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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000538_pilon:32185..40308+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_001077 ID=XLOC_001077|Name=XLOC_001077|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8124bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000538_pilon:32185..40308+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTGGTTCATAAAGTGTTAAGGCTGTAAGTTCAAcaattcatttatat
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TGAAAGGTTCTTTAGAAGATATGGCGCATTTTCGAATGAACCGCGCACGA
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TCTAGATCGAACCAACGTTGTACAGAGCCTCATAGCTAGgtaatcttttg
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GGTGATATCATCATCGCCGTGTTTAATTATCTATCAACCCTAGCTTCATA
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CGGCTCACGTCAAACCATTTAACTTTGACAAAATAAACTCAAACTAAATA
AAAGCAGGCGGTGTTAGTAGTGATTAACGCTAAAATTGTTCatggaaaat
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TTCGAAAATACTCGCAATCTTTATACAATGCAGTGTATTGTAGATATTGT
AGAAAGTTTTTCTAGAATGTGTATAGAATTAAAACTTACAATACACTGCA
TTGCCTGAAGATGGCGCCAGCATGAAACGCCGTGTAGTAATCATTAGTTT
AGTTAGTTATTAGTGGTTATCAATCTTGACTGCCGTCCAGGAggtcgggg
ttcgattcccgctcggtgctgtgattcacttggcaagtgaatgtaccttc
gcccgggcgaacccatgtcatgtgaggggaattgggtagacagaaactca
agaagCCTGTCGGTGACTGTGCTAGGTATCGATTCCACAATCCATCGTGG
ACGAGGTGAGATTGCGCTGGCCTTGTGGCTCCCTAGTGGTTCATGCTGGA
CTTAACACACTCGATCCAAAAACTGTGTGTTAGTGTCTCGCAAGCTGGTC
GCAGTATAAACCATCGCGTAGACGGTTCTAATGAGACGACTCCTAGACCG
CTCAATACGGAACCGGGTGTCCTCTGCAAAGAGCAGCCAGTCATCAGtta
gttatttatatatttcttGTTGATATCTGTCATAAAGAATGAAACCGTTT
CATTATCATGTTTTCTTAGGTCGATTCTTGAAAAACAGTTACAAGATTTC
AAGATCATACCCGAAGGTTCTTTCATCAAAGATTATGATTCGTTTGAACC
AATCTTTCGTAACGTTTGGGCAGATAACGCAGATATGATGGCCCATCAGT
ATACTGGGACGGGCGCTCTCAAAACTGATTTCACAAGGTAACTATCGCTT
TGTTATATCGTTATTTGTTTctagttttgagatttttctaaCAAACTTTG
CTGGAGATTGCACCTCCTCCCGCTCAATCACGTCGCATTGCACCTCTTAA
TTGCACctcttaatttttgaaatctcccgactcgaaatttgaccgagggt
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TACTTCAAGATGGCTACAACTCAATGGTTCGatattacaaaaataatttc
tctGATGGTTACAGACAGGTTGGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000538_pilon:32185..40308+ >XLOC_001077 ID=XLOC_001077|Name=XLOC_001077|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2988bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000538_pilon:32185..40308+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTGGTTCATAAAGTGTTAAGGCTATGGTGGTTCATAAAGTGTTAAGG CTTTACATTGCGCCAGAAAAGTTTTACATACAGCCTTTAGGACAAGAAAG TGCTGATGGAAGAGTGTTGGAAATTGATCGTGTTTCTCAAGAACTTCTAC TGATAGTTACATTGCGCCAGAAAAGTTTTACATACAGCCTTTAGGACAAG AAAGTGCTGATGGAAGAGTGTTGGAAATTGATCGTGTTTCTCAAGAACTT CTACTGATAGaaaaccaCGGACAAATCCCACCTCGAACTGCAGAAGTGAA AGAGATTTATGGTATTGTTGGAATACTCCATCTTTTAGCAGaaaaccaCG GACAAATCCCACCTCGAACTGCAGAAGTGAAAGAGATTTATGGTATTGTT GGAATACTCCATCTTTTAGCAGggCCTTATTTGGTAGTGATAACCAAAAG ACAGAGTATTGGTTTCATATTTGATGAtgagatttttcaaatgaaagatt ttgaaatcatCCCTTTCCCGAAGACAACTATGCATTTGACGGAGAGTCAG ggCCTTATTTGGTAGTGATAACCAAAAGACAGAGTATTGGTTTCATATTT