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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000216_pilon:549381..563545+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.19206.1.p1 ID=MSTRG.19206.1.p1|Name=MSTRG.19206.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14165bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:549381..563545+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTCAGTGAagatacaaaaaaaacatattaaaaatgacaaaaaaataac
tAAACAATTAACAACAATGTTGGACTGAAGCTGAGACCATGTGAATTAAT
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ttatcggggaaaacttcgtcggggaaaaatattcgtcacttgctggcagt
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TATCCTTGTGAGATTTAACATCTTTTAAGGTAAAAAGCTGGTTATAAACT
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TGCAGATACATCGTTTATTAACTGTTTTGTAATTATTAAAACTCTTCCGT
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CTTCCAATTTGGTCACGTGATCATCTTTCGCCTTACAATCCAAAGTCATT
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ttttcatatttcaattttgtgGCCAGTAGAACTTTCTTTGGAtcattctt
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ATTTCAATGAGGTCTTCACGAAGATTCGAGATATACAATAACACTTTTTG
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AGTGCTCCTTCCAATGATTCGACATCTCTGTTTTCTTGTTCACTTGCGTC
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TGTGGCAACACCAAGGCCTCGTTCAGCTTTTCTCTTTTTGATACACCTCT
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TGAAAACAGCATTGCTTTGGTTATCGTTCTGCAAatagaaacaagaaaaa
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ttgacacctttttctattgtctatatatacgaaaaaaggactgggacggt
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TTGGAGCGCTCCCTTTTATCCATTCGGTAAATTTgtttacgtcataaaaa
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agcggacactaaccctattccccgatggtgtccgctaattagaggttcca
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TcaagggtttataaaggtcagtggtgaATACCTACCTACTGAGGAATTGA
ATTCGAAATACCCCTGGTGAacacttgaaaaattaaattgatttgtGATT
TTCgtaataaaacctttaagacatAAAGACTGATATGGGATAGCAGTTCA
CGATTTACAATATCTTTGTGAGTTCGCTTTTCATGGAGATATTGGTAGTA
ATCTAGTCTAGGAACGTGGGCCACCCGGGTCAGCTATTTTTGAGTTTGAC
CTTTTGACCAAGCAGGGGTTCGAATAGTCTGTACCAGAGCGTATCTCATA
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caatgaattttgaaattagtcgtagatatcgggtctgtgtacagactagg
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ATGAACCCTAAGAACAAGCTCTCTATCTTCGCTTGGTTTTTGTTGCATCT
CATCATCTTCTTCTCCAATCACTTGGTGAATATGGGGCCTTAACCCCGAC
