTATATTTTTACGGCCACAGACCCAGTTGAAAATCAGCGTT
ACGTACGGTGATTTTCTTCCTACTATTATAATTAAACTTGGAATAGTCTT
GCCAGTTACGGTACGAACTTTATTTTCAATTCTCGGGGACCTTAAATTCA
AATATACTTTTTCGTGTTCCTACCCTAGGTAAGTGAACTACCGGACGTGC
GGCCCTTAAGGGTAGGTTTTTTGGTTTTCTTTGTGAGCAAGTGGGAAAAA
ATGCACTGTAAGGGTGTAAAATTTGAGAAAATACCAAATTTCGAGGTAAA
ATTTGAGAAATTTCAAAAGATTTTGCCCTGAAAAGGGCAAAAAATTTCGA
AAAATTGCACTATAAGGGTCGATTTTCAGCCCCCCGGGCCCTAACCATCG
CCCTTGCATTGCTTTGGGTTTTGAATTACGGGCTTCGAATTCTCCGTAAT
TTTATTTTGTAAGTGAAATTACTTAGATTCTCTAAATATTTGTTTCTACT
TTATATACAGGGAACATTATAAACGTATCAAGTCTTTCAAGTCTTCGAGC
AGTAAGATATCTATATCCAAGCCTGAGTAGTTATTCTGTTTTTAAATTTC
TCCTTCATATTTTTGTCTAAAGTCATTTCTCTGTTTGAACATTGAGAAAT
GGTGAAATATAGTTCAAACACCTCTTATCATTTCCTTAAATTCTGATTTA
TCAGTACGATAAAATAATTTGCTATCCTTTTAAATCACGATCTCATAAAT
CGTTTTCATAAAAGTGTTAACAATTTAATTCTACTTTCTTTCAGAACACA
CACGCAGTTGCATACTCACTATCCAAAGCTGCGTTGGATCAATTCACAAG
GACAACAGCCTTGGAGCTCGCATCACACAAAGTTCGTTGCAATGCTGTTA
ACCCTGGTGTGATTGATACTGAGATCTTTGTCACGTCTGGATTGACCGAA
GAACAACGTGACGGGGTAATAGACCTTTTCATAAATTACGTCACGAATAT
CACTTGCCTCGTATTCAAACAATTATCATGGTGATTATGTCTCTTGAGAC
ATTGAATGGGTTTTTATGAATAGGAAGTAGTTTTAATAAAATCTGCTGGG
AGTTAATCACCATGGCAATAATTTCAAAACGAGGCAAGCGATGTTCGGAA
CGTAATTTATGAAAAGATCTACCTAATATTCAATATTTTATCGGACAAAA
AACTATCGGACTAATTTTTAAACTTCTCGAAGATTTCACGATCTCAAACT
CTTATTACTTATACATGTTTTTTATAAGCAGGTGTCTGCCCCTATATCAG
GTTCGCATTATGCTTAGCATTCTATTGTTCTCAAAAAATAGAGCTATTGT
TTAGGTGCCAAAAACTGAGCCTGCGTATCCTTATAAACGTTATGCTTATA
AAAGAAAAAACATGTATGCTTATATCTATCTCTATATCGATCTTCTTTCT
TTTTCTTTCTTGAAAACATCTTGAGAACATCTCTTGATTTTTCCATTTTT
TTGGATACAATGAAACACCCTCTTCACTTCTCACAGACCCTTCCCACTGA
AAAAATTGGCCAAAATATCGTCCCCAAGTGGAAAATTATACCCTAATTTT
TGTCCCCGCTGAAAATATTCAGATAAAGCAAATCCGCACTACAAAACATT
GTGCTATTTTTTCTATCCCCACTGAATATTCTGGCTAGGAAACATAATGG
AATTCAAATCCCCAGCCATAAAAACATGGGAATATCTCCATCGATTTTTG
GTCCGTTATTTCTACCCCCACTGGCTGATAAAATCTCACTGGGTCTGTGA
GAAGGGGGTGTAATGAAAAACTACTTGGAAGAAAAAAGGTTTTCTTAAGG
TGGTCGTTAACACTTCTGAGATAGGATCATTTTTTTTGGGTTGATTTTTC
AATTTTTGGTTTAAATTAAAGTTTGAACCTTACTAAACAATATCCCAAAG
TTTTATTTGATATAAAGAAGAGGAAAGTGGAAAAATTTAGGTCTTTAGAC
