MSTRG.19179.1.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.19179.1.p1
Unique Name	MSTRG.19179.1.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000216_pilon:821..49586+
coding sequence from alignment at sc0000216_pilon:821..49586+

mRNA from alignment at sc0000216_pilon:821..49586+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.19179.1.p1 ID=MSTRG.19179.1.p1|Name=MSTRG.19179.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=48766bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:821..49586+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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tgtattttcaggttttttcaattttttgggcaaaaaatcaGGTATCCCCT
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ACGGTTTCCcttccttattttttttttagaaacctGGATTATTCACGAAT
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TGGATTAGATTTCCACTTTGGTCTCTTTTTAACAAGGTAAATCTCATTTT
AGCTGAATATTTTTAGAGATCCTTGGCCCTGACATCACTAATACTACCAA
GGATCTGGCTGTGACTGACTTTTCTGATACCATGAGACACCAAGGTTAAA
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TCTCAActccaaaaaaatcttttttttcttgatgTGTTGCTGaggatttt
gaaaaaagcagAAATTTCCACcaagcttcatttttctttctgaaGTCATG
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TTGCTTTTTGCCAGAGCCAACTCTTGAAGTaaaaaaagtgcaaatttttg
cttaaaatattttccttattttttaggAGGAATTTTGGTTATTCAGGTGA
GATTCTGAAAGAGTAACAatacagaaatatttttttcttgggcAAGCCAA
AAATGCAATCTTTCTTAAAAGTTTGTGCTAGATCCTAGCTAATTATTAAT
TAGTTAAGAGGGTTTTAAAGGATATGCTTTCTTAAATACCTGTATAGAGG
AGTGCCCAGTGTCTTGATTTGAAAAGTGGAGATATGGAGTCCATATGACA
ACCATTTTTCTctaatagaaaaaaaattcgattttgaCCCACTAATATGG
CTCAGATGAATGGCCCTTTACCAGATAAATTTCTCCCTTAAATGATTCCA
TTTAGGTCAGAATCATggtatttagaaaaaaaactCtcttCcaaaaatca
GgaGAAATTGCTCTCCTGGCTACCATGTATTGTAATCATCACCCTTCCCC
TAATATTTTATCCTTATTTAGTTATAATGCAATAAAaactgttttaattt
ttcacagGATTTACACCGTTGTATAGAATGTGTGTGAACTACAAAAGTTG
TGCTCTGGTCTTTGATTCTGGAATCAGAACCTCATTCATTATTGCTCATG
AAATCGGCCACAGGTCAGTTTTAACATGATGATAAGTTATTGATATTATG
TCTATAGCCgggtttcaatgttttgattttgtacggGCGGACTGAGGTGG
GTGGGCGATTGCGCTTGATTATTGGAGGCAACGATTTATATGGAGACGAG
TgaatatcaatcaaatttttgataacTACCAGTCATATTTCTTCGAAATT
TATGAATGGTAAGCCTATATACCTCTGagaaaacatactaaaatttattt
tcaaaagtcctaCCAGAGACttcgtcaaaacaaaaaatttgcttGCCTCC
AGCTAATGTTATGGTATTTTTGCCTCCAAAAAATCGGGCGGTAAAGCACG
TGAGTAAACAAATGATGTATCACGAAAGCCGTCTATtggaattttgtttt
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GTTTTTCAGTTATCTAATGGCCCTTATGATGCTAACATCTTGAAGCATTC
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CGTGGCTTGTGATTGTGGTATTAGATCTTGAATGTTTATTTTTAGTGTTG
GTATAGCACACGATGGTGACCATAATGAATGCGGAGTTGATGTCGCTCAT
GGAAGTGTCATGGCTCCACAAGTACACAGCCGCTTCGATCGAtttttttG
GTCCAATTGTTCAAGAAGACAAATACATCAAAATATCAGGTTATTGAACT
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GGACGTTTTTGATGGAGGTACAGTGGAacctcggagctccaattttgaaa
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CTGACTGCCCTCCATTACTCGCCCTCTATTTAACCAGTTGCATTGCCCAC
CCTCTTTTATCCGCCCTCTATTTAACAAGTTGCATTGtaaaactttttaa
tatttCTGTTTTGCATGGACAAACGTAGTAGTGGTTTATATTTTTAACCT
gtaattttttatacttttattaTTGCAAGAAAGATTTCGTAGCTAGTAGA
ATTGGTCTTTATGAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000216_pilon:821..49586+

>MSTRG.19179.1.p1 ID=MSTRG.19179.1.p1|Name=MSTRG.19179.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=103443bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:821..49586+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGCAGTTCATATCCAAGCAGAAGATTTGATTGAAACATTACAAga
tgtttctgttAttgttctgCCAACCAACATTTACTATGCAACATCGAAGA
AAGACATATTAGAATTAACATTCCAGGTTCAAAATGGCGATACTGTATAC
CATTTTAATCTCAGAACAAGAcatgataaaatattggagGATGATTCATG
CTTCATGGAAGGCTTTGTTTATGCTAAAGAACTACAAACAGTGGAAATGA
CAGTTTGTAACGGAATAattggtactttcaatagaaattcaacTAAAGCA
TCAATGATCATGCCtttattcaatgaaaatgaagaagtcaCAATAGATAG
ACTGTCAGTCACTCCTCATGTTATAACAACGATCAATGCAGAAGATGAGC
TTCCTGTCTATTCAACATTTATTTCCAATGAAATTGTGAAAGGAGGACGC
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TGAAAATCTTGCAATTAGACGTTAACAATACAATCATAAGTGTGTTATGG
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TACATTCCGATTGGATTAAATTTGACTAATGATGTGTACTCTTGGATCAT
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CATACATAAATGTGTCACAAAATATGAATACGGGTACACCCGTTGGGGTC
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CAGTAAGGTTGCCAAGccatcaactcaaatgaaatgcTTCCGTTATTGTC
CAAaaaTCCGAAAATGTATCGAAAAATCCAGAATGTGTCCTAGATTGTTC
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aagaaaatcaaagtcaagATCGAAGTCAAGATCAAGGAATTGA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.19179	MSTRG.19179	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


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Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000216_pilon	genome	sc0000216_pilon:821..49586 +

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MSTRG.19179.1.p1 (mRNA) -