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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000233_pilon:565478..573495+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.19858.1.p1 ID=MSTRG.19858.1.p1|Name=MSTRG.19858.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8018bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:565478..573495+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAATCAAGATAACAAAGTTTTATCCATTGTTGCACAACTCGAAAAGCTTT
GCTTTGTTGTCTTGATTTGAACTTTCTATCTAAAATTAAAATGGCtactt
tcaaatttcttttcttttaaacataCAGGAACAGATGATAGTTCAACATA
TTATTACTTATTTATGGCAGAAAATAATGATGGTGAGCAGCAGTGTTCCT
CACAGCCATCACAGTCAAAGCGACCAAGAAAGACAAGTAAGTAGTTTCTT
CTTTgtgttcaacattttcatttgccacattttgtgaaaatgtcGGCGAG
TGGTggaaaaacaagtttttgtgATTGTTTTTTAACGCCCAGTCcagtca
gcaccttgaactgactacccaattcccctcacatggcatgggttgactcT
GGCGAAGGTTCAtccacttgccaagtgaaccgctgcgagttgGAATCAAA
CCTCAGTCCACAGGTCCACAGTCCACAGTGCCTAATTTTTATGCATATGC
ATTTACAAGCATTTACCACATTTACCACTGAAAGGCATGATATTAGATTG
TGATCTGATattaccagacggtgtcaatcgaacaacttcgaacaaaaatc
gcaatcgaaccaatcgaacgtaatcgaaccaatcgaacgtaatcgaacca
atcgaacgtaatcgaaccaatcgaacgtaatcgaacgtgatcgaatAATT
TGCAATTCGATTATCgttgactatgttccattggttcgattacCTTCgat
tacaatagaccttttttttccgtttttgcagattttcattggattttttc
gtttatgtctttgttttttttttcaaacaaaaacattatttataacaatg
tccacgattaagcatggttcaattttcaatggaactgattttggtacagg
aactttctaaaaatcgccagaacagccgagaatcgccgaattttttgaat
ttctagaGTTTTTCTtatattattctgcattttcatactattgttgtcat
ttttcaattattatattatacatcaatcttcaggtacaGTTGTTTCTATT
TAAGAAACTccaaaggaaaaaaagaaagaggatcaaacaaaaaacaaaaa
acaaaaagttgaaaggtTGACTGTGAAAGTTCATTGTGAAATATTGGCat
acatttcaaaatttatttcatcttTGAATGATTTTGATGTTATTAGTGAC
AACTTTTTATTAAGTTTCAACTTTTACCAACAGTTACATTACTACctgaa
aggaagaaattttggcgggaatttaatttggcggatttggtttttctgcc
atccgccaaattaaattcccgccaaattaaactttttgaaaagatgatct
cttttaaggtgtttttgcatttttttgctgtttttacgccatcttaagga
tacatttttcagcaaacgccaaaagaaattcctgccaaatttagtttttt
cggccatccgccaaattaaattcccgccaaaatttcttcctttaaggtag
ttgaATGACCCTAATTTCTTTAGAGAAAGAAAACCAATCAAAGAAGGCCA
AGGCAAATACATCAAATTTGCTTGCACAGGAAATCCTTGCGAAAGGTAAA
AACCATTATAGCAATATTCCAAGACTAAAGAATAAGACTGtgactttctt
ttttttgaccGATGTTGAATCAATATGGCCAAAGTTTATCATTTATATGA
CTAAATATTTGGcatctttcttcttttagatGCAGCAATCAATCTTGATA
TCAACGACAAGTTGTTGACTGAATATGTTGACATTGACGATGTTcaagaa
aaagccaaaaatatgGACAGTTTTCTAGGTAATCAAGGTTTAAAAAATGT
