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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000135_pilon:92604..95007- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_000282 ID=XLOC_000282|Name=XLOC_000282|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2404bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:92604..95007- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGAGGAGTGATGAGAATCTTGCTCAATTTCCTGAGCTGTCGTTGGAA
GTTGTCTTCAAAATCAATTATCATTGGTATGATTATTTTCTTTGGTGGAA
ATTATATTATTCTACGATCAATGTTTGCCCGGAATTATACTAATGAAACA
AAGGTTGGTCACAGTACTGAAGATGATGGTGTTATTGTTAAGCAGAATGT
CTATCATAATAATAGAAAAGACAATACAAATGAATTTATTGAATCTTTAG
TTGATAAAAGTCAAAATGTTGGGAATGGGAAAAGTCCACATAAATTTAAC
CGTGAAACTGAGGCACCTGTTGGAAATGAAAATCATATTGATGTTAAGAA
TGTTGATCATGAAAATAAAAAAGATGGTAAATTTAAAATTGCTTTATTGA
TAATTTCTTGTAATCGAGTCGAAGTACGGCGTTGTTTGGATAAGATTTTT
GAACACAAACCTAAAGATTATCCGATTGAAATAATTGTCAGTCAAGATTG
TGGTCACAAGGCAACAGCAGATGTTATACGGTCGTATGGTGATCGAATCA
AGTTTATTCAACAGCCTGATTTAGGCCCAGTTCATGGAGTACCTAACAAC
ATGCATCGTTTTATGGGTTATTATAAGATTTCTCGACATTTTCAGTTTGC
ACTTGGTAAAGTTTTTGAAATGACGGATAGTGATAGTGTAATTATTGTGG
AAGATGATATAGAAATAGGTATGTTTTTATTTACTTTTTACATATATTTT
CGAAATCTTTCTAGTTGAGAATTATTAATGCTTCACAACCCTTTAACTGT
CGATGTCGGCATATCCCGACATGAGCACTTTCAATTTCTTTGCGGATGTC
GGGATTTGCCGACATGGGCACTTTCCATTTCTTTGCCGCAAAATTTAACA
CTTCTACAAAGATTTTGTATTAGATGGTTTGAAATGAAAAAAGATAATAG
TTAAAAGCTTTTCTATGTTGAAAAAAATAACTATTCAACAATGTTCAACT
CAAAATTATAGTCCTTGGCTGATACTTCATATATTATTCAGAAAATGAAG
TCAAAATCGCTACCTTTTGCCTATGTCGGCATATGCCGACATCTGGCAAA
TAGGTCGAACCTTCTTTTTTTCCCGTGGCAAATAGGTCGAACCTTAAAAA
ATACGAACGGCAGTTTAAAGGGATAAAGAGACTAGTTTGAGTAAAGAAAA
CGATTTAACACAATTCACTGAATATTGCCATCCTGGATGGCATGAAACTT
TGAGTATGAAATTAACTTAAATAGTTTTCTTTACTTAAACTATAAAGCTC
TGTTATCATTAACATTGAGCACTGCTATTGGTTTTGGCTTACACAAAGCA
GTGCTTCACAAGAGATGTATTTTCATGGGTTTTTGTTACAATTTGAGAGA
ATTTACTCTTTCCTGTTGGGTTGGGTGGAGGATATATAATTTTTGAAGTG
ATCTACCAGTAAATATTTTGATTTTTCATCGCCTGGACACGTGCCTTACC
TTTGGACAAGCATCGACCTCTGAGACACTAAAATGAAATCCATGGAGCAT
TAATTCATCTAATCGATAAGGCAATTTCATAAATTTGTTCTATGCTATAT
CTTCCATCACCTAATGACGATCCATTTTGGTTTTTAAAATGTGGATTTTC
