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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000199_pilon:571478..579688+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.18493.1.p1 ID=MSTRG.18493.1.p1|Name=MSTRG.18493.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8211bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000199_pilon:571478..579688+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAAGATATTTGGTGATTGTGAACAAAACTAAAGCATAGAGGGCGTGACG
GTGAAATTAGTGAGTTTATTTTATCTTTACTTTTCTGCGACATCCTGACA
GGAGATGacggttacacgttttttttttattagaacccagtttataagaa
cattgaggctgaaattcgtcgaaaaattaagaacatcgtaagaacatggg
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caaatattgtccaaattttaccaattttaaaagTGCTCTTTactttgcat
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GAATTGTAGAAAGACTCGAATAATATAATTCGAATAGGCGAGAGTCTACA
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ACAAGCTGTCCAGGAGTCAAAGTTATTTGACAGAGGTTTGAAATTCTCAG
GGTCAAcccccccccTCCTCCATGAAACTTTTCTTTCTTAGGCCATTGAA
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TTCAACGTTTTTAACTTGTTGAAACCGATATAAGACCAGTCTAAGCTTAT
CCCAATAAAAGTTAACGATGATAGATTTTACAACGTCACAAATTATGTAA
TAAACCTTCCATGGCTGTGTATATTCATGATGATCTGATTCAATGGATAG
CTATAGCTTTGGCGTAATTCTTACAATTAGGCGTaaaaaaaTTCTCGAGT
AAAAGAGAATTTTGTAGCAGTTCTTGGAGTAGTAGAACTAGATTTCCCAA
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AAGGCATTAGACTCGTACCTttggaaattaaaaatcaaGCTAGTGTTCTA
AATTAGTTTTACATATATAAATTCTTTATGGTTGATTTCTCTCATAACTA
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AAAGtataaattttttaagaaacaataaatcaatatttttttgataaaac
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CAAGTTATACATGTTATTTAAAACCAAAACgttcaaataaaaattctctA
AGATTTCATTCATACtcttaaaaactttttgtaaGGATGTTTACAAAATA
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CACATAATATAAGTTCAAAACATTTATTAAGTGAAGTTGGTTAGGTTATT
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TAATTCCTAAATGGTATCTTAACAGTATTCTATAAACTATTTTGAGGTGA
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TATAGTCTTTGAAAGTGTCTGTAGAAGGCTTTTTATACAAGGGACATCGA
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AAAATGGTTCTCTCAAAAGAGTACAAAACCATGAAAAAGCAATCCAGTCT
ATCTAAAATGATTCCCTCAAAGAgtcaatttttggaatttcgacaaaaat
ttgacaattttagcttaaattttgggaaaatagtCTCAACGATATCATTT
TggacaaaattttctaaattcagtCTCCCTTAGaaaaaaaCTCAATCTTT
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TGGAAAGCTTTAATTTCATTTTGTGAAGATTTCTTTGATGAGAATGATAG
TGAATGAAAAGCTGCATAAATATGGGCCTATGTATGAGGTAGTTATAAAG
GCTAATATTCCACTGAAACGTAAATTAAACTTTTTCGTGTCACCCATTTA
TCAAAATTGTCTTAGTGTTAACAAGACGTACTTCAAACAGTGTAGAAAAC
GTATAGCTAATGATGAGTTGACGATATGAAATAAGGTCGATCCATGTGAT
ATAGGGTGGATCAAACCATGAGAGAAGCAAAGATTGTCAAGAGTATCGAA
