XLOC_001103 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_001103
Unique NameXLOC_001103
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000049_pilon:616141..626522+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001103 ID=XLOC_001103|Name=XLOC_001103|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10382bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:616141..626522+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgggtTTCTTCAAATATGTTATGATCACTTCAATTCTTCTGACGATTGC GATCTCCCAAGTCAATACGCAGACATTAGAGGAAGACATAATACTcttaa aacaagcaaaaacattacccaactttacaaacacattaaaaaagataaat ttccaaaatatttttaaaaatgaaaccgTAAAGACATTATTATCTCCACG ATAtaacgaaaaatatttacaagTGATGGAGAAACAGAAAAACATTTGGG AGATAATGAATACGAATAATTTGATGACACAAATTCATTCCAAGCAAAAT ATAACTGAGGAGAATTTTTTGAAGATGGTTTTGAAGAATATTGATGCTTT GAAAGCTGTTAATTTAGTTGATTGgtcaacttttgtgatgcagaGTGACG GAGGTGAGTTTAGCTAAAAACTTTACATTTAGAACACCCCATGCTctcag acccggtaggatttttctaGTCAGTGGGGGTAAAACTAACGGATCAAAAT TCGATGGGGATTGGTATTTTCATGTATTTAATGAccggggatttgaattc cattgtttttgagccagaaaattcagtggggatgggaaaaatagcacaat atgtGAGAATTGGTTTATTCGGTTACACTCAGTGGGGAAAAGAAATGGAT TATAATTTCccactggggacaatattttgtcCAATtattccagtgggaag ggttcccactGTTCAATTTTCTCCCCGATTTTGGTCCTGTTACTTTAAAC GGCTCACATGAAAAGGTTCTAACCTGATATTATTATCggtatagcggtca ttaagtaagccattaaaggttcaataggcgggcggtattgaaaggttttg tgactcaaattgtcatacccgcgctAAGGAAACTAAAGCGCCAGGCTTCA GAGGGCTAAAATATCATTAACGGCCCAGGTATAGGGCAATAatgtcattt gcggcccgctcggaattggatcgaagtcgttgcattgaagcgaagagact aaactaacgtcagaaaaaaaacacttttggtcatttgcggcccgctcgca aggtgctaaaaatttgttgaagacattgcattgaagcaaaaagaattggt tgacgctagaaaaaaacgttgtttgaatgtccgatatggataataatagt aatagcgttaagttttcgttcgttgttgtcattaattctgcccttgcagt tcgattattagccctctagtgccatttgcgccctccgcttcgcgtcgggc ccaaatgacactatcgggcgaataatcaaactacgcgggcagaaaataac aacaacgacctcaaactgaacgctattgttatataaGCGACCATGATTCA TACTGTTGTGGCAGGTTTCTTCGGTAAATTTGACATGACTCATTTTACTT TTAGATGACGTTGTTTATATTCCTGGCTTACCGAAAGGTATTTCCATTGA TTGTGGAATCAGATTCGCTAAATATTTCGGTAACATTCTAACAAGCAATG CAACCATGTTCGATGTTCGTGATATTGGAAAAGTGTTGGCATCCCCTGTT GGAAAAAGTAAGTACTGATTGTGGAACTATCCATAAGGACTAACTTTCTG GcttcatttaattttgtatGGTGTTTATATGATCACTGAGACACCCTTTT