|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000199_pilon:387300..395959+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.18483.1.p3 ID=MSTRG.18483.1.p3|Name=MSTRG.18483.1.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8660bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000199_pilon:387300..395959+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTAAAACCaggtttttgaagaattttataGTTTGAAAATGAAGTCATTA
GGaagtaaaaagaaatatttcatcGTTTTCACTATGATAAGTATGCTAGG
CTTCATTGTGTTTTACATGTTTAAGAAAGTGATGGCAAAACGGGCACAAT
ATCTGAGAGATTTGGCAAGGCATGATGGTACTAAACATGGagaatccgcc
atctttgaagAACAATCAGCAATATTAGAAGAAAAAGACGACGAGAAAAT
TGACCAAGATGACATGAAGGTCGACGTCACTCAATATTTCgaatatcaaa
aatatgatCCCGAAAATCTTTGGGagcaatataaaaaaaagcCAAGTAGG
TTCCTGAATGTTGCAGCGTTATGTGAAAGTGATAGCGACGATACAACACc
aagaattgaaattcaaatctaTTACCAAACATTTGTTCATTTGTTTCGTG
TCCACATTTTATCGTTGACAAAAATGCTATCTTTCCAGACAAATGACAGT
AAGAATATCAAGTTAAAAATCATGCTCAgaagaagttcaaaaacatgttt
CTCCGATGTTACTGACATTTATCCATTTGGAGAAACAATTGAATTTTCCG
ACAAGTTCTCATTTGCAATCAAATTCAAAGAACTACAGGAATACATCATC
TACATATCTGTCTGGAATGTCAACATATTTCACCATGAGATCTTATTAGG
AGCAGCTCATATGGATTTGAGCAATTACAGTGATTTCACCAACAAGAACA
TAATTTCGAGCGACATTGTCCCTGTCAAAAAGGTGTGTAGAGAAACAATG
AATGTAGCTAATTTCAAATTGCAGTTTCTCCAATATATACAACACCGAAT
CTTgcaatatcaaaatattttcctctcTTTCTAGGACAAAAACATTTATG
GGCACATCTTGGTCGGGTTGTGTTATCTACCGAGTGTTGAACGGTTGATG
TGCGTGGTGATGAGCGCCAAAGACTTGAGAGATGATGTCACTAATCTTTC
CATTCTCAATAATGTCATTAGTGAGTGGCTTGAAAATGCCTACACACTAT
AATTCTTAACTCTTTCGAATAAAGGTCCTACCGAGGTGTTTAGAACAGCT
GATGAGCGGTAAAACAAAGCTCTGCCTCAATGACATCCCTGTCTCCCTGC
TTAACACGTTCGCTGCCAACTACGAGTATGCTCGTAGTAGAGTAGTCTAA
ATACCGGTAGTACTTCAAAGAGTCGTAACTTTTGATACGGAAACTTAGCT
TGCCTTTTTCACTGTATTTTTGGTATATCTACGTGAAATTTTGCGTCGAC
AGGTATACAATTTGTAGGCATTTGAAGTGAAACTAAGGCCACAGGAGCCT
CTGAAAGTCAAACATTCGATAACATTCCAAGaggttgaattttcaatttc
tgaaaaaggaTCTGCAGTAAAAGTGTCAAAATGTCGgtggttcttttaaa
aacgcaaaaaatgtACGTGAAAGAAGTGTTGCTAGCTTACTCGATACCTG
ATAATACCGTGGTTTTATGTTTTAGATCCCTTTGTAGACGTGTTTTTGGT
GAACGATGGGAAGATGATCAAATGTCATTCCACTAAAATATTACTCGATG
ATAAATCACCTGTTTTCAACGAAGCTATCGAGTTTTACATTCCGAATCAT
CAAATAGAAGGATCGGATATCCATCTGATTGCAATGCATAAATACAATCG
TATCACGAACACTCTGAtagggaaagtcatgattggaAGTCATTCCGATG
GTCATTACAAAACACACTGGACTGAAACATTAGCTAACCCAGAAAAAGTC
ATACCATTTTGGCATCCCTTAACACGATGACGTCAAGATCAAGGAAAtaa