GGAGGAATTGGAAATACACAATGAGAGAAatcctattcataaaaattttG
TCTCGACCATACAAAAGTCTATAGAATTCGAGACAAAGAGTCAGTCAGAA
GGAGGAAAATAGAAAGAGGCAAATATTTCGGAGACAAGTCAAAAGTATTT
CCGATGCGAACGAGTGAAGTAAAAACGACAAGTATACCTTTTTATAATTA
CGTaaacaaaaagcaacaacaaaaacaaaacgagaaagaaatgtttgttt
gttatATAAATAATACGAACAATTACTGACAAAGGAGCCACACAAATAAG
AGAATTTTGGAAGCTGAATATTTCTTCCACACaaaaaaaGAGGACACCGT
ATAAAGGATAGTAAGAAACGTGATCCGGTAACTGTTATCTCTTTCACTTG
TATATGGTTGTTTGTATTATTGATGACATTCATTTCTTTCACACACAACA
ACTTGGATGTTGTTACAAATAAAATATCATCGTTTaaaaaaaaGGGGTAG
AGAAATTTTGTATGAGtgtttataattagttgatgtttatgttgtttttc
atatgtatgtgttctgttgtttgttatAGCAGTAAAATGCTCGTTTGTGT
GAGATTGATTTTTAGGTATGCTTTATGCAATTATCAAAACGAAGTAACAA
AACGTGTCCCCGAAGGGGCTAAAGATGAAACTCTTAGATGGAAAATGAGG
CAATTCGAAACATGTGGCCCGCGTGGTTTTCTTTTTACCAACTGAAAAAG
TACCATGTctaccattatggatttgagaGTGTTCCCATCTTCCTGGGTGT
GGGGCTTTGttttggtgattcctgacatgttcctggacctctgtgcaaaa
tttcatctctacaccatttttgtcccggttttggcggtttatgacctaat
tctacctgaATACTACCTCCTTACAACATTAACGATGTTGAGCAAGACAT
TGTTTAGATGTTGTGTGCCGgtttctttgaaagtttttcgtATGAAAACG
AGTAGTTTCTGGATATATTTCCAGGTATTTATTCACTTTAAACAAACTAG
AAAACAAAATTGGTAATAATCTAAGAGAggctttcaaatgaaaatttctc
tATATATTTTCAGGTAGTAATTCAACATTATAAACAAACAAGAggaaaac
aaataaacaaatataaTATTCAATGAAGAAGAATGGTACAAGACAACATT
ATCAATCTCATCAAAACAACACTACATCCAATCCCTATTGTCTTTGGTGA
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TTGTTCCAACATCAGGTATCACCAATGTCAGCTCAAATAATTATCCAGAA
ATACCTCTGGGTACAGAGATTGGTATTTCCACAGCTGTCTTCGCCGGCCT
TGGTATTCTCATTAATGCTTTGGTAATAACGGTTATAGTCATGGCCAAAA
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GATTTTCTATGTTCAATTGTGTTATTGCCTTACGTGCCGTTAGAATTGAA
AAGTCATTATTGGACCTATCCAGATGCAACATGTCAAATCATCTATCCAA
CAATATCTCTCCTGACCAATGTTTCGACAGGGACGATTTTGATTATAACC
ATTGAACGATTCAGAGGCGTTTGGTTCCCACACGCCCGTCAATGGGGCGG
AACAGACGTAAAGAAAGCATTCGCCATTGTCTGGCTCATAAGTCTTGTAT
CCGTACTACCCAATATCATCATGTTACGTGTGAAACAATATGACAATATA
ATATATTGTAATGAGGTTTGGGATGAAAACGATCCCACTTATAAGCGTTT
GTATGGATTCTCATTTTTGGctgtttcttttttcattccATTACTGGGAA
TTACTATCATGCACACCTTGATTATCTGTCGATTGAAATATAAAGAACTC
ACACCGGACAACATGTCAGCTCACCAGCAACGACAGAACCAACGCATTAT
GAGAGTTCTAACTGGTATTATAGCAGTCTTCTTCTGCACTGTCAGCCCAA
ACAAGATATTGTATTTCGTCTGGGATGTGGACCCCCAGTTGGAAAAGGAC
TTGGAATCAAATACACGATATTATTTAAGGACAGTACAATTTTTCTACTG
GTCTCGAGTAGCTATCAACCCTATGATTTATTGCTTCTTTGATACACGTT
tcaagaaagatttcaaaaagtcCACTAGAAGGATGCGTGGCTTGAGTATA
AGAGACAGTGAAGTTCGAAGCCGATCGGCTAGCCAACGCACTTCCACAAT
ACTCTCCGTACGATCAAGAGCGAACAGTAGCTTTATAGGCGAGGCGGAAG
AAGCTATCTCTCGATGTAACCGTATGAGTAAGATCTCAAAAATGGATGCA
ACGTCTTTGCAAACGTTCGTTGAAGACAGGGGACGTCGCGTACGTTCAGC
CACGGTAGATACGGACCTAAGTGTCTCACCAATGGCCCACAGCACATTGG
TAAAACAAGGATCTAGATAAATCGAAATTTATTATTGTATATGAGGTTCt
cgttttataagaactttaatATTTGTTAGGTGTATTATAAAATGCCGTAC
