MSTRG.19881.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.19881.1.p1
Unique NameMSTRG.19881.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000234_pilon:506515..521076-

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.19881.1.p1 ID=MSTRG.19881.1.p1|Name=MSTRG.19881.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14562bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000234_pilon:506515..521076- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATCCTTAGTGGAACAATCGCGAATGTCTGGAACGAAGAAGACCAAATTA GTGGCAAAACGATGGAGCGTTTGACGTCACTCGGGCGGCAAGTTACACAC TCATTATTTGTTAATCCCATTCGGCGATAGGCGGTTAGGCGGCGGGTGTT CTCTAATTCTCCAGTCTGGAAATTAAATAGGCCTGAAATAGGCCTTTTCA TTAATTATTTTGCTTGCACGACTGCCTTGTTTTGAAATCATTACCAAGAT GATCAAATCTCTTGTTTATTCAAGTGTTACTTTTTAAATAGAGTGAACTT ATTTTGAATCGCCGTGAACTTCTCTGGGAATCAATTAACAACGAGGTAAC CGTTTTCCATGACGTAATTTATGAAAAGGTCTATTTAGAGGGAAGATGAA AATATCGTCCATTACTTTCGAGATATTATTTTCGCAACATTTTGCTTTAA CACTATCTCCCCCGATGTAACAAGGAAAAAAGTATTGCAAAAATTATCAT AATGAGCTTACCCACTGCACTGTAGGCATCCCCTCTGATATGTTTTGATA TAGATGATGCGTATCGTGTATACAATTCCTGTCTGACAGTTACTGCTTCA TTTTTCTTAAAAAGGCTCAGAAATCCAATGATTGTATTAACCCCTAGTCA TTCAAATTTTCAATTCAAATTTAATGAAATTTAAAGATTTCTCATATAAT AAAACTTACTAATCAAGCTAATCAAGTTTCTAAAAGTCAAAAATATAAAG ATGGGGTAACTCTCAGACGGGAATTTTTTACACGATACGCATTCCCTATA TCAAAACATTTCAGAGGAGATACGCGCAGCCTAGTCATACTTCTCACTTC ATCGGAATCTAAAAGTGAAATAAGATATGTGTCCCACAAAAACAAATACA CGACCTCATTTTGATATTAGCAAATCTGAATATTTAGCACAGCAATTTCC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000234_pilon:506515..521076-

>MSTRG.19881.1.p1 ID=MSTRG.19881.1.p1|Name=MSTRG.19881.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=36423bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000234_pilon:506515..521076- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CATCACTGTGACGGATTTCCTTGCATCGAATCTGTTGATACTCCTGATGT
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GGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAATAGTGACGCGACTGGATGGA
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TGGTTACTAAGGGCGCTAAACTCCATATCAAAAATGCTCGTGATTTTGTA
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AATTATGATTACGATGCACCAGTATCTGAAGGAGGCGATTTAAACACCAA
GAAATATAACCTCTTCAAGAAAACCATTCAACATTATACCACGAAAGGAG
GGACGAATTTCGGATTTTATAACGGTGCAAATGCCAATGACGATGGATCT
AATTACCAATGTGATATCACCAGTTATGCCGAACAAACCAGTGTTTGTGA
CGGAATTTTGGGATGGTTGGTTCACTCATTGGGGAGAGCAATACCATTAT
GTTGGTGCTGAAAGGTTAACAAAAACATTGGATTACATGCTGAAACATGG
ATACTCTGTTAACTTCTATATGTTTCATGTTTTCCAGACAATCAACTTTA
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AGACGACATGGACTTCATGAACTGCATTTCATTTGTGATAATATGGAGGG
AATTGGGAATTACGAAATGAAAGAGCAAGCATTCAAAGGGAGGTCCAATC
ATAGCTTTCCAAGTCGAAAATGAGTATGGCTCATTTGGCACAGATGGGAA
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ATAAGGTCATTATATTCTGGTTTTACAACAGCTGTTACTCGCTATTTCAA
TCATTTGCTCCCTATACTAGAGCCATATCAGAATGTTTATGGACCTGCTC
AAATCTAATGACATGTATGCAGTAATGAGACCTGGACCTTACATTTGCTC