TCTTGTTTCAATGTGTCCAGGGTTTCATCAGTCTCAGTTGCTTTGATTGT
AGCTTGAGATGTTTGACTATCATTTTTTGGATCTAGAAGAGTGCTAGTTG
ATTGAAGTGACTCGTTAGCTATTTGTGTGTCACTAGCTTTATGTGACTCA
CTGGTGTCATTTGACTCGTGAGCTTCGTATATCTCATTAACATCACGTGA
TCGAAGCGACTCGTTAGCTATATGTGACTCAGTAACTTCATTTTGACCCA
GTTCTTCCGGTTCCCAGTTCTTTGAGCCTTCTCCCTGCAGCACGTTGAGA
AttttatcagtttttattttgtGGTCAATTTCATAAGTTTCACTAGTCAT
GATAGGTTCTGGCGGTGGTAGAACTAAACTTGTCTCCTCGATAAGGGCGC
CTTCATCAAGAGATAAACCGGTTGATTGGGCGGTAACACACTCAGCACCG
CCCTCAAGTGGTTCATTATTAGTCTCATCTGCAAAGTCGGCAGGTGGTGG
TAACACATGATTAGTTATACCTTGAAACAACGTCTCGATTCCCGATGGTG
TTAATGTGATCATCGGGTTGGTTAATCGGTGTCGTGATTGACTGTCACTT
CTACGAATCGTACGAGTGCCATCATCAACATGAGGTATCGGTAGGTTTTC
TATATGCTGATCAGGGTGAGCGTCTACATCTGTCAGGTGGTAATGTACGG
TGCTATCATTCGGGAGATCAGTTTGTCCGGGGTCAGTAACACTTGATTCG
GTATGATCGACTGTGTTTTGATTATTTGCCGTGCGTTCTCGAATGTCGTT
GGTTTCTGCACCGAGTATTCTTTCATCCTGTACGTCAGCCATTTTTGTTT
GAAATAAATTTTGTTTGTAACAGCAAAAACTATCTGGCTGGTTCTTTCAT
AAGAAAGTATTTTTTGAAGAATTTCGTTTTTCTTTTTTTTGAACCTCTTA
AACTTTTCTAACGTCAAATAATCTTTTGTGTGATGTTTATGATGACGTCA
GTTTTTACAAATGTTACTTTTGACCTTCCGCTTGGGATTGATGTTTTTTC
TAGACGATGTTATCGTACGTTACAGTGATAGTAAAGGCGGGAAAATATGG
CGGTATGGCGTTGTTATGGCGGTATACGAAAAAAGCGGCGGGAGAGTTTC
GAAGAAGACTGGCAAACTCTACCGCTGTAAACTCTTTTCGGCAAAAAAAC
CTGTTTGCGAATTTCCTTCGGCTTTGGGCTTATTTCTTAGTTAGCGATTT
GTCTTAGACTATAGCATAGTCTATGTTTTTCATGATTTCATGATCCAAAT
GTATTCCGTATTCCATAttttttgaaacgaCTAAAGACATTTGACAATTT
GGCTTTAAGCTAGAACTTAATCTTCCTAAATGTAGcctggggtccactta
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taattcgatctttaaggggaattggattttcatcgaatagggGAGCTTAT
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aaatttcatcgaataagggagcctatcacatagtagaacgtcgaattaga
gaacgtcaacTGTGTATGGTAATATGCCTTTGCTAAGATGGACTGTAAAA
CATTCTAAATGTAGCTCTTGATGTAGTAAAAGATGGCAAGCGTATAGACG
GTTGCAGCAAATAAAACGAAGGTGTGAATAACGTCAGATATCCCAAAGAT
TATCAGGGAAGCTTATATTTATGTACGAGGTGGGACAATGTAAAGGTGGT
ATAAGTCTTATGTATCTTGTGAATTTCGTCACATAAAGCAGGGGGTGTGC
TTAGAGCTCACAGATATATtacataaaacactagatagagctactctgta
tttcccaagcaacagCAGGTGAAGTAAAATATTGCACCaactttgctgaa
agtaggtcacagtagaaaacttgaatttcactgttgaaactttttgacac
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TCTATCCAGTGTTTTATGTAAGATATCTGTGATAGAGCCCCCTgtataaa
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AATTGAAGGACGGTGTAAATGGCGGTGTTCAATCTCAACCGCCCACGCAA
GCTGCCGCTGTATCGGTGCCGCCGCCACGCCCAATACGTAAAATGGTCAG
AAAGTAAGTTTtgggacctaccccggtggaggtcctataaattcacctct
