XLOC_001414 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_001414
Unique NameXLOC_001414
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000287_pilon:87207..101033-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001414 ID=XLOC_001414|Name=XLOC_001414|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13827bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000287_pilon:87207..101033- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGTATTTTGGGGAAATTCCCTTTAACCAAATAAGAAAGTATAGCTTTTCT CAATGTTGACTCATAATTTTTTTCTGATTTTTTGCACAATGATGCAAAAT GGCAATGCCCAAATTGTGACGAAGCCAGATTTTTAAGGAAAATTATTTTG GGCAAATTTGGGCAAAAAACAGCTTAAAAGGTTTTTTGGGCCTGAATGGT TCAAGTGATTTTCGTATTTGGGGAAATTCCTTTTTACCATTTTACATTAT TCAACACACAAGCTTTATTTTTCCATTCTGAATTTTTGTACAATTATTGT CACTTTTTTCTTATTTTCATCTGATGTTAATCATTAGGTAGGTCCATTCA GCATGTTGCTTGTTCAACTTTTTTCTTTCTCGTACCTTTAAGAGACCTTC GAGGCTATTTCGACTTTTTGTTGTTTTTGTAACCCTTGGAATTCTTGGGA CATTTTTTGTGGAGACTTTGGAATGCAAAAAACGACATTTACCGTCCGCA CATACAAAGCACTTATTTTTTCCCATGCTCCTCCCCTCCCGGATTTCTTC CCTTCAGATGTTTCCAATAAACAACTATGATAGATGAATTACCCCAACCT TAAACATAATACCATCCACCGAAATTTAACACTTTTCACATCTTTCAGCA TTGGCTGCCTTGTTGGGAGTTGTACCCTTTATTGGGACCTATTGGGCTGC CATACCAGCTTGTCTTGAACTCTTGTTTATACAAAATGATCAAATGAGAG CTGTGTCGCTTATCGTTGCTCATTTTGTACCTACTTATGTGGTAGATACA GCTATCTACAGTGAAATTGGTAAGTACAATTTGTACCATCCCCAGAGACT AACAAAGATAGGTTTTCAATTATTTCGTTGGAGAGTGTTAACACTCTCGG CAATTAATAAAGGTTTCTCTGATGCTCTGATAATAGTCCAGGGAAAGTGT 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TGGGCCAGGACTGGCCAGGAGCCATTCTGGTCTGTAAAATACTCCCATGG CCTATAACTCGGACCCAGTCCATTTTGAGATACATATCATGATGATTTTT AGAATCAGTGTGAAAAAACCTTTCCAACAGTATATGATATGACATGTTTT AGAACAAAAAAATTTTCGGGCATGCAGACTGGTCTGTAAATTACTTCCGT AGCTCATAACTCGGACCTAGTCCATTTTCAGATATATGTTGTGATGTTTT TTAGAACCAGTGTAAGAAAACCTTTCCAACGATATATCATGCTTTAAAGA TAAAAATTCTTTTTCTTGCCTGGGAGGCATTCTGATCGGTAAAATACACA AACAGGTGTTCCGGAAGTGGGTCAGAGGCTTAAAATGTTTCTTACCCCCT AAGGTACCACTGTACCAAATTTCATGCTTTCTAGTCAAAAACGCACAATT GATGCACACTTTCCCTGGACTATAAGACGATGACGGTGTTGACGAAGTTT CAATTGGCAATATGGCAAACAAGTTCAAAATTTTTAAAAAGAAAGTTGTG ACAAGGGATAGAGTTAATGAAAATAAAGTTTGAATGTGATGATGTGATTT AAAATGATGTCTGAAATAGTGATAACTTTGTGAAATTCTAAATGGTTTTC TAGTTTTTCGCTTTACTTTTCAATGGTTGAATTGCTCTTTAATTTCTTTA TAATTATCGCCAATGTTCTGCTTATAACTAGGAATTCATCCATACTTGAC AGCTCTGGCAGTAGCTGGAGGTGTCATCTATCTTGGGTTAGAAGGTGCAT TTGTTGGTCCATTTGTTCTCTCGTGTTTGATCGCTGCTGTGGATGTTTAT AACAGAATCATGACCAACTCCAATAACATCAGTCCTGTTGATAACCCTAA AAAAAACTGGAGGTTTGTCTTTTCAATGTTTACGTTAAACTCGAACCCAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000287_pilon:87207..101033-