ACCTACCTGAGCAGATCTTGCGGTCCGCCCTAACCGCCCACCCCGCCGCC
CGTCACGAAAACCGCAATATTCGCTCTTCTGGTCCTTGGAGCGACTCTAA
ATTTTTACCGTCGCTACTTGGAGCCACAAAGAACATTTCCGGAAAATTTT
ACACCGGTACTGTTAATAGTTCCGGATTTATGACAATCAAAACAAACCCG
CCATCTTGAATCTTGTCAAACTTCAAGTGTGGATTTTTGGTAAAGGGAAT
AACTGTTTCATGGCTTATTTTCTTGTAGTTAGTAAGTGATGGTTTAATGC
TTCCATTTATATAAAGAGCTTCTCAAAAACTCCAAGGAACATTTTTACTT
GATAATCTTTCTAATTTCCTCCCCATTGGGATCAAATTTCAGCGCCACAA
ATGTGTGACAGGTACGTGAAACGTTTCTTCTGTTTTCTCTCTCTTTTTAA
GTTATTTAATTGATAATTTACCTTTAAAAACGTCCATAATATATTCTTGA
AACTAACCATACACCTTTAGTTGGGTTTCGATAGTGATATAGTTGATTTT
GGTGCATTTCGGGGTTTTCGCAAAAGTGAAAGTGAAAGTGCTCTTTACTA
GACTTGAGTGCAGCTTGTATTTCAAGTAACGGGGATGAAAATTTGCTTTT
CTACAATAAAATGTGTTACTTTAACCAATGAAAAGGTTAGGGAATATTTT
TCAATCACTTTTCACCAACTTTTAGCTTTTTCGCAGGCAAAAGTAAGGTT
TACGCAACTTTTTTGCATGTTTGCGGTAAATCTCAGGGTTCCAGGCGAAG
CCATGAATTTGCTGACACATGCAAAAAAAATGGCTTTACTTTCTTTCTTA
TATTGAAAATTGAATAAGTGCATCAAGTTCAACTGAAATATGTCAAAAAT
CCCATATTAAAAGCTTTTTTTCCTCTTTTTACAGCAATAAATAGTTTTAA
GGCCAGTTTACGCAAAACAGCAAAACCGGGGGTTTTTGATCTCTTGGCGG
AAATATCTCAGGATTGGATGGTCCGATTGGCATGAAATTTTCAACACAGC
TTTCCCTCATGGAAAGGTGTGATCTGAGTGAAACAGTTTTTTAAAAAAAT
GTTTTGTTAATTTTATATTTATAAAAAACATTTTTTTGGTTTTTTACCCC
CTGATTTTATTTTTTTCAAATTTTTTTTTCACTCAGATCACAGAAGGTCA
CTAGTGTAACATAACTGCCAAATATCAAAAGCTAACTCCTTCTGGTTGCT
GAGATTTTTCTGCCAAGAGATTTTCGAATCTATTTTTAGAAGTGACGTCA
TGACCCCCGTCTTTGATATTTTTTATTATTTTTTCTATTTTTAGAACAAC
ATAATAATGAAGTACCATCATACAAAGTTTCAACAATATATCATTTATAC
ATTTTGAGATATTTCAATTTGAATATTTTTTGACATTTTCAAAAAGTTTG
TTAACGACCACCTTAAGATTTTTGTTAGGAAAATATATTCAAAGCAAATC
TTTTTTTTAACTTTCATCACACTTTCATTGCAGCTCATGAAACGCACTGC
TGATATGTATCCATTGGGAAGACATGGTGAAGTCGTAGAAGTAGCATCTG
TCATTGCTTTCTTAGCTTCCGATTCTGCATCGTTTATCACTGGAGCTATT
GTTCCTGTCGATGGTGGAATGAACTTAGCATGTCCTCGATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000485_pilon:11565..19706- >XLOC_001531 ID=XLOC_001531|Name=XLOC_001531|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1614bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000485_pilon:11565..19706- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCTAACAGTACAATTAGTAAAAAGATGTCTTACAATTTCACTGGAAAAGT