CACATTGAATAAAGTAACAAAATGTGTGTGCATGGAATATAAAATTAATA
CTGACACATTGCCTTAGTTTCAAGAAATGCACCActatttctattttaat
ttgttattattacgttaagggaacttattttagcgggaactaatttcgAC
GAGCagcaaaaatcctgaaaatgtttagtttggcgagaacttattttgac
gattgatgagtttttttaattttgaagaaagacagcgtaaatctgttcta
ctTTGCCTTATTGGAGGCGTTATTtgtgaactcaagaagttatttaggca
aaataccaaaacatttaattttggggagaacttattttggcgactgagca
aaatatttaattttggtgggaactaattttacgGAGAAATTAAATTCTAG
TACATACATCATTATCATAAATTCTTTTTGCAGATTTCAACATTCAAACA
ACAAACAGAAGTCAATCCATAGAACACCAAACAATCGACAATGACACATC
AACTAAAAACAATTCAGTGTTGAAACCTAAATGTCAAGCTGAAGTACCTG
AGGAAAATGGTAAATTCTGAACTTTTAGGTCTTTCTTAGGTTTGAAATTG
CTGAACAGTAATGTGAGTGGTTTTCAGAGTCTTGAAATGTTGAAACATTC
TTCCTTATATGTGACCAAAAGTCTTTTCTCATTTGGTTCTTATCAAAATA
TTTGTGCAGAATAACTCAGAAGATATCAAATAAACAATTTCATTACCTTA
AGGGATCTGGTTCACTCCGAAGACAACCAAAAGAATAAATGATCAGTGCA
CCAACATGTTGAAACTGCCCAGTCCAGTTATTTCTGAAAAAGGTAATCAT
AAAATGGTacaaaattgttgaaataaTCCAAACATCAGTTATTGCTAATT
CCATTAGGCAACATAGTAGCGAACGTTAAATCAATGATTATCATGTTTTT
CGTTTTAATCGTTCAATCAATGGTTTTAGTTGATTTAATGATCAAAACTA
CGGAACTATGATAATACCGCTATACGGTTAAAAAGAAACCCGGGTATCTA
ACCCAAGGACACAAAGGGAAAGCAAAAAGTATACAGTAATTATTATACCG
TCAGTACAACTTATCTTGTTTGCTGGATGAAATAAAATCAAGATAACAAA
GTTTTATCCATTGTTGCACAACTCGAAAAGCTTTGCTTTGTTGTCTTGAT
TTGAACTTTCTATCTAAAATTAAAATGGCtactttcaaatttcttttctt
ttaaacataCAGGAACAGATGATAGTTCAACATATTATTACTTATTTATG
GCAGAAAATAATGATGGTGAGCAGCAGTGTTCCTCACAGCCATCACAGTC
AAAGCGACCAAGAAAGACAAGTAAGTAGTTTCTTCTTTgtgttcaacatt
ttcatttgccacattttgtgaaaatgtcGGCGAGTGGTggaaaaacaagt
ttttgtgATTGTTTTTTAACGCCCAGTCcagtcagcaccttgaactgact
acccaattcccctcacatggcatgggttgactcTGGCGAAGGTTCAtcca
cttgccaagtgaaccgctgcgagttgGAATCAAACCTCAGTCCACAGGTC
CACAGTCCACAGTGCCTAATTTTTATGCATATGCATTTACAAGCATTTAC
CACATTTGCCACTGAAAGGCATGATATTAGATTGTGATCTGATattacca
gacggtgtcaatcgaacaacttcgaacaaaaatcgcaatcgaaccaatcg
aacgtaatcgaaccaatcgaacgtaatcgaaccaatcgaacgtaatcgaa
cgtgatcgaatAATTTGCAATTCGATTATCgttgactatgttccattggt
tcgattacCTTCgattacaatagaccttttttcaaagaggccaccctgtt
gaataattatgtagtccagcagaaaaacatgataaaaccatgcataatta
ttacaatatgcattatacagtaattatgcatggctctatcattgttttta
tggctggacttaataattattcaacaggacgtcctctttgaaaaaaggtc
tattatgttcgctgagtttgattgcgattaaattaaattggatcactctg
ttagagctttttagcgtgggcggcatttgatggctatgcaagtttccctc
cactgatgcaagttacccgacttcacgatATCACCTTTCCATGGTACTCT
CTTTTAAGGTACACATCAATATTTGAATTACGATTATTTGATTAATGTAT