>XLOC_001414 ID=XLOC_001414|Name=XLOC_001414|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5592bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000287_pilon:87207..101033- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCATCCTTTCTTGAGACCATTAATATGGGCATCTTTGGCTGGTGCTTTTA
TATTTCCTTTTAAGAGGAATGCTACTAAAATTGTTCATGAATGGCTACTA
GATCTACAAGTTGATAAAACACCATCCATTGTTGGGATGATGGTCCTTCC
TGCCAAAGTTGTCAGTAACGCTGCCAATACTCTTGGATGGGTCATCAAAT
CATACCAAAGATTGTTATTCATAGTCTTTACAGCATATGTTTTATTCAAT
CTTTGGCTTCACACTTATTTCTTTGCATGGGCTTTTCAAATTTTTTCATC
CTGCCACATGTTTCTATCAACCTTGCTGGCCTTGTTCAGTCAAAAACTGA
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TCTTTAATTACAAGAAAAGGGACAACCAAACCTTTATGACCGTCATTTCG
ATGTCTGTTTGGTCTGTTTTGGCGTTACATCTGGCGACGTATGCAGGAAG
TCTACAAATACCAATATCTTTGCTATTTCTGGCTATTATGGGAAGAGCCT
TATACTTATCACATTATGGCAAACTGCCTGAATGGATCATGGAGGACGAT
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ACTAACCAGATTCCCAAAAAACCACCCAGTGTTGAGAACCTTATACCAGG
AAATCCAAAAACTCCAACCAGACCACCAAAACTTGTAAAACGTGTTGCCT
TGAAATTAATGCACGATGTTTATAAATCAAAGACAGGACATTCTCATAAG
AGAATAAAACGTAGCAGTGATCCTTATTTCATTGCTTTGTTTTGGTTGTT
TGCCATCAGTCTTATTGTTCGACATCAATTCATTCTTTACGTCATTGTGG
CACCTTTACTGGTCTTCATTGCTTTGAGAATGGATCATGGAGGACGATAC
TACTTGCTATGAACATCCTTCAGAATCAGTGGAATCTTCACTGCACCAAT
CAACCAAACCAACCACAATATTTCACCCACCACCGCCACCAGTCAACTCA
CCAGCACCGCCACCCCAACCACCAGCCACGCACAAGAAAGCTGCAGGATT
GAACAGGAGCAATTCAAGAGTTGCAGATGGTATCCATGGTTTCATGAATA
TGGTTGGAATCAAAACAATCACAAAATCAAGCACTGATACTCTTTTAGAA
CAATCGGATTCAGATACCAGTGATTACCAACCTGAAACAATAGACACTAC
TAACCAGATTCCCAAAAAACCACCCAGTGTTGAGAACCTTATACCAGGAA
ATCCAAAAACTCCAACCAGACCACCAAAACTTGTAAAACGTGTTGCCTTG
AAATTAATGCACGATGTTTATAAATCAAAGACAGGACATTCTCATAAGAG
AATAAAACGTAGCAGTGATCCTTATTTCATTGCTTTGTTTTGGTTGTTTG
CCATCAGTCTTATTGTTCGACATCAATTCATTCTTTACGTCATTGTGGCA
CCTTTACTGGTCTTCATTGCTTTGAGATGGATTATCAATCGGTATGAGAT
ACTTGATTTGATGTTATGTAAACTGATCGATGTCATTCATGTGGTCAGAA
ACTTCTACGAAGACAGAAAGTATATCATTTTTCCTAAACCTGTTCGAAGT
ATTGGGATCTTTTGTCATGGATTAGACCAACAGATGGATTATCAATCGGT
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GTCAGAAACTTCTACGAAGACAGAAAGTATATCATTTTTCCTAAACCTGT
TCGAAGTATTGGGATCTTTTGTCATGGATTAGACCAACAGCTGATGTCAA
TGATATGCCAATGGACAGATTTGTTCATGACAGCACTCATCATTGTTTGT
ATGGCATTCGCGGTGGTTCTTCTCACCACATTATTCGCAGTACAGCTGAT
GTCAATGATATGCCAATGGACAGATTTGTTCATGACAGCACTCATCATTG
TTTGTATGGCATTCGCGGTGGTTCTTCTCACCACATTATTCGCAGTACAG
GTTCATCACGAGAGTACATTTTTGTTGACGGTGGGTGCCAATGTCGTTAA