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TATTTCAGGATTGTACCGGCCGACAATTCGTGTTTGTTTGCAAGCATCAG
GTAAGCCGGATGATATATTTCCGATACCATCCAGATTTTTAGGTCTTTTA
GTTTTGTAAATAAACTGGTGATATTCCATGCCCTCATGCAAACCAAATTT
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GGAAATCGTTTAAATCAGGAAAATAATCGGCTTTAGTATTGTAGAAGGCT
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TGAAATCTAAATATCTGACTCTCAACCTTCTCCCAGACCATAGTTTCTCC
TAACCCCTGGACTCTCTTAACCCATAGTTTTGTTGTGCTAAGTGACACCG
CCTTCAAAGACGATTTAAGAATGTTAGCAGCCAACACGATAGCGAGTGAC
CCTACAACATATAACGATGCTTTCCTTGGCAAATCTAATTGGGAATATTG
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ttttcttcgaataagagaaagattcgaattacagagagtaactTAAACCA
CTTTCCCAACTGGTATAGAAATTCTATCGTTCCCGGATGAAAAAATCCCA
TAGGGGTGGTTTTGGAATGCAGTTTTTCTTTTGGTCTAATTTGTAGTTGG
GCGGGGGTTCAACAGGGAATTTCGAGTGGGCGAGGGTCCAACagggaatt
tcgagtggggtgTTGGACCCTAACAGGGTCTGGGGAGTTTAATGGGCATG
TTACTTAAAAGTAAGAggttgcacgtttttttatttttaagaaacacact
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ttaaaaaaaaaacgtgtatgtatgATTTTCTCCTGATTTTAATCATGTCA
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GTTTTCCCAACATTATCAGATGGAGATAAACGCTGTTGATGTGCAGAGTG
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ATTAATATTTTGATTCATAATTCCATgttgagttgttttttttcagaacg
GTAGCCCTCTAGATTTCTACCAGAATTTCAATAACCCGTTCTGCATAGCT
TCATGAGGGTTGGGAGCATATTCTTGTCTCTCTGACGATAGCCGTAGATG
GCATTCTTAGACGTTTGCACAGAATtgttaaacaaaagaaagaaaagttt
cTCCCTTCCGCACCGCACGcgcacaaattttgagaaattctattgttaat
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tttcaaaaagaacgacaaatttcaccaTCCAAAACCCTGACTGAAAGTGA
CTGTACTACCCTTACGTATTCATTCCTTTATGTGACTTGCGGATAATAAC
GACTAACGGTTTATAAATACGCATGCGTTTTAACttcatttgaaaatgaa
acaatagaatggGAAGTAAACACTTTCTCTGTGTGTTCATTCTCAGGCGA
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ACATATCAGCTTTCTCGGCTCATACAGTCTGTCTGGTGTGAAAAGGTAGA
GCATTCGGTTACGGTGCGAAAGatcgaaaaaggagccttcgggtcacaCC
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GACAAAACATTAATCAAtggataaaataaaatgttctcaattttCCGATT
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GTTTCATCCATCTACGAAACACACATTTCAGACAAATTAagttaaaagtt
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AGGAATCATTCTGCAACAACTTGGATATGCAAGAACTTAACCTGTTTGTA
GGCTCCTGGATTTTCTCATTCTCGTTTCTCTCTCTTCTCGCACACACACA
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GTAATACTCCTTTGAAAGGACAAACACAAGCTCAACAGCATGCCAAAGAA