GAGAGGGTTTGGactaaagtttttttgttttttttactatactttttttc ttttaagtgATTGATTCCTGGGGTAAAGTTCCATCTCGTTTATTGAGCGG CAACACTCATTGGTTGGGAGCTTTCGAACAATGTCAATCAATATCACATG CCAAATACTGTGCTGTTAATATGCTGGTCATGAAAGAGGTATATTGAAAT GACGTTATTCAAAAAATAgacgtacgcttttgctaaagcGCCTCttcccc ttcactgcgtacgcaCTATATGAATGGCCCTAGTAAGCTTGTGCATCGAT GCAACTTTCTATACCCCGTTTTGACAATTTATCGATCATAATATAACGAT TGGCAGTATGAAATTCAAAAGACAATATTATGATTTGCAGCATTATTGGT TGCCTAACACTgtatactgtaaaaaatgtACTAGTAAGAAATAAGTTAAA AGCAGAGACAAGTAGCTTGCAACTGATATAACGGTGTTAGATGAGACATT TACTCTTCAAGCAATGCAGTGTTTTGTAGGTtctatgttcttatttttct aaatcGAACTCGAACTATATTTCGAACTAAAACTCGGTCTTGAGAATAGG TTGTTTATGTTTCTCTTTTCATGTTTCACAGTATCCAGGCGTTTATGGGA CATGCATGCCGAAACAATGCACCGAACATGATGTTGGATCCATCTATCAA TCCATCTTCAATAGACGTAAGTGAAATAGAAATAGGTTTGTAAGGTATTG CCAACTAAAGGAACTATCAAACTTGCTCtggttaaggagacattcgaatt ataggGGTTCGAGTAAGGGTGAGATGAAGTTAAAAGTTAATTGTTTTTTA CAATCGCACGATATCGAGTTAGTTTTTCAAATGCAtcttttccttcaatt tttcaGAGATGAAGATGGTGAAATATTTGGGCGTTGGTCATGTCAATTGT GtggatgaaaaaattgaatattctaACGGATTTATTGCAACCATGTAAGA ATTTTGATTTCTTGGAATAGTTATTATGAGTATAAACGTGAAACTTCGAT CAGATTCAGATTTCCTGGCATACTTCTATGTCTAAGGACatgtctttttt aatttgaaagaaaattgagGTAAGGGGTATGAATTTCTCCCATCAAATTA CAGCAAATTTATGTTTTACTTTTgattaaatttgttaaaaaaggtTAGTA ATTTCGCCATATTGCATATAGACAAAAGAGGTTTTAAACTTGGGACAGAG ATTTCTTGAAAATATCCAAAACTGTCTTTACCATGATCATTGatcaattt tttaatgtttttttctcagttGTCTTTGCTGtttcattcttcttttgatc ctgCTCGGAACATTTGCTGACGTCATGGACGTACGTATCGCGCCACGTGA ACGTCGTCCGTCACAAAGTAAAAATGGAAACGTCCCTCGGAGAACGGTAT CACAAGTATCAAGAAACGGCAATGGAGCTATCCCATTGGTAAAGATGACT TCTTTTCTCTCTACATCTATACATGCCTTGTTTTATCAAGTGACTTTGCT TGGAGACTTATGTTACCTTGTGCGAcccaggagaccgatatttcactGTC TCTGAGTGTGTCTATCTGTACAGGCCTTAATATATTAAGTGACGTTGCTT GGAGACTTGTGTTACCTTGCGCGAcccaggagaccgatatttcactaTCC TTGAGAGTGTCTATCTATACGGGCCTTAacttattaagtgactttgcttG GAGACTCGTGTTTACTTGCGCGACCTAGGAGACCGATATTTCATCTTTAC AGGCCTTAacttattaagtgactttgcttGGAGACTTGCGTTATCTTGCA CGACCAAGGAGACCTATTTTGAATTGTTATATTACAAGTGTAATGAAAGC GCATAGAAATAAAGCACATGCACGTCTGACGTTTCGGAAAAGTAAGACTT GAAAGTCAGTCAATTTACGAAATTTACCACAGTGAAGACCTTGACGAATT GTTTAGATCTAACAATGCATGCACGTCAGACGCTTCGGAAATGTTGGACG TGAAAGTCCGTCAATTTCGAATTTGACGGTAGCGAAAACCCGACGATTTC