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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000093_pilon:537942..543556+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_000102 ID=XLOC_000102|Name=XLOC_000102|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5615bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:537942..543556+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gaatttttgataatatttaaaGCAAACATGGAAGAAACAAGTGCTGTTGA
AAAATCAGAGAGTAAAGCAAATCTTGGAGAAGATTACTGGCTGCAAGAAT
TGGTACGTAtttttttACTATGAATTAATAAGGTTTGTCTCTCTCGTGCT
ATTTACTTTACCAGCAGCGTTTAGCAACCCTCAGGTTTTTAGGGGTACCA
AACACAATGTcttgaatgtatttttgatgttattttaaAAACCATTTACA
GGGTGCACCAGGTTGGTCTCATCTTGAGCATAGGATAAGCAAATCTAAAT
TCATTGTTATCAAAAGACTACAATGTTTGTATGTGAGCTGCCTCTTCAAT
CTAGTCATTCTTCTTTAGGGCATATTGCTTTACTGTCATCAAtaatttcc
attattttttcagTGTTTATCCAATGGACTTGACCCTAAAAGTGATTTGT
CACAGGTGGAACTGCTTGAGCTTTTTCTTAGTGTTATACCAATGGTACCA
TCATTGAATACATATCCTTCTTTAACAATTCTACGCATTGTTGGTTGTAC
gattacaaaaattgaaaatcttcaTATTGTACCTAATCTGAAGGAACTTT
GGCTTTGTGAGGGAAAAATACAGGTTTGTTCTGATATTCCATagtttact
tttgtttttatgaCAGGAAATAAGAAGTTGTTACTTTAATtccttaattt
tcatttttccatttgcAAGTGCTATTCTATAGTTTTAAAGGGTCTAATGA
TCACCCACTTCTCAAGCCCCTAACATTAGAAAATGCCTTCCTTTTCAAAG
TTGAATAATACTTAGTCGTTCGACTCACATACCACTCACATACCTTACTA
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tggattaaggtgaactttctcttgattcgattttatttttatttttttct
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TCACGTTGACAACATTAtggttgaataaaaacaaaattgaagtgatAGAG
GTACTATTGTCATCTTTAGTACTTTTGAGTTAGTAAGTTTtagcaaaatt
tgccaaaactcTTCTAGTTCTAGTCAAAATTTAATTATCTGTAAATTTTG
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ACTTACAAAATGGTAGGTCATTTGTGAAAGTTAATTCATGCCAAATTTAA
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ACTATTTTGGTTATTTGGCAAATGTTCTTCTGTCCAAAAGGTGGAAAGGC
CTCATCCTAGCAAGGTCAGAGTTAAGATAGTAATTTAAAGGTATAtcaac
aatttaattttttgatacACAGAAAGCAATTTAAGGACtaccaaaagttc
aaaatttcattcttgTACCATTTTGTAGGAAGCTTTTGACTGATTAGAAG
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ATTTCATTAAATGTCCATACAGGAGGgtagacgaaccttttcaagtcaaa
aaaaaaattcttggaaatgtgtggatttcccctggaaaatggcataattt
gaaaaaaaaacctcaaaaactttcctttcataccttaaagtatCTAAAGT
TCTTCTACCCCCtgggaattttgaaataattctttaccccccccccctct
gtaTGGATATGAAATATAATGTTGCCAAATGATGTTGTCCCACAGGTTTT
GGTAAAtgtttttctgtgttttgttgtaagaatattttattgaaatacAG
AATTATTCTTTTACTCTTTAGAATATGGAACAATTACGACAactcaaatt
tttgaatttgagtGATAATCAGATACATAGTATTGGTTAGTTGTCATCAG
tttttttGATTCATTAAAATTATAAAGTTCATGGCTCTTTGACGATTTTC
AACATTGTCTAATGTATTTGTTAGTCTCAAGATTACAATTATACGCTctg
aatttccaaaaaatacaCCTGGTCTAAATATTGAAATAcctcttaaaaat
aaaattagctCCTCACATCTCTCTCAGTATTGATATTATCTTTATTGTCT
CTATTCAGGTACATCACTAATTTGTTGTAATCTGTTAGAAGAAGTGAATC
TATCTGGCAATAGAATAAATTCTCTCAAGGTATCATTTAGTATTGTTCTT
CAATCATTTAGAAATTGAAATGCAACCCAAACCTTCCtttttttGATTAT
TGCTCAAAAAAGTAATGGAATTTAAACATGACATGAGATACATTCATGGA
ATAGTTATTATTTTAAGTATTATTTTGTAAAAGTCCCGCTCGAGTTCAAA
