MSTRG.188.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.188.4.p1
Unique NameMSTRG.188.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000001_pilon:3509707..3528434-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.188.4.p1 ID=MSTRG.188.4.p1|Name=MSTRG.188.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18728bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:3509707..3528434- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATATAAGTTTGTCTCAGCGAAGGTTTTTATATTTAGATTTTTCACTCAAT CTAACCCTCAAACTGGAAATCACATAAGGGCTGCAACAGATTTTTATTTC TGTTAACGTTAGTTAAGAAAATAAAAGTTTGTTTTTCTTGGAGAGATTAT ACAGGTTTTGTGAGCCCTGATTATGTCATCAAGAAAGAGTGACGTGTTTT TCTGTTTTTCAAGAATAGCACTTCATCAAGAATTCCTTTCAATTTGGTGT TGGTAACCTTGAGTTTATTTGTTTGGGTGAATGGTTCGAAGTCAGACGTC TTTTTTTACATTTATGAAGCTTGTTGAATCTGGTTGATGATAATCGGAAT CAGAGCTAGATTTGGTTTTACATTTATATTGAATTTACAGAAAAGAAAAT ATCACAAGGTGAAAGCTAACTTAAGTAAAGAATGTCACGTAGACCACGTC CAAAATCTGCAATTTTTGGTAGTAAATATCCTTCACGGCGTTCTTTCATT GAAGATTTGATCGACAGTGAAGATGAAGAATTGGAGGAAGAAGAAGAAGG TAAATGGTTTTGCCCCATTATATTCATTTCAACGAAATTTCAACGAAATG TCTCAGATCATTTTACATGAAGTGTTATTTTTGCAAAAGTATTTGGCAAA GGAAATTTTTCATACACTTTTAACTGCTGTCTTAGTGTTTTTAGAAGAAG CCCTATAGAAAAGGAAATAATTATAAAAAAGGTAATGGACTCTTGCTATT ACAGATTACCTACTGTAGTTTTAAAAGCTTATATATTTACCTTTAAGGTA TAAAACATTTAAACCTTTTTCTTAAAATCTAATAACCAAACACCAGTTTA CTTATAAGCTTGCATATTATTTTTTTCAAAGTTATGAACACTATTTTTCC CCTAATCTGAAATGCTGATAGTTCCCTTTGAAAAAGGTTTTATTTTAATT 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CCCGGATATTGTCGGTGTAGTTCGACCAAATAATACAAGGACAGTAGTTG ACGTGGAAATACCACCGGAACCGATACAAGAAAAGCCGATACCGAAAAAG AAGAAAAAGGGTATTATGAAGGTGTTTAAACTTTGTACAGGGAAGTCCGG ACAAGCTAAAGAGTACGCTAAGGATGATATGTATGTTAAACGAGAACCGG TTAAAGTGACTATGAATACATATTCTAATGAAACATGTAGTTAAGTAAGG AATATTTGTTCGTGGTTATTGATCAAAGATGCTTGAATCTTCAATTCGAA AGAATGTCGAGCTCTCCTTCTAAAGATGGATTTGGAGAGGGCGTTAGTTG GAGTATTTTGATTATTCTGATATAGATTTTGACCTTTTGAAAGGGTATCA TTAACAGACAACTCGTATCTTCGAATGATTTTCTCATATGTTTAATCCAT TGAGTTTACTGACGTGACTCACTCTATTGGAGCTTCATGTGTTTAGTTTC TTAAAGCAATGATCTCTTCTTCTTATTTTCAAATAAAGCAGACATCGCGC GGACAAAAAGTTACAGTTCTTTGTGATAATAATATCAGTTGTGATAATAA TATGGTACATGGCGACAAAAAGGAAAATTTTTTATAATGGTTGAAATTTA TGATTTGACGGTGATAGAAGTCTGGTAACGAGGCTTCTTTTCCCGTTCGC TGATTGGTTGGTTGTTCATTATTTTTTATTGTTTTATTTTTAAGAACTTT TGTGTTGGTTGATTGTAATTACCTTAACGGCCCTATTTCACGCTGGTCGT TATTATGCCAAAGCTCAATTTTTCTATGATTAGGCCGGCCTTTATTTAAT TCTAATCCTGTACACCGGCCCTTGTTACGACAACGATGAAAAAATAACGT TAATAAGGTCTGGCATAAAAAAGTCAGATAAGTTATTAGTTGTAGTCTGT TCATTATCATTCGGATAATAGTTAACAACTTTTAAGAAGTAGCAAAACCA CCATTGAAAAAAAAATATGATAGCGGACTATATATATGATTATAAATTAA GCCCCATTTACATACAAACATTGTATAATAATGTAACCGATAGGGCCAAA GGTGGCCGGTAGGTGTTGACCGTACTACTGGCACTCGGCCCCATTTTAAG AATTAGCAACCTTTAAAGATTACTCTTGGGCGGAAGAGTCTATACTGAAT CTCTTTGAAATGAAATAGTGTCACGAATTTTAAACTGATGCTTAGACCAA