GACCATTACTGCATATATATAAAACACCATACTGTGTCTTAAAGTTtgag
aaatgtttgtttgctAACTCAGCTTTTTTGAATTATATACAAGCTCTTTA
GTAACGTCGAAGAGTGATACATTGCGCTTCTCTGCCATCCTTTGCACGGT
GTATTTTACCAAATCGCCAATATGTACATTTTAAAGACAAAGGCAAATTT
TTGTAAGGTTTAGGTTGTAATTGATCACATGTTTCAATCTGTAAACAAGA
GATTTAATTTGATGACtggaattttgagtaaaacaaaggaaataaaGTGA
GTAAAAAGTATGGCAGAAAAGTGCAATATATCACCCTTCGATGGTATTGA
ATAGATATGAACGTGGAGCAATCTTTGatcgaaaacaaaaagaaatccaa
aatatttgtttacctCAACCAAAAAGAGCAATAGACCGATATCtggtctg
atatgaaacatgaaTACCGATATCTCAATCTAAAAAATGAGAGTTATGTA
ATTTAAATTTACACAAGAATGATTTAATAATTTATTATAGTGTCCAATCT
TAAATTTAACCACAAAAGATATTTTGTCCAAGAAACCTTAACTTTTCTAA
GACGATGTCATAGAATCCCGAAAGCTCTATTCAATCTTAAAGATTAATTA
AAAATCTCTAAGATTAATATTAACCTCCtttaaaaacataactttttaat
GGAACTAATCATAAaccaatttttcagaatttaaaaaatcaaactttgtt
ggTCGATAAATTTCTATTAAGTTTTGTTGTCAAACTAATAGAACTaaaga
actaaagaaaaaatctgCATGGTGTGCCTGTTAAACTGATGGCCACTACT
CAAAGCTCTAAAGTCTCTGCACACTAATTTACTGGTCGAACTTTGTGGAA
CTATAATATTTGTCAGGTTTGCTGAACTTTCTCTGTTGTCATACTTTGCA
GAAGTTCCTTGAATTTTAATCAAACACTTGGATTTTTTAAGACAGTCTGG
ATTACATGATATGACATGAGATTGATAATTGATGATTAAATAATTTGCAT
TCAGATTTTAAAAGTCGGCAAtgatctatctatctatctatctatatttt
aAGTATCAAAAGGTCATAAGACCCATTATCCATACataaaaattataaga
ttgtataaaaataaaaagtaaataacctatgtaaatttttttgcacTAAC
AGAGGACACAAAGAAATAGCTTGAGAAGGCTAAATTAGAGAAATGGCTAG
AGTAGGCTGAATTAGAGTATAAGTAGTGGCAGAACAACCAGCAAAACTAG
GAAGGTGCACAACAAGAcgccaaacaaaaacaaaagagttATATATGCAA
AGATAAAGAAAAGCTGGTTGTAAAATAGTggctaaaatttgaaatgggGG
AGTCCTCGATTCAAACAAttgctaaaaataaattttatttaataagTTAC
ATAAATGTAATAGGGATAAAATGCTAAACTAGTGTAATAATCAAGGTTTG
TCTAATTTATTAGTTCATTTTATTGGGTGATCAATAGTGCTAATCTATCA
TTTCAGTTATCTAGATCATGATTGCTGGTCAAGAATTtataaatttcaag
aattttttaagTTGTAACATCTGAAAAGGTATTACATGTATAaacagtgc
tgcaaatagggaaatatatattatttaaaacaaatttcaatcaattagaa
ttgattattgatatattattattattgattaGTTGTCAATTGCTAACAAT
AACACAAGTCTAAGGATAAGCAATCAATTACTGTCAAAGGACAAGAAAAA
ACATATCATCCATGTAGCATTATGTCTGATGTTTTAGATAAAAccaagaa
tgtttttttttgcccttGGGAATAGGCTTCAgttacttttgaaaaacaaa
gtATTTTAGTTGCCttggaaatatataaaaagtattttgCAAAGAAAGCA
TGTTTTCACCATTTCTTTTGCAACTAAACTTACTACTATTGACTTATCAC
CTTGGCTATACaagatatgaaattttgaaggtTTGATTTTGTTTAATTAC
TTTAAAGCAGTGTTCAGACAAGACAAGTTAAACCCTCTTAATAGCAAGca
gggggtagaatctaccacccttgataattttttatcaatatgatCATATG
TAGTTTATATCAAACTTacagaaagtaaaaaataatttacacaACATGca
ttatcataattttttctctattttttctatttctctattttcCTTCACAC