GAAGGAAACTTCAGACTTAAGTTTTCCTTGGTTATTATTGAATGCTACTT
CATTATTACACACACTATAGTTTTTCGACTTCTTAGTAAAACTTGACTCA
Gagtcattttcttatttaaaaatccctcagtaacatttcttttcctcttc
aaaaattttgttctcTTTTAGGATATTACCAACATCTCATGCTTGAGGAA
TCTCATAGCTTTGGATTTAAAAGATCCTATGTGTCATCCAAACCCTGTGA
CACTACTATGCAATTATTCCACCTATGTTTTGTATCATATGCCATCATTA
AAAAGATTGGATTCAGTtgatgtttcaatgaaaatgcTGAAAGAGGCTGC
TGAGGTATTTtgataccttaagtggattaattagtgtggactttttttcg
cgaaaCAAGAATCTAAAAAGTCTGTAGATTAAATCTTGCAAATCAgcctc
tttttttaaattccttttttttccctagggttttggccaaaatcttgatt
taattttttttgcaagacTAAATTCCACAAAAAGGGCCaaactcgcgaaa
attaatccacgcaaaatttaatccacttaaggtatctCCTTGTgggaact
catagaaaacaagGAAAAAGTAACTATGGTCTTTTTCTACTTTGATGTGA
TGAATTCTTGTGAAGCTAGTCTTCAATCCTGGAGAATTTTTGTGGTCTTA
ATTTCACAGATGAGTGAAAAGCAATTTTTCATGGCGATAATTTCCACGAG
GGAGTTTTCTATTCATTGAAATGAGGAAGTGTGTATTTTCTCGAGAATTA
CATTATTTGCGGATGAAgcctttttaaatttctctcTTGAGTTATTTTTG
CAGAAATACGCATAATATAATCCCCGCAATGCGCAAAAAACTTATCTCAT
CAAAGCatctaaaacacaaaaatttcaattctaaTGGTTATTAATGCATT
AGATCACCCATTATTTCTTTGATAGTCAATTTCATTGGAGAACATGGATG
ATTAGAATACAGTCCTCAATAAAAAACCTGAAATAAAATCTGCAATACAC
CCCAAAGCTTAATTTAGCAAATTCTGCAAACATTATATAGATAGCACTTA
GCAGATTGTATGGTTATGCAGGGCCCACGCTACTGAAAGggaggggccat
ggcccccctcactttttttaaatagaatttTATTGGTTAAATATCACGGT
TCATACTTTCGATAGCTTCGTTTCTAGGCAAATTCAGTCTGAAATTGCGC
TATTTAAACACTTTttctccttagtcactatatttttGGCCCCTCCATTT
TCCGGATCATGGTATGGGCCCTGTTATTTAGCTCTTATTCGTACATTTTA
TTTATCAAACTAAATCCTTTTCTCTTGCAGTCAACAGTCAATAAAAAGCG
TATCTTCTACAAGATGAGAATTCGAACCATTCAACGGGAATGTATTGAGA
TGCGTGAACAGCTTAAAGAACACCTTGAGAATCTACGTGAAGAATCTGTC
ACTAGTATTCATAAACTGTCAAATGCTACTAAAGAGGTCTGTTTACATCA
TTACTACCCCAATgatacttagactacacaatatatcgGTGATCAATATT
CAACAATTTTgcttgcggaccgtaatgtacgaagtaaacaacaggtgctc
tattataaaaaggaattttctttctgtaaacaatccccctatattgttgg
aatattgcaaatcgagctgaaaATATATTGCgaacaccttttcaatatat
taccAGCATTCAACAATATATTCTCAATATATTGcccgacaatatattgt
gtagtgtatatAGCCCTATAGAATGAGTAACTTATCAAAGTTATACTTGT
AATAAAAAGGAAAAGTTATACTGCAAATATAACTGTCTCTCAAATTAGGT
TACCCCTTTTCTTGTCATGGGTCATCAGAGCTAGTCAGTCTCACCTTATT
GTTATAGAGAAggtaaaaaatttctctttaaaaagacAACCCACTTTTTA
ccctctttaattcacaatCAAAATAGACAGGGAGAAAGTTGGCCATCTAA
ACTAGATCTTTATTACTTAACACCTATTAACCCAAAACGCCTCCAAGGAT
TTGGGTCGAGGTTATCAGGAGgcaaataccttatcggggaaaaaaatgtc
gggggaaagtgacgaaaattttgagggggtggctaaatttttccccgacg
aactttttccccgatattctaacacccgaccaaaacttttacccaatttt
tcaacccccaaccaaaattaaaatctaaattttttacacctttaataacc
gaaattagtgctttaaacgtcgaattacaagatcttttttcgcgctagtg
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gtaaatttcgtcggggaaaagtgacgaatttgaaatattagtcgggggaa
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ctaaataaaactccgacatttttttccccgataaggtattacaTTTGATG
TTAATCTTCCCTCCCTTCTTTAAAGtgttaaattcaaaactttcttatGG
TGTCGGGGTTGATACTTTTATATATTGTAATCTATCAGTtactactttaa
tcggattaaatttcgcaacgaaaaaaatcgcgaaattttctggatttaat
ttcgtaagtcagagttttgaaaaatttcacgtggatttaatttcgcgaat
aagcctgaaaacagctgaaaaatagccGTTTTTTAACACAAATGGAGACT
TCGGGCTGGTTTCTCCGCCGAAAAtgcgatttaaaaaattttgtggtgga
