XLOC_000087 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_000087
Unique NameXLOC_000087
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000093_pilon:875656..884618+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000087 ID=XLOC_000087|Name=XLOC_000087|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8963bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:875656..884618+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGGAAAAAAGCGTTATATTTTGCAGTGatgattggtttattttattattt tcagtgagaacaaaaattggaggataattttccactggaaccatattttg gccaatttttccagtgggtctgtgagaaaggggtgtgtaAAATTACAAAG ACCTGAGTTATACGATTTACGGTTGAAATTATTATTCTGAACTTTCTGGC TGATACTGAAAATATACTTAAATCTTGACTTTTTCACTTTTAGCAATACC ATTACAGAAAATCATGACCAATAGTTTACTAGCAGTAGTTACAACAAAAT TCGGTGGGCATTTGACGTGGCTTGAAGGAATCATGCCAACTTATAAACGA TTTCCACATCGAGTCTTTGAACAATATGTTGATATCTTCTTTGGCGAAAC TAAATCTGTTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:875656..884618+

>XLOC_000087 ID=XLOC_000087|Name=XLOC_000087|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2544bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:875656..884618+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaaaacgtttACCTTTATACCAAATCATCCATTTTACAGGTCTTTAAA
AACGTTCATAATGAAATTCGAATATCTAGAAAGCCTAATCACGGTATCAA
AACAAGAGGGCGTTATCTCTTGGGCGGAAATTACAATCACCCTTGTGTGT
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ACAGaGCTATTGGTCTTAACTTCAGAGGCTGGGGACGAGGTGTTAGACTT
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GCTTGAAGGAATCATGCCAACTTATAAACGATTTCCACATCGAGTCTTTG
AACAATATGTTGATATCTTCTTTGGCGAAACTAAATCTGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_000087XLOC_000087-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:875656..884618 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1105-1272:8796
Aaloc934-1101:8167
Aaloc871-933:7812
Aaloc691-867:6254
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Aaloc1-348:1