AGAATGGGATCTTGGTGGTCTTCCAAGATACATACCCTGGAATCTACATG
AACCCCAGCCTGGGAAATTCTCAACAACATATGCAAAGCAATTAAGTAAC
ATGGCAGAGAAAACATCACATACATCATCATTGAAAATCAAAGGGAAAGA
TTTTGTCTTGGAAGGTAAACCATTTCAGATTCTCTGTGGTGCAATACATT
ATTTTCGAATCACACCTGACTCTTGGGATGATCGAATCAAGAAAGCCAAA
GGAATGGGATTGAACAGTGTTGACATATTCAACATGACATCCTGATTAGC
AAAAGGTGTATTACCAGGGTTGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGTTAACGGT
AAAAATCTTGGTCGTTATTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACACTTTACGT
TCCAAAACAGTGGTTGAAGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTCTTTGATT
TGCACGGTGAGCAGTCCCATCACTGTGACGGATTTCCTTGCATCGAATCT
GTTGATACTCCTGATGTTGGAGCCAAAAAAGAATTCCACATTTGAGCTTG
AGAATAATCCAACACTATGGGAGCCATCGGATGGTGAAAAGGAGAACTCA
CAACCTACACTTTATAAAGGTTTCCTAAACATTGATGGTCCTCCGAAAGA
TACATACTTTAAAACGAGGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAATAG
TGACGCGACTGGATGGACCATATACCCTTTACAATTTGACGAAGATCTTG
TTTCAAAACTGGGTCAGCAAACAACATCAAGATTCTAGTGGAAAATGCAG
GACGTGTTAATTATGGAAAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGGTTTTGAT
TAACGATCGATTGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCAATTACCG
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TGTTGTGTATGAGACGGTGGTTACTAAGGGCGCTAAACTCCATATCAAAA
ATGCTCGTGATTTTGTATTCGCAATATTGAACTGAAATATCAAACGACTC
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GGCGATTTAAACACCAAGAAATATAACCTCTTCAAGAAAACCATTCAACA
TTATACCACGAAAGGAGGGACGAATTTCGGATTTTATAACGGTGCAAATG
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CAAACCAGTGTTTGTGACGGAATTTTGGGATGGTTGGTTCACTCATTGGG
GAGAGCAATACCATTATGTTGGTGCTGAAAGGTTAACAAAAACATTGGAT
TACATGCTGAAACATGGATACTCTGTTAACTTCTATATGTTTCATGTTTT
CCAGACAATCAACTTTATGACAAAAGCAGAAGAAGCTGTTGGAAAACTGT
TGGAAATACAGGAATTCAGACGACATGGACTTCATGAACTGCATTTCATT
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CAAAGGGAGGTCCAATCATAGCTTTCCAAGTCGAAAATGAGTATGGCTCA
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GAAAATGAGTATGGCTCATTTGGCACAGATGGGAAGTATATGGATTTCAT
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TCAAGAAAACCATTCAACATTATACCACGAAAGGAGGGACGAATTTCGGA
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TCATGAACTGCATTTCATTTGTGATAATATGGAGGGAATTGGGAATTACG
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CGAAAATGAGTATGGCTCATTTGGCACAGATGGGAAGTATATGGATTTCA
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GTATGCAGTAATGAGACCTGGACCTTACATTTGCTCAGAATGGGATCTTG
GTGGTCTTCCAAGATACATACCCTGGAATCTACATGAACCCCAGCCTGGG
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CAGGGTTGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGTTAACGGTAAAAATCTTGGTCG
TTATTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACACTTTACGTTCCAAAACAGTGGT
TGAAGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTCTTTGATTTGCACGGTGAGCAG
TCCCATCACTGTGACGGATTTCCTTGCATCGAATCTGTTGATACTCCTGA
TGTTGGAGCCAAAAAAGAATTCCACATTTGAGCTTGAGAATAATCCAACA
CTATGGGAGCCATCGGATGGTGAAAAGGAGAACTCACAACCTACACTTTA
