MSTRG.19713.5.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.19713.5.p1
Unique NameMSTRG.19713.5.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000229_pilon:472393..494180+

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.19713.5.p1 ID=MSTRG.19713.5.p1|Name=MSTRG.19713.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21788bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000229_pilon:472393..494180+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gcaattttcaagaaaaagaaatgcatcaaaaattaaatcaaaatggattg gatgtgggaaaacaaagaccaaatTGACAGGTCCACCAGAACGTTCCTCC CACCAAAAGCCTAATGATACTTCTAAATTGCCACCTGATGTTATTAATAC TGATGAAGAAATTGAAGTTGGAAATTTCCACAATTTTGACGAGGAATTGA TCATACCTAAGACTAAGAGGCAGTGTTATGGTGTGagcaaagaaaaagaa tttaaatgttGGGAGAAGCATAACATTGACTATTGCTCCCTTTATTCAAT GAAGTTTGACACTCTCCCAACATATTGCTGCTTTTGCAATGGAGAATTCA GTTCAAGCTTTATATGGTGTAAATCATGTGGACCTCTCTCGTTTTATTGT CACGATTGTGCAAATAAAGTTCACCAGAACACTCTATTTCATTCCTTGGT CGAGGTGAAGGTAACAGcactctttttatttttgttgatttctgaACTAA TTATTCTATTTTACTAAGCTTTTTATACAGGGAAGTAAAGCTTTTGTCTC AATTATCCATTTTTCTATTCACTTCAAATACAGAAAGTTTATACATGCTC ATTTTACTTTCTAGGTTGATGGAAGTATTGAGTCATTTCAGGTCAAGTCC ATTTTGCAAAGCGAGCATACACGAAAGTGCTTATCAGCTTATTCAAGAAT ATTGACTGTCATCTCAGAAACAGGTTTATAGATTTTTATGAGCATGCCTT TTCATTAGGGGATGCCAACATTTTGGATTTGCCTTACATATTGTGTTGTG TTGTCTTACTTACTAATTGTGGAATAAAATGCTATGTGGGTggttttcat gaaattttttaaagggGGGTTACTATTAAAATGATGGGGGTCAAAGTTTC CATTTTGAACGTATGGCTACAACGGGTAACTGAaataattaaattgattt tttgaaattattgttaaTATATATATTGTTAAATAAACTGAAGCATGACA TTTATTGAACGTTTGCTTTACTACTGGTCTGGTCTAAATTGGCATTCAGA GTCTTAAAATTGGGgttaagcacagaagagtagaTAAAAAGCCAAAAGAC TTCATTGTGTGAATATGTTGATTGTtagatttgttattttttgtccTAAT AGTCACTCATGGGAAGATTGAGcttattaaaaaagtaaaaaagtttccaa aaagtggtttgtcttttcaaaattcaaattttagggCTTTATACTTTCTG AAGCTTGAAGTTATCTCCAAAACaatttgttttttctctttaatGTTTCA GAAAACTGTCCATATTTTATGCATATTTTATCATAATATTGTACTCTAGG TTCCAGTTACCAATGTGTTATATATTTTTGCAAATGTCAAGAAGAGTTCA ATACATTGATACACCTTGATTTATGGCCAGTGACACCCTTGAAGCCAAAC ACagttttatcaataaatttgcTGCATCTGTTTGTATCATTGCAATTAGA AGGGAAAATATCTTTTACATCTTTTTGTGATGGCCTATCATGGAAAAGTG GTGTGGTAGACTCTGATCTGGtaaattctttttcatatttgttttagaaa aaaagccctcttttttacatttcttggtgaaaatattttaaactaaAGCT TGTATGCATTTGTGATTGGCACAAAAATGGAAAAGGGTGTAGACTCTCTT CTAGACAGTTAAAACAAATTAACATACCACATACAATTGACTTTTTCAGA GGAGGCACCTAAACCGCATGTCGCAAACTGATTCATTGGACCAATTTAGA CATTTCCGTCGGCAACTAACCAGTCTGAAAACAATATGTGGAAATTATGA TGGCTTAGGAAAGTGTGCATCCTGTCCAAAGGTAATAAGTCAATAATAGG TTTCAGACTTAGCAAAGAACAAAACTAATCCGTAGATGGTATTTTaattt atatatacttttaatTGGCTTAGAAGTGATGCAGTGTGAAAATTCAGGTT CAAGCTAATTgcaatgtttttgttatttttaggaTAATGGTTGTGTCTTT TATTGCCTTGATGCCAATTTTGGCCTTGTGCTTAAAGCTTctgcatcaaa atcaaaacgaCTTGCCATTCGGTCTGAAAACTTGTTCATTTTGGATCAAG ATGTCAAAGCATTTATGGAAAGTTATGATGACTCGTTGAAAACAAAGGTA TATAGATTGACacaaattataataaaaataagataaatgaacagaatttc tcaaaatagtTTTACTGATTAAAATCTTATTACAGGATGCCAAATTTTCA CAACAACATACTGTGAACCCCTCCTTTACAAAGGTAGGGGTAGAGCCTcc aaaaaatcggggaaaataatatagggaatagggaaaaaatcttataaaag gaggggTAGATTTTCAAAAGGAGGacaaagaattttgaatttttagaggG AAATTTGTAACAATAGACAGCAGCTTAAAACATGAATTGTATACCCTGGA GTATATaatatttaatttaatttaatgcGTCTGCAGATGTCataatcatt ctttttaaatctTAGGATTGTAGTAACTTTCAAGCTGGAAACAACTTAAG ATCCAAGCGGAAGACAAAGAAGCTCAGTGTCACAGGAATATTTGGAATGT