|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000233_pilon:33534..36958- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.19823.2.p1 ID=MSTRG.19823.2.p1|Name=MSTRG.19823.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3425bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:33534..36958- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GCATTACCATTCTTCGTTGCAGCAGTATTTCTTGAGATGTTTATCGCTTT
CTTACAAGATGGATACAATCACAAGTTATTTTACGTTTTCAACAATATTT
CTGCTGCAATGTTTCAAGTGACCATAAATAAATTGGTCGTTCAACCTTTG
GGATATGTTTTGTATTGCTATGTTCACCAACACTACAGGTTAGTTTGAAA
TAAGTGCGATCGGGTTGGAGCTCTTTTAAGCGAATACATTTTTCTTAAGG
GGAATGGCTTCAAAAATTGTAGTGGTTATCGTTGTTTTTTTCAGCTAAAG
TAACGATACAGTGACATATTTCGATTTATCCTATCTATGTCAAGACCAAG
CTATTAAAGAAACTTTTATCTTATAGATTGACAACACTTCCTTGGGATTC
TGTTTGGACATGGTTGTTTGCGTTCGTCGCTATTGATTTTGCATATTACT
GGTTTCATAGAATGGCACATGGTATGTATATAAACTTGAGAAATGCAACT
AATAGACACTCGATAGAAGTAAAAAAGTGTCTGTCCGCTATTATTTGCAG
TGTCCGTTGATATTAGTTAGAGCTCACTAAATCTTAAATTATTATTATGA
TAAGCTACAATCTTGGAAAAAATATTTAAGACAAAGAAGATTTCCCTGAA
AAATCTTAATTACCACAAATTATTTTAGGCGCTCTGATTTACTTCTGGAA
TCCCCACTAAATAAGCAGTTACTACTACGCCGTGACTGAAAATATATACT
TCTATTTGTATTGCAAAACTCAATATTCAGAAGTGAATTTGTTATGGTGT
GCGCATCAGATGCATCACAGCTCTGAAGATTACAATTTAACAACTGCCTT
TCGACAAAGTATTGCTCAAAAATACTTCAAAGTAAGTTTAACTAAACCTA
TGATTTAAACCTTCAGTCCCGAAATATGTATTGAAGACTATTTGATAGTT
ATGAAAAACCTCGAGACTAAAAGGGTTAATATGTTGTTCAAAAAACACCC
CTGTGTCCGCTGAGACCCCAGCCCAACTGAAAAAATTTGCCAAAATTTCG
TCCCCAGTGGACAAAATACCCTACAATTTCAGTCCCACCGGGAAAATGAT
TTTGATTTCATCCTCTTTGGAAATTCAATGCAAAAATTTGCTGTCCAAAA
CCACTAGATACTTTAAAGCTCGGGAACGATAAAATTTCTATCCCCATTGG
GATTTCAATAAAAAACGAGTGTTTTAGAACAATTCAATTTAAAATGTTGC
GTCGAATTCCTGAATTTCTTTTTCATTTTCAGTTGGTTTACATCCCGATC
GCATTGATTCTTCCTCCTTCTATATATCTGGTGCATGCGCAGTTCAATTT
GTTGTACCAAGTTTGGATTCATACTGAGGTAAATAGTAAAGAACTACACC
TAAATGTGCAGAGAGCCGGCATCAAAAGTTACAAATAACTCTAAGTTTCT
CAAAGGGGTGTAGTTTTCTAAGTCGGTACGAAAGGCGCAGGTCATTTTGG
AAGTTTTTTATGAAAAAAAAAACAGTTGGTCTAAAGTTTTATAGCAGAAA
AAAAGAAAAAAAGCTGATATCACGGTCATCAAAAACCTTGAACCCCTTCA
ACTATTTATCTTATTGATAGAGACTTCTTTGATATAAAGTTATGAGACGA
TTATTTTCGTAGTTTTTGCCGACGAATATTCTTTCATCACAAATTTTCTA
CAAATAATGTACCTATTACTTAATCATATTTAATCGAAACTGAATATGAA
GATTTAAATAACTAGCTATGTGTTCTTCTCTAACAGGTTGTTCCAAAACT
TGGTCCATTGGAATACATTTTTAACACGGCAAGTCACCATCGAGTTCATC