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AATGCcatcatggaggtaataaaaatatagatggagagtcaatgcctttt
gttctattccgatttatcatcggaagcaaacagctgtttggttgctttgg
gaataagatgattaattttgggtatactcgtggaaatatttaagatgaat
gaaaagacattacatttttaacaagtatattgaaatataatagcctcgtc
atgaaaaattgaaaaaaacttcacataataagcacaatagtgaggttaag
tatcgatagaTGAATCACGACGGCGGACGAATTTTCTCTAGCCTTCGTTC
ACGCCACGGCACTTTTTTACAGGCTGATCGAAAAGCAAGCTAGACTTATC
CCTTGTATTATATCCGCTTTGCTTTTAGAACGGAAAATCAAGCGGAAATT
TGTTCTGGaagcaaagttgatttcattGTGGGGATAAGTctaattcgtcc
gtcgtcgtgatttatctatcgatacttaacctcactaatactccaaactt
ctaggggaagctgcccataaagccatcgatagatttaaaaaagaattacg
tgttgTTACAATTAGGAcgcttgtatcgatcattttgtcagagtatgaaa
accgctgcccacttagacgtgaatattttaaaaaaagaaactttcaatga
caatgtgatgcaactctcaatattaacaaaatgccagcccaaaaatctgt
ccttatgaaattaatttaCTTTTAGTCTTCAACAttagttgaaactattt
cgaatcgcattttaacaaggattttcggtaaaattaagtttttcaaaatc
aaccaaacagtctctttctgttcttataaattaataaattgatgtttttt
tccttccaatgatggtacatcaaagaaaagccgctttgaatagatctata
aaagatttcaacgaccatttagatcattaccgagacgttttctctccatc
tatatctttattaccttcatgatgccatgcaccattgcaatgtcctCTAA
AACTACATCACAGAACCAACAGCTGATGGTTGAAAgggacgtattgactg
attttacgtcacttacaaccaatcagctgttgggtccgtgatgtaatatc
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CCTTTGTAAGTTAGGTACATTCGTAAATCTAAAAGTAGGAATAGttagat
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TTTATCAGATTGTTACATAATActtatttgaatgaaaattttaaaaacat
ttcaaaaaaaattgtttttcgaaaatatatatttatctGTGCATTACAAA
TCgcatgtttttttcaattttctaaatttgctTTTCGTCTTATCGTCTCA
CGAGCTTTTTTCGTCTTCCATTTAGCACTGAGGAAGGGAAACGGTGTTCG
TATTATAGTTTTCTTACAAGATGGATCTTAAGTTGTTCAGTGGTTCAAAT
TTATATTGAAATAAACTTTCAGATTTCTAACTTTCCTAGAACAACTCTCC
TATGAAGTATGATGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000216_pilon:549381..563545+ >MSTRG.19206.1.p1 ID=MSTRG.19206.1.p1|Name=MSTRG.19206.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7392bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:549381..563545+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTAAACCTTTGAATTTGAGATGTCAATTTGGAAGTGGACAACGGCA
ACCCATCAAGGGCTTAAAAGAAGAATCGACACTGGACGAGTTACAAGCTC
TCATCTTCAGCATTACTCAAATACAACCTGACAAACAATGCATTAAAAGT
GGCTACCCGCCAAAAGCATTGAACTTATCCGGCGCCGAAACGAACACTTT
GAAAACGGTTGGCTTGAGGTCAGGTGATACCCTCATTATTGAAGAATTGA
AGGACGGTGTAAATGGCGGTGTTCAATCTCAACCGCCCACGCAAGCTGCC
GCTGTATCGGTGCCGCCGCCACGCCCAATACGTAAAATGGTCAGAAAGAT
TGTACCGGCCGACAATTCGTGTTTGTTTGCAAGCATCAGTTTTGTTGTGC
TAAGTGACACCGCCTTCAAAGACGATTTAAGAATGTTAGCAGCCAACACG