AGGTCTACATACATTGCGAACTTGCCGCCGAACAACAGTCCTAGATTCTA TAACtgcttttcaaaaatcattttttcattgaTAACTCAACTGACCATCA GATTTAACTCAGTTACTGAATCAATCTAGCTGAGATATTTAGGCAGACTT TGCAATCAGGAGCATCAGAGGCGCCTTTTCTCCTCCCAATTTTTTCTGCC ATAGTTGGTGGAAGGTGAAATGCTCCTTCTAGGATAAATAGCGAgttttt atgtatttgcacttttgagggtGGTAGATTGACTGAAATGATTTGGGGCA ACCTGCAGCTCTGACCCTGAAAATCGAGGACGGTTAAATTGCTGATTTAC TGACCGTCGTCCACAGGATCTAAACAATCGGAGTATAACCGTCAATCTCG TCCTCGTGTATTCCAggttttatttacgttactgataggTGCCAGATAAT ATTATCTCACGCCGTCAGTAAGCATCATAAAGCAGATACTACACAGGGAA CGTGTGTAAAGATTGGGTAACCATCTTCGTCGCAGAAAAGCACAGATACA TAGgacatttcacagtcgaaatggatcatgggtactcaggactgattgcg ccccgATATCGATTTCCCGTTGGTTAGaggcaaaaattttcaaaaatttt caaaactttggaccaatagtaagttatcattactctaaggtcccgaatag acgtcccccccccccgcttattaattttcgaaaatatttcggaccccccc gttcttattaggacccccccgtttattagtttttaagaatattttcagct gtcaaagagaaggacccttattttgctctaaatagcctgattttagcctt tatttacctaaatattttcagacccccccgtttattcagaccccccgttt attatattttgctaaaatttcggaccccccccttttattcagaccccccc tactattcgggaccttagagtagcgCGCAgcggtcctgattacccattac gctttgcgactgtgaaatggcctataaaCTCGCTAATTCTTATGCAATCT TATCGTCTAATGCAATCTATGTCATTTTTGTTACCAGGGTGACGGTGAGA ACGTGCAAATGATTGAAGTGAATGGACACGGTGGTGAAGAAGGTGACGGA GAAAATTCATTGgatgatgatgacgtcatgttGAATGATGGTGACACACC TGTCGAAGACGAACAACAAGAGAAGGAACGGAGAAAAAGTAACgcagttt ttgtttttcttgtgtTGTAGCTTTCTCTCAAGAGCTTCGTCATTTTTTAT atacctctatagatatacttcttatctataagaaacattttcgctagagg atggtCTTTACTGTAGCTTTCTTCGGACAGAATCTCATCATTTGTGATCT CCAACGATCTTTCAATGTTTGTCTAACGTCCGGGCTAACGTCATATAGCG TTGTTATTGACAAGATCTATACTTATTAGTAGCTTATCATTGCCAAAGGT ATTATGAATACCTGAATCTTTCAAGTTTCAGATTCCACACCAATCcttta aatttcaatttacCTCTTTCGAATCAATGTACAATGTCTTCATAGCTCGA ACCTGCAGgggggtactaacttttttgagttaaggaaacttagatttatg gagtaaggtttataaggcattgatGCTATGAGGGCGAGAAAACTTGTTTa ggttaaggagacattcgagttatagagattcgaattaaagagacttAACT GTATCTTATGGTCCAAACATATTTCTTGTTTTAGAAGCGGCAATTCTTCA GATTCTGCTTTGTTTCTCGTTGGCACGAAACGCGAAAGCTGTTTTCTCCA CTGAAGTACCCAAACGTGCTATTGAGTCCATTAATGGAATCAGAGCAATT AGTATGTTTTGGGTCATCCTTGGTCATCTCTTCTTCTTTGGAACTGTTAT CAAAAATCAAGGTAAGTGAAACCAAGGGGCCAGAGCTTTGAACAGGAGGA AGGTTTAGACAACAAGATGAGAACCTAAAGAATCTTTTTCGACTAATCCG AATTCGGCTTTGAGAATGaaaaaaaGCACAAGATTACACGCCCTGAAAGC