GATGAtgagatttttcaaatgaaagattttgaaatcatCCCTTTCCCGAA GACAACTATGCATTTGACGGAGAGTCAGAACTCAGACAATAAGATCTTTT TACAAATGGCAAGGAATGCTTTCAAAACAGATGGATTCTATTTCTCGTAC AATTACGATATCACACACTCCATTCAAAGACTTCATAACACCAGCAATGA TTTCCAACAACTTCCCCTTTATGAAAGGAACTCAGACAATAAGATCTTTT TACAAATGGCAAGGAATGCTTTCAAAACAGATGGATTCTATTTCTCGTAC AATTACGATATCACACACTCCATTCAAAGACTTCATAACACCAGCAATGA TTTCCAACAACTTCCCCTTTATGAAAGGGCTGACCAAAGGTTTGTGTGGA ATCACCACATGTTGAGATTGTTCTCCGTTCAACCTGAGGCTGACCAAAGG TTTGTGTGGAATCACCACATGTTGAGATTGTTCTCCGTTCAACCTGAGCT TTCAGCTTACACGTTGCCACTAATGCATGGCTCTTTCAGCTTACACGTTG CCACTAATGCATGGCTTTGTGAAGATTGAAAAAGCATCCATTAAAAGTTT TATATTCGATTTCATTTTGGTGTCAAGAAGAAGTTGTTACAGGGCAGTTG TGAAGATTGAAAAAGCATCCATTAAAAGTTTTATATTCGATTTCATTTTG GTGTCAAGAAGAAGTTGTTACAGGGCAGGTACCCGATACAACATTCGAGG TTTGGATGATCAAGGCGAAGCAGCCAATTTCTGTGAAACCGAACAAATTA TCATATATAATGGTGAAGTCGCATCATACTTACAGGTACCCGATACAACA TTCGAGGTTTGGATGATCAAGGCGAAGCAGCCAATTTCTGTGAAACCGAA CAAATTATCATATATAATGGTGAAGTCGCATCATACTTACAGaCACGTGG ATCAATTCCCTTGTACTGGTCACAATACCCAACCATCAAATACAAACCTA AGCCAAAGTTGAATGCCAGCAAAAGTCACaCACGTGGATCAATTCCCTTG TACTGGTCACAATACCCAACCATCAAATACAAACCTAAGCCAAAGTTGAA TGCCAGCAAAAGTCACAGTGACGGATTCAAAAAGCATATCAACACTCAAC TAATGTTCTATGGTAAACAAATACTAGTCAATTTGAGTGACGGATTCAAA AAGCATATCAACACTCAACTAATGTTCTATGGTAAACAAATACTAGTCAA TTTGATCGATACAAAAGGTGGCGAGAAAATCCTTGGTGATCGCTTTGGTG TCGAATGTAAAAACAGTGGATATACTGATGTGCATTTGAAATCGATACAA AAGGTGGCGAGAAAATCCTTGGTGATCGCTTTGGTGTCGAATGTAAAAAC AGTGGATATACTGATGTGCATTTGAAatacATTGCGTTCGACTTTCACAA AGAGTGCAGTAAAATGCGATGGGATCGTCTTTCCTTGTTGATGGACGAGT TGAAAGGTTCTTTAGAAGATATGGCGCATTTTCGAATGAACCGCGCACGA GAAGCACTCTTGGAACAGGGTGGTGTTGTGCGCACAAATTGTATGGATTG TCTAGATCGAACCAACGTTGTACAGAGCCTCATAGCTAGatacATTGCGT TCGACTTTCACAAAGAGTGCAGTAAAATGCGATGGGATCGTCTTTCCTTG TTGATGGACGAGTTGAAAGGTTCTTTAGAAGATATGGCGCATTTTCGAAT GAACCGCGCACGAGAAGCACTCTTGGAACAGGGTGGTGTTGTGCGCACAA ATTGTATGGATTGTCTAGATCGAACCAACGTTGTACAGAGCCTCATAGCT AGGTCGATTCTTGAAAAACAGTTACAAGATTTCAAGATCATACCCGAAGG TTCTTTCATCAAAGATTATGATTCGTTTGAACCAATCTTTCGTAACGTTT GGGCAGATAACGCAGATATGATGGCCCATCAGTATACTGGGACGGGCGCT CTCAAAACTGATTTCACAAGGTCGATTCTTGAAAAACAGTTACAAGATTT CAAGATCATACCCGAAGGTTCTTTCATCAAAGATTATGATTCGTTTGAAC CAATCTTTCGTAACGTTTGGGCAGATAACGCAGATATGATGGCCCATCAG TATACTGGGACGGGCGCTCTCAAAACTGATTTCACAAGGACTGGAAGGCG AACAAAATTCGGTCTACTTCAAGATGGCTACAACTCAATGGTTCGatatt acaaaaataatttctctGATGGTTACAGACAGGTTGGTGACTGGAAGGCG AACAAAATTCGGTCTACTTCAAGATGGCTACAACTCAATGGTTCGatatt acaaaaataatttctctGATGGTTACAGACAGGTTGGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000538_pilon | genome | sc0000538_pilon:32185..40308 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1396-1494:8026 |
| Aaloc | 1228-1392:7621 |
| Aaloc | 1015-1224:6478 |
| Aaloc | 928-1011:5925 |
| Aaloc | 859-927:5747 |
| Aaloc | 772-858:4470 |
| Aaloc | 667-771:4130 |
| Aaloc | 586-663:3862 |
| Aaloc | 550-582:3488 |
| Aaloc | 490-549:3177 |
| Aaloc | 340-489:2494 |
| Aaloc | 214-339:1981 |
| Aaloc | 133-210:1610 |
| Aaloc | 28-129:1135 |
| Aaloc | 1-24:1 |
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