MSTRG.19411.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.19411.1.p2
Unique NameMSTRG.19411.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000221_pilon:542482..566219-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.19411.1.p2 ID=MSTRG.19411.1.p2|Name=MSTRG.19411.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23738bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000221_pilon:542482..566219- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGTTTTAATTTCGATATTTTGAAGTAATTCTAATTCTGTAACAAAAACAG ACATTGTAAATACTTTAAAAAGTGAAAAAATTCGTGAATACGATAAACCC GACTAGTGGTCTGAAATTCCAATATACAATAACATACAGGGGAATCTTAA AATGTTGACAAATTCCAGCACGCTGTCCTTTCCAGAAATGATCTTCTTTG AGGAGGGGGTAAAAGAATTCTTCAATCAAGTCTGATCAAGTTGAACCCAT AAATTTATAAAGCCCGAAGGGCTAGATGTCGTGTTTTGGCTGAAAAGTGT GCTGAGAGGTTAGGTAAGAAATCCTACCTAGATCACATGACATTACAATA GAATATCAGCGCTTGACCAATAAGAAGCTTCGCGAGTTTTCGAAAACAAA AGTAGAAATATTTTTTATATAATTATTCATTTTTTTTCCTTGGAAGAGCT TAAAGCACAACATCTAGCCCTTCGGGATTTACAGAGATCTGTGTTTGAAC CCCATTTTCTTGAAGCGTTTGTGTTGTTCTTTATTGACAGGTGTCATCGA TTCTATGACTCAGCGTTCTGGAACATCTGGCTATTCTTAATGATTTATTC TCAGCAGCTTTTCGCGGCATTAATCAGCGAAATGCGATAAGACGTAACAA ACAAATTTGTCATTGAAGTTATTTAAAATTCACTCTAATGACATACATAC GAAACATAAATTAGAAATATTAGCTTTCAATGAAAAAGAATTTGCGAAAT TTATTAAAAATAGAAGAAATATTGTCGATGTTTTGACACTGTTAAAGAAA CATTTTTTCTTATCTTGACGACGAGGAAGTAGAAACATTGATTGGTGGAA TTGTCATTACTCATCCAATCAACCAATTACCGGAAATATTACGCCTTTAT TATTACAAAGGCTAATTAAGAATTTTTGATATCACATCTCGTAAAAACGA TTGGATAGGATATAAGATTCGTCCTGTCTTCACTCATTTTCATTCTTCTT CCAACATCCTTGGTGTGATAAGGAAGGCAACGAATAAAAGAGAAACATAA AAATACGTGATTATATTTAGAGGTTTTTTTTTATTTTTTCATAAAGATTG ACACTGTTGATATTGGTTGGTTTGTTGTTAGATTTATAGAAACGTTAAAG GAATAGCAAGGTGTAACAAGAGAGGATGAAGCTTCTGGTAACTTTGTGTT TCTTTGCTGTCTTCAGCTACAATGTCGCTTTACCAGCGACAACCACCGCT CACAAAGCAAAATCGACTATTCCTGTAATTACGACGACGGTTGCTGCTCC TACTGAACCTGAAACCACGACTGCTGCCCCTACCACTACAGCTGCTGCTC CAACCACCACGGCTGCTGCCCCTAAAACGACAACTGCTGCCCCTACCACT ACAGCTGCTGCTCCTACCAACACAACTGCTGCCCCTAAAACGACAACTGC TGCCCCTAAAACGACAACTGCTGCCCCTACCACTACGGCTGCTGCCCCTG AAACGACAGCTGCTGCTCCTACCAACACAACTACTGCCCCAACCACCACA ACTACCGCCCCAACCACGACGACAACGACTCCTACACCGACAATCAATCG TAAGTCCTATTGTTTATTTTATCTGCTAAATAGAAATGTCCGCCTTTTAG AAACTTTTCAATTCTGTGCTCTAATCTTAGGTACTATTAAGGGTTTCAAG TATGTAAAATTTTGGTCCGAATTGCTTTTCTAGAGACACTAGGACATGGA AGAACAAGAGAATGATTATTTAAATGCAACAATTTAGTTTTATGAATCAT AGTAGTCTTGAGGTCCATGTCATTTTCATGATGTAAATAAATTCACGAAT GGATAAAGGAAGCGCTCCAAACGTCTATAAGCGATTTGTTCAATTAAACT