TTAAAATTCACTTGACCTTTTATTGTTAAATAAATTTCCACGGTTGGATT CTTTACTTATTTAGAACCTTCGACTGGCAACAGAGCATGGATCTTGGCAA AATTGTGACCACCAAGCAATATCATCAGGAAAATTCGACATTTTACAAGA AgcatttatttcttttcatttcagaTAATCCAGTCCATACAGTGTCAATG TTGATGAGAAGGTTTTCATACCAACCGGTTGCCAATGCTTATGTTTCCGT CGATACATTCTTTGTATTAAGGTCAGTGTGATAATATTAAAGCAGATTCG TTGCCTCCTTTTCTcttctaaaattgttcttttcacTTGATAAATAATCA CGTAAGAAAAACATTAAACAAAATGTAATTTTCGCAAATGGGTTTTGTTG TGATAGAGCCTTTACAGTCTGTAGAGTTAGCGTCTttccaaaactctacc tttTGCCTAGCCTATCGAGTATACAGTATTGCGCATATATCTTTACACTT TCATCCCTTAGTCTTAGCTCAAACTGATACGGACCAGTAATGATTCGGTa actctttttttgttttttagtggTTTACTAATGTCATATTTATCACTGCG AAGAATGGATAAAACGAATGGGCAAATGAATATTGCATTACTTTATTTAC ACAGATTCATCAGGTACTACCACATAACCCTTCATTAAATGGTAATGAAT ACTCAGTAATAAAACCTTACAAGACTTCTTGGATTCTTGCTTTGCTGATC AGGAAGCTTGTTATCACAATTTGAAGTATCACTGTACtaaattttttgct tgttttttttagaatcacACCACCCTATATGTTTGTGATTCTGTTCTGGA CAAACGTGTATCCTTACATGTTCACTGGGCCATTAGCAAAACAAACACGA ATAACTGGAGACGGGGGTAATTGTGCAAAATATTGGTGGACAAACATGCT GTATTTCAATAACTTTTATCCAGAAGCCATGGGAGAAACTGTCAAAGATA AAACGGTAAGCACGAATAGTCTTGCATAGGCAAGGTTGaaagataaattt ctttgacCACCTAGATACTACCCTAAATTCAAAGTCCCGTACTTATTTAG ATaacaataaaattaaatttcctcTATTATACCTAACAACTACAGAAACT GGGAATGGGAATGTTTAGATAAGACTCCATCACTAAAACTTCGAAATTCA CCAAAGTTTCGCCATTTTGAATAGGTACGATTCTTAACAAAATGATAGAA AATGATTTCTAATTTGTTTGGACTCGTAAAGTAAAATAGCAGtttttttA TACTATCCTAGTGTCTTGGTTGGTCGTGGTACTTAGCAAACGACATGCAG TTTCACATTCTCGCGCCAGCCATCTTGTCAGCATTTTTCTTGTAAGTAtc tgaaaaatttattaaaaacttatttatttatttgaaaatatcatcGACCG GAGATCTCTCATATGAGTGATACGAGGGTGTTTGCGTGCGTTTGATGTTG GCTTTCAATATGTGATAGGTTGCAGTCTTGACCCTCAGTAAGCATTTAAA ATATCCTTTACTGAAGACTGCttgaaacggcacgaaactccgagtattcg gaaaataaatttgtctctATTCTTGACTGATATATCGCTCTACCGATGGT ATAGAACATTTTCTTGAATCGCAAGTCAGATTTGCAAATAAAAATATCCT TTATGTTTTCAGCTTAGAGAGACGTTTCAAGAACTCGAAGTTCATTCACG GAGGAGCTTTCATGATCACGCTTGTATGTTGTATCGTGACAATTGTGATC CGAATGGTATTATTAATCGTTCACGAATTCCCTGGTGTCATCAGTCTTGG CATGATGCCTGATAACCCTTATCCGTAGGTTGATTTGTTATCTGTTTTTC TTTGTCCCacatatctgtaaagcccgaagggctagataagcaactttaag ctttctccagcaaaaaaaagtgaagcaaaaatttgaatttttaaatttcg tgcgatggataggatctagcattttaattgttttcgaagcgcgagatcaa aaaaagtaggcggtaAACGCTagttcgcatctctcaaaccagtgaagcta