GTCCACGCCCAAAACGTAACCCATTATTTTAATTGTTAACAATCATGTCG ATGTTTTAGAGAGATAATTTATTTTTTAGAATATTTTTTTTTCGTTATTT TATGATGAATTTTATGGCATACCTTTGCAAGCAAACTTGGAAACAATTTT TTTTATTTTTCAAAACTTTGATAAAATCTTATAATGTAGCCCTTATATAT TCTTTTACTGATGATGTAATGTTTTATTTTGTTTTAAATTTCAATCCTCT ATTTTAATACAAACCTTTATTATTTTTATATCATATTCCACAGCTGCCGC TTCTCCCACAACCAGTAATCTTGTAGTAAATTAGTAAGTTACCAGTAAAT TACCTAATTTTTAGCGAAAACTAATTTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:3509707..3528434-

>MSTRG.188.4.p1 ID=MSTRG.188.4.p1|Name=MSTRG.188.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4284bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:3509707..3528434- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATGCTGAAGGGAAGGTGGGAGAATACGAACAGCAATTGGCTGCACTCTT
AAACAGTCTTGAAGAACAACAACGACTCTCCGATCAACAAACTAGAGACT
TAGAAGAATCGAGACAGCGCGAACGACAGTTGTTGAACGATCAAAAGAAA
ATGGAGGTCACTATGAAAGAGCAGGATGAACAAATACACAACCTCTCTCT
CAACCTTTCACAAGTTTCCAAAAGTATGCATAATATCTCATTAAGTAACA
AACCAACACATCAATCAACGCCCGTTAGAACTGCAACGTCAGCATATTTC
CATTCCGCCCACCACCATGGCAATGACGGCGATGGAGGTGCAGCGAGCGG
GAGTGAATCGGGCGATCACGACACGTCCGCCACAATACGCCATATAAACC
ACATGAATATTTCACACGTAGCGCCCATGCAGCGCGAACCTCAAGTCGCT
TCATCGGTTCCACAAGGCGACCGCTCGCATCTCCTCGACAACGACCAAGG
CTCGAATACGAGTTACACGGAAGGCAATAAATATTTAACAAAGAACTACC
ATTATCATAACGATAACGATAATCGGACTATTAACCTCCCGGAAGGACCC
CCGGATATTGTCGGTGTAGTTCGACCAAATAATACAAGGACAGTAGTTGA
CGTGGAAATACCACCGGAACCGATACAAGAAAAGCCGATACCGAAAAAGA
AGAAAAAGGGTATTATGAAGGTGTTTAAACTTTGTACAGGGAAGTCCGGA
CAAGCTAAAGAGTACGCTAAGGATGATATGTATGTTAAACGAGAACCGGT
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AAGAACTGAAGAAAGAGAATTTCGACCTCAAACTTCGTCTGTATATGACG
CAGAAGAACAGCGAGATGGACAGAAGAATATCACAATGAAAGACAAAGAT
GAGATGTCACGTAGACCACGTCCAAAATCTGCAATTTTTGGTAGTAAATA
TCCTTCACGGCGTTCTTTCATTGAAGATTTGATCGACAGTGAAGATGAAG
AATTGGAGGAAGAAGAAGAAGAATGCTGAAGGGAAGGTGGGAGAATACGA
ACAGCAATTGGCTGCACTCTTAAACAGTCTTGAAGAACAACAACGACTCT
CCGATCAACAAACTAGAGACTTAGAAGAATCGAGACAGCGCGAACGACAG
TTGTTGAACGATCAAAAGAAAATGGAGGTCACTATGAAAGAGCAGGATGA
ACAAATACACAACCTCTCTCTCAACCTTTCACAAGTTTCCAAAAGTATGC
ATAATATCTCATTAAGTAACAAACCAACACATCAATCAACGCCCGTTAGA
ACTGCAACGTCAGCATATTTCCATTCCGCCCACCACCATGGCAATGACGG
CGATGGAGGTGCAGCGAGCGGGAGTGAATCGGGCGATCACGACACGTCCG
CCACAATACGCCATATAAACCACATGAATATTTCACACGTAGCGCCCATG
CAGCGCGAACCTCAAGTCGCTTCATCGGTTCCACAAGGCGACCGCTCGCA
TCTCCTCGACAACGACCAAGGCTCGAATACGAGTTACACGGAAGGCAATA
AATATTTAACAAAGAACTACCATTATCATAACGATAACGATAATCGGACT
ATTAACCTCCCGGAAGGACCCCCGGATATTGTCGGTGTAGTTCGACCAAA
TAATACAAGGACAGTAGTTGACGTGGAAATACCACCGGAACCGATACAAG
AAAAGCCGATACCGAAAAAGAAGAAAAAGGGTATTATGAAGGTGTTTAAA
CTTTGTACAGGGAAGTCCGGACAAGCTAAAGAGTACGCTAAGGATGATAT
GTATGTTAAACGAGAACCGGTTAAAGTGACTATGAATACATATTCTAATG
AAACATGTAGTTAAATGCTTCAAGAACTGAAGAAAGAGAATTTCGACCTC
AAACTTCGTCTGTATATGACGCAGAAGAACAGCGAGATGGACAGAAGAAT
ATCACAATGAAAGACAAAGATGAGATGTCACGTAGACCACGTCCAAAATC