CATGCCGGCACGAATtcccaaaactttttttgaacatGCAACATGGTGAA AGGTAATATCTATTTACAACAGCCTGACAAACAGTGGTtagttaaaatct ttgaaatataattttcctGAAAGTACATGATATTAGATACATTACTTTTC CGTCAGATTCTTTCCCAATTTCTGCCATACCATCTAAAACGGAAACCAAG ATTCTCTTACCAGAAATTTCGTTGAAATGCATTGTTTTTGTCgaagattt cagaaattttgatacTATGCAAATTCCCGAATTCCGACTTGCGCACCTTC TGCCATCTAGCTCCTTCGTCAATTGTGAAACCCCCTTCAAATAGGGTTGT TGTACGTTGttatattgagaaaaaaattgcacttttgTGTTTTCAGACTT GGCTATGCTGTACTTTTACTTGAACGCATACTGAAGGAAACCGAAAACAA GAACTTAAACATTCACATTATATATGACATTGCTTGCGTTTTGAAGTCCC ATTTGCAGGTTTTACTTTACATAATATTATTAGAGTAGTATGCTGCTGTA CTACAGCTAAAATATCCCATCAAAGCCATTCagttctttttttaaaatgt tgataaaaaagGAGAACCTTCAAGAGGCATTGATACTGTGTACTGAAATg acactaaagtctgtctcgaaataatttgcagctggagaaaaaaatggctg taacttttgatagaattcgaatcaagttgcgattttgtgctcgttaaaaa gatattcgtgagtgggaTATTATCAAgtagaaaaattgagaaaaaaaagg aaaatgaaaatgaaaaatgaagaagaaaaaaatcaactttttgtagaaat gtggtatatttaccattttcacaggagtgactcttcaatcttagatcatc atcaatgtgaaaaaattttataaaagtattcattcaatcaaaaaatatca aacaaagtttattactggttgatcgacaaaaggctgtttttttgtcgttt tttaccagtttttactattttatagagtcaaccagcaataaactttcttt gatatcttttgattgaatgaatatttttgaatttttttttgacagtgatg atgatctatgattgaagaatcactcctgtgaaaatggtaattataccaca tttctacaaaaagttgatttttttcttcttcatttttcattttccttttc cttttttttctcaatttttttacttgataatattccactcacgaatatca tTTTAACAAGCActtaatcgcaacttgattcgaactctatcaaaagttac agccatttttgtctccagctgcattATTCCATCTccattatttcgagaca gactttacactactttttttatttactatatttttagaaaaagaaaacat ttaacAAGTATCAACACTTCAAGTTTGGTATCCCAGTTTTCCATTCTTAT GGTCATAAAGGAGACTGCCAGGTTATTAATATGCTAATGAttttatatga tttcaaacagtttagttttttcagtttggcctttttcaatttactttgga ctttGTCACAAGTGGACTCTCACccatttctttcaaatctttgctttttg aaagaaatatccCACGTTTTTACAGATACCTCAAGCTTTTTATAAAGCTT ATAAAAATAAGGTTCTTTGAGAAAGGAGAAGTCTGTATGAATACATTATG TAAAACACTTTACTTTgagactttttaaaaatatatccCAGCATCTAGAA TGACAGATGGGCTTTCTTGAAGTGACTGAGAAAGAGCTACAATGTGATTT AAAATCTACCAGTTCTTTTATTTACTCCATTAATCGATTATCAGGTCATT GTTCCCAACTCATACGTTTCATATTCTTTTTCTTAATTATAAGGTGAAAA ATTCAATAAGGAGATTGGATACATTCGGACTGATGGATGGAGAACTAATG GAGAGATTATGGTCTTACCTtcgatcattttcaaaaataacaaaggaaat GACCCCTGCCCACCGCACAGATTTGCTAAGTGATGCACTGATGCATTTTG GCTCTaaaaaaaTGGGAAACATCGGTATTTGTTACTTTCTAAAACCTTAG CTTCTgttattttgggttttcaatACGACATGATTTTTGGTGTTGCCACC AAAGTTGTGTTATTTGAAAATCATcaacaaaaatgaaacatttccaTACC AAAGTATTGTACAGCCTTAACTTGTATTTTCAAACATGTTCAAACATAAT GATTTTAGCGGTACTCAAATAAAGCCACTATGGCTAAAATTCCTGATAAA AGGCCTAAAATGTTAACACAAATAGGGGAAAAGTTATCCAAGTATTCTAT TTGTTCGATTTCTGTCTCTTTTCGTCTCAATTTTACGGAAGTTTTCttct ataatataaaaaatattgttaagGCTCATTTGTGGAGTAGTTTAATAATC TAAGTACTTTACTGAAATCAATTCTATATCCTAAAATCTTTGTAGCCCAG TTGTTATCGTGACCCGATTATCAATTTGAATCACCTACTTTTTTACATAA AACTATGTTCTTTCAGGAAAATACCTTGTGTTTTTACATCACAAAGCAAC CGAAACTGTAAATTCTTGCAACACAGAGATTGAATCGATATGCTCAAAAC TACCTGGTAAATAAATGTTTTGAATTAAAACGTTTGCTTCTTCTATTAAT CGTACTAGATCTTTGTAAAAACAGCTATAACTGCAATGTctttttggtta tattatcgtaaagccttttattttttgcttatttctgattatgacttttt tCTGTGTTTCTAGTTGTTGTGAATGAGGAAATTATCAAAACGTGGAAAAT AGAGGAAGACAATATCGTAAGCAAGAACGGAAAAGCTCTAGAAGCAGGTA actacactgttcctactatgtactactactactactactgctactacAAT CAATATTTGATGACACACACATCGCAGCTGATTAATTTCTATCTACATTA GGTTTTATCGCCACTGTCGAAAGGTCAACAGTATATGTAAGGGAGTGAAT AATAgggggggggTAATGTGGTTCTTCGAAAAATTATCaacagataaaaa