ATGGTATGTAGACGGGAAACTTAATTTGAATACTACTCTACCAGGAATAT
TACCATGGTCCAATTAATTAAGGGAATTACTACACTCTACAATACCCACT
GTAATACTTGGCACAAAAGGGGAATTCCCTCAAATTTGAAAACCGCAAGT
GATTTTTAAGTGCTTTATAAAGTACGGTTGGAAAGTAGAGTTTTAATTCT
GAGTTTTAGCATGAAGACTTACGACCTTAGGATCTCAAAGCTCAAAAATG
TTCCTGAGAATGTAGCCTGGAATCCACTTAACCCCTCCCAAATCGAAAGA
TCCAAAGCAACAAAGTGCCAATAACATTTCGGCGCCGATAGTTAAAAGAA
ACATTCTTAACTAAAGATTTAAGTTTTTCCTCATTTACGCTAATTTTAAC
ACCAGAAACCTAACCTTTTTAATTGTAAACTTTTTTTCTTCCAGGAAGGA
ATATATATTGTATCGATACAAACTACGGTTAGTCATAGTTGTATGTTAAA
ATCTGAATCTTAGGCTTGCGATTAAATCGAAGAAAAGATTTGTTTTGAGC
TCCAATCATGGATCATACATCATCCACCTAAATTTTGGTGTGCGTGTATG
CTCAGAAGAATTATAATTCTTGTCTTCATCCGGTAAATACTTTGTCTTTT
CATTTATAGGTGGGACTTTGATAATATGGGACAGAATTCTGGGTAAGTAA
CTTTTTATCTTATTGACCATTTGAATTATGAAAGATTTAGGGTTATAAAT
ACTTTTTTATAAAAGTTTTACATAGGACCACAGGAACATTGTTCTAGTGA
AGGAGAGATTCGAATTCGAGTTTAAAAGACTTCACTGTACTCTATTCGAT
ATAGGGACATTTGCTGAAGAAGAAGAGAAAGTATCATATGGATTAGTTTA
TCCAGAATATACAGCGAACCCACTTTTGCTACAGGTAGCCCAACTAGCCA
TACACCCTTTACTTCAACATATAATAAACGTGTCTTTTACATTTCCAAGT
GAAGAGTAAAATTTCAAGCCAAGCATCACAAAATCACGAAATTTCCTCTA
AAAACTTTATTGAGCTTGATTGACATTGCTTGAGATTCATCCCCTCGTGC
TCTCGTCCCCTCGTACTCCCTCTTATTGGCAAGTATTTTTATGACTTTCA
GTTAAAAACATCACCTGCCTTTTACAGGGTGGCCATTTTTATTATCTCTA
TCGACGATTTTGTAAATTGGAAAAATGGTCTGACAAGGTAAGCTTTGGAC
AGGACCCTAACATTTCTTGATATTTCAACATTGGGTTAGTAAGATAGAGA
AGGGTTTCCATTTTTTTTCAATCGAGAACTTAGTAAGATTAGAAATCTGT
GTCTAAAACTTTTTGAATAACTGTTTTTCTGGTAGTTTTGAGACCCATAA
GGAAGCTATCTACAAAATTTCAGTCACATTATATTAATATTAAGGTGTGG
GCCTTTTTTGAGATAATTCTACTAGTCTTTTCGATTTCATTCAACTATCA
GCTCAATTGCTTGTTCCGTAAACCTTGTTGGATGGCAGAAAGTGAAAAAG
TTGGATTAACTCCAGAACAAATGGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000233_pilon:33534..36958- >MSTRG.19823.2.p1 ID=MSTRG.19823.2.p1|Name=MSTRG.19823.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6885bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:33534..36958- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CTCAATTGCTTGTTCCGTAAACCTTGTTGGATGGCAGAAAGTGAAAAAGT TGGATTAACTCCAGAACAAATGGGACATTTGCTGAAGAAGAAGAGAAAGT ATCATATGGATTAGTTTATCCAGAATATACAGCGAACCCACTTTTGCTAC AGGTGGGACTTTGATAATATGGGACAGAATTCTGGGAAGGAATATATATT GTATCGATACAAACTACGGTTGTTCCAAAACTTGGTCCATTGGAATACAT TTTTAACACGGCAAGTCACCATCGAGTTCATCATGTTGGTTTACATCCCG ATCGCATTGATTCTTCCTCCTTCTATATATCTGGTGCATGCGCAGTTCAA