tcacgtgatttctttggtaggaaatcctaccaaaatttgcttcacttttc gataaaggccgcgcATCTAGCCCTctgggctttacagatctgtgcaTTGT TCCCGGTGACCTGACactgaaattttcagttttaagaaTTGGATATTTTG CAAACCTTACGGGAACTGAATTTAAATCAAAAGGAAGAGCCATTAAGAGT TATTTTTATCCttatcatttcaaaaaagtccatGTCAGAATTTATATTGA TGATTATACTTGACAGAATCAAACGCCGTCAAGATAACTTATACGTCAAG CCGTACGTCCGTTTTTCGCCGTATATTATGGGAATGTTACTTGGTTACGT TTTCTCAAGAAAGATAAAGATCCCACTGAACCAAAGGGTAAATACACagt tgttttttattagaattacATAGAATTGAGCCTCGTCATTTttagttctt aatatttttagcttttaaatatttttaagtgATTCTTGCAGTGAAATAAA TAGAACCACAAAGTGCTCGGAACAAAATTAGAAgaaatttgagcaaaata tcgagattcttaatttttttaaattagagcaacaatttttttttttgatt gaggATAAAAATATATCATTCCTTCAGTATTATCTCAAACgtgcgaaaaa aattgaatgaaacaaagaaaattcaatttcaagtttcaaaaagctaaaaa tgcACAAGCCTGATTTACATTGTAGACCAATTTGAACTACATATTGACCT TCATATCTTGAAAAAGTCACTGATCATTAGGGTAAGTCCACCACTGTATT GACTAACAAGAATCTATAttttttttACAGGCTTTGAGTATTGTTTTTTG GTTGTTGGCTTTCGGATTTGGGTACGCCGTTGTTTTCGGTCCATACGTCA GTGGTTACAAAACAAAAGGTGATCACTTCAATAAAACTGAGAATGTACTG TATGGTTCACTCAATGAATTCACTTGGTCGTTAGCTGTCGTTTGGGTCTT ATACGCATGTCATAATGGATTTGCAGGTTTGTTGATatagtagagtctct ttaaatCGAACTCCTAtagctcgaatgtctccttaactcgaacaagttct ATGTTCCCTTCCCGTTCCCTTCAGGtaataaaccttactccatataacat gaaatttcattaactcgaacaaatttgcgttccccgtgcgtgttccaGTT ATGAAGGTTTTACTGTATAAGCTTTTTATACATCCTTAACATGATTCTTG ATATGTATTCTTTAACTCGTTTGCAACGTTACTCTTATTGCGGCTCCGAA TTCTCTGTCGTCTGTGGAAAAAGGATACATGAATTACCAGATCTGACAGA CTTGAAGTTACATCATTAATCTATTTAGTATGACCTGTTCAAATTCCTAC GATAtgaacttgaaaaaatgttgagcTAGGGTTAAAATAAAAGGGTTAAT ACAGGGTCATGCTTCCAAGGAGCACTGGAGCAAATCTTTCTACGAATAAT AACGTGTATGTGTCTAAAAATATCCATTCAGGCATTCAGGCAGATTGAGA TTCTTTGACAGTTTCTTTCCCTTTTTAGGCGTCATAAACAGTTTCCTCTC TTGGAGATTCTGGATCCCATTAAGTCGTTTGACGTTCGGTGCATATCTTT TACATCCTTTGGTCATCTTCTACTTTTTCCTGGTCCAAGAAAATCCTTTC CATTATCAAGATAATATCATGGTAAGTGCAACCACGACGTACCTGTATAG ACCAGCGTCCaaggtagtgaattgtgtcacttcgtagggcaccccttaga tcaggatAAGGATAATAAGGACAATTTATTTGTCAATTccacaccctatt aggagcataatatcaaagaTTTGCCCTGAGccaaggggtgccctacgaaa acctgttttaaagtcttttctgaatctcggacgctggtctagtACCTTTC GATGAGCAAGTTAGTCCTCTGCCAAAACCTTTCACTGAATACCGACTCTG AGCATTATACTTGATAGCTTGTTGCATTCTAACAAATCTTGAGGGTATAT CTCACATCTTTGTGAAGAGAGGCCTTTCTAAATGGATTATTGAAACTATC