atgttttgggtGTCTCATTAAAAAgagttttcaaagattttgtatgTAAT CTTTTTGTTCCTCTTCAGTTACAGGGACTATTTGACTAAACTATCAAGGA GACTTGACATGACGAATTAACAGCTcaaaaagacagtgacacaaacaaag acaatgacaaaaacaaaaacaaagacaataacaaaaagcaaaaacaaaca caacagacaaTGACGCCTCTGTAATTTAGCTTATGGAATTTTCgtggaaa tttgatttttgagggTTTGAGTATCGTCCGCGAATTAGGTCTTAAAGGAA ATCTGGGAAGACTGTTTTCCGCGAAGTAGAAAAATAAATCAGCAATGTCA AGTAACTATCAAAATCTTTACTAGCATCCAATCCGTAATTTAATGACTAA AATTCGAAATCCGCGAAAGTCCTtgtgaaagtttatcccatttaaAAGGT TGACTTAGTTTTATTAGTTCTGTTAGTTTCTGAAAAAACATGTCGGACCT GGTTAATGAAAAAGGATGCACTGCACTGTGTTTCCATCATTCTTACTTAA ACGGAAACATGAAAACTACTCTTCAATTCTTATTCATTCAATTTCCGTTT TCTTCAGCACCTGCAGATTGGAAGCACTCCTATTACCTCAAACTTAAAGA TTTCTACAAAGAGTCTGCTTTAGTTCTAATGAGCGAAAAAGTATGTGACG CTGCAATGCACCAACGTAAAGCTAAAAGGTAAATGGTTAAGACAAATCAT AATAAAATgtattctttcattttatttatcattgaaaatttttttaatcc ttCAAAATCTTTCACATACTGTGGAACTGTATATTATAGAAGCAAATTAT GTCTTCTTTCTGACCCTGATgcttttaaagaaagtttttgaccTCTAACG TAAAATGTTGCACTTCTACTTTTCAGACTCGAGCGAAGCTTAACATCGTT TGAAAAGGTTCATAAAATAGCTAAAAGATGGAAAACCACAGAGAGCCAAT TTCGCAATCAACATCTGTCTTTTTTGCAAGAAAAGTCGAACGAAACAGCA TCCACACTGTACAGCAGGTGCTCCGAAAGACTAATGTTGCTAACTCTAAA GAAACGATATGCAGGTAAGTGTTTTTAGTGACACCTATTAACATTCTATT CAAAAATCTCGAGTTACCATAGAAAATTACAAATTAGGCGCGTTGATACT TTAAACGTTGTAGTGTATGAGGAACTTTCAATTCAAATGATAAAGTGAAG TGTGATGTGTCGATTTGGTTGTAATGAAGTGCAATAAAAATCCGTTTTTC TACTTTTAGATGGTTCAGCTATAGCAACGAGGTTGAGCAAACAAATCAAT AAAGTGTgcaaagaaataaagaatttaTTGGCTTCATACAATTCCATGCG ATCAGAGATTTCGCCTAAATTCAAACCTGTTGATTATAAAGAGGCTCTAG ATGTCAAGTCTTCAATATATAACGAAATAAATCTTGTATCCAACTTGGAT GAGGTAAGTGTAAAAGTGTGTAAaaaaggtcataagtagagGAGCAAAAA GAGAAATCTATTAGTTTGAGCTAAGCCCgggggggCACTTAAGGTAAATG Acttaccagacgttcggcccttaagggtcggtttttcatagttcagttag tgcactgtaagggtaggaaattacaaaacttcacagaactgcactgtaag ggtaggaaattgtaataaaaggccaattttttggtaaaattggcaaaaaa attgggCAATTATGGAgtaaaattggtcaattttggaggaaaatttccac attttcttggaaattgcaaaaatttcgcccttacgggcaagaaactttga aaaagtgcactgtaagggtacgatttttcatggaaattcactgcactgta agggtccgattttggaagccaaattttgggccgaacgtatggtcgttttc agatcgagtgccccccccccccggggagcTAAGAGATTGGGTGAAACGTT CGAAGTATTTCGAGGGTCAATCGGTGCAAGTTTAGTGTGTGTAAAGAACC ATCCATTGATGGTACTAAGTCTTTAAGTTCCAACCGGGTCTTCCTATAAA CTTTCGACCACATTTCGATATTGTCAAATTTTCTTCAAGGACGTTTTATG GATGAAGTCTACTATCGCAAAAAAGTGTCCTTCATAATGGTTTGGTCTCA AATTTGAATCCTTACAGTTTCTTCTCTCCTCTTTCATTTTAGGCAAGAAG TTCACAAGTCCCTATCAACGTAGTGAAGTCACTCGTACAATTCTACCTCA GAAAACAAAGAGCACAAGAAGAAATAATTATCGTCGAGGAAGAAATGAGA TCGACATTGCACTTTTGGGAAAATCAATTGACTTTTCTTGATGAATGTGC TTCACACCAAACTTCTGTTGGGATTAGATACCTCTTAAGAGAAAGAATCT TGATTGTGAAGAACTTCCTTGGGgatttaaaaaaactctttgAGTTTGCT ACCGAGCCAGTAGAACGAGTAGAAATTAATCACACGAATAATCATATCTC CTTGAATGGCTCCGAAAATGAAGAGTACCTATTCAGTGATCAAGATTTTT CGAGCGATGAAGAAGCCATATCATCTGGTGACAGTGACAGCGACACTGGT GACTCTGTTTTAAGTGATGACTTGTACATATAAATTATTTTGCCAATgat gtttgctattttttacTGTTGTATATAACTATCGTTacaaagaaaagcat tttttacCTGCGTCTTTTTCTTCTCTGATGTATCTTGGTAGTGGTTCTCA AAATACCCTGAAAGAAGTTTATTCCGAACTGAATTTATGGGCTTTTGTTT GAGTTACCCGTATTTAGTTTAAGCAATCTGATTAAATTCATTCCCCTCAA GTATCTTTCCTTCATTACACAATTTCGCCCATATCTTTTCTACTTTGCTA AATACCTTTGACGCAATCGTTCACGATACGTGTTGAGGTGGATAGCTTAG TATGAAAGTATCCCTCGCTACTCTCTCGCTTTTCTAAATACCTTTGACGC AATCGTTCACGATACGTGTTGAGGTGGATAGCTTAGTATGAAAGTATCCC