XLOC_000016 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_000016
Unique NameXLOC_000016
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000093_pilon:505680..517950-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000016 ID=XLOC_000016|Name=XLOC_000016|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12271bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:505680..517950- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCTTCTTCTTTTTTTCTTTCAAATCAAAAAAATACTTAAAGTTATATCT GGAAGCGTTTGCGTCGCTCTTCACACATATTCTTTTCTCATGGAAATTAA TATTTCCACAAACGCAGGTTTTTCATATCATTATCTACGCGTTTACTATG GCTGCAGTGCATCGGAGATTTTTACAGAGATGGGGAGCATTACTTTTAGG CAATGATAAAATTGCAATCATACATTTTCTACAAGGACAAGGTTTACTAA GTGTTGTCAAAATGTGTCAAACTTGTGGTTCGCCGATGCAACTTGAAGCT AATAGACAATGCCGTGATGGGTTTAGATGGTAAGTTCGGATCAGGTGCAG TTAGCGTGGTCACTGGTTGGATTCTTTAGTAGTGGAGAGCACTGTTAAAG AATATAACCTAATGTCGTTTAACCTAATAATGTTATAAAATACAGACCAG AAAGTATTTCACTATTAAACAATTCAACCTAGCCATGTCCGGTTCACTGT TAAACAATCCAACCTAGTTCACTGTTAAACAATCCAACCTAGTCCACTGT TTAACAATCCAACCCAGTCCACTGTTTAACAATCCAACCTAGTTCACTGT TAAACAATCCAACCTAGTCCACTGTTTAACAATCCAACCTAGTCCACTGT TTAACAATCCAACCCAGTCCACTGTTTAACAATTTAACCTAGTCCACTGT TAAACAATCCAACCTAGTCCACTGTTTAACAATCCAACCTAGTCCACTGT TTAACAATCCAACCCAGTCCACTGTTTAACAATCCAACCCAGTCCACTGT TTAACAATTTAACCTAGTCCACTGTTAAACAATCCAACCTAGTTCACTGT TTAACAATCCAACCTAGTCCACTGTTTAACAATCCAACCTAGTTCACTGT TTAACAATCCAACCTAGTTCACTGTTTAACAATCCAACCTAGTCCACTGT 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TTCCGTGTGAATAGCGACGCAAACGCTTCCTGATATAACTTTAAGTATTT TTTTGATTTGAAAGAAAAAAAGAAGAAAAAATTGTAGACACTATTGTTAA TGCCTTTTCAATATGCATGATAAATAATAATAGTCTTTTTCTTGAACTTC ATTCTCACATTCTCAAAATGGAGTACACATATGTTTTTATTTTTTTCTTC TACTCATTTGCCGCAAGGACAAGACGCAATCTGATTGGCTAAAAGAATCT TTATATGACTTTTTAATTTTAATAGCTGACATAACTGAGAACAGATACGA TATCCGATAACAAATCACTGACAAATCATTTAGGTAAAGAGTTATGACCA ATAGAGAGTGTCCGGTTCACACCGGTAGGCTGTGTGAAAAAGCAGAAAAA GTTTAAACAAATTCCACAATACATTAAATCACACGTTGTTAGGGAGCGGT CATAAAGTATCTACTAGAGGGGGGTGGAGGATATTTTGAAAAATCCAAAA AAAAATTCGCACCCCCTCCCCTAACCTGGAAAAAATTTTCGAACCCCCCT GATAAGGCCCAATATTTTTTCGCACCCCCCCCCCCTACTAAGAAAATTTT TACGCGAAAAAGAATTCATCCAGACGCGGTACAAAGAGTATTATTTGTTT GTATGACAGTTTTTTTATGTCAAAATAAGGTAAGGGAGATAGTTTAACCC TGTTAAGTTAAAGTATAACAGTGTTAAGACAAGAATCATCAAGTGGTTTT CTCTGAGCTTCTGTAAAATTTGGAAAAAAATACGTCTTATTTTCCCCAGT AGCGACCTGGCTTAATTTTCTGGGGTTGCAAACTATGAAATTGGCGCCCC TGGTATTTTTTGTCCCTACTTGCGCCCTCCATTGTTAAGTGAAAATATTA AACTGTAAGAGCAGTATGGTTGAAAGTAACGCCCGGAATCTTTGAGTCAA 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CGCGTTTTCTTCTTTTGTATCCCCTTTTCATTTTTCTTTCTTTATTTGTT GGCTTGAACGTTAGACGTTCACATTAATAAACTTTGAGGGAGATTTCATT TCGGTCATTTGCAAATTGAAATCGTAATCATGACCTTTGAAGACATCTTA GCGATTTGTGAAGATGAGCAAGTTTTGATAAGGGAGCTGATGGATGCTGG CTTATTAGCGAGTACAAGAAAATGTATGAACCGGAGAAAACACGAAGAAG ATATTCAGATGATATTATTGCCAGATATGAAGACTTGGTAAGACGTTTTA ATTTGCTTTTGTTTACCCTGAAAAATCATTTACGTTTCTATGAAGCTCTT