GCTGAATATCAGTCTAAATTTCAGAACTCAAATCTAAGCACGATAAAACA AAGTTTCGGTATTATATAGTTTTTGGATGTCTTTATGTCTACTTAAAGTA TAGCAGTTGATTTCGGTTGTTGAGTTTGTTTAGACcaaattacatttttg tcaTAATGATATTTTCGCGTTGACTGGTCTGTTGACTGCTCTATTTTCta attcttcttaatttttaggcATTTGTTTACATTGCgaatttgtttttctc ctttGTGATGGCTTTTATCTTGGCAATGGTGGTGGAATACCCTGTATTaa acttggaaaaattattaTTCAAACATTCATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000049_pilon:616141..626522+

>XLOC_001103 ID=XLOC_001103|Name=XLOC_001103|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5112bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:616141..626522+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgggtTTCTTCAAATATGTTATGATCACTTCAATTCTTCTGACGATTGC
GATCTCCCAAGTCAATACGCAGACATTAGAGGAAGACATAATACTcttaa
aacaagcaaaaacattacccaactttacaaacacattaaaaaagataaat
ttccaaaatatttttaaaaatgaaaccgTAAAGACATTATTATCTCCACG
ATAtaacgaaaaatatttacaagTGATGGAGAAACAGAAAAACATTTGGG
AGATAATGAATACGAATAATTTGATGACACAAATTCATTCCAAGCAAAAT
ATAACTGAGGAGAATTTTTTGAAGATGGTTTTGAAGAATATTGATGCTTT
GAAAGCTGTTAATTTAGTTGATTGgtcaacttttgtgatgcagaGTGACG
GAGatgggtTTCTTCAAATATGTTATGATCACTTCAATTCTTCTGACGAT
TGCGATCTCCCAAGTCAATACGCAGACATTAGAGGAAGACATAATACTct
taaaacaagcaaaaacattacccaactttacaaacacattaaaaaagata
aatttccaaaatatttttaaaaatgaaaccgTAAAGACATTATTATCTCC
ACGATAtaacgaaaaatatttacaagTGATGGAGAAACAGAAAAACATTT
GGGAGATAATGAATACGAATAATTTGATGACACAAATTCATTCCAAGCAA
AATATAACTGAGGAGAATTTTTTGAAGATGGTTTTGAAGAATATTGATGC
TTTGAAAGCTGTTAATTTAGTTGATTGgtcaacttttgtgatgcagaGTG
ACGGAGATGACGTTGTTTATATTCCTGGCTTACCGAAAGGTATTTCCATT
GATTGTGGAATCAGATTCGCTAAATATTTCGGTAACATTCTAACAAGCAA
TGCAACCATGTTCGATGTTCGTGATATTGGAAAAGTGTTGGCATCCCCTG
TTGGAAAAAATGACGTTGTTTATATTCCTGGCTTACCGAAAGGTATTTCC
ATTGATTGTGGAATCAGATTCGCTAAATATTTCGGTAACATTCTAACAAG
CAATGCAACCATGTTCGATGTTCGTGATATTGGAAAAGTGTTGGCATCCC
CTGTTGGAAAAAtgATTGATTCCTGGGGTAAAGTTCCATCTCGTTTATTG
AGCGGCAACACTCATTGGTTGGGAGCTTTCGAACAATGTCAATCAATATC
ACATGCCAAATACTGTGCTGTTAATATGCTGGTCATGAAAGAGtgATTGA
TTCCTGGGGTAAAGTTCCATCTCGTTTATTGAGCGGCAACACTCATTGGT
TGGGAGCTTTCGAACAATGTCAATCAATATCACATGCCAAATACTGTGCT
GTTAATATGCTGGTCATGAAAGAGTATCCAGGCGTTTATGGGACATGCAT
GCCGAAACAATGCACCGAACATGATGTTGGATCCATCTATCAATCCATCT