TGCAGATGACTGGATTGCATCATTTTAATCACTAAAACTATTCTTTTAAC
ATGAatggatttgaaaaattgttatttCTTTGTAAAGAGGATAATATTAA
TTCCATGGGAAATTTTGAAGGTTGCTAAAAacctaaaaattacaaaaatt
cttTGTCTACACATCACTTTGTTTAGGTCTTGGTTTGATGAAACAAATTG
TGGCAGTTAACAAATCACTTAAAGCTAAAGCAAAACCCAAGAAAAAATCA
GAGATTTGCTTTGTTGAACTCAAGAGATCTGCTGAAACTGGTTAGTATAT
TTTGTTTGTGCGGGACAactgaaactctaaattttgtCATCAATACAGAC
CAAAAAGATTTCTCCctgtttcaaacttttcaacctgaattttattgcac
aaaaacttttgaaagttttaatcttTAGCTAAGGTTTGTTGTCTTGTTCA
ATTTTAAATGCATGcattctttctcttttttttggataATCTAGGTCAAA
GGATCTACAAGCTGAAGAGACCAAAACATAACAATGGAATGAAAAGAAGA
ATATCAAATACTGGTAAATGTGCAGTTACATTACTTTATGCACTGGGTAA
TATTGAGGTACCTAAATCTAAATAGAGTTGTGTATCTTGtatgtattgaa
atttcaaCTCTTTCTTGTTATTTTCACCAGTAATCACTGCAGATGAGCAA
GTTTTGGATATTgatgcaaaaaattcaaactggcAAATTGCAGAAAATCT
GGACACCATCGATAATGAAGAATTAAATGACATAAATCCACAAAGTGATA
CAAAAAGTAGGTATCATATCATCCCTTCTTGAAGTCAATTAAGGAAAAaa
cattgtttaaaattttcactgtTATAAGACTCTATGTAAGATCAAATCCA
CCCTCataaaaaaaggggaaaaactggcaaaaaaaacatttttggtgtTA
TAATGTAACAGAGTAATAACGATCAactattttaatttatttcagtGAAT
AGTTGGTTAGAAACGCTTCTTAActttgtcaaaacaaaaaaaagaagaag
tcaTGGTTCGAAAGATCAAGATCCTGCCAAGAAGATTGGGATTTGCTGAG
GAAGAATATTTGGAGGACAGTGCAGGATAGGGAAGTTTTGGATGAACATT
GTAATGTGTGTTGTGATCGACTTGGTGATCTTTATTGCATGGATTGTCAC
AAATCATTTTGTCATGTATGTGACGATGTCTTCCACTTGGCAAATCCATT
TCATGATAGATTGTCCTCTGGCAGGTACCTAGATGTTCTGGAGTGTTTGG
atgagaagaaagaaattatacCAACAGGTATTTTTCAAATAGTCAGTTAT
AATTAGAAAATGTATCATGCAATACATCTAACAGCTTCATATACACACTT
TAATCATAGTGCATAGAGCCttctcaaaatcacaaaaagggAGGGAACAT
CTGTGAAttgctattttttcattaacTTTTAGTTCGCTATCCACCACTTA
AATGTGTTTGTTCAGTTTGTGGCAGTAAGGAGGTCACCAAGATCGCTACA
GATGAGTATTGCATTGCCGTTACATTGAAAGGTAAGCAATttgatttaga
aatttcaaagtcaacaATTATAGGAATCTCCTCTTAAAATTGTAATTGTT
ACCAAATTTATTCACTTA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000233_pilon:565478..573495+ >MSTRG.19858.1.p1 ID=MSTRG.19858.1.p1|Name=MSTRG.19858.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:565478..573495+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGAAAATAATGATGGTGAGCAGCAGTGTTCCTCACAGCCATCACA
GTCAAAGCGACCAAGAAAGACAAGTCTTGGTTTGATGAAACAAATTGTGG
CAGTTAACAAATCACTTAAAGCTAAAGCAAAACCCAAGAAAAAATCAGAG
ATTTGCTTTGTTGAACTCAAGAGATCTGCTGAAACTGGTCAAAGGATCTA
CAAGCTGAAGAGACCAAAACATAACAATGGAATGAAAAGAAGAATATCAA
ATACTGTAATCACTGCAGATGAGCAAGTTTTGGATATTgatgcaaaaaat
tcaaactggcAAATTGCAGAAAATCTGGACACCATCGATAATGAAGAATT