TTTGTTGTACCAAGTTTGGATTCATACTGAGAAGTGAATTTGTTATGGTG TGCGCATCAGATGCATCACAGCTCTGAAGATTACAATTTAACAACTGCCT TTCGACAAAGTATTGCTCAAAAATACTTCAAAATTGACAACACTTCCTTG GGATTCTGTTTGGACATGGTTGTTTGCGTTCGTCGCTATTGATTTTGCAT ATTACTGGTTTCATAGAATGGCACATGGCATTACCATTCTTCGTTGCAGC AGTATTTCTTGAGATGTTTATCGCTTTCTTACAAGATGGATACAATCACA AGTTATTTTACGTTTTCAACAATATTTCTGCTGCAATGTTTCAAGTGACC ATAAATAAATTGGTCGTTCAACCTTTGGGATATGTTTTGTATTGCTATGT TCACCAACACTACAGCTCAATTGCTTGTTCCGTAAACCTTGTTGGATGGC AGAAAGTGAAAAAGTTGGATTAACTCCAGAACAAATGGGACATTTGCTGA AGAAGAAGAGAAAGTATCATATGGATTAGTTTATCCAGAATATACAGCGA ACCCACTTTTGCTACAGGTGGGACTTTGATAATATGGGACAGAATTCTGG GAAGGAATATATATTGTATCGATACAAACTACGGTTGTTCCAAAACTTGG TCCATTGGAATACATTTTTAACACGGCAAGTCACCATCGAGTTCATCATG TTGGTTTACATCCCGATCGCATTGATTCTTCCTCCTTCTATATATCTGGT GCATGCGCAGTTCAATTTGTTGTACCAAGTTTGGATTCATACTGAGAAGT GAATTTGTTATGGTGTGCGCATCAGATGCATCACAGCTCTGAAGATTACA ATTTAACAACTGCCTTTCGACAAAGTATTGCTCAAAAATACTTCAAAATT GACAACACTTCCTTGGGATTCTGTTTGGACATGGTTGTTTGCGTTCGTCG CTATTGATTTTGCATATTACTGGTTTCATAGAATGGCACATGGCATTACC ATTCTTCGTTGCAGCAGTATTTCTTGAGATGTTTATCGCTTTCTTACAAG ATGGATACAATCACAAGTTATTTTACGTTTTCAACAATATTTCTGCTGCA ATGTTTCAAGTGACCATAAATAAATTGGTCGTTCAACCTTTGGGATATGT TTTGTATTGCTATGTTCACCAACACTACAGCTCAATTGCTTGTTCCGTAA ACCTTGTTGGATGGCAGAAAGTGAAAAAGTTGGATTAACTCCAGAACAAA TGGGACATTTGCTGAAGAAGAAGAGAAAGTATCATATGGATTAGTTTATC CAGAATATACAGCGAACCCACTTTTGCTACAGGTGGGACTTTGATAATAT GGGACAGAATTCTGGGAAGGAATATATATTGTATCGATACAAACTACGGT TGTTCCAAAACTTGGTCCATTGGAATACATTTTTAACACGGCAAGTCACC ATCGAGTTCATCATGTTGGTTTACATCCCGATCGCATTGATTCTTCCTCC TTCTATATATCTGGTGCATGCGCAGTTCAATTTGTTGTACCAAGTTTGGA TTCATACTGAGAAGTGAATTTGTTATGGTGTGCGCATCAGATGCATCACA GCTCTGAAGATTACAATTTAACAACTGCCTTTCGACAAAGTATTGCTCAA AAATACTTCAAAATTGACAACACTTCCTTGGGATTCTGTTTGGACATGGT TGTTTGCGTTCGTCGCTATTGATTTTGCATATTACTGGTTTCATAGAATG GCACATGGCATTACCATTCTTCGTTGCAGCAGTATTTCTTGAGATGTTTA TCGCTTTCTTACAAGATGGATACAATCACAAGTTATTTTACGTTTTCAAC AATATTTCTGCTGCAATGTTTCAAGTGACCATAAATAAATTGGTCGTTCA ACCTTTGGGATATGTTTTGTATTGCTATGTTCACCAACACTACAGCTCAA TTGCTTGTTCCGTAAACCTTGTTGGATGGCAGAAAGTGAAAAAGTTGGAT TAACTCCAGAACAAATGGGACATTTGCTGAAGAAGAAGAGAAAGTATCAT ATGGATTAGTTTATCCAGAATATACAGCGAACCCACTTTTGCTACAGGTG GGACTTTGATAATATGGGACAGAATTCTGGGAAGGAATATATATTGTATC GATACAAACTACGGTTGTTCCAAAACTTGGTCCATTGGAATACATTTTTA