TCAATAGACTATCCAGGCGTTTATGGGACATGCATGCCGAAACAATGCAC
CGAACATGATGTTGGATCCATCTATCAATCCATCTTCAATAGACAGATGA
AGATGGTGAAATATTTGGGCGTTGGTCATGTCAATTGTGtggatgaaaaa
attgaatattctaACGGATTTATTGCAACCATAGATGAAGATGGTGAAAT
ATTTGGGCGTTGGTCATGTCAATTGTGtggatgaaaaaattgaatattct
aACGGATTTATTGCAACCATttGTCTTTGCTGtttcattcttcttttgat
cctgCTCGGAACATTTGCTGACGTCATGGACGTACGTATCGCGCCACGTG
AACGTCGTCCGTCACAAAGTAAAAATGGAAACGTCCCTCGGAGAACGGTA
TCACAAGTATCAAGAAACGGCAATGGAGCTATCCCATTGttGTCTTTGCT
GtttcattcttcttttgatcctgCTCGGAACATTTGCTGACGTCATGGAC
GTACGTATCGCGCCACGTGAACGTCGTCCGTCACAAAGTAAAAATGGAAA
CGTCCCTCGGAGAACGGTATCACAAGTATCAAGAAACGGCAATGGAGCTA
TCCCATTGGGTGACGGTGAGAACGTGCAAATGATTGAAGTGAATGGACAC
GGTGGTGAAGAAGGTGACGGAGAAAATTCATTGgatgatgatgacgtcat
gttGAATGATGGTGACACACCTGTCGAAGACGAACAACAAGAGAAGGAAC
GGAGAAAAAGGTGACGGTGAGAACGTGCAAATGATTGAAGTGAATGGACA
CGGTGGTGAAGAAGGTGACGGAGAAAATTCATTGgatgatgatgacgtca
tgttGAATGATGGTGACACACCTGTCGAAGACGAACAACAAGAGAAGGAA
CGGAGAAAAAAAGCGGCAATTCTTCAGATTCTGCTTTGTTTCTCGTTGGC
ACGAAACGCGAAAGCTGTTTTCTCCACTGAAGTACCCAAACGTGCTATTG
AGTCCATTAATGGAATCAGAGCAATTAGTATGTTTTGGGTCATCCTTGGT
CATCTCTTCTTCTTTGGAACTGTTATCAAAAATCAAGAAGCGGCAATTCT
TCAGATTCTGCTTTGTTTCTCGTTGGCACGAAACGCGAAAGCTGTTTTCT
CCACTGAAGTACCCAAACGTGCTATTGAGTCCATTAATGGAATCAGAGCA
ATTAGTATGTTTTGGGTCATCCTTGGTCATCTCTTCTTCTTTGGAACTGT
TATCAAAAATCAAGaTAATCCAGTCCATACAGTGTCAATGTTGATGAGAA
GGTTTTCATACCAACCGGTTGCCAATGCTTATGTTTCCGTCGATACATTC
TTTGTATTAAGaTAATCCAGTCCATACAGTGTCAATGTTGATGAGAAGGT
TTTCATACCAACCGGTTGCCAATGCTTATGTTTCCGTCGATACATTCTTT
GTATTAAGtggTTTACTAATGTCATATTTATCACTGCGAAGAATGGATAA
AACGAATGGGCAAATGAATATTGCATTACTTTATTTACACAGATTCATCA
GtggTTTACTAATGTCATATTTATCACTGCGAAGAATGGATAAAACGAAT
GGGCAAATGAATATTGCATTACTTTATTTACACAGATTCATCAGaatcac
ACCACCCTATATGTTTGTGATTCTGTTCTGGACAAACGTGTATCCTTACA
TGTTCACTGGGCCATTAGCAAAACAAACACGAATAACTGGAGACGGGGGT
AATTGTGCAAAATATTGGTGGACAAACATGCTGTATTTCAATAACTTTTA
TCCAGAAGCCATGGGAGAAACTGTCAAAGATAAAACGaatcacACCACCC
TATATGTTTGTGATTCTGTTCTGGACAAACGTGTATCCTTACATGTTCAC
TGGGCCATTAGCAAAACAAACACGAATAACTGGAGACGGGGGTAATTGTG
CAAAATATTGGTGGACAAACATGCTGTATTTCAATAACTTTTATCCAGAA
GCCATGGGAGAAACTGTCAAAGATAAAACGTGTCTTGGTTGGTCGTGGTA
CTTAGCAAACGACATGCAGTTTCACATTCTCGCGCCAGCCATCTTGTCAG