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CGAGGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAATAGTGACGCGACTGGAT
GGACCATATACCCTTTACAATTTGACGAAGATCTTGTTTCAAAACTGGGT
CAGCAAACAACATCAAGATTCTAGTGGAAAATGCAGGACGTGTTAATTAT
GGAAAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGGTTTTGATTAACGATCGATTGG
TCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCAATTACCGTCAACGTTGAAGGT
TATATACGGCATAAAGAGGTTCGTGAGGCGATTTGTAACATGGAATCAGT
CAAAATGGCTGATGGCTCAAGTCAACAATACGGTTATGTTGTGTATGAGA
CGGTGGTTACTAAGGGCGCTAAACTCCATATCAAAAATGCTCGTGATTTT
GTATTCGCAATATTGAACTGAAATATCAAACGACTCTATCTCAATTGCTT
AAAGACTCAGATATGAACCTGAGAAACAGTCCTTTGATGAGAATTATAAA
CATAATTATGATTACGATGCACCAGTATCTGAAGGAGGCGATTTAAACAC
CAAGAAATATAACCTCTTCAAGAAAACCATTCAACATTATACCACGAAAG
GAGGGACGAATTTCGGATTTTATAACGGTGCAAATGCCAATGACGATGGA
TCTAATTACCAATGTGATATCACCAGTTATGCCGAACAAACCAGTGTTTG
TGACGGAATTTTGGGATGGTTGGTTCACTCATTGGGGAGAGCAATACCAT
TATGTTGGTGCTGAAAGGTTAACAAAAACATTGGATTACATGCTGAAACA
TGGATACTCTGTTAACTTCTATATGTTTCATGTTTTCCAGACAATCAACT
TTATGACAAAAGCAGAAGAAGCTGTTGGAAAACTGTTGGAAATACAGGAA
TTCAGACGACATGGACTTCATGAACTGCATTTCATTTGTGATAATATGGA
GGGAATTGGGAATTACGAAATGAAAGAGCAAGCATTCAAAGGGAGGTCCA
ATCATAGCTTTCCAAGTCGAAAATGAGTATGGCTCATTTGGCACAGATGG
GAAGTATATGGATTTCATTCAAAACCTGGCTGTTATCTGATGATAGTATG
AAGATAAGGTCATTATATTCTGGTTTTACAACAGCTGTTACTCGCTATTT
CAATCATTTGCTCCCTATACTAGAGCCATATCAGAATGTTTATGGACCTG
CTCAAATCTAATGACATGTATGCAGTAATGAGACCTGGACCTTACATTTG
CTCAGAATGGGATCTTGGTGGTCTTCCAAGATACATACCCTGGAATCTAC
ATGAACCCCAGCCTGGGAAATTCTCAACAACATATGCAAAGCAATTAAGT
AACATGGCAGAGAAAACATCACATACATCATCATTGAAAATCAAAGGGAA
AGATTTTGTCTTGGAAGGTAAACCATTTCAGATTCTCTGTGGTGCAATAC
ATTATTTTCGAATCACACCTGACTCTTGGGATGATCGAATCAAGAAAGCC
AAAGGAATGGGATTGAACAGTGTTGACATATTCAACATGACATCCTGATT
AGCAAAAGGTGTATTACCAGGGTTGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGTTAAC
GGTAAAAATCTTGGTCGTTATTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACACTTTA
CGTTCCAAAACAGTGGTTGAAGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTCTTTG
ATTTGCACGGTGAGCAGTCCCATCACTGTGACGGATTTCCTTGCATCGAA
TCTGTTGATACTCCTGATGTTGGAGCCAAAAAAGAATTCCACATTTGAGC
TTGAGAATAATCCAACACTATGGGAGCCATCGGATGGTGAAAAGGAGAAC
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AGATACATACTTTAAAACGAGGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAA
TAGTGACGCGACTGGATGGACCATATACCCTTTACAATTTGACGAAGATC
TTGTTTCAAAACTGGGTCAGCAAACAACATCAAGATTCTAGTGGAAAATG
CAGGACGTGTTAATTATGGAAAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGGTTTT
GATTAACGATCGATTGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCAATTA
CCGTCAACGTTGAAGGTTATATACGGCATAAAGAGGTTCGTGAGGCGATT
TGTAACATGGAATCAGTCAAAATGGCTGATGGCTCAAGTCAACAATACGG
TTATGTTGTGTATGAGACGGTGGTTACTAAGGGCGCTAAACTCCATATCA
AAAATGCTCGTGATTTTGTATTCGCAATATTGAACTGAAATATCAAACGA
CTCTATCTCAATTGCTTAAAGACTCAGATATGAACCTGAGAAACAGTCCT
TTGATGAGAATTATAAACATAATTATGATTACGATGCACCAGTATCTGAA
GGAGGCGATTTAAACACCAAGAAATATAACCTCTTCAAGAAAACCATTCA