TCGCTACTCTCTCGCTTTGCTAAATACCTTTGACGCAATCGTTCACGATA CGTGTTGAGGTGGATAGCTTAGTAGGAAAGTATCCCTCGCTACTCTCTCG CTTTGCTAAATACCTTTGACGCAATCATTCACGATCACTGACCTATATTT AAAACCCTGGACTAAGCtacatccgccatctttgattggagttttttgaa aagtggtacccgaggagaagccattgcaatgttaaaaattaacgtctaac gccgctacatcatcaaaagaatttgaggaaaagtagacctagcgctctcg atgcatttacaccgctattgagtagtgccgccattagggtaccacttttt aaaaaactccgatcaaagattttggttggccGAGATTGagtagcttggtc cagggtatataaaggtcagtgttcaCGATACGTGTTGAGGTGGATAGCTT AGTAGGAAAGTTACTCCATTTTTGCACCCTTCGATCCAAGGAAATGGCGT AATTATAAGTTTTTATGATCAAACTCTCAACATTATTTACAAAAAACCCT TTAAATTTACTTCCTTCGATTTCGATTTAAAGAGCATTCGCACTAATTTT TAGAGGAAataaattacacgcttttttataagaaccgtTAAATTTTGACT CGggcttggctgttcttattttttcgaatctgacttcaaaaatagaaata attaaTCCGCATTAATTAGAGGACGCGCTAAATTAGAATAATTACGGTAT gttcaaaacattgaaaaccTATGAGAGTCGATTCCCTACCGATAAAACCC CTCAAGATTGTTTAGtttttttCACCAATTAAAGCTACAGGTCAAATACc ctctgatgacgtcacataATAAGAATTTATGCTATAtctttttaagtaaa aaacaggctacatttttttaaacctCGTATATTCTCCTTTTAAATACACA CTGGTCTTTTAATTATATAAATGGGCCTACTTGGCTATTATTTTTCGAAA GTGCGGCGTCtttttttCGAACTTGGTCAACGGCCACTTAAGTGATGTTT CATTTGACGAAAACTTCTTTATGTTTAATTTCAGCTGGGTGACCGTTAAA TGTATAAAACATAAGAAGGCCGTATGATAATTCTTAATTATAAAGGTAAG GCATAGCATACAGTAGGTAGGTGAAAAAACATAGCCAAAATAATTTGTCG TACTTTTTGCTGatcatgaattttgaaaatttccatttttattacATTAA CCGGCTGCCCCGTATTTTAGACAATCTGACAGTGTAGGACACAAATAACG CGAATTTAATccaaaagcaataaaaatgtgaaactttttttcttttttat ttggaaaacGTTGGGCGCGTgttcacactggaaagtttCCTGAATTAAAT CCATCAAAGTCAAACAATGAGATTCATGATATATGAATACACTAGTTTAT TACACTTCCTTGTAGCTTCATGAGTAGACTGgaaatccagtcgtttataa cgtttttttgaaagcgggaaatttttatgtcgggatatggttaaaatata ctatattgatgctcctgttAAGTGTTCTACTTCCTACTTtctactgagtt aagtcgtctagcatgctagactacttCATGAGCAGATCTATCATAATAAC GCTAATTGATTTTGCTAGGCTTttttcattggttgatttttttattaata tttCCTATTTTGCATTGAGTACggttgtacacatttttttttttataagc aaccaggttgctaaggcttGAGGcctcaaatttgccaaaatttttcacta tctcgtaaagtaaaagctttttagatgaTCTAGCTATGGCAAgcgatagc ccttgacccaataagcataaatatgctATAATATtaggggtggtcaaagc aaatttttcagaaaatgagccaGAATGCTAGCAACCCCCAGGCCTGACCC GAAaaatggagttgcttataaaaaaaaatgtgtactcaATAGCTGCATTA GTTTTTAAACGTCAACACTTACTGTTTGCACTGTTTCGAGATTTTTTCTC CAAGTCATCTGTGTTTGAAATCGCAACACATTTGTTTATTGCACGCATCT TTTGTTCAAGTTTCCTTactaaaatcttttattttaaaggGTGCCCCTAC CCAATTAAAGAAGATCGATTAAAAGTGACAAAGCAATGCGTTCAACCAGG GTCTGGTTCAACCTTTTGTTGCGTACACGCTTCTATTGCATATCGATATG ATTGGATGCATGCAGTAAACCGCAAGTTTGCTTTCGTTTGGATAGGATAA TTTGTCTTACCTTCGACCAAGACATACCGCCACTTCCCAAACCACTTAAA GGGACGgccagataaaaaatgaaacttcgcTAAAAGATTCTTTTCATGGT GCTCAGTAAGAACTCCAAATATTTTTACTGATAAACATTCTGAAGTTAAG ATATgacgatttttttgaaatcttagaTTTTCGTATCTcacgttgaaatt ttattgttttcgagCATAAATTGAATTTACAAATCTACATATCTCAGCTT TGAAAAAAGGTAGCCTGTAAAATTTGGAGCTTTTGCTATGGATCATGGAA GGAATCTTTAGGCTAGATTTTAAGTTTTATGTATCTGGTTATCCATTTAA GAATTTGATCGTATTTTTATTAGACACTCGCATTCTATTTCGAGTTTTGA TTAAATTACTACTAAAACTAAGTACTACTAATGTCAACAAGAAAACCTTG TATAGGGTATAGAAGCGTTATTGTTCTATTTAAGTGTGCTCAGAATAGTT AAAAGCCtcttttcgtcttttttttcATGAGAATTTATTAGGAATGAGCT GAAGCGAAAGAAATTATTTACGTCCATTCGATTCGGGCAAATAAGCTTAA TCGCTTAGATTTTAGCTTATTCTaaagtcaaaaaatgttaaTTACAACTG AACAGTTGTTCATTccaagaaatttgaaatgatacCTTATGCATCGCTct tttttacttaaagcgacattactttttgacggtttttcttaatttatttg tacatttttttataagcaactccatttTTCGGGTCATGCCGGGGGGTTGC