TTCAAGAGTTTAAGAAATAGATAGTTTGGATAAATCAATCCTATCTATTT CTTTTTAAGTCTATGTTATGATCAGTTTGACCGTTGATGTCCCCTGATTA GAGAGGAAAAAAGTAGCGTTTTGGCCATTTCGTGCAAAAAAACGGTCCGC TAATGTCCACCTTTTAGAAACTTTTTTATGAGGATTTGACTAGGAAATGG CCGGGGAAAATAGAATTGTCCACCACTAGTCAAAGGTGTCCGCCAACTTA CGCTTATAGCATTTTTAAGCTTCCCTATTTTCTCATCGATATCCTAAGTT CCCTTTCTTAATTCCTTGGTAAATTCGGCTGATGGTTGCTATTTAGTTGC CATTAATTTCATTTGTTGGATTCATCTAGGTCGATTCTTGATGATTTACA TGAGATGAATAATTTTGGTTGGTTTTCTTGTATATTGACTTATGGACGAC TTATCAAGATACTTATTAAGAGAAGAATTCATTTTCATAAAATTTTATTT TTTAACCTTCTTATATTTCTACTACCAATTTATTGCAGCATTTTGTATTG GTAAAGTCGAGTTCAACGCTGATCCAAAGAATTGCAGTCAATTTATTAGA TGTCCACGAACCGGTAAACTCAAAGGTCACGCAGTGGTCTACCACTGTCC CCCTACTCTGGTCTTCAATGTTGCAGGTGAATACTGTGATTGGCCTCGTA ATGTCAAATGTAAGGACGGAATTCGCCCAACAAAACGCCCAAGAACTACA ACACCTCCTAAAGTTACGAAACCAGCAACTACTGCCGCTGCTACAACCGA AGCTCCTACCACTACAGAGGCTCCTACCACCACTGCTAAAGCACCAACCA CTACAACAAAGGCAGCTCCCACCACAACAGCAGCCAAAGAGACAACCACA GCAGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCAGCAGCCAAAGAGACAACCACAGC CGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCG CAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCA GCCAAAGAGACGACCACAGCCGAAGCCAAGAGACCGACAGCCGCAGCCAA AGAGACGACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACGACCACAGCCGCAGCCAAAG AGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCAGCAGCCAAAGAG ACAACCACAACCGCTCCAACTACTACAACCACCGCTACAACTACCACCTC TACAACCACCCCTGATCGTGAGTGAAAATTTATTTTTCAAATGGCCCTCT TATCTATTAAGTCCGATCGGTTATATAGTGCTATGAAAATGCATATCAAA GTCGAACGAACTTCAACCGTGAAGTTGACTCTTTGAGGCATCGAAAGTAT GAAAAATCATAGGTATTAAGTTATCATTGCTTTGAAATTTCTTCCCATTT ATATTATAGCATTTTGTATTGGAAAACCTGAACGAAACATTTTCCCTGGA AGTTGCCACAAATATATTACTTGTATCGATGGTAAAAAAGGAGTGGTCAA TTGCTGGTGGTTCAAGTATGACCCAACCCTCAAGAAATGTGTTAATCCAC GTAGTGTTTTGTGTAAAGATGGCGAATTCTGTAAGTTGTAAAAATAATTA AAATCTCTAACCAACAAATTGCAGAAGAGTCTAGAAAAGTAAGAGATTGA CGTTACCATATTCTACTTCTATAACTACAGAACTACAAAACAGGTTTTGA TCTTGTTCTTGTGGGGAATCAAATAAGAATATAATGTCTAGTCATAAGAA AGTAACATAAATTAAACTTCTGAAGGATACAGTATGAGCAAACCTCACAT CTTTTTCTGAGGGATGGTGAGTTGACTTTTAAATATTATTATTACTAAAA CTTTTGAAAAATATAAATTCTTGATTTCCTTTATGAGAACGGTTATTAAC CTAATCAACCCAAAGCCAATTAGTTGCATTCTTTACGTTCATTCTTCTTT ACTTTGTAGTCACGACAACAACTACAACTACAACAACGACAACGACCACC CCTTTCACTGGTTCCACCATCCCCACAACTAGGCCCACGACCACCAAAAG TATGTTTCTCCTTTTCAATTCTTTTTGGTTAATTCTATCCATTGGATTTA CAGCCCATCGTTATTAAGGCTGAATTTTTTGCTTAGTGTTGTCTTTTTTT GTTATTTGTCTTAAACTCTTCACTTGAATAGAATGATGTGATCGATGAGA AATTTTGAGAAACCCACCAAAATGACATTCGGAAATATCGGTACCTTTGA