ACATTATACCACGAAAGGAGGGACGAATTTCGGATTTTATAACGGTGCAA
ATGCCAATGACGATGGATCTAATTACCAATGTGATATCACCAGTTATGCC
GAACAAACCAGTGTTTGTGACGGAATTTTGGGATGGTTGGTTCACTCATT
GGGGAGAGCAATACCATTATGTTGGTGCTGAAAGGTTAACAAAAACATTG
GATTACATGCTGAAACATGGATACTCTGTTAACTTCTATATGTTTCATGT
TTTCCAGACAATCAACTTTATGACAAAAGCAGAAGAAGCTGTTGGAAAAC
TGTTGGAAATACAGGAATTCAGACGACATGGACTTCATGAACTGCATTTC
ATTTGTGATAATATGGAGGGAATTGGGAATTACGAAATGAAAGAGCAAGC
ATTCAAAGGGAGGTCCAATCATAGCTTTCCAAGTCGAAAATGAGTATGGC
TCATTTGGCACAGATGGGAAGTATATGGATTTCATTCAAAACCTGGCTGT
TATCTGATGATAGTATGAAGATAAGGTCATTATATTCTGGTTTTACAACA
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GAATGTTTATGGACCTGCTCAAATCTAATGACATGTATGCAGTAATGAGA
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GGTGTTATTTTCGTTAACGGTAAAAATCTTGGTCGTTATTGGAAACGTGG
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GGATTTCCTTGCATCGAATCTGTTGATACTCCTGATGTTGGAGCCAAAAA
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TGCTCAAATCTAATGACATGTATGCAGTAATGAGACCTGGACCTTACATT
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ACATGAACCCCAGCCTGGGAAATTCTCAACAACATATGCAAAGCAATTAA
GTAACATGGCAGAGAAAACATCACATACATCATCATTGAAAATCAAAGGG
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TGATTTGCACGGTGAGCAGTCCCATCACTGTGACGGATTTCCTTGCATCG
AATCTGTTGATACTCCTGATGTTGGAGCCAAAAAAGAATTCCACATTTGA
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TTGATTAACGATCGATTGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCAAT
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CAACATTATACCACGAAAGGAGGGACGAATTTCGGATTTTATAACGGTGC
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TGGATTACATGCTGAAACATGGATACTCTGTTAACTTCTATATGTTTCAT
GTTTTCCAGACAATCAACTTTATGACAAAAGCAGAAGAAGCTGTTGGAAA
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TCATTTGTGATAATATGGAGGGAATTGGGAATTACGAAATGAAAGAGCAA
GCATTCAAAGGGAGGTCCAATCATAGCTTTCCAAGTCGAAAATGAGTATG
GCTCATTTGGCACAGATGGGAAGTATATGGATTTCATTCAAAACCTGGCT
GTTATCTGATGATAGTATGAAGATAAGGTCATTATATTCTGGTTTTACAA
CAGCTGTTACTCGCTATTTCAATCATTTGCTCCCTATACTAGAGCCATAT
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GTCCTCAATTTACACTTTACGTTCCAAAACAGTGGTTGAAGAGTGGGATT
AATACTGTTCTGGTCTTTGATTTGCACGGTGAGCAGTCCCATCACTGTGA
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GGATGGTGAAAAGGAGAACTCACAACCTACACTTTATAAAGGTTTCCTAA
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GCTCAAGTCAACAATACGGTTATGTTGTGTATGAGACGGTGGTTACTAAG
GGCGCTAAACTCCATATCAAAAATGCTCGTGATTTTGTATTCGCAATATT
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CGATGCACCAGTATCTGAAGGAGGCGATTTAAACACCAAGAAATATAACC
TCTTCAAGAAAACCATTCAACATTATACCACGAAAGGAGGGACGAATTTC
GGATTTTATAACGGTGCAAATGCCAATGACGATGGATCTAATTACCAATG
TGATATCACCAGTTATGCCGAACAAACCAGTGTTTGTGACGGAATTTTGG
GATGGTTGGTTCACTCATTGGGGAGAGCAATACCATTATGTTGGTGCTGA
AAGGTTAACAAAAACATTGGATTACATGCTGAAACATGGATACTCTGTTA
ACTTCTATATGTTTCATGTTTTCCAGACAATCAACTTTATGACAAAAGCA
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ACTTCATGAACTGCATTTCATTTGTGATAATATGGAGGGAATTGGGAATT