TAGCATTCtggctcattttctgaaaaatttactttgacCACCCCTATATT ATagcatatttatgcttattgggtcaagggctatcgtttgccatagctag attatctaaaaagcttttaatttacgagatagtgaaaaaaaaaattggca aatttgagacctcgagccttagcaacctggttgcttataaaaagaaaaat atgtatGTGTATTTAAAATGTGTATTTAGGTATCATTGGAATAACGGGTT AGagtaggtggattaagaactcatggAAAACACTCCTTGTTAGGTTATCA ACTTTTATGATGGATGGATATCTTTTGGAGCTAAGAAAGAAGTTAACCAC CTATTCTGGGTCTGTTGATTAGAAGATAGAAAAACTAATTTACTGCACAT CCAAATCTTCACaaaaaattagtcattttcTACAAAGAACTTTTCAACAA CTACTACCGAAAAAAGACATTTTAGTGTAAATTTTAGTATataagttttt aaataaaagttgaCGCTCTCCAATTCTTTCCTCAAGGGGAATTCCGATTT TCTTGCCTTTtatgagtttcttgttgacaaaTAATTGTAATAATAGAACT ATAGAAGGCGTCAACTTTTCTACTGTTGtttgaagcctgaatagcgAAAC TTGCAAATTTTGGCATTATTTACGGTTAACGTAATAAGGGCCGACGTTAA ATTAAAAAcgacgtaaaaagggccgataaagCTATTGAAGATTAAATTTT ACAATATTGTTATAAAGTCACGTCATGCATACCTCTACTCAATTTATtac gattttacaaaaaattgggCCGCCGGGCGGGTCAGTAGAATATAACAAAT ATGGTTCGAAATGAACCATATTTGTTATATTCTACTGAACCGCCCGGCTC ACCACGCCTAGAAAAAGTGAATGAAATTattctttctcataaaaaatgaa tGCCGAATGAAAACACACGTCAACgcatattattttttcttcaaaaaaaa taaatgtatcTAAAATAATGTTCATGCTAAAATATATTTAtgttgcttct tttgaaaaatagaaaaacataaaaataacatCAACTACTACACGAAGCTC CAAAATAATTTAAAGGCGGCCTTCGACAATTACAAATGTATATCACCAAA ATGTACCATCATTATTCTAGGGTGaaaaaaaaaCCAGAAAGGCTGAAAAA TTGCATTCAAATAAATTTAGTTCATATGTACTATCAGTCAATTGTCCTTT GGGTAGTGACTGTTTCAAAATATAACGACAGTCTTTTGTTGTTGCCTTAT AGAATAAACAAAAAGGATGATTGATTATCAAGTTCTGCAGTTGAAAGTTT ATTGTCTATTGCTCGAACTCGATTAATAAAAGTCGGTCACAAAAAATATC CAAAGAATAATGGGAAGAATAAACTCTTCAAAGACTAGCAAAAACCAGCT TAGATGAAAAAGGCATCAGATATTTATAAAAATGCAGAATAAAAGGCTTT TCTTACAGTGGGGATACcctttaactcgaacacgcGAGGAAAAGCAAATA TGTTCGAGGTATGGAGAATTTATCTCAAAGTTTCTTTCATAAGATCAGgc agaaattcatatttttcgAGGTATAGAAAGGTCCGAGgcatggagactcc actgtacagtactcttctgtgcttaattgtagggggtcgAATAAGCAGGG GATCGACAGTCCggtagaaaaatcataaaatggggtGGCCATAATGAGtg attttagtgattttcccTAGGAAAATTGGGGTTAAAATGGGGGATGATAT Aaagtgattttgaaaaaaaatcgaaaaatggaaaataccccctcccttac aaaaagcaccggagagtacaccgaaaaaaaaccttttcattTTAAGGAGC ACTTATAATATGAAAGGATGTGCTCTGGGATGTGCTCAGCTTTCTCCCAC GTCAACTTTTTGAACCCGATCCATTTTACAAAATATCGTTCCCCTCCTTT CACCTTCCCGTGTGTTTTTATGTACTCAACATAGCCCTCGTTTCTTTCAT CCTTCTCTTTCACTTCCTTCAGGGTGACTTCTTGGTCACTAGCATTTGGC ACCAAGTCGTCATCGTCCAACATCCTGCAAATATCTTCCAGACGATCGTC AAAGGCTGCCTTTCTTTTGCGATGGttttttttGTGGGTAACTTCTTCAG GTTCTGTACTCACTTGGTCAATTGCTTCCACGTTCTGACCTTCAAGTTCG ATATTCTGATCTTCAATCGGTTCTGTATTTTTCATTTGGTCAATTGCTTC CACATTCTGACCTTCAAGTTCGATATTCTGATCTGATTCTGATTCTGTAt ttttttCTTCGAGAGGTTTTTCACGTGTCTTGACaactaaaatgaatttt ttttcaattttatcttAACTTAATAAAAACACCTAAAGTCTTTTCAGGAT AAATGGAcagtcttttttcttttgtctctGACTTTTCAAGAAGCTCTTCA ATGCTAATGAAGTTTTATGgtgtaaaaatcaaattcatgCCATGCTTGTA tcaaaagctcatttttttcatcttcttttttctttacttttgcttaattc tttAAGACAAATACTAATGTAGAATGTTGtgcttttgaatatttttccaa tggtaccaaaaataaaaaagactgcACACTTATCCTGAATAGACCCCAAA CTaactaattttcgaaaattatcaacccaggacattcttagtGCAACCCT CGCTCATCAATTTTTGGTAGTTGTCACAAGATACAAGACTTTGAAGTTGA acttcacttttcaaaaagtgcaaagaACACATTAAAcagagagaaaattt ttctctcaaagggtcacgatttccaaaaatttggtgaaaataaaaccaaa atttggaaaaaatagaccaaaaataaaaaaagtctctcaaagggtcccaa aatcatcaaaatttaggCTCGGACAAAACCgtacctcgcaaacctagtac cccccggatTTTACGACCTAATTTGTTATTGAAATACTTCAAAAGCGAtt tttttGTAACACAGTCAGATTTTAATAAAATAggcagtttaaaaaaaaaa