TGCAATTTTTGGTAGTAAATATCCTTCACGGCGTTCTTTCATTGAAGATT
TGATCGACAGTGAAGATGAAGAATTGGAGGAAGAAGAAGAAGAATGCTGA
AGGGAAGGTGGGAGAATACGAACAGCAATTGGCTGCACTCTTAAACAGTC
TTGAAGAACAACAACGACTCTCCGATCAACAAACTAGAGACTTAGAAGAA
TCGAGACAGCGCGAACGACAGTTGTTGAACGATCAAAAGAAAATGGAGGT
CACTATGAAAGAGCAGGATGAACAAATACACAACCTCTCTCTCAACCTTT
CACAAGTTTCCAAAAGTATGCATAATATCTCATTAAGTAACAAACCAACA
CATCAATCAACGCCCGTTAGAACTGCAACGTCAGCATATTTCCATTCCGC
CCACCACCATGGCAATGACGGCGATGGAGGTGCAGCGAGCGGGAGTGAAT
CGGGCGATCACGACACGTCCGCCACAATACGCCATATAAACCACATGAAT
ATTTCACACGTAGCGCCCATGCAGCGCGAACCTCAAGTCGCTTCATCGGT
TCCACAAGGCGACCGCTCGCATCTCCTCGACAACGACCAAGGCTCGAATA
CGAGTTACACGGAAGGCAATAAATATTTAACAAAGAACTACCATTATCAT
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TGTCGGTGTAGTTCGACCAAATAATACAAGGACAGTAGTTGACGTGGAAA
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CTATGAATACATATTCTAATGAAACATGTAGTTAAATGCTTCAAGAACTG
AAGAAAGAGAATTTCGACCTCAAACTTCGTCTGTATATGACGCAGAAGAA
CAGCGAGATGGACAGAAGAATATCACAATGAAAGACAAAGATGAGATGTC
ACGTAGACCACGTCCAAAATCTGCAATTTTTGGTAGTAAATATCCTTCAC
GGCGTTCTTTCATTGAAGATTTGATCGACAGTGAAGATGAAGAATTGGAG
GAAGAAGAAGAAGAATGCTGAAGGGAAGGTGGGAGAATACGAACAGCAAT
TGGCTGCACTCTTAAACAGTCTTGAAGAACAACAACGACTCTCCGATCAA
CAAACTAGAGACTTAGAAGAATCGAGACAGCGCGAACGACAGTTGTTGAA
CGATCAAAAGAAAATGGAGGTCACTATGAAAGAGCAGGATGAACAAATAC
ACAACCTCTCTCTCAACCTTTCACAAGTTTCCAAAAGTATGCATAATATC
TCATTAAGTAACAAACCAACACATCAATCAACGCCCGTTAGAACTGCAAC
GTCAGCATATTTCCATTCCGCCCACCACCATGGCAATGACGGCGATGGAG
GTGCAGCGAGCGGGAGTGAATCGGGCGATCACGACACGTCCGCCACAATA
CGCCATATAAACCACATGAATATTTCACACGTAGCGCCCATGCAGCGCGA
ACCTCAAGTCGCTTCATCGGTTCCACAAGGCGACCGCTCGCATCTCCTCG
ACAACGACCAAGGCTCGAATACGAGTTACACGGAAGGCAATAAATATTTA
ACAAAGAACTACCATTATCATAACGATAACGATAATCGGACTATTAACCT
CCCGGAAGGACCCCCGGATATTGTCGGTGTAGTTCGACCAAATAATACAA
GGACAGTAGTTGACGTGGAAATACCACCGGAACCGATACAAGAAAAGCCG
ATACCGAAAAAGAAGAAAAAGGGTATTATGAAGGTGTTTAAACTTTGTAC
AGGGAAGTCCGGACAAGCTAAAGAGTACGCTAAGGATGATATGTATGTTA
AACGAGAACCGGTTAAAGTGACTATGAATACATATTCTAATGAAACATGT
AGTTAAATGCTTCAAGAACTGAAGAAAGAGAATTTCGACCTCAAACTTCG
TCTGTATATGACGCAGAAGAACAGCGAGATGGACAGAAGAATATCACAAT
GAAAGACAAAGATGAGATGTCACGTAGACCACGTCCAAAATCTGCAATTT
TTGGTAGTAAATATCCTTCACGGCGTTCTTTCATTGAAGATTTGATCGAC
AGTGAAGATGAAGAATTGGAGGAAGAAGAAGAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.188MSTRG.188Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.188.4.p1MSTRG.188.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.188.4.p1.exon4MSTRG.188.4.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.188.4.p1.exon3MSTRG.188.4.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.188.4.p1.exon2MSTRG.188.4.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.188.4.p1.exon1MSTRG.188.4.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001_pilongenomesc0000001_pilon:3509707..3528434 -