ACACGGCAAGTCACCATCGAGTTCATCATGTTGGTTTACATCCCGATCGC ATTGATTCTTCCTCCTTCTATATATCTGGTGCATGCGCAGTTCAATTTGT TGTACCAAGTTTGGATTCATACTGAGAAGTGAATTTGTTATGGTGTGCGC ATCAGATGCATCACAGCTCTGAAGATTACAATTTAACAACTGCCTTTCGA CAAAGTATTGCTCAAAAATACTTCAAAATTGACAACACTTCCTTGGGATT CTGTTTGGACATGGTTGTTTGCGTTCGTCGCTATTGATTTTGCATATTAC TGGTTTCATAGAATGGCACATGGCATTACCATTCTTCGTTGCAGCAGTAT TTCTTGAGATGTTTATCGCTTTCTTACAAGATGGATACAATCACAAGTTA TTTTACGTTTTCAACAATATTTCTGCTGCAATGTTTCAAGTGACCATAAA TAAATTGGTCGTTCAACCTTTGGGATATGTTTTGTATTGCTATGTTCACC AACACTACAGCTCAATTGCTTGTTCCGTAAACCTTGTTGGATGGCAGAAA GTGAAAAAGTTGGATTAACTCCAGAACAAATGGGACATTTGCTGAAGAAG AAGAGAAAGTATCATATGGATTAGTTTATCCAGAATATACAGCGAACCCA CTTTTGCTACAGGTGGGACTTTGATAATATGGGACAGAATTCTGGGAAGG AATATATATTGTATCGATACAAACTACGGTTGTTCCAAAACTTGGTCCAT TGGAATACATTTTTAACACGGCAAGTCACCATCGAGTTCATCATGTTGGT TTACATCCCGATCGCATTGATTCTTCCTCCTTCTATATATCTGGTGCATG CGCAGTTCAATTTGTTGTACCAAGTTTGGATTCATACTGAGAAGTGAATT TGTTATGGTGTGCGCATCAGATGCATCACAGCTCTGAAGATTACAATTTA ACAACTGCCTTTCGACAAAGTATTGCTCAAAAATACTTCAAAATTGACAA CACTTCCTTGGGATTCTGTTTGGACATGGTTGTTTGCGTTCGTCGCTATT GATTTTGCATATTACTGGTTTCATAGAATGGCACATGGCATTACCATTCT TCGTTGCAGCAGTATTTCTTGAGATGTTTATCGCTTTCTTACAAGATGGA TACAATCACAAGTTATTTTACGTTTTCAACAATATTTCTGCTGCAATGTT TCAAGTGACCATAAATAAATTGGTCGTTCAACCTTTGGGATATGTTTTGT ATTGCTATGTTCACCAACACTACAGCTCAATTGCTTGTTCCGTAAACCTT GTTGGATGGCAGAAAGTGAAAAAGTTGGATTAACTCCAGAACAAATGGGA CATTTGCTGAAGAAGAAGAGAAAGTATCATATGGATTAGTTTATCCAGAA TATACAGCGAACCCACTTTTGCTACAGGTGGGACTTTGATAATATGGGAC AGAATTCTGGGAAGGAATATATATTGTATCGATACAAACTACGGTTGTTC CAAAACTTGGTCCATTGGAATACATTTTTAACACGGCAAGTCACCATCGA GTTCATCATGTTGGTTTACATCCCGATCGCATTGATTCTTCCTCCTTCTA TATATCTGGTGCATGCGCAGTTCAATTTGTTGTACCAAGTTTGGATTCAT ACTGAGAAGTGAATTTGTTATGGTGTGCGCATCAGATGCATCACAGCTCT GAAGATTACAATTTAACAACTGCCTTTCGACAAAGTATTGCTCAAAAATA CTTCAAAATTGACAACACTTCCTTGGGATTCTGTTTGGACATGGTTGTTT GCGTTCGTCGCTATTGATTTTGCATATTACTGGTTTCATAGAATGGCACA TGGCATTACCATTCTTCGTTGCAGCAGTATTTCTTGAGATGTTTATCGCT TTCTTACAAGATGGATACAATCACAAGTTATTTTACGTTTTCAACAATAT TTCTGCTGCAATGTTTCAAGTGACCATAAATAAATTGGTCGTTCAACCTT TGGGATATGTTTTGTATTGCTATGTTCACCAACACTACAGCTCAATTGCT TGTTCCGTAAACCTTGTTGGATGGCAGAAAGTGAAAAAGTTGGATTAACT CCAGAACAAATGGGACATTTGCTGAAGAAGAAGAGAAAGTATCATATGGA TTAGTTTATCCAGAATATACAGCGAACCCACTTTTGCTACAGGTGGGACT TTGATAATATGGGACAGAATTCTGGGAAGGAATATATATTGTATCGATAC