aattcgtatcgaaaaagcttgaaaaatgcttaaaatttaATACCTTTTTA CATGTTTTCACATTTTTCGAAAAGTATTTTTAATTCCAAAGTTAACAAGT ATATATAAATGACCCAGAAATATATTAATAATGTCGTTGATATAACATCC TGTGAAGACTGCTAGTGAgataaaaggtaaaaaaattacCAAGGAATGAA ATGTTTTCCATGTGCTGTTTAATTATGTCCAATTCCCAATTAGCGCATTT CGAAGGGTTTCGGAGCTCGAAATCGTTTGGAAGGCCATCAACTTTTATTT CACCCTCTGATATCATTTTATAAGGCACAGAGCTTCTATTTCCAATTTGC TTGCCTGAAAAGGTACAGAAAGtgaaaagttttactttttatttcagaat tttCCTGCAGCTAAAAAATACCACTGCCTGGTTGTTATACTTTGCATGAC GCCTCCTTCTCTCCTTCATTTAATTTACTTAAAGAATTTAATAAATAATG TCCTAATAATACTTACGGAACCTGCTGTTCAATAAATCTGCAACTTCTTG TCGGACAGATTTCGAAGGTTTCTGATCGGCCTTATTGTGGGACGTTCCTT TAAGAGAAACAAAACAGTAAATTTTGTCCTGAACAAGATAAGATGTAAAG TTGATTTCAGTTACAATAAAATTAACAGAGCCCCCACAGAGCTTTACCGT TTTCTCTTGAAAaagtaatacacgtttttttcaattagaacaagtttata agaacacggGGATGAagattggccaaaacctaagaacaaattaagactGA GCCTCAGATTTTAGAAATTACAAATAAAGTACAGATTTTAACGGATTTTA AACCATATTAAGttcttaagtaaagaaactaagcgtattttaagaacatc ttaagaacattttagcctgaaaaattcaaaaattcaagaaCAGCCCAGTC TGAACAAAGATTCATTGGTTCTTAgttaaaaaaaagcttttgtgTTAGAA TTTATCTTAGAATTACGAGTCAAGACTTACCATTAATAAATGTCGAAAAA TCCCAGTATAAATCTTCTTGGGCTTCCCAAAAATCACGTGCTTTAGTACT GCCGTACGCGTTTATGTGCCTCCCCATTCTAAGAGAATCAGCCTCAATTA CCAAGGTGTCGACGCCGTACGATTCCAACTCCGTgcactaaaaaagaaaa atttgaatctgtATTATAAGAACCTTTCGTAACGTATAAACGAATACTCA TGCCTGCACTATACACTtaagatttctcaaaaatagaCGCAAAAGCTAAA CGTATGAAATATACGTTCATCGTTCAcgttcaatttttgatttatatCAC TCGACATAATATCTCTAATATGGCTGAAAACTCACTCATCTTTTACATCA CTTTTTAAACTTCTCTAACTATAGTGAAGCTGTAGAACTTTCTATCTTCT CCCAATATTATTTACCACTATCCTTATAGCTTTTATACTTTTATACACCA TCCACTATCCTCTATTTACTTactaattgttttattttgtttctgaTCGA AGTCAACTTAATTTTCTGCGCATCAGGTGAAAGGTCTTCAAATTTTGGTA TAACCACTTGAGATGCCCTTTCGTTGAATTCCTTTCTCTCTTCTGCGGAG AGATCAGCCCAAGCCTTGTTTGCCGCAGCCACGGAGTTTGTTGGGTTGAC CTTGCCTgtagagaaataaaaaaaataccacCTTAATTATGTTTAACGCA TAGCAATGAGTAATGCAAAAATAGAGTTGTGTACATTTTCTAGGGGATTG CGTCTGAACTAAAGGGTAATATGattatcaaagaaaaaacatatcGGAAA ATTTATTGGGAACCTGGTTTATTGACCTAAGAACTGACCCCAGTGAGAAC ATTCAATGAACCTTTGGTATCCAAACCAAAGATCTAAATTGGTTAGATCT TAGATTACATGCTACTTTCAACATACCTGCTAATTCTTCTCTCCTAAACA AATCATAGCCTCGTGGTTTTCGAGTcaacactttttcttttttgctatCA TCCGTAGGCTTTTTCTGGTGGTTTATCCAATTCTATAAAATGAATGGATA CTAAGGAATTCaaatactttaaagaaaaagataaaacattttcaaaatat aaaatcataACTCTCGCCGTGGTTGAGCAAAATCCGAATTCGACCCGAAA TAGACTGCGACATTTTCATTAGCGAAAATTACCTTTATTTGTTGTGCAGT CAAACCAGTCCTCTCAACTGCTTCTTCGATCAATTTCTTTACCTCTTTAT GATCTCGTCCATAAGAGGTCATCCCTCTTTCATATAACTCATCAAGAATT TTAACTTGCTCTGGAGTCTTGATAACACGTTGAACAGACATTTTTATATG TTTCCTGTTTAAAAGATGACAGTGAATACACACTATGTTATAAGAAAAGG GCTTCTGTGAGAGTATCACAGTAAAAATTGGCCAATTCGTAAAGAGGCAC TATATATGAGTATGTTGCCATGGTGATTACTTCACCCTCAAACTTAGCAA GCTCTCTTAGCATAAGTGTACTATTCTattcttattcttataaaaacatg taaattATAGAATTAGTGTTGATGATAACAGGTTTCCTTCCCAAAAAAGA ATCTGTAATGTGAACAAACCCATATCCATGACTAACACTTTAGACATTGG CACCGACATAAATATAATTCAGACTCTCTGTTAATCGATTTACTGTAACA TTTACGGTTATAATTGTGATCATTCTACaaaaaaaaggagataaaaatat tcaaaccgAAAATTGAACCGTTCAAATAAAGCACAAATAATACGCAGAta tattcgacaagaaaaatgggatatcgaaaattattcagtcgagcttgatg aTATTCAACGAAGCTACGTTGAATATGTGGTTTATAGTTTTAAGCTTTTA TTGTACTTTTTGATTAAATGTGTTATCTGGTTAAAATTTTCGCAAAATGT GACAACATGTAGGGCTCTGAAATATAAGGCTAATTGACAAAgtgaagata aaaataaaaaattccatcATGCGGCTTCAAGCATTACTTTTACTCTATTT