TCTCCTTTCATGAATCTGATAAATATCAATCTCAAAGATGTTTGATACTT TCATTTGAAGTCTTAAAAGCCTTTAAATATAAAATATATCAAGAAACAAA GTTTAATAAAATATCAACACAATATATCAGCAGTAAACAAATAACTGACG CTTAAAAGCGGCCATTTTTTAATCCCGAGTAAGTTAATTATTTTTAACTT ATTTTTTGCCTACATGTTTTTAAGGCGATGCCCAAGATGTACAAGCAAAG CTTCATTCAAGACGGGGTCGTTTTTTTCGCAAACAAATATACCACTTTCA AAATGGATTCAAGGCATTGATAGATGGGCACGCCAGATGAGCCTTAGGGT AATGATATATTTAAAATAGAGGACACAATGAAAAAAACAGACCTTTATGT CCTTCGTAAATACTAACCTGATATTCATATGCTGAATTTTCTATCGGTAC GTTTTTAAAGCTCTAAAGACACGCCATCTACGTAGGCTAGGTCATCTTTT CAAAGCCCTACCTTAAGCTTAAGTAGCTAAATGCATACCCAGCAGGCATG GGACGTTGTTTTAACGTCCAAAAAACGTTTTAAGAAATTTTAAGCCCTTA 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TTTATTGTTCTTTTTTTGAGAAAAAAAATATAAACTTAATTTCTATGCTT TCATCGCCTATGCTTTCATCAATTTGACTGGGTCAAATTGTTTAACAGTG AACCGGACATGGCTCTAGGTTGGATTGTTAAACAGTGGAAGGTTGGATTG TTAAACAGTGGACTAGGTCAAATTGTTTAACAGTGGACCGGACATGACTG TAGGTTAAATTGTTAAACAGTGGACTGTAAGTTGGATTGTTTAACAGTGG ACTAGATTAAATTGTTAAACAGTGGACTGTAGGTTGGATTGTTTAACAGT GGACTAGGTTGGATTAAACAGTGGACTGGTTGTAGGTTGGATTGTTAAAC AGTGGACTAGGTTGGATTGTTACAGTGGACTGGTGTTAAACGTGGCCTTG GTGTTAAACAGTGGACTAGGTTAAATTGTTAAACAGTGGACTGGGTTGGA TTGTTAAACAGTGGACTAGGTTGGATTGTTAAACAGTGAACTAGGTTGGA TTGTTAAACAGTTGACTAGGTTGGATTGTTAAACAGTGGACTAGGTTGGA TTGTTAAACAGTCGACTAGGTTTAGGTTAAATTGTTAAACAGTGGACTGG GTTGGATTGTTAAACAGTTGACTAGGTTGGATTGTTAAACAGTGGACTAG GTTGGATTGTTAAACAGTGGACTAGGTTGGATTGTTAAACAGTGGACTGG GTTGGATTGTTAAACAGTGGACTAGGTTGGATTGTTTAACAGTGAACCGG ACATGGCTAGGTTGAATTGTTTAATAGTGAAATACTTTCTGGTCTGTATT TTATAACATTATTAGGTTAAACGACATTAGGTTATATTCTTTAACAGTGC TCTCCACTACTAAAGAATCCAACCAGTGACCACGCTAACTGCACCTGATC CGTAAGTTCTTATGAAGAAGTTGTAATCGTACCTTTAGTTTTGAGTTATT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:505680..517950-

>XLOC_000016 ID=XLOC_000016|Name=XLOC_000016|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=720bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:505680..517950- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCTTCTTCTTTTTTTCTTTCAAATCAAAAAAATACTTAAAGTTATATCT
GGAAGCGTTTGCGTCGCTCTTCACACATATTCTTTTCTCATGGAAATTAA
TATTTCCACAAACGCAGGTTTTTCATATCATTATCTACGCGTTTACTATG
GCTGCAGTGCATCGGAGATTTTTACAGAGATGGGGAGCATTACTTTTAGG
CAATGATAAAATTGCAATCATACATTTTCTACAAGGACAAGGTTTACTAA
GTGTTGTCAAAATGTGTCAAACTTGTGGTTCGCCGATGCAACTTGAAGCT
AATAGACAATGCCGTGATGGGTTTAGATGTTCTTCTTCTTTTTTTCTTTC
AAATCAAAAAAATACTTAAAGTTATATCTGGAAGCGTTTGCGTCGCTCTT
CACACATATTCTTTTCTCATGGAAATTAATATTTCCACAAACGCAGGTTT
TTCATATCATTATCTACGCGTTTACTATGGCTGCAGTGCATCGGAGATTT
TTACAGAGATGGGGAGCATTACTTTTAGGCAATGATAAAATTGCAATCAT
ACATTTTCTACAAGGACAAGGTTTACTAAGTGTTGTCAAAATGTGTCAAA
CTTGTGGTTCGCCGATGCAACTTGAAGCTAATAGACAATGCCGTGATGGG
TTTAGATGGAGGTGTAACCGACCATGTCGCAGATGTTTGGAGGTGTAACC
GACCATGTCGCAGATGTTTG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_000016XLOC_000016-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:505680..517950 -
Properties
Property NameValue
Aaloc331-360:31
Aaloc1-327:12272