AAGATGTGTAACTGTTTGTCCAAAATAAATTGTTCATATTTATATAAAAT
CTATCATTTTTTTTCTTCTTATAGCTTCTGATTTCTTTGATTATTTCTTG
GCAACTCGGAAACTTTTAGAAGTTGATAACACTTTGTTTTGTGTGTCTGC
TTGGAATGATAATGGGAAAGAAGACTCCGTTGATCCATCTGCTATTGATG
TTTTGTACAGGTCTGACTTCTTTCCTGGACTTGGCTGGATGATGACTCGT
AAACTTTGGAATGAGATTGGGCCTAACTGGCCTAAAGGTTTTTGGGATGA
TTGGATGAGAGATCCTAAACAACGTAAAGATAGATCATGTATAAGACCAG
AGATATCACGTACAAAAACCTTTGGACGTATTGGAGTCAGTCAAGGGCAG
TTTTATGATCAATATTTAAAATATATCAGACTGAATAATCAAGCTTTTCC
ATTTCGTGATTACGATTTGAGTTATTTAATGAAATCAAAATATGATGAAG
AATTTTTAGAGAAGGTTTATACAACACCTGAAGTGGACTCCCAACAAGCT
ACATCAAAAGGAGCATCAGATGTTCGTATTACTTACAACAATCACTATGA
ATTCGAAAACTTTGCAAGACGATTTGGATTAATGTCAGATTTCAAAGCTG
GAGTACCTAGAACAGCATATCATGGTGTAGTCACTTTCTTTCGTGGTGGG
CATCGCATCTATATAGCTCCACCCAAAAATTGGAAAGGCTACAAAGAGCA
TTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000135_pilon:92604..95007- >XLOC_000282 ID=XLOC_000282|Name=XLOC_000282|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2796bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:92604..95007- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGAGGAGTGATGAGAATCTTGCTCAATTTCCTGAGCTGTCGTTGGAA GTTGTCTTCAAAATCAATTATCATTGGTATGATTATTTTCTTTGGTGGAA ATTATATTATTCTACGATCAATGTTTGCCCGGAATTATACTAATGAAACA AAGGTTGGTCACAGTACTGAAGATGATGGTGTTATTGTTAAGCAGAATGT CTATCATAATAATAGAAAAGACAATACAAATGAATTTATTGAATCTTTAG TTGATAAAAGTCAAAATGTTGGGAATGGGAAAAGTCCACATAAATTTAAC CGTGAAACTGAGGCACCTGTTGGAAATGAAAATCATATTGATGTTAAGAA TGTTGATCATGAAAATAAAAAAGATGGTAAATTTAAAATTGCTTTATTGA TAATTTCTTGTAATCGAGTCGAAGTACGGCGTTGTTTGGATAAGATTTTT GAACACAAACCTAAAGATTATCCGATTGAAATAATTGTCAGTCAAGATTG TGGTCACAAGGCAACAGCAGATGTTATACGGTCGTATGGTGATCGAATCA AGTTTATTCAACAGCCTGATTTAGGCCCAGTTCATGGAGTACCTAACAAC ATGCATCGTTTTATGGGTTATTATAAGATTTCTCGACATTTTCAGTTTGC ACTTGGTAAAGTTTTTGAAATGACGGATAGTGATAGTGTAATTATTGTGG AAGATGATATAGAAATAGATGAGAGGAGTGATGAGAATCTTGCTCAATTT CCTGAGCTGTCGTTGGAAGTTGTCTTCAAAATCAATTATCATTGGTATGA TTATTTTCTTTGGTGGAAATTATATTATTCTACGATCAATGTTTGCCCGG AATTATACTAATGAAACAAAGGTTGGTCACAGTACTGAAGATGATGGTGT TATTGTTAAGCAGAATGTCTATCATAATAATAGAAAAGACAATACAAATG AATTTATTGAATCTTTAGTTGATAAAAGTCAAAATGTTGGGAATGGGAAA