AAATGACATAAATCCACAAAGTGATACAAAAAtGAATAGTTGGTTAGAAA
CGCTTCTTAActttgtcaaaacaaaaaaaagaagaagtcaTGGTTCGAAA
GATCAAGATCCTGCCAAGAAGATTGGGATTTGCTGAATGGCAGAAAATAA
TGATGGTGAGCAGCAGTGTTCCTCACAGCCATCACAGTCAAAGCGACCAA
GAAAGACAAGTCTTGGTTTGATGAAACAAATTGTGGCAGTTAACAAATCA
CTTAAAGCTAAAGCAAAACCCAAGAAAAAATCAGAGATTTGCTTTGTTGA
ACTCAAGAGATCTGCTGAAACTGGTCAAAGGATCTACAAGCTGAAGAGAC
CAAAACATAACAATGGAATGAAAAGAAGAATATCAAATACTGTAATCACT
GCAGATGAGCAAGTTTTGGATATTgatgcaaaaaattcaaactggcAAAT
TGCAGAAAATCTGGACACCATCGATAATGAAGAATTAAATGACATAAATC
CACAAAGTGATACAAAAAtGAATAGTTGGTTAGAAACGCTTCTTAActtt
gtcaaaacaaaaaaaagaagaagtcaTGGTTCGAAAGATCAAGATCCTGC
CAAGAAGATTGGGATTTGCTGAATGGCAGAAAATAATGATGGTGAGCAGC
AGTGTTCCTCACAGCCATCACAGTCAAAGCGACCAAGAAAGACAAGTCTT
GGTTTGATGAAACAAATTGTGGCAGTTAACAAATCACTTAAAGCTAAAGC
AAAACCCAAGAAAAAATCAGAGATTTGCTTTGTTGAACTCAAGAGATCTG
CTGAAACTGGTCAAAGGATCTACAAGCTGAAGAGACCAAAACATAACAAT
GGAATGAAAAGAAGAATATCAAATACTGTAATCACTGCAGATGAGCAAGT
TTTGGATATTgatgcaaaaaattcaaactggcAAATTGCAGAAAATCTGG
ACACCATCGATAATGAAGAATTAAATGACATAAATCCACAAAGTGATACA
AAAAtGAATAGTTGGTTAGAAACGCTTCTTAActttgtcaaaacaaaaaa
aagaagaagtcaTGGTTCGAAAGATCAAGATCCTGCCAAGAAGATTGGGA
TTTGCTGAATGGCAGAAAATAATGATGGTGAGCAGCAGTGTTCCTCACAG
CCATCACAGTCAAAGCGACCAAGAAAGACAAGTCTTGGTTTGATGAAACA
AATTGTGGCAGTTAACAAATCACTTAAAGCTAAAGCAAAACCCAAGAAAA
AATCAGAGATTTGCTTTGTTGAACTCAAGAGATCTGCTGAAACTGGTCAA
AGGATCTACAAGCTGAAGAGACCAAAACATAACAATGGAATGAAAAGAAG
AATATCAAATACTGTAATCACTGCAGATGAGCAAGTTTTGGATATTgatg
caaaaaattcaaactggcAAATTGCAGAAAATCTGGACACCATCGATAAT
GAAGAATTAAATGACATAAATCCACAAAGTGATACAAAAAtGAATAGTTG
GTTAGAAACGCTTCTTAActttgtcaaaacaaaaaaaagaagaagtcaTG
GTTCGAAAGATCAAGATCCTGCCAAGAAGATTGGGATTTGCTGAATGGCA
GAAAATAATGATGGTGAGCAGCAGTGTTCCTCACAGCCATCACAGTCAAA
GCGACCAAGAAAGACAAGTCTTGGTTTGATGAAACAAATTGTGGCAGTTA
ACAAATCACTTAAAGCTAAAGCAAAACCCAAGAAAAAATCAGAGATTTGC
TTTGTTGAACTCAAGAGATCTGCTGAAACTGGTCAAAGGATCTACAAGCT
GAAGAGACCAAAACATAACAATGGAATGAAAAGAAGAATATCAAATACTG
TAATCACTGCAGATGAGCAAGTTTTGGATATTgatgcaaaaaattcaaac
tggcAAATTGCAGAAAATCTGGACACCATCGATAATGAAGAATTAAATGA
CATAAATCCACAAAGTGATACAAAAAtGAATAGTTGGTTAGAAACGCTTC
TTAActttgtcaaaacaaaaaaaagaagaagtcaTGGTTCGAAAGATCAA
GATCCTGCCAAGAAGATTGGGATTTGCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000233_pilon | genome | sc0000233_pilon:565478..573495 + |
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