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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000093_pilon:483334..491989+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_000104 ID=XLOC_000104|Name=XLOC_000104|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8656bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:483334..491989+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGAATGGAAACTATCCTGAAACAGATTACTCCTCTGTTGGAAATAT
ATCAggtattttttttagtttttaagggGCAACAAAACTACTGCCGGTTA
ACAAGTAAATAGTTTTCACCTCCAATCTCAGGTAATCCTCTACTTTAATA
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caaattcagtatatatcacaagtgtttcaaccggtattccaacgaagcca
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aaaatttcctatatttttgacacgtAGTTCCTTCTGAAAGCtatgttgaa
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caacaacttccatcaaaatgatctgcCACAACtatgtctaccattttagc
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ATTTTCACTAGTGGGGGCAGaggctgttgtttttgtatgaagtcaTGGTG
ACCAGcgacccttgaaacccttgaaacacccttgattCTTTTCCTGCCCT
GGAAAatttccttgaaacccttgaaatgccaaattttgtggcatatttca
gccattttaactttcaggaatacaaaatttttcaaacatgaGTGTATTAG
AtgagaaaatattcttttggaacCCCTGAGATTCAAGGTGATGATATTCC
AAGCTCGTTCTTAAAGGGGTTTATCTTTTAACCCGTTAAAGTGCCACTTG
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tggaagctccggcttaagagattaaaagatgtgaaagatgagcttgttga
gttagttgtgttagaacgttgcccacaaactgctaatcagaacagatcag
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atttttacagcataaaatcaTGAGAAACACACGTATTTGAATTCAGTATA
CAATAGCAGTACAACGTACAACGCaacatcaaacttctcataaatcatgt
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gtcAGTATTCACAGCTCACCAGTCCACGACCTTTCgatagccatcttttt
ctaatattttcggccaatcaaatcacagtattatcggaatcagtgatccg
tttttgttaaatcggaatagatcatcggattagataaacagacaaaaaat
gtcttgaccctTCTtcttgtcggaagagagaattaaaggctcctaggccg
gagcaataatGATCTTCCAAACAGGATGATCTTATCATGTCTACCATTCA
AACCATGAATTTGTTctgctttaaaaaatttgatctTTAGAGTTACTTTT
AATAACACATTTAATCATAtacgtacacacttttttattataagaatatc
ttctataagaatatcagggtgaaaattggccaaattgtaagaatacccta
agaataccctgtagggtgaatttcacaaaatttgataagaatacagtttT
GGTTAACTTCCTTagttagagataaattgaaggtTTGaagaagaaatgta
attttaaggtttaaacccaaatgttcactctaaagtccaaaactcccaaa
ttgatcatttctcatgtttgtaaaaaagtctaaaGAAAGTCtagaaaagt
aagaatacgttaagaatatttcaccctcaattttggcacttttttaagaa
tacttgaccctcatccaaagtacactattcttataaaaagaaaagcgtaT
AGGTTGCAAATTGCACTGTTTGTATTTTTGTACTTTAGTGTACTCGTCCG
GACTTGGAAGCTTGTCACCTTACTTGAATGTTGACCCTTCCTTTCTACAC
CAGGTAAGATTTATTAAACAGCTACTACCACCTACTTTCAATGGCATCAA
AAGCACCAATCAAGGGTGATTGGAGCAATCTAGGAAGAAAACCTTTGAGA
