MSTRG.19179.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.19179.2.p2
Unique NameMSTRG.19179.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000216_pilon:1503..18384+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.19179.2.p2 ID=MSTRG.19179.2.p2|Name=MSTRG.19179.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16882bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:1503..18384+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATAGgtagggcaaaaagtgggccgtctaaactagagcatAGTTACTTGT CTTTTGGAGGCTTCTATTAAGGCCTACACTAAGGTACCACTTGCTTGCGC TGCGATCGTACTTTTCCGAGCAAAGCTTTCACACTACTGgtcaaaggaaa aatgaaacacTTTCATTGGCGCGATCAGACGTAACGgttcaaaaaagttg aaatgtattcaactttttttcgagcgcatgctatatttttatgacgtaat cttttttccaaacaaaaaggattgaaggcaaaaggtgcgatcgcagcgtg TGCAAGTGAAGACTGGCCTTTACTCtttcagagaaaaatatttattttat gcCTGAAGATGGGCAATTTAGTCCGAAATAAATATCAATATTTGTTAGCG TAAATTTATCTAAACACAGTCTTGAGATGAAGTTTGATGGTTACTATaaa aaaaTCGTAAGAAAATTGGCAGGGATTTATTTCTCTCTTATTTCTCTCTG GATATTTTGATGTCttctgttttgaaaaagaatcgaAACCCCATCTCAtt atttgtaaaatatcacaAATTCTTTAACATTAAGAATTCTATTTTGCAGG TACTTTTCATGTTTGCTAAAAGAGAAGCCACCCAAAATCAACACATCAGC ATTGGATCTTCCTGGAGTAACACACAATTTAGATGGACAATGCAAATACA CTTTTGGTAGAAAGTACAGTGGCTGCTTGGGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000216_pilon:1503..18384+

>MSTRG.19179.2.p2 ID=MSTRG.19179.2.p2|Name=MSTRG.19179.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1089bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:1503..18384+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGTGTGAACTACAAAAGTTGTGCTCTGGTCTTTGATTCTGGAATCAG
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ACGATGGTGACCATAATGAATGCGGAGTTGATGTCGCTCATGGAAGTGTC
ATGGCTCCACAAGTACACAGCCGCTTCGATCGAtttttttGGTCCAATTG
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GTTGGTATAGCACACGATGGTGACCATAATGAATGCGGAGTTGATGTCGC
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CATCAGCATTGGATCTTCCTGGAGTAACACACAATTTAGATGGACAATGC
AAATACACTTTTGGTAGAAAGTACAGTGGCTGCTTGGGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19179MSTRG.19179Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19179.2.p2.exon1MSTRG.19179.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon2MSTRG.19179.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon3MSTRG.19179.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon4MSTRG.19179.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon5MSTRG.19179.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon6MSTRG.19179.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon7MSTRG.19179.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon8MSTRG.19179.2.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon9MSTRG.19179.2.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon10MSTRG.19179.2.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon11MSTRG.19179.2.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.19179.2.p2.exon12MSTRG.19179.2.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19179.2.p2MSTRG.19179.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000216_pilongenomesc0000216_pilon:1503..18384 +