XLOC_000337 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_000337
Unique NameXLOC_000337
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000306_pilon:405476..414309+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000337 ID=XLOC_000337|Name=XLOC_000337|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8834bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000306_pilon:405476..414309+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atGGCATCAATATGCAGACGCATCAAAAGTAGTAAACATGTAAGTATTAG TGTCCTGTTTTTCCCCAATTTGATAGAAATACTCTGTAATACTGTAAACG CATCAGGCAAATTTCCAGGCCTTTTCTGCTACCGGGTAATGGTAGTAGGA ACTCAATCCTAATTTTTGTATATGAGCCATGAGAATCAtgacaaaaattt gatgtccTAGGCCCTTATTAACAGAAAAAGCCCATTTTGAggttaattct ttgtgttttaatagTTCTCAACTAATAACAGAGCCAACCAACTGAATTAA CAGAGCATGGGTCGATTATTTTGTTCTTCGAGCTGAATTCAAACTtaatc tttgaaataaaatcGATAGCAGCTCAATACCCTGGAAATTTTTGCCTGTA TTGTGTGAGTACTGATATCCAGgcaattaatgattttttaatacttttac CTGGGATTTCAAAGAATGTGTACCAACTTGAATCGAGATTCAGAAAAGCT AGAAATGTTATCTATCTAACCTTTTTGGTAATGGGAAAGGGAAAGGCTAC CTTAAATTATAAACTCTGAAATAAATTTGGTTCGAtcattcaaaagttat gaataaagaaaattataaaaatttctcaTTCAAAATGTAATTTTGTTTAT GACTTCTTCTAGATTTCTTTCTCGGCACTTCGCTATTTATGTTCATCAAA CATCCAACGATTACCGTGGACTGGTAACGAATCATTGAAGCAAGATGACC CTGAAATGTTTACTCTCATTGAAAAAGAAAGGTCTCGTCAAGTTAATGGC TTGGAATTGATTGCATCAGAGGTGTGTTCAATATCCTTTTTACTGACTTT TTCAAAGCGGGCTACACAGCTTTTTGTGAAATGCAATTGGCTCTTTTCGC CAATTAGACGACGGGCATTTTAGACCAATTTATGTGCGTGCCAGTGTGTG 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ACAAACAATGGCTGAAGAGATGGTCAAGCGTGGATATAACATTGTCTCTG GTAagacaatttcaggctcaaaatgAAGAATACACGGGTAGCAAAATTAT AGAAGTGcagtcaaaacatgtgattactcgaaaattttcacgtgatttta ttcccatgttacttgttTTACAGCTTACAATTAATTATTTTATTAGTGTC aaaaaaTGCCGACCAATTAGAAATAGAGGTCATGTAACATGCATATTAAA ACTTCGATTAGAAACGTGCCCTGacttcaaactttaattttgcaacccat GTATTCTTTCCTCTCATCCGTACTCCTTGCATGCCAATATCCTTTTCCGA AAATTGTGAACCTCCTTCACTAAAGTCCATTAACTATATTGGTAATATAT AATTGCCATCAGTTTTATATCTGGGTATGAATTTAACAAAGCTGATTTTT TCTACCCCGTGAACATGAGAGATGATGCCTCCTTATGGTGTACCAGCTTC AAAATGTTTGTTTGCATGCTGTGTGTTGGAGAAACTGAATTCAGttaatt gtaaaattgtaagaTCGACAATCTTTATTGAGTTGAATGATGAGATAATG TTAAAAATGATGTTTGGtttttttACAGGTGGCACTGATACCCATCTGGT GTTGGTTGACTTGCGACCAAAGGtatcttttctctttatttctCATATCC CCGAACCTTTTGGATCATAGTTTTACTACACGCGATCTTGTGAGATAAAT GAGACATGGATGTGATACagtgaagtctccataactcgaatacaCACAAG GAACACAaatctgttcgagttaaggaaaattCGAATCattgagtaaggtt tataaggcgttgttaactgaagggaccctAAAACTTGTTCGTGTTGGAGA CATTCGAGTTCAAGTGGCGCCACTGTTTACTGTTTTTCTGTTGGTATGCT GAGTATTTTCTAGTTGTTTCAATTTCTCAGTGTTTTATTTTGTAAGGAAA ACATATTGTTACTAAGAAATTACATATTTTCAGGGAATCGATGGTGCACG AACGGAGTACGTATTGGATCTTGTTCACATCACGGCCAACAAAAATACCG TACCTGGTGATAAAAGTGCAATGAAACCCAGTGGTCTTCGTTTAGGTgag gaaatatttcaatttagaaAACAATTGCTTACTCATCATCATCAAATTCG TTCAATTCTAACTGTCAAGAAGAGTAAATTGTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000306_pilon:405476..414309+

>XLOC_000337 ID=XLOC_000337|Name=XLOC_000337|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2664bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000306_pilon:405476..414309+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atGGCATCAATATGCAGACGCATCAAAAGTAGTAAACATatGGCATCAAT
ATGCAGACGCATCAAAAGTAGTAAACATATTTCTTTCTCGGCACTTCGCT
ATTTATGTTCATCAAACATCCAACGATTACCGTGGACTGGTAACGAATCA
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TCGTCAAGTTAATGGCTTGGAATTGATTGCATCAGAGATTTCTTTCTCGG
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ACAAGTGCCTATTCAAGGCTAATCGATTATAAACGATTCAAAGATGAAAG
CACAGGTCTTATTGACTATGACCAAATGGAGGAACTAGCTTGTATATTCC
GTCCCAAAATCCTGATCGCTGGTACAAGTGCCTATTCAAGGCTAATCGAT
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GTAATGCATACCTTTTAGCTGACATGGCACATATCAGTGGTCTAGTTGCT
GCAGGGgtGGTACCAAGTCCATTTGAACATGCTGATATCGTTTCAACAAC
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GAGTAAATTGTGAGGAATCGATGGTGCACGAACGGAGTACGTATTGGATC
TTGTTCACATCACGGCCAACAAAAATACCGTACCTGGTGATAAAAGTGCA
ATGAAACCCAGTGGTCTTCGTTTAGGTgaggaaatatttcaatttagaaA
ACAATTGCTTACTCATCATCATCAAATTCGTTCAATTCTAACTGTCAAGA
AGAGTAAATTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_000337XLOC_000337-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000306_pilongenomesc0000306_pilon:405476..414309 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1132-1332:8634
Aaloc1090-1131:8231
Aaloc988-1086:7551
Aaloc883-987:7010
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Aaloc1-39:1