MSTRG.199.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.199.2.p1
Unique NameMSTRG.199.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000001_pilon:3705857..3741078-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.199.2.p1 ID=MSTRG.199.2.p1|Name=MSTRG.199.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=35222bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:3705857..3741078- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTGCAAGGACTCTCGAAACAAAACATCTAACAAGATGGCTTTAATGTCA AGATGTCAATTAATGTGATTAAAAAGGGTGAGTTGTAAAAATAATTACCT CTATTATTCTGAATCTGTTGCTCGTGTTTAGAATGTTAACATTTTATGTA ATAAAAAATTAAGTTTTGTATAAGAAGCACAATTGTTGTAATTTGGTTCA AATCAATGTGTATCAAATCTCTCATCTCTCTCATTGCGTCAGGGCAAAAG GTTTGTTTTTATTTTAGTTTCTTTGAAAGACCCCATCGGATTTAGGCAGG GCTGTTGGATTTAGGACGACTCACGGTAAAGAACCTCTTATAGCTTTATC TGAATAAATCTTCTTGAAAAGCTTGTCAGGTTTCATTTTGTACGTTTTTT ATCCACATGGAGACATTGAAATCACAATCACATTCAGATGGCACTTGGAA AATTCGCAAGTATGACAAAACTCCTTTAAAATCATGAAATTTATCTATTT ACCGTCAACTGCTCCAACCTGGGACTATCTTACGCAACATGGGACGGCGG CCATTCCACCACCATTTCACCGAACCTCCAAAGTCATTTGATTTGAGTTT AATGAACCGCGTATCAAAAAATACACGATTTCTCTTTCGCACTGAGTAGG TTTTTAAATCGAAATATGAAAAAAATCCATAGTGGAACACGCGTTCAGAC ACCTTCACTTCAAGATAGGCCACCATAGAATGAACTTCCTTTTATAGGAT GAACCATGTTCATGTGGCTTTCAGCCTTGCACTCCATCACAGAGCCTTTT TGAGATAATAATAATAATAATAATGTTTTACAGATTTCCAGGCCACCGTG CAAGCACATGGGCCTCTATAAATCGCTCATACATTGGTTTGGTTTATTAC AAAGGTTAACTTCAAACAGATATGCAACAATAGTGACAATTTCAATCGTA 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CGTTTTGTCAAAGCAAGCATTTAAACATTTTTTTATCTTTGTATTTCATC GCATTTTTTAAAAGGATACTAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:3705857..3741078-

>MSTRG.199.2.p1 ID=MSTRG.199.2.p1|Name=MSTRG.199.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=8715bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:3705857..3741078- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAAACGATGAAAGGCAACCTTTACTACAACCAAGACACGCGTGAATCAA
TCATGGAGGTTCATGAAGTGCACGGATGGCAGTGATTGTTTTAACCGATC
CAGTAAACGATATCAATTCCCAATGCAACCATTCATCCCGTCAACCATAT
TCGTTCAAGATTATCACCCTTTCTTACAAAAACAAGTCAACAACAACCAA
ACTTTACAACGCTCTAAATGGATCTCGATGGAGATACCGAACGACGCCGA
CTTGACGTTGAAATTACCCGTCACCATCGGTACCATTCCTTGGAAAGATA
ACAAAACTTCACAAATACAACAACAAGAAGAAGAAAAAGGACTGAAAGCG
AGGCTGGTTCAAACTATACAATATCAATCAGAAGATAACAATAAAATAAA
AGAAGTGGAGGTTATTCTAAAAGCTATCGGTGGAAACCGCATTCAGAGGA