GCGATACCTATTATAATATATATATATATTTCCCTGTTTTAGGTGTTTGC GCAAAGAGCGGTGAATATTACATTCGCGATGCAAAAGATTGCAGCAAATT TATCCATTGTCAAGGCTCCCGACCAACGTTCAAGACATGTCCTGGTGTCC TTGTTTTCGATGTAGAGAAGAATGTTTGTAATTGGCGTTTCGCAGTCGAC TGTGGTGATGGTAAGATATTACAGAAAATACACCACTGTATCTTTTGTTA CATCCACCACCATTATCTGACTGTTCAATATTAATAGATTATTGCAACCA CACCTTCTGTTAGGAACAGTATCTATGACAGGAGACTGAGATGACCATAA TTTAGGCCATTTAGGCAGAATTGAAAAGTGAGAAATTAAAATTACAAAGA CAATACTAATTTTAAATCTCTTAAATCCTTTTCATAGATAAACTATAAAG AAAACATATGGAACATTTAAGCCAACAAATCACTATAGGGTAAGGACAAC CGTAGGTCAAGCCAAATTTTAATTGCTTTCATTCATCGTATAGCAACAAC TGCCGCCCCAGCCACGACCACCACAAAAGCCCCTGCAACAACACGAAAAC TAGAAACAACAGTTGCTGCACCTGAAACTACAACCAAAGCTCCCGCAACT ACGCAGAAAGCACCAAGAACCACTACAGTCGCTGCACCTGAAACGACAAC CGTTGCTGCACCTGCAACCACGACAGCTGCTGCACCTGAAACTACTACCA AAGCACCAAAGACTACAACTGCTGCACCCAAAACCACTACAGTTGCTGCA CCAGAAACCACTACCACAGTAGCTGCACCCGAGACAACAGTGAAAATTGT CACAACAAAAGCAAAACCCACAACAACAGAAGCTCAATGTAAGTGGAAGG GACTTTAACATCATATTTTTTTCTTGTTCGATTTATTCATTCCTTCGTGT GATTTTTGAAACTTTAAACGATTTTTAGTAGGGTAGGGAATTCCATTAAA AACAGTCGCTAGAAATCTTGATAATAATGTTCTTCATGTTCTTCTTCGTT ATTAACTTATACATGTTTTTTACAAAATTGTTTATCATTACTTTTTTTAG CACTTTGCAAAGGCAAGAGCGGCCCTGTTCCACACCCAAAAGATTGTACA AAATATTTCCAATGTGTCCATGGACGAAGTTACGATCGATCGTGTCCAAA AGGATTACATTTCGATAAAAAGAACGGATACTGTAATTGGCCAGCTGCAG CAAAATGCTCTACACATTAACCAATCAAATTGCATATTCTCAAAATATAG ACCAATCAAAATTTTAGATTGACGCCGATATTTTTTAGGCTTTTTTTCAC GTTTTATCTTTTTAACAATTTTAAATGACTTAAATTTTATATTTTTTACA TTCTTTAATAAAATTTATTAAATTTTTTACTTTGACAATATTATTTTTGA AAGCCTGTTTAGGTAAAAAAGAGAGAATTATTTTAAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000221_pilon:542482..566219-

>MSTRG.19411.1.p2 ID=MSTRG.19411.1.p2|Name=MSTRG.19411.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3936bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000221_pilon:542482..566219- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGTTTGCGCAAAGAGCGGTGAATATTACATTCGCGATGCAAAAGATTGC
AGCAAATTTATCCATTGTCAAGGCTCCCGACCAACGTTCAAGACATGTCC
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CGACAACGACCACCCCTTTCACTGGTTCCACCATCCCCACAACTAGGCCC
ACGACCACCAAAACATTTTGTATTGGAAAACCTGAACGAAACATTTTCCC
TGGAAGTTGCCACAAATATATTACTTGTATCGATGGTAAAAAAGGAGTGG
TCAATTGCTGGTGGTTCAAGTATGACCCAACCCTCAAGAAATGTGTTAAT
CCACGTAGTGTTTTGTGTAAAGATGGCGAATTCTATGTTGCAGGTGAATA
CTGTGATTGGCCTCGTAATGTCAAATGTAAGGACGGAATTCGCCCAACAA
AACGCCCAAGAACTACAACACCTCCTAAAGTTACGAAACCAGCAACTACT
GCCGCTGCTACAACCGAAGCTCCTACCACTACAGAGGCTCCTACCACCAC
TGCTAAAGCACCAACCACTACAACAAAGGCAGCTCCCACCACAACAGCAG
CCAAAGAGACAACCACAGCAGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCAGCAGCC
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AGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACGACCACAGCCGAAGCCAAGAGA
CCGACAGCCGCAGCCAAAGAGACGACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACGAC
CACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCA
CAGCAGCAGCCAAAGAGACAACCACAACCGCTCCAACTACTACAACCACC
GCTACAACTACCACCTCTACAACCACCCCTGATCGTGTTTGCGCAAAGAG
CGGTGAATATTACATTCGCGATGCAAAAGATTGCAGCAAATTTATCCATT
GTCAAGGCTCCCGACCAACGTTCAAGACATGTCCTGGTGTCCTTGTTTTC
GATGTAGTCACGACAACAACTACAACTACAACAACGACAACGACCACCCC
TTTCACTGGTTCCACCATCCCCACAACTAGGCCCACGACCACCAAAACAT
TTTGTATTGGAAAACCTGAACGAAACATTTTCCCTGGAAGTTGCCACAAA
TATATTACTTGTATCGATGGTAAAAAAGGAGTGGTCAATTGCTGGTGGTT
CAAGTATGACCCAACCCTCAAGAAATGTGTTAATCCACGTAGTGTTTTGT
GTAAAGATGGCGAATTCTATGTTGCAGGTGAATACTGTGATTGGCCTCGT
AATGTCAAATGTAAGGACGGAATTCGCCCAACAAAACGCCCAAGAACTAC
AACACCTCCTAAAGTTACGAAACCAGCAACTACTGCCGCTGCTACAACCG
AAGCTCCTACCACTACAGAGGCTCCTACCACCACTGCTAAAGCACCAACC
ACTACAACAAAGGCAGCTCCCACCACAACAGCAGCCAAAGAGACAACCAC
AGCAGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCAGCAGCCAAAGAGACAACCACAG
CCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCC
GCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGC
AGCCAAAGAGACGACCACAGCCGAAGCCAAGAGACCGACAGCCGCAGCCA
AAGAGACGACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACGACCACAGCCGCAGCCAAA
GAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCAGCAGCCAAAGA
GACAACCACAACCGCTCCAACTACTACAACCACCGCTACAACTACCACCT
CTACAACCACCCCTGATCGTGTTTGCGCAAAGAGCGGTGAATATTACATT
CGCGATGCAAAAGATTGCAGCAAATTTATCCATTGTCAAGGCTCCCGACC
AACGTTCAAGACATGTCCTGGTGTCCTTGTTTTCGATGTAGTCACGACAA
CAACTACAACTACAACAACGACAACGACCACCCCTTTCACTGGTTCCACC
ATCCCCACAACTAGGCCCACGACCACCAAAACATTTTGTATTGGAAAACC
TGAACGAAACATTTTCCCTGGAAGTTGCCACAAATATATTACTTGTATCG
ATGGTAAAAAAGGAGTGGTCAATTGCTGGTGGTTCAAGTATGACCCAACC
CTCAAGAAATGTGTTAATCCACGTAGTGTTTTGTGTAAAGATGGCGAATT
CTATGTTGCAGGTGAATACTGTGATTGGCCTCGTAATGTCAAATGTAAGG
ACGGAATTCGCCCAACAAAACGCCCAAGAACTACAACACCTCCTAAAGTT
ACGAAACCAGCAACTACTGCCGCTGCTACAACCGAAGCTCCTACCACTAC
AGAGGCTCCTACCACCACTGCTAAAGCACCAACCACTACAACAAAGGCAG
CTCCCACCACAACAGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCAGCAGCCAAAGAG
ACAACCACAGCAGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGAC
AACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAA
CCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACGACC
ACAGCCGAAGCCAAGAGACCGACAGCCGCAGCCAAAGAGACGACCACAGC
CGCAGCCAAAGAGACGACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCG
CAGCCAAAGAGACAACCACAGCAGCAGCCAAAGAGACAACCACAACCGCT
CCAACTACTACAACCACCGCTACAACTACCACCTCTACAACCACCCCTGA
TCGTGTTTGCGCAAAGAGCGGTGAATATTACATTCGCGATGCAAAAGATT
GCAGCAAATTTATCCATTGTCAAGGCTCCCGACCAACGTTCAAGACATGT
CCTGGTGTCCTTGTTTTCGATGTAGTCACGACAACAACTACAACTACAAC
AACGACAACGACCACCCCTTTCACTGGTTCCACCATCCCCACAACTAGGC
CCACGACCACCAAAACATTTTGTATTGGAAAACCTGAACGAAACATTTTC
CCTGGAAGTTGCCACAAATATATTACTTGTATCGATGGTAAAAAAGGAGT
GGTCAATTGCTGGTGGTTCAAGTATGACCCAACCCTCAAGAAATGTGTTA
ATCCACGTAGTGTTTTGTGTAAAGATGGCGAATTCTATGTTGCAGGTGAA
TACTGTGATTGGCCTCGTAATGTCAAATGTAAGGACGGAATTCGCCCAAC
AAAACGCCCAAGAACTACAACACCTCCTAAAGTTACGAAACCAGCAACTA
CTGCCGCTGCTACAACCGAAGCTCCTACCACTACAGAGGCTCCTACCACC
ACTGCTAAAGCACCAACCACTACAACAAAGGCAGCTCCCACCACAACAGC
AGCCAAAGAGACAACCACAGCAGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCAGCAG
CCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCC
AAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAA
AGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACGACCACAGCCGAAGCCAAGA
GACCGACAGCCGCAGCCAAAGAGACGACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACG
ACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAACCACAGCCGCAGCCAAAGAGACAAC
CACAGCAGCAGCCAAAGAGACAACCACAACCGCTCCAACTACTACAACCA
CCGCTACAACTACCACCTCTACAACCACCCCTGATC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19411MSTRG.19411Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19411.1.p2.exon10MSTRG.19411.1.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19411.1.p2.exon9MSTRG.19411.1.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19411.1.p2.exon8MSTRG.19411.1.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19411.1.p2.exon7MSTRG.19411.1.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19411.1.p2.exon6MSTRG.19411.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19411.1.p2.exon5MSTRG.19411.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19411.1.p2.exon4MSTRG.19411.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19411.1.p2.exon3MSTRG.19411.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19411.1.p2.exon2MSTRG.19411.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19411.1.p2.exon1MSTRG.19411.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19411.1.p2MSTRG.19411.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000221_pilongenomesc0000221_pilon:542482..566219 -