gatatttttcttttgtttagaaatttGATCTCATGAATATATGTCGAAAG
ATCTATTTGATCAAATAGGACTAAAACAAGtttgagatttgaaaatttcg
aaattgaaCGCATAGTATGTAAGCAAATAAAGGGAAATTAGGCTTAAATA
TGAGAAAACATTTGAGTATCTTGTGCTTTGGCGTTTTATTTTTGGTTCTT
GGTATTGGTTTAGAAACTGCAGGTGTAGCAGCGCCAGAATGGTTTAGAAA
TACCAATATCACAGATGATGCTATAATTGTTCTCAGCATATGGAATCGTT
GTCAAGAAGGACCAGCTCTGAAAACACCACCAAAAGATTGTAACAAAGGA
AAAGTATTATTATTTGGAAAAGATGATTTTGGTAAGTTATTCTATTGCAT
CTTCATCATGTATACAAGAAAAAGATacaattaaaaatgataattttaat
TAGAAAGATCATTTCGAATTGATGAATTCAAGGGTtgaaaagtttataaa
aaaattgaaaaagaagaaactgcAGACTGCTAATTCTTTGAAATGGACTT
AAATTCAGACAAAGATTTTGCTCGTGAAAGTATAAAAATACGGTGAGAAC
aaaaaaaTTGCTcttaccatagtataagaaagccgcggctggaatgataa
catctgaatttctgttattctatcactgtcgtatttgatgactatttgtt
gatcaagaaatcagtaatgtagcatctttaatggtaaattttattggttt
gtcgttaataattacttctcagtgcgttttagacattaatgatatgctct
tgataatacacttgcattataaaatcattgtaaaggaaaaatcaaaacta
agaaattgaaataagcacaaaatggctgggctgaaagaactcaaaaatta
atgaggtgcctcgaaatgccttcgcaatatttcagtgaaatctatttaga
aatcaatgaaaaagtacatcaagataataatgtgaaaatttcaagccagc
accttcaaaatgtatcatttaaactgacaggaaagttgtcttcttgaata
tagttcttataattttaattttagcgaaaaactattgtttccacaaaata
cccctaaaatatgtccaaaatttgttcaagtgttctattgggtacatatt
caaagatatctaacgacaaaaaaactttttgtgaagaaaaataagagaaa
aatttcaaaaactatctaccgaTAACAAACTGATCATCTTGATGtgctta
taaagctcggagacagagatggaacagcaattaactgaaaagacaatgct
gtacatattccagccgcggctttcttatactttCTTACTGTGTTCGTTCT
ATTTCCAttccattttgatgttttaaagGGTTTAATCAAGTTCACTCTCT
TTTTAGCGCTGGATTTGATATTGGCACTTCACTGTGGTTCCATATTGATT
TGCTTCATCGGATTGATCGCTGCAATCAGCATGTTTTATTGCAGAAACCA
AAGGAATGCCTGGAGACATTGTTCACTTTTCACATCagcaattattttga
tttctGGTGAGTTTTCGTCCtgaaatatatttgatttcAGATGAAATTCA
GCCTCGATATTGAAATGTCAGATAAGgacttttaccaaaatttatccaat
ttttagggtttttaaaataATGGCCAGTGAACCATAGTGTAAAGGCAGAA
GTTTCGAATGGGATGTgcaaggtcgtgggttcaattgGTAGTCGGGTTAA
ATCAAAGATTTTAAACTGGTGTTTGATGCCTCTCTTCCTAATACTCATCA
ATCTAAGAGATTGATCACGGGTGATCGAGCAAGCTAGGGAGACAGGCTAC
CTTTGGATAGCTAGAAAGAGCTTTCGGGTTGCCTCCGACTGAAGTCGaaa
aacttacttactttaagACAAGTCAAAGAAATGCGTGAGATTTGAAGATT
TCTAGTTACTAGTCATCGACACGTCCCCATACTGTCCCATACTCGAGTTC
CGAAAGTGACTCCTTCCAAAAGCTTGATTTTAATTAAATGATATatatat
tgataaaatattgaattttagcGGCATGTGGCGTAGTAGCAGTGGTGTAT
AACGAATAcaatcataaagaacattttctaAATTCATATTTACGTGGTTG
GGCGTACATGATGGCGGTATGTGGCGTTTGCTTGATATTCATTTCTGGTG
TCATCCTAGCGGTGTTGATCTTCATCAAACCTAGAAAGAAGATGATTTAT