ATCACACTAAAGTATGGGACAACCAGTTGCTATGGGTACCTTCAATACCA
CCTACAAACAAAGATGGTGATCCTAATGATATCATCAAAGTTCTATACCA
TGTACAGAAAAGTGTATCGAGTTTTACGGAGAAGATGATATGTTGGATGT
GTTTCCGTTACGGAGGGATTAGTTTGACTGCAAATATCGATCGATCAGCG
TATTGTCCTGGTGAAGCCATCGCTGTCAACTGTCGCGCTCACAACAAAGC
TAATAAAGAAATGGGCGATCTATCACATGGCACAGAATCTGGAAATGGTA
TTATCTCATTCCCCTTTAAAATGTATTTACCAGATGGCAAACTTCCTTCA
TCTTTTGAAAGCAAATTTGGTGCAGTGAGATATTGGTTAAAGGTTTCTCT
CAGTCCTGGTACTGTCAACTGTCAATATCCTTTCACCGTCTTGGAGAAAA
TCAATGTCAATGATAAGAAATATCAAATGATGACTTCAAATCAGTTAAAA
ATTGACATGATAGCAGCTGAGCAGAAAGCTGGAAAAGTGAAGATGGAAGA
AACATGTGAGCATCAGATCACCCATTTCGCTGTTCGTTTTGAAAGAAAAT
GTCGATCCTTTTTCACAGGTGAATGCATAGAGGGTTTTATTGATGTGGAT
GTTAACACAAGTCGAATATTGGAAGATATTGCATTGCTTTTTCGTGGGGA
GACGTTAGCCTGTTGGCAAGACAATGAAGAGGCTGGACAACAGAATACCA
TGCGTGTACATCGGTCCCACTGGAAAGACGAAATGATTATTTCTGAAAAA
CGATGAAAGGCAACCTTTACTACAACCAAGACACGCGTGAATCAATCATG
GAGGTTCATGAAGTGCACGGATGGCAGTGATTGTTTTAACCGATCCAGTA
AACGATATCAATTCCCAATGCAACCATTCATCCCGTCAACCATATTCGTT
CAAGATTATCACCCTTTCTTACAAAAACAAGTCAACAACAACCAAACTTT
ACAACGCTCTAAATGGATCTCGATGGAGATACCGAACGACGCCGACTTGA
CGTTGAAATTACCCGTCACCATCGGTACCATTCCTTGGAAAGATAACAAA
ACTTCACAAATACAACAACAAGAAGAAGAAAAAGGACTGAAAGCGAGGCT
GGTTCAAACTATACAATATCAATCAGAAGATAACAATAAAATAAAAGAAG
TGGAGGTTATTCTAAAAGCTATCGGTGGAAACCGCATTCAGAGGAATCAC
ACTAAAGTATGGGACAACCAGTTGCTATGGGTACCTTCAATACCACCTAC
AAACAAAGATGGTGATCCTAATGATATCATCAAAGTTCTATACCATGTAC
AGAAAAGTGTATCGAGTTTTACGGAGAAGATGATATGTTGGATGTGTTTC
CGTTACGGAGGGATTAGTTTGACTGCAAATATCGATCGATCAGCGTATTG
TCCTGGTGAAGCCATCGCTGTCAACTGTCGCGCTCACAACAAAGCTAATA
AAGAAATGGGCGATCTATCACATGGCACAGAATCTGGAAATGGTATTATC
TCATTCCCCTTTAAAATGTATTTACCAGATGGCAAACTTCCTTCATCTTT
TGAAAGCAAATTTGGTGCAGTGAGATATTGGTTAAAGGTTTCTCTCAGTC
CTGGTACTGTCAACTGTCAATATCCTTTCACCGTCTTGGAGAAAATCAAT
GTCAATGATAAGAAATATCAAATGATGACTTCAAATCAGTTAAAAATTGA
CATGATAGCAGCTGAGCAGAAAGCTGGAAAAGTGAAGATGGAAGAAACAT
GTGAGCATCAGATCACCCATTTCGCTGTTCGTTTTGAAAGAAAATGTCGA
TCCTTTTTCACAGGTGAATGCATAGAGGGTTTTATTGATGTGGATGTTAA
CACAAGTCGAATATTGGAAGATATTGCATTGCTTTTTCGTGGGGAGACGT
TAGCCTGTTGGCAAGACAATGAAGAGGCTGGACAACAGAATACCATGCGT
GTACATCGGTCCCACTGGAAAGACGAAATGATTATTTCTGAAAAACGATG
AAAGGCAACCTTTACTACAACCAAGACACGCGTGAATCAATCATGGAGGT
TCATGAAGTGCACGGATGGCAGTGATTGTTTTAACCGATCCAGTAAACGA
TATCAATTCCCAATGCAACCATTCATCCCGTCAACCATATTCGTTCAAGA
TTATCACCCTTTCTTACAAAAACAAGTCAACAACAACCAAACTTTACAAC
GCTCTAAATGGATCTCGATGGAGATACCGAACGACGCCGACTTGACGTTG