TTAGGTTAACAACTCCTTCCGCCCTGTTCGAGTCTGACCAAGATTGGGGT
ATAATAGGGGAGTGGCAAAATTTCGTCGAAAAGTGCTTAAGCTGAAAGTT
TACGCCTCACGTTTTTTATTACTTCACTCACTATAAAAAGGAGACAtttg
gcttccacttttttacaacttgatggcttttaagtacgttttttcctctt
tttgaacatttATATTGCCAACTTCAACGACTTCAATTTAATTGACTCGA
TGAAACATGTTTTAGCGATAATTGCTCCGACTGTCATGTAGTTTCCAATC
CTTGttttaaatgtatatttttcGGAAAGCAACAGAATCTAACGTTATAC
AGTAAACATTAGATTATActtgttgaaaaatgaaaaatttgcaaGTAACA
ATAGCTAATCAGATACAGATATGATTTCTGTGGCCAAACCAAAGACCTAA
ATACTTGTACTGATCGAATAAAATTCATGATGAAGCTTATTATCATATTA
TGTTATAAAGATTGTATTTTTCATAAAGATTGAATATAATATAAATCATA
TCATTTTTCTTGCatttatatagaaacaagtattattacaaatatatatt
ttataaaatattataataatgattatttttaataggtattctttcatatg
tatgataGTCCCCTCCTTGTAAAATTCTTGTAGCTTATTATACtcattat
atttttaaaaagtcatATACATTATAGTATCAAAAAGAGAAAACTAAAGT
TATACTCACAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000199_pilon:571478..579688+ >MSTRG.18493.1.p1 ID=MSTRG.18493.1.p1|Name=MSTRG.18493.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1338bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000199_pilon:571478..579688+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTACAAGACAACATTATCAATCTCATCAAAACAACACTACATCCAAT
CCCTATTGTCTTTGGTGAGAAATACAACAAAACAGATAGTAGTAGTGGAT
TGAATAACAATCGTTTACTTGTTCCAACATCAGGTATCACCAATGTCAGC
TCAAATAATTATCCAGAAATACCTCTGGGTACAGAGATTGGTATTTCCAC
AGCTGTCTTCGCCGGCCTTGGTATTCTCATTAATGCTTTGGTAATAACGG
TTATAGTCATGGCCAAAACAAGACAATATTCTACATATAAACATCTAATG
CTACATTTGGCAGCCTGTGATTTTCTATGTTCAATTGTGTTATTGCCTTA
CGTGCCGTTAGAATTGAAAAGTCATTATTGGACCTATCCAGATGCAACAT
GTCAAATCATCTATCCAACAATATCTCTCCTGACCAATGTTTCGACAGGG
ACGATTTTGATTATAACCATTGAACGATTCAGAGGCGTTTGGTTCCCACA
CGCCCGTCAATGGGGCGGAACAGACGTAAAGAAAGCATTCGCCATTGTCT
GGCTCATAAGTCTTGTATCCGTACTACCCAATATCATCATGTTACGTGTG
AAACAATATGACAATATAATATATTGTAATGAGGTTTGGGATGAAAACGA
TCCCACTTATAAGCGTTTGTATGGATTCTCATTTTTGGctgtttcttttt
tcattccATTACTGGGAATTACTATCATGCACACCTTGATTATCTGTCGA
TTGAAATATAAAGAACTCACACCGGACAACATGTCAGCTCACCAGCAACG
ACAGAACCAACGCATTATGAGAGTTCTAACTGGTATTATAGCAGTCTTCT
TCTGCACTGTCAGCCCAAACAAGATATTGTATTTCGTCTGGGATGTGGAC
CCCCAGTTGGAAAAGGACTTGGAATCAAATACACGATATTATTTAAGGAC
AGTACAATTTTTCTACTGGTCTCGAGTAGCTATCAACCCTATGATTTATT
GCTTCTTTGATACACGTTtcaagaaagatttcaaaaagtcCACTAGAAGG
ATGCGTGGCTTGAGTATAAGAGACAGTGAAGTTCGAAGCCGATCGGCTAG
CCAACGCACTTCCACAATACTCTCCGTACGATCAAGAGCGAACAGTAGCT
TTATAGGCGAGGCGGAAGAAGCTATCTCTCGATGTAACCGTATGAGTAAG
ATCTCAAAAATGGATGCAACGTCTTTGCAAACGTTCGTTGAAGACAGGGG
ACGTCGCGTACGTTCAGCCACGGTAGATACGGACCTAAGTGTCTCACCAA
TGGCCCACAGCACATTGGTAAAACAAGGATCTAGATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000199_pilon | genome | sc0000199_pilon:571478..579688 + |
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