GTACAAAGTAGAAGAATAGAACGTAACAATGAGAATGAGGTGGAGCTAAA
ATAAGATAAGAATAAGAATGTTTTTATTGGTAATTTTATTCATGCAGGAT
ACTTCACAAAATATTACGTTAGTAAAACACTTTCGGAGCCAATTGTTGTT
GTGTTGTTGATATTTAAAAGTTGTTACCTTCTTATATTACGCTTAAAATT
TATATCGtgacaaattgttttttttcattgagtgtcgacaatgaaataaa
aaataggaTTTCAGTTAAGCCGTCTGTGAGTTTAAAGTAACTATTATTTA
TTTGTTGAATGTCTGTAGAGAATATATTTGtaattgttaaaaataaattt
gaaattatcaaaatattatggcaCGAGGATCTTTATTGACTTTTACCTTA
TGGTTGCTCTTGACAAGTTTAGCAGCATTATCAGCCAGCATCTTTGGAGA
TGTTTGGTATGTTTACGAGCCCAATGGAACGACCACAGGTTTACTAAAGA
AATGCTACTTTGACATCCAGACTAAGAAAGTATGCATTAACAGAAAAGTG
tttaaattcaaagaaaagGATTTCGGTGAGTTTTGTTCATAAGTGTAAAT
ATTTAACTTGAATTTTAGCCGGTCTCACCTCACTGTCAATTGGTACTCGA
GCGCAAAACAGCTGAATTCAAGATTAAACCTAGCCTATACCAACCCACCC
ACGgacgttttttatattttgaaaaacttaccGTGTGTCGGTCTGTTTCG
TTTAGCGAGATTCTGTGTCTCAGTTTGTCCCAGATTTTCCAGGAGTGCTC
TTATACCATTGCATTGATGCGTTAAATAGACCATCCCTGCAGAAACATCT
AGAGGTTTGCCTAAAAATGTCTGAGACACGGAATGTTGCTTAACCGTAAC
AAACCGAACTCCGCGTTATCTTTTCAGTAAGCAGTACAGGTTAGATTAAA
ACTTCTAGCCAAAGTTTTGAATaagatattcttttttcaaacgGGGATAA
AAAGTCGGTTTTTACGGACTGCACGAATTTACAGCAAAAAACTATTTCGA
TTTTGTACATTTCAGATTTGGATGTGATATTGACAGGGCTATTGGGCTCC
ACACTTCTCATTATATGCAGTATTTCGATAGCGACAAGATTGTACTGTTC
ACAAAAAGTGATCGTCCCTACCTGGAAATGTTATACCACACTGATTGCAG
TTTTGACTATCACAGCTGGTAATGAACCAAAGTctgtttatttcaaatta
cTGGGAAAGCGAGCATAAACTAAACTTGTACGTACACTAGCGCGTGTGCA
TTTTCggactttttgaaaatcttcttcAATTAGTAACTTGGATGATTTAG
CCTTGATTAATTTTGCgcataatcgcacgatgggttattttttcttattt
ggcgtgccctcaaagagagcaattaatcgttaattgcatcctgtagagag
caattaatcgttaatcaaaCTCTTCGATGTCAcaccaatgtttacaaaat
tgattttaatgttttttcttacatttttttttacatcgaacgttttaatt
gcattcgaaattcattttgtgagaaagaaattttataaacaacaataaaa
aaaacataaaagcgaagagaacaagacgacttaaagtcgaaaatttcgcc
tagaatttaaactacataggaaaaacaagaagtagagattgaagccaatt
tgaaatctactttacatcgagccttgacgAAACAATTTTacagaacaacg
aggcttaaaatcgctaaaaaagagaccaatttaagaactattgtttaatt
tttaagaactaattaACAAAGGTACAAtggaacaactaattaccgaaagc
tatatcaccgtctatcaagagttattggtttgattcttataaagtaaatg
cttataagaaaaataaatatgctcatattgtgcgccatcccttttttact
ttgtaagaactaattaccgaaaggtatatcaccgtctatcaagagttatt
gatttgattcttatcaagtatatgcttataagaaaaataagtaagctcat
attgtgcgccatcccttgtttactttgtaagaactaattaccgaaaggta
tattaccgtctataaagagttattgatttgattcttgtaaagtaaatgct
tataagaaaaataaataaggtcatattgtgcgccatcccttgtttacttt
gtaagaactaattaccgaaaggtatattaccgtctataatgagttattga