CAAAACTATCGCTGCAAATCAAGATTGGCTTGAGTTCATCACGAGAGTAC
ATTTTTGTTGACGGTGGGTGCCAATGTCGTTAACAAAACTATCGCTGCAA
ATCAAGATTGGCTTGATTCATACAACCTAAATGAAGAGCAAGTTCGACAA
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TAAAGTTCATACAACCTAAATGAAGAGCAAGTTCGACAATACATGGATCA
CTGGATGGAAGAAGGCTACCACATGGCAAGAAAAAGAGTTAAAGGGGCCT
TCTCATCCTTCATTGAAACTAACGATACAACCACGACAGACCACCTGGAA
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GGGGCCTTCTCATCCTTCATTGAAACTAACGATACAACCACGACAGACCA
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TTGTACAGTTCCACTGAAGACGTCGTCAAAACAGATACACCATCAGAACA
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GTATATCCAAACTGACCAATATCTTTTGGCAAAACATGCATACAATGAAT
TCGAATCCAAAAGCATTATCCGTAACATCAAGCTCTGCACCAGACTTGTA
CAGTTCCACTGAAGACGTCGTCAAAACAGATACACCATCAGAACAACAGC
AACCAGGACGGTTATCATTCGTCTGGAAAGTGTATTCTTATTTGAGTATA
TCCAAACTGACCAATATCTTTTGGCAAAACATGCATACAATGAATTCGGT
AATGGATTCCATATTTGTCATAGTGAAAGGGAACGCCAGTCTGGTCATCA
ACATCATTGGACACGTCTTGTACGTCATCTTCTCCAGCAGTACTTATGTC
CTCAACTCCATCGTCTCCATGATCATTTTTTTCACCACGCTCTTCTACTT
GTTAAGCTCATCTAAAGACGAATACAAACTCTTAGAATGGTTAACTCAAG
TTAGCATGGGGACGAGGCTAGGTGAATCTATTAACAATGCTGTACAAGAG
GTCTTTGGAGCTTCACTGAAGATGGCATGTTTTTATGGTGTTTACACGTG
GATTACGCATAGTGTGTTTGGAGCAAATCTTGTCTTTATACCTTCAGGTA
ATGGATTCCATATTTGTCATAGTGAAAGGGAACGCCAGTCTGGTCATCAA
CATCATTGGACACGTCTTGTACGTCATCTTCTCCAGCAGTACTTATGTCC
TCAACTCCATCGTCTCCATGATCATTTTTTTCACCACGCTCTTCTACTTG
TTAAGCTCATCTAAAGACGAATACAAACTCTTAGAATGGTTAACTCAAGT
TAGCATGGGGACGAGGCTAGGTGAATCTATTAACAATGCTGTACAAGAGG
TCTTTGGAGCTTCACTGAAGATGGCATGTTTTTATGGTGTTTACACGTGG
ATTACGCATAGTGTGTTTGGAGCAAATCTTGTCTTTATACCTTCAGCATT
GGCTGCCTTGTTGGGAGTTGTACCCTTTATTGGGACCTATTGGGCTGCCA
TACCAGCTTGTCTTGAACTCTTGTTTATACAAAATGATCAAATGAGAGCT
GTGTCGCTTATCGTTGCTCATTTTGTACCTACTTATGTGGTAGATACAGC
TATCTACAGTGAAATTGCATTGGCTGCCTTGTTGGGAGTTGTACCCTTTA
TTGGGACCTATTGGGCTGCCATACCAGCTTGTCTTGAACTCTTGTTTATA
CAAAATGATCAAATGAGAGCTGTGTCGCTTATCGTTGCTCATTTTGTACC
TACTTATGTGGTAGATACAGCTATCTACAGTGAAATTGGAATTCATCCAT
ACTTGACAGCTCTGGCAGTAGCTGGAGGTGTCATCTATCTTGGGTTAGAA
GGTGCATTTGTTGGTCCATTTGTTCTCTCGTGTTTGATCGCTGCTGTGGA
TGTTTATAACAGAATCATGACCAACTCCAATAACATCAGTCCTGTTGATA
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AGCTGGAGGTGTCATCTATCTTGGGTTAGAAGGTGCATTTGTTGGTCCAT
TTGTTCTCTCGTGTTTGATCGCTGCTGTGGATGTTTATAACAGAATCATG
ACCAACTCCAATAACATCAGTCCTGTTGATAACCCTAAAAAAAACTGGAG
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_001414XLOC_001414-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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