TATACTTGTTACAGCCTAACAGTACAATTAGTAAAAAGATGTCTTACAAT
TTCACTGGAAAAGTTATACTTGTTACAGGAGCAAGTTCTGGTATAGGAGC
TGGTACAGCTGTGTATTTCGCAAAAAATGGTGCTAAAGTTGCCATCACTG
GTCGTAATGAAGACAATTTGAAGAAAATTGCTCAAAAATGTGAAGAAGCA
AGTCCTACTAAAGAAAAGGAGCAAGTTCTGGTATAGGAGCTGGTACAGCT
GTGTATTTCGCAAAAAATGGTGCTAAAGTTGCCATCACTGGTCGTAATGA
AGACAATTTGAAGAAAATTGCTCAAAAATGTGAAGAAGCAAGTCCTACTA
AAGAAAAGCCACTTTTAATTGTTGGTGACTTGGCAAAAGAAAGTTATGTT
GAAAAAGTTATGAATGAAATTATAAACCATTTTCAACAACTTGACGTTTT
ACCACTTTTAATTGTTGGTGACTTGGCAAAAGAAAGTTATGTTGAAAAAG
TTATGAATGAAATTATAAACCATTTTCAACAACTTGACGTTTTAGTAAAC
AATGCTGGTATTTATACTGCTGGAAATTGTCAAAGTTTAACAATGGATAC
TTATGATAAACAGATGAATGTTAATATGCGGTAAACAATGCTGGTATTTA
TACTGCTGGAAATTGTCAAAGTTTAACAATGGATACTTATGATAAACAGA
TGAATGTTAATATGCGTTCTGTGTTTTATTTGACAAAACTTGCATGTCCA
CATCTTATCAAAACTAAAGTTCTGTGTTTTATTTGACAAAACTTGCATGT
CCACATCTTATCAAAACTAAAGGGAACATTATAAACGTATCAAGTCTTTC
AAGTCTTCGAGCAGGAACATTATAAACGTATCAAGTCTTTCAAGTCTTCG
AGCAAACACACACGCAGTTGCATACTCACTATCCAAAGCTGCGTTGGATC
AATTCACAAGGACAACAGCCTTGGAGCTCGCATCACACAAAGTTCGTTGC
AATGCTGTTAACCCTGGTGTGATTGATACTGAGATCTTTGTCACGTCTGG
ATTGACCGAAGAACAACGTGACGGGAACACACACGCAGTTGCATACTCAC
TATCCAAAGCTGCGTTGGATCAATTCACAAGGACAACAGCCTTGGAGCTC
GCATCACACAAAGTTCGTTGCAATGCTGTTAACCCTGGTGTGATTGATAC
TGAGATCTTTGTCACGTCTGGATTGACCGAAGAACAACGTGACGGGCTCA
TGAAACGCACTGCTGATATGTATCCATTGGGAAGACATGGTGAAGTCGTA
GAAGTAGCATCTGTCATTGCTTTCTTAGCTTCCGATTCTGCATCGTTTAT
CACTGGAGCTATTGTTCCTGTCGATGGTGGAATGAACTTAGCATGTCCTC
GATAACTCATGAAACGCACTGCTGATATGTATCCATTGGGAAGACATGGT
GAAGTCGTAGAAGTAGCATCTGTCATTGCTTTCTTAGCTTCCGATTCTGC
ATCGTTTATCACTGGAGCTATTGTTCCTGTCGATGGTGGAATGAACTTAG
CATGTCCTCGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000485_pilon | genome | sc0000485_pilon:11565..19706 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 649-807:160 |
| Aaloc | 478-648:2899 |
| Aaloc | 439-477:3181 |
| Aaloc | 385-435:4308 |
| Aaloc | 298-381:5642 |
| Aaloc | 205-297:6197 |
| Aaloc | 67-204:7273 |
| Aaloc | 1-63:8143 |
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