AAATTACCCGTCACCATCGGTACCATTCCTTGGAAAGATAACAAAACTTC
ACAAATACAACAACAAGAAGAAGAAAAAGGACTGAAAGCGAGGCTGGTTC
AAACTATACAATATCAATCAGAAGATAACAATAAAATAAAAGAAGTGGAG
GTTATTCTAAAAGCTATCGGTGGAAACCGCATTCAGAGGAATCACACTAA
AGTATGGGACAACCAGTTGCTATGGGTACCTTCAATACCACCTACAAACA
AAGATGGTGATCCTAATGATATCATCAAAGTTCTATACCATGTACAGAAA
AGTGTATCGAGTTTTACGGAGAAGATGATATGTTGGATGTGTTTCCGTTA
CGGAGGGATTAGTTTGACTGCAAATATCGATCGATCAGCGTATTGTCCTG
GTGAAGCCATCGCTGTCAACTGTCGCGCTCACAACAAAGCTAATAAAGAA
ATGGGCGATCTATCACATGGCACAGAATCTGGAAATGGTATTATCTCATT
CCCCTTTAAAATGTATTTACCAGATGGCAAACTTCCTTCATCTTTTGAAA
GCAAATTTGGTGCAGTGAGATATTGGTTAAAGGTTTCTCTCAGTCCTGGT
ACTGTCAACTGTCAATATCCTTTCACCGTCTTGGAGAAAATCAATGTCAA
TGATAAGAAATATCAAATGATGACTTCAAATCAGTTAAAAATTGACATGA
TAGCAGCTGAGCAGAAAGCTGGAAAAGTGAAGATGGAAGAAACATGTGAG
CATCAGATCACCCATTTCGCTGTTCGTTTTGAAAGAAAATGTCGATCCTT
TTTCACAGGTGAATGCATAGAGGGTTTTATTGATGTGGATGTTAACACAA
GTCGAATATTGGAAGATATTGCATTGCTTTTTCGTGGGGAGACGTTAGCC
TGTTGGCAAGACAATGAAGAGGCTGGACAACAGAATACCATGCGTGTACA
TCGGTCCCACTGGAAAGACGAAATGATTATTTCTGAAAAACGATGAAAGG
CAACCTTTACTACAACCAAGACACGCGTGAATCAATCATGGAGGTTCATG
AAGTGCACGGATGGCAGTGATTGTTTTAACCGATCCAGTAAACGATATCA
ATTCCCAATGCAACCATTCATCCCGTCAACCATATTCGTTCAAGATTATC
ACCCTTTCTTACAAAAACAAGTCAACAACAACCAAACTTTACAACGCTCT
AAATGGATCTCGATGGAGATACCGAACGACGCCGACTTGACGTTGAAATT
ACCCGTCACCATCGGTACCATTCCTTGGAAAGATAACAAAACTTCACAAA
TACAACAACAAGAAGAAGAAAAAGGACTGAAAGCGAGGCTGGTTCAAACT
ATACAATATCAATCAGAAGATAACAATAAAATAAAAGAAGTGGAGGTTAT
TCTAAAAGCTATCGGTGGAAACCGCATTCAGAGGAATCACACTAAAGTAT
GGGACAACCAGTTGCTATGGGTACCTTCAATACCACCTACAAACAAAGAT
GGTGATCCTAATGATATCATCAAAGTTCTATACCATGTACAGAAAAGTGT
ATCGAGTTTTACGGAGAAGATGATATGTTGGATGTGTTTCCGTTACGGAG
GGATTAGTTTGACTGCAAATATCGATCGATCAGCGTATTGTCCTGGTGAA
GCCATCGCTGTCAACTGTCGCGCTCACAACAAAGCTAATAAAGAAATGGG
CGATCTATCACATGGCACAGAATCTGGAAATGGTATTATCTCATTCCCCT
TTAAAATGTATTTACCAGATGGCAAACTTCCTTCATCTTTTGAAAGCAAA
TTTGGTGCAGTGAGATATTGGTTAAAGGTTTCTCTCAGTCCTGGTACTGT
CAACTGTCAATATCCTTTCACCGTCTTGGAGAAAATCAATGTCAATGATA
AGAAATATCAAATGATGACTTCAAATCAGTTAAAAATTGACATGATAGCA
GCTGAGCAGAAAGCTGGAAAAGTGAAGATGGAAGAAACATGTGAGCATCA
GATCACCCATTTCGCTGTTCGTTTTGAAAGAAAATGTCGATCCTTTTTCA
CAGGTGAATGCATAGAGGGTTTTATTGATGTGGATGTTAACACAAGTCGA
ATATTGGAAGATATTGCATTGCTTTTTCGTGGGGAGACGTTAGCCTGTTG
GCAAGACAATGAAGAGGCTGGACAACAGAATACCATGCGTGTACATCGGT
CCCACTGGAAAGACGAAATGATTATTTCTGAAAAACGATGAAAGGCAACC