GCAAGAAAAATATAAGCGGGTCTTTCTTTTGGGTTTCGTTTGAGACAGTG ATCAGCAAGAACCGTAAGTCGAGTTTCCAAACAATCGTCGATATCAAAAT TAATCTTTCTCTTTAGGATAAGCTTGAGTAATACACCGAATGAAAACATG TCAGAACCAAACTGACTTTAGCACCTTTGAAAAGTTCCGGAGCAAAATGG TGTTGATCGTGGAATTTCTTCAATACATCTGCAATGTTGAACTTAGCAGT GTCAACACGACAGGCAAACGTAAACCCAATAATGATGGGCTTGTAGCCAT CAAATATGATGTTGTCAGCAACCAAATGGTTGTGCAATACGcccttttca aataaaaaattcagtccttCAATTATGCCATTGAGCAACCCTTTCAGTTG CAGCAAAGAACTAATTGGTTTCACTATCTTTGACAGGGTCATGCCAGATT GAAATTGAAGAacatgtgaaaatttttttgaggagtGCACTAGCCCAATA GTATTTACTATGTTTGAATGTTTTCCAATAAAAGTTAATAGTCGGTGCTC GTGGCTTAGAGTAGCCAGTTCTTGAGGCCCAAAGGCACCATCTAGGTGGT ATTTACACATCACAGTTTCACCATCCAACAAAGAGACTTTCTCTACTGTT GAAAATGATCCCTGATGGATAGCAATTGGTTTAATCCCATGAAATTGAGC AGGATCTAAAAGAACAGGTTCCTGATTTTGAAGGAGATAGTCGCCTGTAT GAAATGCATTTGTGAAGAGAGAAGCATCAACTAAAAATGTTGACCGTTTC CGTCCAATTTGATCTAGAATTTTTAGCTTTGTAAAGTGAGCATTTCTAAG GGTTAACGAAGCattcttttctttcaataaatctATCTCATGGTCTTTct gtttttgaatttctttgagTGATTTGATATGACTCTTTGCATTTGAAAGC CTTTGCTCACTTTGATTTTTGAGTGTCCACTTAAATTTCTTTCGAGCATG GGTAACCTATAACACAAATATATTGCTGTTGTTTTATcaattaaagattt ttaaattcaaaaaaaattctttgtctcttgtttttaatttcatgGCCGAG TTTAATTTTTAGACGTGAACAAGATGAAATATTGCTCCATAAATCTCTTT AAAAATATAGTAAAGcatttgcttttgtttttttggaagaaTTTTTGATA GTAAATTACgagatgaaaagaaaactaCATACTTCTTCCTCTCCACTGCT TTCATTACTACTGCTTTTATCACTACTACTTTCTTCCACGATATTTTCAC TGGTACtctaaaacaatgataaagaGGTAATAAAAAGGCTTTTGTTATGA AACGAAAATAACCATTTATTTGGTTGCTTATGCCAAAGTATAAAATTAAG ATTCTAGCTCAGtatttattctttgtattttattaGAATGTACTCTACCC TTTCTATTATTTCCAATGGTTTTTTCTCATTCTCATCTATTTTGAGGTTT AAAGTGACCTAAAAAGCACGAAGAAAGCTTATGCCAAAGTATTAAATTAA GATTCTAGTTCAGtatttattctttgtattttattaGAATGTACTCTACC CTTTCTATAATTCCCAATGGTTTTTTCGCATTCTCATCTATTTTGAGGTT TAAAGTGACCTAAAAAGCACAAAGAAAGTTGATCTTAAAATGggtaaata ttgaaaaactaaGATTCAAGGCTGGAAATAGgttaaaaaaaactgatttg tAAAGCTGGGTTgagtatttttcaaattttagacaGTTTTACACAAAATT ACATACATTGAATCGTGATGACAGGTCTGCTCCAACAGTTGTTAGAGTCT TATCAACGCTTTCTTTTATAACTgttttggagatttttttctaggaaaaa atataaaaacacagttatataataataatgaaaaagtcaaaaagttctGA CTTGCAACAGAAAGCTGTGCACCAAACAAATACAAATAAAAAGGctatta aaaaataatgaagaacTTTTCTTCTAACCTCTAACTTTTTCcttatcttt ttcaaaatctttgtctTTCGTTTCGATGGCTTCTTAATTACAGGTTCAAT GCACTCAAAAACTTGAGCCCAGATAGCTTaaaattgaaagagaaaaaCTA TTAATAATGCAATAATACTATAATGCAAATGgggctaaaatgaaaaaaag agtcTCGTTTCCAAATGATATTCTAAAATACCAGCAATATTTCTTTTTCG GATCAGATTAGTTTAGATTTTTGTGGCAATTTCCCTCCTAATATTGCTTC AACTTCATTTCAGCATGAATTTCTTTGGTatctattttgtaaattttaaa aggtttttatgtacctattgaatttaaaatctttcaaaacctTGTTATTT TCCagaatcattttttgttttttatgtaCGAAACAGACCATATTACtcaa acaagcaaaaaattatGAAGAGTTTGAGAAGCTTGATCAAGGAAGTTCTA TAAATTTCGATTGGAGAAAAGTTCAATGATTTAGAAGAATAAGTTTGATA GAAACCTTTCTACTTTTACTCTGCCAGAGAACATTCCATTTGAGGAATTA GAGGAAATATGCCACAATTAAACTAGAGTAggcagattttcaaaattttc aaacttacttgAATTTTACTCAAATTTTTACCATACCTTAGAGTTCAAAA GTTTGGCTAATTACTCAAACTTACTCGAACttcatgtttttgaaaaattg tgagGAGTTTGAGTAATTTGTAAACTTTACAATGCTTCCGGGCTTTTCTG GGGTCTATTTTTCGTAAATCTAAAACAAGTTGCATGGACACTATTAAGTG CCAGATTGGTCATATAAaaaattatctgatattccaatgACGTCCCGGGA CCGGGAGTCATGCCTCGGCAAAAGGAGGTTACGAAACGACCCTAGGTGTG GCCCGcacaattcaattcaattcaaaacatacatTTACCCGAAGGAAGGG ACACCAAGTTTAGAAACCTAATTACAATTCCCACATTTTTTGTCTCAGGT TAAATATCACTGAGGGTAGTTggttttctagaaaaaattggATTTGTTCA