AGTCCACATAAATTTAACCGTGAAACTGAGGCACCTGTTGGAAATGAAAA TCATATTGATGTTAAGAATGTTGATCATGAAAATAAAAAAGATGGTAAAT TTAAAATTGCTTTATTGATAATTTCTTGTAATCGAGTCGAAGTACGGCGT TGTTTGGATAAGATTTTTGAACACAAACCTAAAGATTATCCGATTGAAAT AATTGTCAGTCAAGATTGTGGTCACAAGGCAACAGCAGATGTTATACGGT CGTATGGTGATCGAATCAAGTTTATTCAACAGCCTGATTTAGGCCCAGTT CATGGAGTACCTAACAACATGCATCGTTTTATGGGTTATTATAAGATTTC TCGACATTTTCAGTTTGCACTTGGTAAAGTTTTTGAAATGACGGATAGTG ATAGTGTAATTATTGTGGAAGATGATATAGAAATAGCTTCTGATTTCTTT GATTATTTCTTGGCAACTCGGAAACTTTTAGAAGTTGATAACACTTTGTT TTGTGTGTCTGCTTGGAATGATAATGGGAAAGAAGACTCCGTTGATCCAT CTGCTATTGATGTTTTGTACAGGTCTGACTTCTTTCCTGGACTTGGCTGG ATGATGACTCGTAAACTTTGGAATGAGATTGGGCCTAACTGGCCTAAAGG TTTTTGGGATGATTGGATGAGAGATCCTAAACAACGTAAAGATAGATCAT GTATAAGACCAGAGATATCACGTACAAAAACCTTTGGACGTATTGGAGTC AGTCAAGGGCAGTTTTATGATCAATATTTAAAATATATCAGACTGAATAA TCAAGCTTTTCCATTTCGTGATTACGATTTGAGTTATTTAATGAAATCAA AATATGATGAAGAATTTTTAGAGAAGGTTTATACAACACCTGAAGTGGAC TCCCAACAAGCTACATCAAAAGGAGCATCAGATGTTCGTATTACTTACAA CAATCACTATGAATTCGAAAACTTTGCAAGACGATTTGGATTAATGTCAG ATTTCAAAGCTGGAGTACCTAGAACAGCATATCATGGTGTAGTCACTTTC TTTCGTGGTGGGCATCGCATCTATATAGCTCCACCCAAAAATTGGAAAGG CTACAAAGAGCATTAACTTCTGATTTCTTTGATTATTTCTTGGCAACTCG GAAACTTTTAGAAGTTGATAACACTTTGTTTTGTGTGTCTGCTTGGAATG ATAATGGGAAAGAAGACTCCGTTGATCCATCTGCTATTGATGTTTTGTAC AGGTCTGACTTCTTTCCTGGACTTGGCTGGATGATGACTCGTAAACTTTG GAATGAGATTGGGCCTAACTGGCCTAAAGGTTTTTGGGATGATTGGATGA GAGATCCTAAACAACGTAAAGATAGATCATGTATAAGACCAGAGATATCA CGTACAAAAACCTTTGGACGTATTGGAGTCAGTCAAGGGCAGTTTTATGA TCAATATTTAAAATATATCAGACTGAATAATCAAGCTTTTCCATTTCGTG ATTACGATTTGAGTTATTTAATGAAATCAAAATATGATGAAGAATTTTTA GAGAAGGTTTATACAACACCTGAAGTGGACTCCCAACAAGCTACATCAAA AGGAGCATCAGATGTTCGTATTACTTACAACAATCACTATGAATTCGAAA ACTTTGCAAGACGATTTGGATTAATGTCAGATTTCAAAGCTGGAGTACCT AGAACAGCATATCATGGTGTAGTCACTTTCTTTCGTGGTGGGCATCGCAT CTATATAGCTCCACCCAAAAATTGGAAAGGCTACAAAGAGCATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000135_pilon | genome | sc0000135_pilon:92604..95007 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 721-1398:679 |
| Aaloc | 1-717:2405 |
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