tttaattcttataaagtaaatgcttataagaaaataaagaaaaaatcaaa
actgttgAGCTCAAGACAGAAAGATATAttacgtaatccaaagaaaaccc
gcgaaaatcgtccgtggttatacgagcgtgtaatttgtaaattaaattta
gtgagttcgtccaccgtatcaagcactttcgttttctaattttttttccg
aggacaccgcagaaaggctatcgtaatactttcgctaagcgaaattaaaa
atataaaactctcagtgtaatttctataatttactttcctaactgagaaa
cccattgtgcgattagctagTAATCACATagtaactcgtacaattcgaaa
attgcactcgtgttTCGATTTTTTCTACTCCTTTCGgagtcaaaaacaaa
aaagtgttttttcgaCTAGTTGCGTTTTAAGGGTCCACCCCGTGCGAGCT
GGGATGAGATACCGAGAATTTCCCGAAaacgattttttcaaaatcttcat
aTGCAAATATATCTTTTTCAAGGTAACTTCatttaatattgaaattcaaa
tgttaATAGCCTTACCACTGGTTGATACTAGTCCCAAATATTATATTAAT
TTGATGTCACATAATTGACTTGCCTAGTATAAAAACTGTGGGTTGTCcca
aatcgtttcagtcacttCTTCATCCTCGAAAGCGTACAATACGTAAACTC
GCTAATAGAAATTAAAACAGTTGCTTTCTACCAAAGCAAAGtgattttta
tcgaattttcTGAATTTCCCCCATAATACGAGATGCTCTCTTTGTTTTTA
ATGGCTTCATCCTATCCAAATAGGAACTGGTGATAGAAAAAGATCGTCAA
GGGTTGTTTGTTTAGTGGGTACGAAAGCGTAGAAATAATTACGAAACTTA
TTATTCTTTCTTATAGCTTGTTCGACGACGGCAACTATGGTTTACTACAT
TTACGATGACTCGGGAATGCTTATAGATAAAACAAGTGGGTGGACAACTA
CAATAGGATGGGTGGCAGTTGGAGAGCTAAACTTTACCATGGTTTTTGCT
GTCCTTTTGAGATATATTGGTCCAAATCATGGAAACATAGTGAATGGAGT
ATATGAAACACGGAGGGGCGAATATGAGATGAATTAAAATCTCTGCTGGA
GACTGCGTTTGGTAACACAACAAGTTATGACGGGAAGATGAATCATTAAT
TAAGTGATGAACAGTTTCCTAAGGACAATCTTCAATAGATGCCGATAAAC
AACACTGCTATTTCTTTCATTCTAGCTCCCCTACCGTTCAACGAAAATCG
GCCAACAGCGCCGTCAGGAAAGGCACTTTGAATTCCAAATTAATATTTCA
AAGATCAATGAAGAAATGCCCGAAtaatatttggcaaaaaaaatcaaaac
gccTTTGATTTGAATTTACGGAACTTTTTTCGTAAACAATTATAAAGTAT
AGAATTagtaataaaaatcaaaacgaaataaaaaaattcataccttttta
cttttcaattttgttcATGGAGTAGCTTTGTTAATAAAATTGTATATATG
ATTTGAACTGTTTTCGATTTCGAAGAAAATGAAGTACCAGGGGTTGATCT
TTCTTCTCCTTTTCACTCGCCTAAAAACGTAAGTTAAAAATCTCTCAACG
AACACTTCCTTCGGTTGGAACACCAAATAAATCGGGACTCGAGAATTGAG
ACTTAAGGTTGGCTCCAGATTCCCATAATAATTTCTAGCTCTATAAGTTA
CTCATTTTAATAACAGCATAGTTCCTTGCCAGCATAGTTCACCAtataat
tgaaaattatttaccgTTAGTTTTCTTTTCTCAAAACGTCAGGATTTCGT
CTAATTTTTCCTGAAGGGTTCCTTCTTCCAAGTGACAGAAAAAAGAATTC
AATGAATTAAGATTACTATAGAACCTTAACAATTGAAGCTCAGCGTTCCA
TGAATAAAGAACTAAACCACAATTATCCGTGTCCTTCGTTgtgtatttga
aatatttttactacaTTGAATTAGAATGATAAGTAATGTAGAAAGAAGTT
TAGAGCTATTATATTTAGTAAGCGCGTATTCTTTTCTTCTTATTCAATTC
AGGATTGAAAGTGCAGAGCCAGTGATCAACAACGCCATAAACGAGATTAA
AGTATCTTACTGTTCAACGCAAGAATACAAACTTGACGCAAATGCTTATT
CTGATGCAGAAGACGGGAATTTAGTAGGTGGAAAACTTACATTGAAACTT