AAACTACGGTTGTTCCAAAACTTGGTCCATTGGAATACATTTTTAACACG GCAAGTCACCATCGAGTTCATCATGTTGGTTTACATCCCGATCGCATTGA TTCTTCCTCCTTCTATATATCTGGTGCATGCGCAGTTCAATTTGTTGTAC CAAGTTTGGATTCATACTGAGAAGTGAATTTGTTATGGTGTGCGCATCAG ATGCATCACAGCTCTGAAGATTACAATTTAACAACTGCCTTTCGACAAAG TATTGCTCAAAAATACTTCAAAATTGACAACACTTCCTTGGGATTCTGTT TGGACATGGTTGTTTGCGTTCGTCGCTATTGATTTTGCATATTACTGGTT TCATAGAATGGCACATGGCATTACCATTCTTCGTTGCAGCAGTATTTCTT GAGATGTTTATCGCTTTCTTACAAGATGGATACAATCACAAGTTATTTTA CGTTTTCAACAATATTTCTGCTGCAATGTTTCAAGTGACCATAAATAAAT TGGTCGTTCAACCTTTGGGATATGTTTTGTATTGCTATGTTCACCAACAC TACAGCTCAATTGCTTGTTCCGTAAACCTTGTTGGATGGCAGAAAGTGAA AAAGTTGGATTAACTCCAGAACAAATGGGACATTTGCTGAAGAAGAAGAG AAAGTATCATATGGATTAGTTTATCCAGAATATACAGCGAACCCACTTTT GCTACAGGTGGGACTTTGATAATATGGGACAGAATTCTGGGAAGGAATAT ATATTGTATCGATACAAACTACGGTTGTTCCAAAACTTGGTCCATTGGAA TACATTTTTAACACGGCAAGTCACCATCGAGTTCATCATGTTGGTTTACA TCCCGATCGCATTGATTCTTCCTCCTTCTATATATCTGGTGCATGCGCAG TTCAATTTGTTGTACCAAGTTTGGATTCATACTGAGAAGTGAATTTGTTA TGGTGTGCGCATCAGATGCATCACAGCTCTGAAGATTACAATTTAACAAC TGCCTTTCGACAAAGTATTGCTCAAAAATACTTCAAAATTGACAACACTT CCTTGGGATTCTGTTTGGACATGGTTGTTTGCGTTCGTCGCTATTGATTT TGCATATTACTGGTTTCATAGAATGGCACATGGCATTACCATTCTTCGTT GCAGCAGTATTTCTTGAGATGTTTATCGCTTTCTTACAAGATGGATACAA TCACAAGTTATTTTACGTTTTCAACAATATTTCTGCTGCAATGTTTCAAG TGACCATAAATAAATTGGTCGTTCAACCTTTGGGATATGTTTTGTATTGC TATGTTCACCAACACTACAGCTCAATTGCTTGTTCCGTAAACCTTGTTGG ATGGCAGAAAGTGAAAAAGTTGGATTAACTCCAGAACAAATGGGACATTT GCTGAAGAAGAAGAGAAAGTATCATATGGATTAGTTTATCCAGAATATAC AGCGAACCCACTTTTGCTACAGGTGGGACTTTGATAATATGGGACAGAAT TCTGGGAAGGAATATATATTGTATCGATACAAACTACGGTTGTTCCAAAA CTTGGTCCATTGGAATACATTTTTAACACGGCAAGTCACCATCGAGTTCA TCATGTTGGTTTACATCCCGATCGCATTGATTCTTCCTCCTTCTATATAT CTGGTGCATGCGCAGTTCAATTTGTTGTACCAAGTTTGGATTCATACTGA GAAGTGAATTTGTTATGGTGTGCGCATCAGATGCATCACAGCTCTGAAGA TTACAATTTAACAACTGCCTTTCGACAAAGTATTGCTCAAAAATACTTCA AAATTGACAACACTTCCTTGGGATTCTGTTTGGACATGGTTGTTTGCGTT CGTCGCTATTGATTTTGCATATTACTGGTTTCATAGAATGGCACATGGCA TTACCATTCTTCGTTGCAGCAGTATTTCTTGAGATGTTTATCGCTTTCTT ACAAGATGGATACAATCACAAGTTATTTTACGTTTTCAACAATATTTCTG CTGCAATGTTTCAAGTGACCATAAATAAATTGGTCGTTCAACCTTTGGGA TATGTTTTGTATTGCTATGTTCACCAACACTACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000233_pilon | genome | sc0000233_pilon:33534..36958 - |
|