CATTTTTCTTTGTCTTGGTTGGTCGTGGTACTTAGCAAACGACATGCAGT
TTCACATTCTCGCGCCAGCCATCTTGTCAGCATTTTTCTTCTTAGAGAGA
CGTTTCAAGAACTCGAAGTTCATTCACGGAGGAGCTTTCATGATCACGCT
TGTATGTTGTATCGTGACAATTGTGATCCGAATGGTATTATTAATCGTTC
ACGAATTCCCTGGTGTCATCAGTCTTGGCATGATGCCTGATAACCCTTAT
CCCTTAGAGAGACGTTTCAAGAACTCGAAGTTCATTCACGGAGGAGCTTT
CATGATCACGCTTGTATGTTGTATCGTGACAATTGTGATCCGAATGGTAT
TATTAATCGTTCACGAATTCCCTGGTGTCATCAGTCTTGGCATGATGCCT
GATAACCCTTATCCAATCAAACGCCGTCAAGATAACTTATACGTCAAGCC
GTACGTCCGTTTTTCGCCGTATATTATGGGAATGTTACTTGGTTACGTTT
TCTCAAGAAAGATAAAGATCCCACTGAACCAAAGGAATCAAACGCCGTCA
AGATAACTTATACGTCAAGCCGTACGTCCGTTTTTCGCCGTATATTATGG
GAATGTTACTTGGTTACGTTTTCTCAAGAAAGATAAAGATCCCACTGAAC
CAAAGGGCTTTGAGTATTGTTTTTTGGTTGTTGGCTTTCGGATTTGGGTA
CGCCGTTGTTTTCGGTCCATACGTCAGTGGTTACAAAACAAAAGGTGATC
ACTTCAATAAAACTGAGAATGTACTGTATGGTTCACTCAATGAATTCACT
TGGTCGTTAGCTGTCGTTTGGGTCTTATACGCATGTCATAATGGATTTGC
AGGCTTTGAGTATTGTTTTTTGGTTGTTGGCTTTCGGATTTGGGTACGCC
GTTGTTTTCGGTCCATACGTCAGTGGTTACAAAACAAAAGGTGATCACTT
CAATAAAACTGAGAATGTACTGTATGGTTCACTCAATGAATTCACTTGGT
CGTTAGCTGTCGTTTGGGTCTTATACGCATGTCATAATGGATTTGCAGGC
GTCATAAACAGTTTCCTCTCTTGGAGATTCTGGATCCCATTAAGTCGTTT
GACGTTCGGTGCATATCTTTTACATCCTTTGGTCATCTTCTACTTTTTCC
TGGTCCAAGAAAATCCTTTCCATTATCAAGATAATATCATGGCGTCATAA
ACAGTTTCCTCTCTTGGAGATTCTGGATCCCATTAAGTCGTTTGACGTTC
GGTGCATATCTTTTACATCCTTTGGTCATCTTCTACTTTTTCCTGGTCCA
AGAAAATCCTTTCCATTATCAAGATAATATCATGgcATTTGTTTACATTG
CgaatttgtttttctcctttGTGATGGCTTTTATCTTGGCAATGGTGGTG
GAATACCCTGTATTaaacttggaaaaattattaTTCAAACATTCATGAgc
ATTTGTTTACATTGCgaatttgtttttctcctttGTGATGGCTTTTATCT
TGGCAATGGTGGTGGAATACCCTGTATTaaacttggaaaaattattaTTC
AAACATTCATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_001103XLOC_001103-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000049_pilongenomesc0000049_pilon:616141..626522 +
Properties
Property NameValue
Aaloc2443-2556:10269
Aaloc2302-2442:9531
Aaloc2104-2298:8781
Aaloc1984-2103:8218
Aaloc1822-1980:7564
Aaloc1741-1818:7162
Aaloc1549-1740:6664
Aaloc1456-1545:6422
Aaloc1360-1452:6027
Aaloc1183-1356:5537
Aaloc1030-1179:4838
Aaloc862-1029:2971
Aaloc775-858:2559
Aaloc688-771:2282
Aaloc559-687:1710
Aaloc406-555:1407
Aaloc1-402:1