CATCCCAGCACATCCATGTTTTTGCGAAGCCCACACGATGTGGGCCGCCC TAAGGTTTTGTTACGAATCACAACGAAAATATCCGTACAcagatattttg atttgatgtCAAAATTGAATATCTGTTTTCGGATATTTGCCAGACTGTTT GATGGTAAATTGGCCTGCTGATTTAGAATTCTAGCACAGCACATGGTGCt tatgaattatttttgaataactcatttacatttataattttttttgttaa aatgtttttatattttgttactACTTTAATAATATAGATGGATAGCTGCC AAAACCCCATCCACCGGAATATCAGACAACCAAGAACAGAGCAACATTTT GACTTCCAAGATCTCAGCATTTAACAACAAATTAGATGAAATCTCTGCAA ATGAGaccatgaaaaatgaaaacttgtTAACCTGCcctttttaatttatt gtttcTATTCAATCAAAATAGCTAACACTGATTaggcggccatcgaaaaa ttgttctatttgtATCACCCGCCTGCATCATATTTTCC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000229_pilon:472393..494180+

>MSTRG.19713.5.p1 ID=MSTRG.19713.5.p1|Name=MSTRG.19713.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1746bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000229_pilon:472393..494180+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
caattttcaagaaaaagaaatgcatcaaaaattaaatcaaaatggattgg
atgtgggaaaacaaagaccaaatTGACAGGTCCACCAGAACGTTCCTCCC
ACCAAAAGCCTAATGATACTTCTAAATTGCCACCTGATGTTATTAATACT
GATGAAGAAATTGAAGTTGGAAATTTCCACAATTTTGACGAGGAATTGAT
CATACCTAAGACTAAGAGGCAGTGTTATGGTGTGagcaaagaaaaagaat
ttaaatgttGGGAGAAGCATAACATTGACTATTGCTCCCTTTATTCAATG
AAGTTTGACACTCTCCCAACATATTGCTGCTTTTGCAATGGAGAATTCAG
TTCAAGCTTTATATGGTGTAAATCATGTGGACCTCTCTCGTTTTATTGTC
ACGATTGTGCAAATAAAGTTCACCAGAACACTCTATTTCATTCCTTGGTC
GAGGTGAAGGTTGATGGAAGTATTGAGTCATTTCAGGTCAAGTCCATTTT
GCAAAGCGAGCATACACGAAAGTGCTTATCAGCTTATTCAAGAATATTGA
CTGTCATCTCAGAAACAGCTAACACTGATTagcaattttcaagaaaaaga
aatgcatcaaaaattaaatcaaaatggattggatgtgggaaaacaaagac
caaatTGACAGGTCCACCAGAACGTTCCTCCCACCAAAAGCCTAATGATA
CTTCTAAATTGCCACCTGATGTTATTAATACTGATGAAGAAATTGAAGTT
GGAAATTTCCACAATTTTGACGAGGAATTGATCATACCTAAGACTAAGAG
GCAGTGTTATGGTGTGagcaaagaaaaagaatttaaatgttGGGAGAAGC
ATAACATTGACTATTGCTCCCTTTATTCAATGAAGTTTGACACTCTCCCA
ACATATTGCTGCTTTTGCAATGGAGAATTCAGTTCAAGCTTTATATGGTG
TAAATCATGTGGACCTCTCTCGTTTTATTGTCACGATTGTGCAAATAAAG
TTCACCAGAACACTCTATTTCATTCCTTGGTCGAGGTGAAGGTTGATGGA
AGTATTGAGTCATTTCAGGTCAAGTCCATTTTGCAAAGCGAGCATACACG
AAAGTGCTTATCAGCTTATTCAAGAATATTGACTGTCATCTCAGAAACAG
CTAACACTGATTagcaattttcaagaaaaagaaatgcatcaaaaattaaa
tcaaaatggattggatgtgggaaaacaaagaccaaatTGACAGGTCCACC
AGAACGTTCCTCCCACCAAAAGCCTAATGATACTTCTAAATTGCCACCTG
ATGTTATTAATACTGATGAAGAAATTGAAGTTGGAAATTTCCACAATTTT
GACGAGGAATTGATCATACCTAAGACTAAGAGGCAGTGTTATGGTGTGag
caaagaaaaagaatttaaatgttGGGAGAAGCATAACATTGACTATTGCT
CCCTTTATTCAATGAAGTTTGACACTCTCCCAACATATTGCTGCTTTTGC
AATGGAGAATTCAGTTCAAGCTTTATATGGTGTAAATCATGTGGACCTCT
CTCGTTTTATTGTCACGATTGTGCAAATAAAGTTCACCAGAACACTCTAT
TTCATTCCTTGGTCGAGGTGAAGGTTGATGGAAGTATTGAGTCATTTCAG
GTCAAGTCCATTTTGCAAAGCGAGCATACACGAAAGTGCTTATCAGCTTA
TTCAAGAATATTGACTGTCATCTCAGAAACAGCTAACACTGATTag
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19713MSTRG.19713Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19713.5.p1.exon1MSTRG.19713.5.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19713.5.p1.exon2MSTRG.19713.5.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19713.5.p1.exon3MSTRG.19713.5.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19713.5.p1MSTRG.19713.5.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000229_pilongenomesc0000229_pilon:472393..494180 +