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TCATTCAAAACCTGGCTGTTATCTGATGATAGTATGAAGATAAGGTCATT
ATATTCTGGTTTTACAACAGCTGTTACTCGCTATTTCAATCATTTGCTCC
CTATACTAGAGCCATATCAGAATGTTTATGGACCTGCTCAAATCTAATGA
CATGTATGCAGTAATGAGACCTGGACCTTACATTTGCTCAGAATGGGATC
TTGGTGGTCTTCCAAGATACATACCCTGGAATCTACATGAACCCCAGCCT
GGGAAATTCTCAACAACATATGCAAAGCAATTAAGTAACATGGCAGAGAA
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AAGGTAAACCATTTCAGATTCTCTGTGGTGCAATACATTATTTTCGAATC
ACACCTGACTCTTGGGATGATCGAATCAAGAAAGCCAAAGGAATGGGATT
GAACAGTGTTGACATATTCAACATGACATCCTGATTAGCAAAAGGTGTAT
TACCAGGGTTGGTTCAAGGGTGTTATTTTCGTTAACGGTAAAAATCTTGG
TCGTTATTGGAAACGTGGTCCTCAATTTACACTTTACGTTCCAAAACAGT
GGTTGAAGAGTGGGATTAATACTGTTCTGGTCTTTGATTTGCACGGTGAG
CAGTCCCATCACTGTGACGGATTTCCTTGCATCGAATCTGTTGATACTCC
TGATGTTGGAGCCAAAAAAGAATTCCACATTTGAGCTTGAGAATAATCCA
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TTATAAAGGTTTCCTAAACATTGATGGTCCTCCGAAAGATACATACTTTA
AAACGAGGGAATTCTTGGTGGAGTGACATTAGATAATAGTGACGCGACTG
GATGGACCATATACCCTTTACAATTTGACGAAGATCTTGTTTCAAAACTG
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TATGGAAAAGATATTGGAAATCAACGAAAAGGTTTTGATTAACGATCGAT
TGGTCGAAACGGTGTTGAATATTCAGAAAGCAATTACCGTCAACGTTGAA
GGTTATATACGGCATAAAGAGGTTCGTGAGGCGATTTGTAACATGGAATC
AGTCAAAATGGCTGATGGCTCAAGTCAACAATACGGTTATGTTGTGTATG
AGACGGTGGTTACTAAGGGCGCTAAACTCCATATCAAAAATGCTCGTGAT
TTTGTATTCGCAATATTGAACTGAAATATCAAACGACTCTATCTCAATTG
CTTAAAGACTCAGATATGAACCTGAGAAACAGTCCTTTGATGAGAATTAT
AAACATAATTATGATTACGATGCACCAGTATCTGAAGGAGGCGATTTAAA
CACCAAGAAATATAACCTCTTCAAGAAAACCATTCAACATTATACCACGA
AAGGAGGGACGAATTTCGGATTTTATAACGGTGCAAATGCCAATGACGAT
GGATCTAATTACCAATGTGATATCACCAGTTATGCCGAACAAACCAGTGT
TTGTGACGGAATTTTGGGATGGTTGGTTCACTCATTGGGGAGAGCAATAC
CATTATGTTGGTGCTGAAAGGTTAACAAAAACATTGGATTACATGCTGAA
ACATGGATACTCTGTTAACTTCTATATGTTTCATGTTTTCCAGACAATCA
ACTTTATGACAAAAGCAGAAGAAGCTGTTGGAAAACTGTTGGAAATACAG
GAATTCAGACGACATGGACTTCATGAACTGCATTTCATTTGTGATAATAT
GGAGGGAATTGGGAATTACGAAATGAAAGAGCAAGCATTCAAAGGGAGGT
CCAATCATAGCTTTCCAAGTCGAAAATGAGTATGGCTCATTTGGCACAGA
TGGGAAGTATATGGATTTCATTCAAAACCTGGCTGTTATCTGATGATAGT
ATGAAGATAAGGTCATTATATTCTGGTTTTACAACAGCTGTTACTCGCTA
TTTCAATCATTTGCTCCCTATACTAGAGCCATATCAGAATGTTTATGGAC
CTGCTCAAATCTAATGACATGTATGCAGTAATGAGACCTGGACCTTACAT
TTGCTCAGAATGGGATCTTGGTGGTCTTCCAAGATACATACCCTGGAATC
TACATGAACCCCAGCCTGGGAAATTCTCAACAACATATGCAAAGCAATTA
AGTAACATGGCAGAGAAAACATCACATACATCATCATTGAAAATCAAAGG
GAAAGATTTTGTCTTGGAAGGTAAACCATTTCAGATTCTCTGTGGTGCAA
TACATTATTTTCGAATCACACCTGACTCTTGGGATGATCGAATCAAGAAA
GCCAAAGGAATGGGATTGAACAGTGTTGACATATTCAACATGACATCCTG
ATTAGCAAAAGGTGTATTACCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19881MSTRG.19881Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19881.1.p1MSTRG.19881.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19881.1.p1.exon19MSTRG.19881.1.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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