TTTACTACAACCAAGACACGCGTGAATCAATCATGGAGGTTCATGAAGTG
CACGGATGGCAGTGATTGTTTTAACCGATCCAGTAAACGATATCAATTCC
CAATGCAACCATTCATCCCGTCAACCATATTCGTTCAAGATTATCACCCT
TTCTTACAAAAACAAGTCAACAACAACCAAACTTTACAACGCTCTAAATG
GATCTCGATGGAGATACCGAACGACGCCGACTTGACGTTGAAATTACCCG
TCACCATCGGTACCATTCCTTGGAAAGATAACAAAACTTCACAAATACAA
CAACAAGAAGAAGAAAAAGGACTGAAAGCGAGGCTGGTTCAAACTATACA
ATATCAATCAGAAGATAACAATAAAATAAAAGAAGTGGAGGTTATTCTAA
AAGCTATCGGTGGAAACCGCATTCAGAGGAATCACACTAAAGTATGGGAC
AACCAGTTGCTATGGGTACCTTCAATACCACCTACAAACAAAGATGGTGA
TCCTAATGATATCATCAAAGTTCTATACCATGTACAGAAAAGTGTATCGA
GTTTTACGGAGAAGATGATATGTTGGATGTGTTTCCGTTACGGAGGGATT
AGTTTGACTGCAAATATCGATCGATCAGCGTATTGTCCTGGTGAAGCCAT
CGCTGTCAACTGTCGCGCTCACAACAAAGCTAATAAAGAAATGGGCGATC
TATCACATGGCACAGAATCTGGAAATGGTATTATCTCATTCCCCTTTAAA
ATGTATTTACCAGATGGCAAACTTCCTTCATCTTTTGAAAGCAAATTTGG
TGCAGTGAGATATTGGTTAAAGGTTTCTCTCAGTCCTGGTACTGTCAACT
GTCAATATCCTTTCACCGTCTTGGAGAAAATCAATGTCAATGATAAGAAA
TATCAAATGATGACTTCAAATCAGTTAAAAATTGACATGATAGCAGCTGA
GCAGAAAGCTGGAAAAGTGAAGATGGAAGAAACATGTGAGCATCAGATCA
CCCATTTCGCTGTTCGTTTTGAAAGAAAATGTCGATCCTTTTTCACAGGT
GAATGCATAGAGGGTTTTATTGATGTGGATGTTAACACAAGTCGAATATT
GGAAGATATTGCATTGCTTTTTCGTGGGGAGACGTTAGCCTGTTGGCAAG
ACAATGAAGAGGCTGGACAACAGAATACCATGCGTGTACATCGGTCCCAC
TGGAAAGACGAAATGATTATTTCTGAAAAACGATGAAAGGCAACCTTTAC
TACAACCAAGACACGCGTGAATCAATCATGGAGGTTCATGAAGTGCACGG
ATGGCAGTGATTGTTTTAACCGATCCAGTAAACGATATCAATTCCCAATG
CAACCATTCATCCCGTCAACCATATTCGTTCAAGATTATCACCCTTTCTT
ACAAAAACAAGTCAACAACAACCAAACTTTACAACGCTCTAAATGGATCT
CGATGGAGATACCGAACGACGCCGACTTGACGTTGAAATTACCCGTCACC
ATCGGTACCATTCCTTGGAAAGATAACAAAACTTCACAAATACAACAACA
AGAAGAAGAAAAAGGACTGAAAGCGAGGCTGGTTCAAACTATACAATATC
AATCAGAAGATAACAATAAAATAAAAGAAGTGGAGGTTATTCTAAAAGCT
ATCGGTGGAAACCGCATTCAGAGGAATCACACTAAAGTATGGGACAACCA
GTTGCTATGGGTACCTTCAATACCACCTACAAACAAAGATGGTGATCCTA
ATGATATCATCAAAGTTCTATACCATGTACAGAAAAGTGTATCGAGTTTT
ACGGAGAAGATGATATGTTGGATGTGTTTCCGTTACGGAGGGATTAGTTT
GACTGCAAATATCGATCGATCAGCGTATTGTCCTGGTGAAGCCATCGCTG
TCAACTGTCGCGCTCACAACAAAGCTAATAAAGAAATGGGCGATCTATCA
CATGGCACAGAATCTGGAAATGGTATTATCTCATTCCCCTTTAAAATGTA
TTTACCAGATGGCAAACTTCCTTCATCTTTTGAAAGCAAATTTGGTGCAG
TGAGATATTGGTTAAAGGTTTCTCTCAGTCCTGGTACTGTCAACTGTCAA
TATCCTTTCACCGTCTTGGAGAAAATCAATGTCAATGATAAGAAATATCA
AATGATGACTTCAAATCAGTTAAAAATTGACATGATAGCAGCTGAGCAGA
AAGCTGGAAAAGTGAAGATGGAAGAAACATGTGAGCATCAGATCACCCAT
TTCGCTGTTCGTTTTGAAAGAAAATGTCGATCCTTTTTCACAGGTGAATG