tttaatttgacgAGTCATAAATCTCAcgcgttttcgcgagttttaatttc
gtaaaaatggcataaattttaatctcgcgaaagttaatccgattatgTCA
ATAGACTTTAATGATGTTTTAGGGTTGTAGCAACAGCTGCTATGAATCAA
ATCATATAgttctctttctttttcagcTTGAACGTGAGCTTGATGAGTTG
TCAACTAAGCCGGAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:537942..543556+ >XLOC_000102 ID=XLOC_000102|Name=XLOC_000102|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1932bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:537942..543556+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gaatttttgataatatttaaaGCAAACATGGAAGAAACAAGTGCTGTTGA
AAAATCAGAGAGTAAAGCAAATCTTGGAGAAGATTACTGGCTGCAAGAAT
TGgaatttttgataatatttaaaGCAAACATGGAAGAAACAAGTGCTGTT
GAAAAATCAGAGAGTAAAGCAAATCTTGGAGAAGATTACTGGCTGCAAGA
ATTGTGTTTATCCAATGGACTTGACCCTAAAAGTGATTTGTCACAGGTGG
AACTGCTTGAGCTTTTTCTTAGTGTTATACCAATGGTACCATCATTGAAT
ACATATCCTTCTTTAACAATTCTACGCATTGTTGGTTGTACgattacaaa
aattgaaaatcttcaTATTGTACCTAATCTGAAGGAACTTTGGCTTTGTG
AGGGAAAAATACAGTGTTTATCCAATGGACTTGACCCTAAAAGTGATTTG
TCACAGGTGGAACTGCTTGAGCTTTTTCTTAGTGTTATACCAATGGTACC
ATCATTGAATACATATCCTTCTTTAACAATTCTACGCATTGTTGGTTGTA
CgattacaaaaattgaaaatcttcaTATTGTACCTAATCTGAAGGAACTT
TGGCTTTGTGAGGGAAAAATACAGAAACTGGAAGGGCTTGAGAAGAACAG
CAAACTGGAGAAGTTATATATGTACAAAAATGAGCTGagtaaaatagaaa
atatatcCCATTTACTCACGTTGACAACATTAtggttgaataaaaacaaa
attgaagtgatAGAGAAACTGGAAGGGCTTGAGAAGAACAGCAAACTGGA
GAAGTTATATATGTACAAAAATGAGCTGagtaaaatagaaaatatatcCC
ATTTACTCACGTTGACAACATTAtggttgaataaaaacaaaattgaagtg
atAGAGAATATGGAACAATTACGACAactcaaatttttgaatttgagtGA
TAATCAGATACATAGTATTGAATATGGAACAATTACGACAactcaaattt
ttgaatttgagtGATAATCAGATACATAGTATTGGTACATCACTAATTTG
TTGTAATCTGTTAGAAGAAGTGAATCTATCTGGCAATAGAATAAATTCTC
TCAAGGTACATCACTAATTTGTTGTAATCTGTTAGAAGAAGTGAATCTAT
CTGGCAATAGAATAAATTCTCTCAAGGATATTACCAACATCTCATGCTTG
AGGAATCTCATAGCTTTGGATTTAAAAGATCCTATGTGTCATCCAAACCC
TGTGACACTACTATGCAATTATTCCACCTATGTTTTGTATCATATGCCAT
CATTAAAAAGATTGGATTCAGTtgatgtttcaatgaaaatgcTGAAAGAG
GCTGCTGAGGATATTACCAACATCTCATGCTTGAGGAATCTCATAGCTTT
GGATTTAAAAGATCCTATGTGTCATCCAAACCCTGTGACACTACTATGCA
ATTATTCCACCTATGTTTTGTATCATATGCCATCATTAAAAAGATTGGAT
TCAGTtgatgtttcaatgaaaatgcTGAAAGAGGCTGCTGAGTCAACAGT
CAATAAAAAGCGTATCTTCTACAAGATGAGAATTCGAACCATTCAACGGG
AATGTATTGAGATGCGTGAACAGCTTAAAGAACACCTTGAGAATCTACGT
GAAGAATCTGTCACTAGTATTCATAAACTGTCAAATGCTACTAAAGAGTC
AACAGTCAATAAAAAGCGTATCTTCTACAAGATGAGAATTCGAACCATTC
AACGGGAATGTATTGAGATGCGTGAACAGCTTAAAGAACACCTTGAGAAT
CTACGTGAAGAATCTGTCACTAGTATTCATAAACTGTCAAATGCTACTAA
AGAGcTTGAACGTGAGCTTGATGAGTTGTCAACTAAGCCGGAGcTTGAAC
GTGAGCTTGATGAGTTGTCAACTAAGCCGGAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000093_pilon | genome | sc0000093_pilon:537942..543556 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 928-966:5577 |
| Aaloc | 772-927:3931 |
| Aaloc | 589-771:2722 |
| Aaloc | 520-588:2311 |
| Aaloc | 454-516:2022 |
| Aaloc | 313-453:1060 |
| Aaloc | 103-312:414 |
| Aaloc | 1-102:1 |
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