CTAGATGCGTCTGCAGCAACCTTCGTGCCAAATGATGAGAAGCCAGTACA
ATTGGTGGGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000199_pilon:387300..395959+ >MSTRG.18483.1.p3 ID=MSTRG.18483.1.p3|Name=MSTRG.18483.1.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1746bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000199_pilon:387300..395959+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggcaCGAGGATCTTTATTGACTTTTACCTTATGGTTGCTCTTGACAAG
TTTAGCAGCATTATCAGCCAGCATCTTTGGAGATGTTTGGTATGTTTACG
AGCCCAATGGAACGACCACAGGTTTACTAAAGAAATGCTACTTTGACATC
CAGACTAAGAAAGTATGCATTAACAGAAAAGTGtttaaattcaaagaaaa
gGATTTCGATTTGGATGTGATATTGACAGGGCTATTGGGCTCCACACTTC
TCATTATATGCAGTATTTCGATAGCGACAAGATTGTACTGTTCACAAAAA
GTGATCGTCCCTACCTGGAAATGTTATACCACACTGATTGCAGTTTTGAC
TATCACAGCTGCTTGTTCGACGACGGCAACTATGGTTTACTACATTTACG
ATGACTCGGGAATGCTTATAGATAAAACAAGTGGGTGGACAACTACAATA
GGATGGGTGGCAGTTGGAGAGCTAAACTTTACCATGGTTTTTGCTGTCCT
TTTGAGATATATTGGTCCAAATCATGGAAACATAGTGAATGGAGTATATG
AAACACGGAGGGGCGAATATGAGATGAATTAAatggcaCGAGGATCTTTA
TTGACTTTTACCTTATGGTTGCTCTTGACAAGTTTAGCAGCATTATCAGC
CAGCATCTTTGGAGATGTTTGGTATGTTTACGAGCCCAATGGAACGACCA
CAGGTTTACTAAAGAAATGCTACTTTGACATCCAGACTAAGAAAGTATGC
ATTAACAGAAAAGTGtttaaattcaaagaaaagGATTTCGATTTGGATGT
GATATTGACAGGGCTATTGGGCTCCACACTTCTCATTATATGCAGTATTT
CGATAGCGACAAGATTGTACTGTTCACAAAAAGTGATCGTCCCTACCTGG
AAATGTTATACCACACTGATTGCAGTTTTGACTATCACAGCTGCTTGTTC
GACGACGGCAACTATGGTTTACTACATTTACGATGACTCGGGAATGCTTA
TAGATAAAACAAGTGGGTGGACAACTACAATAGGATGGGTGGCAGTTGGA
GAGCTAAACTTTACCATGGTTTTTGCTGTCCTTTTGAGATATATTGGTCC
AAATCATGGAAACATAGTGAATGGAGTATATGAAACACGGAGGGGCGAAT
ATGAGATGAATTAAatggcaCGAGGATCTTTATTGACTTTTACCTTATGG
TTGCTCTTGACAAGTTTAGCAGCATTATCAGCCAGCATCTTTGGAGATGT
TTGGTATGTTTACGAGCCCAATGGAACGACCACAGGTTTACTAAAGAAAT
GCTACTTTGACATCCAGACTAAGAAAGTATGCATTAACAGAAAAGTGttt
aaattcaaagaaaagGATTTCGATTTGGATGTGATATTGACAGGGCTATT
GGGCTCCACACTTCTCATTATATGCAGTATTTCGATAGCGACAAGATTGT
ACTGTTCACAAAAAGTGATCGTCCCTACCTGGAAATGTTATACCACACTG
ATTGCAGTTTTGACTATCACAGCTGCTTGTTCGACGACGGCAACTATGGT
TTACTACATTTACGATGACTCGGGAATGCTTATAGATAAAACAAGTGGGT
GGACAACTACAATAGGATGGGTGGCAGTTGGAGAGCTAAACTTTACCATG
GTTTTTGCTGTCCTTTTGAGATATATTGGTCCAAATCATGGAAACATAGT
GAATGGAGTATATGAAACACGGAGGGGCGAATATGAGATGAATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000199_pilon | genome | sc0000199_pilon:387300..395959 + |
|