CATAGAGGGTTTTATTGATGTGGATGTTAACACAAGTCGAATATTGGAAG
ATATTGCATTGCTTTTTCGTGGGGAGACGTTAGCCTGTTGGCAAGACAAT
GAAGAGGCTGGACAACAGAATACCATGCGTGTACATCGGTCCCACTGGAA
AGACGAAATGATTATTTCTGAAAAACGATGAAAGGCAACCTTTACTACAA
CCAAGACACGCGTGAATCAATCATGGAGGTTCATGAAGTGCACGGATGGC
AGTGATTGTTTTAACCGATCCAGTAAACGATATCAATTCCCAATGCAACC
ATTCATCCCGTCAACCATATTCGTTCAAGATTATCACCCTTTCTTACAAA
AACAAGTCAACAACAACCAAACTTTACAACGCTCTAAATGGATCTCGATG
GAGATACCGAACGACGCCGACTTGACGTTGAAATTACCCGTCACCATCGG
TACCATTCCTTGGAAAGATAACAAAACTTCACAAATACAACAACAAGAAG
AAGAAAAAGGACTGAAAGCGAGGCTGGTTCAAACTATACAATATCAATCA
GAAGATAACAATAAAATAAAAGAAGTGGAGGTTATTCTAAAAGCTATCGG
TGGAAACCGCATTCAGAGGAATCACACTAAAGTATGGGACAACCAGTTGC
TATGGGTACCTTCAATACCACCTACAAACAAAGATGGTGATCCTAATGAT
ATCATCAAAGTTCTATACCATGTACAGAAAAGTGTATCGAGTTTTACGGA
GAAGATGATATGTTGGATGTGTTTCCGTTACGGAGGGATTAGTTTGACTG
CAAATATCGATCGATCAGCGTATTGTCCTGGTGAAGCCATCGCTGTCAAC
TGTCGCGCTCACAACAAAGCTAATAAAGAAATGGGCGATCTATCACATGG
CACAGAATCTGGAAATGGTATTATCTCATTCCCCTTTAAAATGTATTTAC
CAGATGGCAAACTTCCTTCATCTTTTGAAAGCAAATTTGGTGCAGTGAGA
TATTGGTTAAAGGTTTCTCTCAGTCCTGGTACTGTCAACTGTCAATATCC
TTTCACCGTCTTGGAGAAAATCAATGTCAATGATAAGAAATATCAAATGA
TGACTTCAAATCAGTTAAAAATTGACATGATAGCAGCTGAGCAGAAAGCT
GGAAAAGTGAAGATGGAAGAAACATGTGAGCATCAGATCACCCATTTCGC
TGTTCGTTTTGAAAGAAAATGTCGATCCTTTTTCACAGGTGAATGCATAG
AGGGTTTTATTGATGTGGATGTTAACACAAGTCGAATATTGGAAGATATT
GCATTGCTTTTTCGTGGGGAGACGTTAGCCTGTTGGCAAGACAATGAAGA
GGCTGGACAACAGAATACCATGCGTGTACATCGGTCCCACTGGAAAGACG
AAATGATTATTTCTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.199MSTRG.199Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.199.2.p1MSTRG.199.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.199.2.p1.exon8MSTRG.199.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.199.2.p1.exon7MSTRG.199.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.199.2.p1.exon6MSTRG.199.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.199.2.p1.exon5MSTRG.199.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.199.2.p1.exon4MSTRG.199.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.199.2.p1.exon3MSTRG.199.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.199.2.p1.exon2MSTRG.199.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.199.2.p1.exon1MSTRG.199.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001_pilongenomesc0000001_pilon:3705857..3741078 -