ATAGCGAGTGACCCTACAACATATAACGATGCTTTCCTTGGCAAATCTAA
TTGGGAATATTGTGAATGGCTTACCAAGAAAGATCATTGGGGTGGTGCGA
TAGAACTGAACGTGTTTTCCCAACATTATCAGATGGAGATAAACGCTGTT
GATGTGCAGAGTGGACGAATCGATCGTTTCGGCGAAGACAACAAATATCC
GAATCGCGTGTTCGTCATGTATGATGGCATCCATTACGATCCGATGGGAT
tagaagaaaatgggaaaattgtTCAAACAGTCTTTCCAACTGATCAACCA
CAATACCAAGCACAAGCTCTCCAGGTCGCCAATGAACTGAAAAAGAATCG
ACAATTCACTGACCTGGCTGGTTTTACCTTACGGTGTATGATATGTAATA
CTCCTTTGAAAGGACAAACACAAGCTCAACAGCATGCCAAAGAAACTGGA
CATATGAATTTTGGTGAAGTTTAAATGGCTAAACCTTTGAATTTGAGATG
TCAATTTGGAAGTGGACAACGGCAACCCATCAAGGGCTTAAAAGAAGAAT
CGACACTGGACGAGTTACAAGCTCTCATCTTCAGCATTACTCAAATACAA
CCTGACAAACAATGCATTAAAAGTGGCTACCCGCCAAAAGCATTGAACTT
ATCCGGCGCCGAAACGAACACTTTGAAAACGGTTGGCTTGAGGTCAGGTG
ATACCCTCATTATTGAAGAATTGAAGGACGGTGTAAATGGCGGTGTTCAA
TCTCAACCGCCCACGCAAGCTGCCGCTGTATCGGTGCCGCCGCCACGCCC
AATACGTAAAATGGTCAGAAAGATTGTACCGGCCGACAATTCGTGTTTGT
TTGCAAGCATCAGTTTTGTTGTGCTAAGTGACACCGCCTTCAAAGACGAT
TTAAGAATGTTAGCAGCCAACACGATAGCGAGTGACCCTACAACATATAA
CGATGCTTTCCTTGGCAAATCTAATTGGGAATATTGTGAATGGCTTACCA
AGAAAGATCATTGGGGTGGTGCGATAGAACTGAACGTGTTTTCCCAACAT
TATCAGATGGAGATAAACGCTGTTGATGTGCAGAGTGGACGAATCGATCG
TTTCGGCGAAGACAACAAATATCCGAATCGCGTGTTCGTCATGTATGATG
GCATCCATTACGATCCGATGGGATtagaagaaaatgggaaaattgtTCAA
ACAGTCTTTCCAACTGATCAACCACAATACCAAGCACAAGCTCTCCAGGT
CGCCAATGAACTGAAAAAGAATCGACAATTCACTGACCTGGCTGGTTTTA
CCTTACGGTGTATGATATGTAATACTCCTTTGAAAGGACAAACACAAGCT
CAACAGCATGCCAAAGAAACTGGACATATGAATTTTGGTGAAGTTTAAAT
GGCTAAACCTTTGAATTTGAGATGTCAATTTGGAAGTGGACAACGGCAAC
CCATCAAGGGCTTAAAAGAAGAATCGACACTGGACGAGTTACAAGCTCTC
ATCTTCAGCATTACTCAAATACAACCTGACAAACAATGCATTAAAAGTGG
CTACCCGCCAAAAGCATTGAACTTATCCGGCGCCGAAACGAACACTTTGA
AAACGGTTGGCTTGAGGTCAGGTGATACCCTCATTATTGAAGAATTGAAG
GACGGTGTAAATGGCGGTGTTCAATCTCAACCGCCCACGCAAGCTGCCGC
TGTATCGGTGCCGCCGCCACGCCCAATACGTAAAATGGTCAGAAAGATTG
TACCGGCCGACAATTCGTGTTTGTTTGCAAGCATCAGTTTTGTTGTGCTA
AGTGACACCGCCTTCAAAGACGATTTAAGAATGTTAGCAGCCAACACGAT
AGCGAGTGACCCTACAACATATAACGATGCTTTCCTTGGCAAATCTAATT
GGGAATATTGTGAATGGCTTACCAAGAAAGATCATTGGGGTGGTGCGATA
GAACTGAACGTGTTTTCCCAACATTATCAGATGGAGATAAACGCTGTTGA
TGTGCAGAGTGGACGAATCGATCGTTTCGGCGAAGACAACAAATATCCGA
ATCGCGTGTTCGTCATGTATGATGGCATCCATTACGATCCGATGGGATta
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CATGCCAAAGAAACTGGACATATGAATTTTGGTGAAGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000216_pilon | genome | sc0000216_pilon:549381..563545 + |
|