GGATAGCTATCATAAGAGGATACTTTAGGTTGGTTGATGTTGTCAAAGAC
TTTACCCTAAAGGAAAGACAGAAGGTTGACTGAGTTGGCCGcttcaaatc
ttttgaaaaaggttGTAAGTGAATGCATTGGTATCCAGAGAGGGTTGACT
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GCAAAAATAAAAGGAGCACGAAATAGCCTATTTTCACGCACTTGGaggcg
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CTCATCTTAAGGCTTTTTTACTAAAATGGGACCTCGATTCATGGTAAATA
TGCCTCTGGGATGTAAGATCTAGCTTGAATACACACTGAAAGCAAGTAGT
TAACTCACTTTAATCATCAAAAACACTCAGAAAATATGCCAGAAATTGCA
ACATGAGTGAAAATTAAAGGATTCgggaatattttattttacaagcTGCG
CGAGAATTAAAGGcgcgaaaataaaaggcgcgcaaaaattaatggaatta
agATAGAGACTTGATCAATTAAATTAGAATTTAGAAACAAAGTCACATTT
GAGAATGCTTTTGTCGGCATGCCAACAACCACTAAAAAATACGCCTGTGT
TCTGTGGGCCAGGGACTAAGtttttttCCTTGTTTGCTACCAGGGGTATC
AGCAGTAGGTTCTGGTAGGTTCAACATCTCTTTAACTTTTAGGATGGTGG
AGCTGAATTCGTTTTTGCCGAGGACAGTCATAAAAAGAGAGGCTGGGGTG
AACGGATGTTTACAAGTATTGGTTGGTCATATGGGTCCGGTAAGATATGA
CGTACCTGAAAGGAACtaatttgtccaaattttgccaaaataaggTTGCC
TCACCAAAATATGAttcatttaattattttttcatcatcTGTAAAATAAC
TccctaatttcaaacttttttactaaCTTTTTTCTTGCTGTTATTTGGCA
AAGTCAGTCAATCTCTTACTAAAATATGCTCCTctccaaattatttttat
tgtatttttgttACTCACACTAAACTTAGACTTTTTCTTAGgataatatc
tttttaaatagAAATGTAAGTCCTCCATACAAATTTACTCCAAGAATCTC
ATTTCAAAGCTTtccttttttattgaaaatgaaaaattatggtctgaaaa
aaatacaagGAAATACACCCAAAAGAAACCtgttatttacaaatttttat
attCTAGGTCTTTTGGTTGGAGGAATCTGGGGTCTTGCTGAAGGCCTACG
TAGACCTGATGGTACAACATTCAAATTGCGATTGAACAGGTCTGTCTTTT
TCTCAAATGAAAGTAATTTACTCAAGGTGGTCAATGAAATTAGAAAATAG
GGTTTAGTCACAGGGTACTTGTGCCCCTAAAAGTGCCTTTGGCCCTATGT
TATGACTCgagtccaaccctgaccctaactgataataatcaaatcctgac
ccccggaaaattaTCACAGatagaaagaacgaaaaaaattgcTGATTGAC
AAACACCCTCTTGTTACTTATATCTCCAAACAAAATGTAATTAGCCATTA
TGAAAGCAAAACAGACGTTTCTTATGAAAGTATCAATTGAAATAATATGG
GTTTAATAATAATTGAGTAAATTTCACTACCTAGAAAGGTAAGAAGCACT
ATACTGTTAACCCTTGCTAATTCGAATTGAAACAGGAAGTCtaattttgt
tcaaattatagagagtatCTCAGGCTGCATCGTTTAAGGCGTGTGATAGC
ACGCGCACgcctccacacacacctaaaatctCTGAGCGGTGTGATCAATC
ACACGCCATAAATGCAAATTTCACTACTAAAGTTGTACAcagcactcctt
atcacacgcctaaattccaaaaaataaagttttgggAGTGTGATTGACCA
TACGCCTGCAtttttcaaatgacaaagccGGGTATCTTTTGAGACTTTTC
CTTCAACTGGAACTGaaaattagtttgaattatagaagGATTTGTATGAT
AGAAGTTTGAATTAGTGAGAGTCTACTGTATGTATAATAATAGTTTGGAT
CACAATTTTCGGCTGATGACTTATTAACCCCAGGCTCTACTGGTACTGAA
ATAGTTTGGTTTATATTGATGacagattgttttttatatgttttcttatt
tattttagtGTACTCAATGGGTGTACAAGAAGGGGTCCTTTTCTTGGAAA
CAGCCTTGCTGTTGTAGGTGAGTGATATGATATGGTTGTCATCACAAGTG
ATAACTAAATAAGCATTGAGATCAGCATTTGGGgtaaatttaaaagattt
tcagtgTGAATTCccttttgtaaattatgatTTTTAACTCTTTCACAGAA
GTTTTTAAGTGTATAACAGATAaggtttaaaaaagtttgaaggaCTTAGG
