XLOC_001077 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_001077
Unique NameXLOC_001077
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000538_pilon:32185..40308+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001077 ID=XLOC_001077|Name=XLOC_001077|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8124bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000538_pilon:32185..40308+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGGTTCATAAAGTGTTAAGGCTGTAAGTTCAAcaattcatttatat tttttataaggcGTGACCAGTTTAATTTGTTATTCTACGAGCCCAACTGa ccctatttttgctaaaatcaaaaaagaatttggaTTTCTACTACAATATT TTACACACtatagttatttgtaagaattaaatttgaataaagctgaaaat taattcaagaaattgaaaaatttagaaaatcaagcattccattccataca ctaagtatatgtaatcacatgataacgagtgcaattcgagaataataagt gcattttttgaattgtacgagttattatgtgattacgagctaatcgcaca atttttttactactttttccttgtctggaaaataaatcacactgaaagtt ttaaatttttctgttctctttttgttttatgtttttattgtttgcttaaa gattttctttctcaccaaaatgaatttcgaaagaATGCAATTTAAACATT CGATGaaaaaatgtatgaaaaaaCATTAAGATCAATTTTATAAACATTGG CGcgtcattgaagagtgtgattaacgattaattgctctctacatgATGCA ATTAatgattaattgctctctttgaaggcgcgccaaataagaaaaaataa ctcatcgtgcgattaaattttaaattatgaTCTTCATGGAAGataagtga atttttgatccagatattttttggaaaatatttttggtaccttaccaacc tagatgaatgaaaaatttatttttattttacctaccaacccatatttttc taatgatctgcccgtagaacaacaaaatAAATTGGTCTTGCCTAATGAAT ACTTTTTACtggtcaaaaaaaattgaatttaaaattggTCAGAAATCCTG TACAACTCCTCTCTGATACCTCTTAAAGATCTCTTTGCCATATCTTATTA 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CATTATCATGTTTTCTTAGGTCGATTCTTGAAAAACAGTTACAAGATTTC AAGATCATACCCGAAGGTTCTTTCATCAAAGATTATGATTCGTTTGAACC AATCTTTCGTAACGTTTGGGCAGATAACGCAGATATGATGGCCCATCAGT ATACTGGGACGGGCGCTCTCAAAACTGATTTCACAAGGTAACTATCGCTT TGTTATATCGTTATTTGTTTctagttttgagatttttctaaCAAACTTTG CTGGAGATTGCACCTCCTCCCGCTCAATCACGTCGCATTGCACCTCTTAA TTGCACctcttaatttttgaaatctcccgactcgaaatttgaccgagggt aatttattcagaatttcacgaaaacaagaaTGTGATTGTAAAAGGTAAAT TTCTCCCTTTTTTCCTGCACAAAGGACTGGAAGGCGAACAAAATTCGGTC TACTTCAAGATGGCTACAACTCAATGGTTCGatattacaaaaataatttc tctGATGGTTACAGACAGGTTGGT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000538_pilon:32185..40308+

>XLOC_001077 ID=XLOC_001077|Name=XLOC_001077|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2988bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000538_pilon:32185..40308+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGGTTCATAAAGTGTTAAGGCTATGGTGGTTCATAAAGTGTTAAGG
CTTTACATTGCGCCAGAAAAGTTTTACATACAGCCTTTAGGACAAGAAAG
TGCTGATGGAAGAGTGTTGGAAATTGATCGTGTTTCTCAAGAACTTCTAC
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TTGATGGACGAGTTGAAAGGTTCTTTAGAAGATATGGCGCATTTTCGAAT
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AACAAAATTCGGTCTACTTCAAGATGGCTACAACTCAATGGTTCGatatt
acaaaaataatttctctGATGGTTACAGACAGGTTGGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_001077XLOC_001077-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000538_pilongenomesc0000538_pilon:32185..40308 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1396-1494:8026
Aaloc1228-1392:7621
Aaloc1015-1224:6478
Aaloc928-1011:5925
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Aaloc667-771:4130
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Aaloc133-210:1610
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Aaloc1-24:1