TATAGACATTACTAAAGATGATTTGTATAATTCCttgttttagctttatt
gtATGGTTGCACAAGTACTGCAATTGAAAAAGCTCGTGGAGTTGAAGATG
AATACAACTCAATAGCTGCGGGTGTTACAAGTGGTGTCCTTTTTAAATCA
ACGGGTATGTAAACTTAATAATTACGCATTACCTTTTAAGGAAACTATAC
TTCACTATATTTCACAGGAAGTTTTATTATCAGCTTTGGATGTCTACCGT
GAAAATTATTTCCACAAAATAAAATCCGTAAAGAAGCCTTTGAGTCTTAA
ATGTCTTAAACCATTAAAATATTTGAGTCTCAACTACAAATTTAGGTTCT
ACAAAAAGCTTATTTTATAACGTTGCAATACAAAAAGTAGTATTTTTTGG
GGGCGACAGGACAAGTTCTAGTGccaaaacaaagttttaaatCAGACAGc
cttaagattttcaaaaaatgatcagCACATTCAACAgtattgaaaatcaa
attatttttactacTAAATTATTTTCAGGTGGACCACGTGCGATTGCTAT
CGCAGGAACCATTGGTGGGGCAGCTGCGCTCATGTTTATTGCATCAAACC
GCTTATGGAACAATAGAGGACAGACCTGGAGCAAGTCACAGCCTAATTGG
GCTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:483334..491989+ >XLOC_000104 ID=XLOC_000104|Name=XLOC_000104|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1194bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:483334..491989+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGAATGGAAACTATCCTGAAACAGATTACTCCTCTGTTGGAAATAT
ATCAgATGATGAATGGAAACTATCCTGAAACAGATTACTCCTCTGTTGGA
AATATATCAgTGTACTCGTCCGGACTTGGAAGCTTGTCACCTTACTTGAA
TGTTGACCCTTCCTTTCTACACCAGTGTACTCGTCCGGACTTGGAAGCTT
GTCACCTTACTTGAATGTTGACCCTTCCTTTCTACACCAGGATGGTGGAG
CTGAATTCGTTTTTGCCGAGGACAGTCATAAAAAGAGAGGCTGGGGTGAA
CGGATGTTTACAAGTATTGGTTGGTCATATGGGTCCGGATGGTGGAGCTG
AATTCGTTTTTGCCGAGGACAGTCATAAAAAGAGAGGCTGGGGTGAACGG
ATGTTTACAAGTATTGGTTGGTCATATGGGTCCGGTCTTTTGGTTGGAGG
AATCTGGGGTCTTGCTGAAGGCCTACGTAGACCTGATGGTACAACATTCA
AATTGCGATTGAACAGGTCTTTTGGTTGGAGGAATCTGGGGTCTTGCTGA
AGGCCTACGTAGACCTGATGGTACAACATTCAAATTGCGATTGAACAGtG
TACTCAATGGGTGTACAAGAAGGGGTCCTTTTCTTGGAAACAGCCTTGCT
GTTGTAGtGTACTCAATGGGTGTACAAGAAGGGGTCCTTTTCTTGGAAAC
AGCCTTGCTGTTGTAGctttattgtATGGTTGCACAAGTACTGCAATTGA
AAAAGCTCGTGGAGTTGAAGATGAATACAACTCAATAGCTGCGGGTGTTA
CAAGTGGTGTCCTTTTTAAATCAACGGctttattgtATGGTTGCACAAGT
ACTGCAATTGAAAAAGCTCGTGGAGTTGAAGATGAATACAACTCAATAGC
TGCGGGTGTTACAAGTGGTGTCCTTTTTAAATCAACGGGTGGACCACGTG
CGATTGCTATCGCAGGAACCATTGGTGGGGCAGCTGCGCTCATGTTTATT
GCATCAAACCGCTTATGGAACAATAGAGGACAGACCTGGAGCAAGTCACA
GCCTAATTGGGCTTAAGTGGACCACGTGCGATTGCTATCGCAGGAACCAT
TGGTGGGGCAGCTGCGCTCATGTTTATTGCATCAAACCGCTTATGGAACA
ATAGAGGACAGACCTGGAGCAAGTCACAGCCTAATTGGGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000093_pilon | genome | sc0000093_pilon:483334..491989 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 472-597:8531 |
| Aaloc | 361-468:8046 |
| Aaloc | 301-357:7760 |
| Aaloc | 220-297:6810 |
| Aaloc | 121-216:6293 |
| Aaloc | 58-120:5341 |
| Aaloc | 1-54:1 |
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