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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000196_pilon:566989..571312- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.18370.1.p2 ID=MSTRG.18370.1.p2|Name=MSTRG.18370.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4324bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000196_pilon:566989..571312- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAAAATTGTAAAATACTTTAGGCAAAAACTCCTGACTGGCAGGTCAAAT
CTTTTCATCTACAACTCAAAATCTACCCAGTCAGCGATGTCAACCCACCA
ATTTATTGAAGGAATTGAAGATAACTGTTCGATTACCGAACCAAATTGAA
CAGTTATCTAACTTAGAAATTCTGGTAAAGTTCGACTGGGACTTTAGCTT
AAGAAGAAAAGTCCATGTGTTTCCAACAGATTTTTTATAGGAGTGCTTTT
ACCAAGTCCTTTTGGGACAACAGAATTTAACTCAAGAAATGTGCTTTTCA
ATCATATTCTTTCCCTGTTCTTTTGATCTATTCTAAAATTTTGTAGAGGC
AAATCCCTAGAGGCAAATCCCAAATTTCTTAAGGGTTATTGACTTTTCTT
AAAATAGAGTCATTGAGTTTTTTATCTTTCACAACTACAACCTTCCAACC
TGAGATGACCAATTTTGATTTGTTATGTTTACAGACGAAAAATTTCAAAA
TTACTGCACATTGTGTGTTATTTTCTAATTATGATTTTTGAGATCACTGT
CTTATCCTTTCTATGGTTCACATTATATTTGATGCTAAGAGTTTTATCTG
GCAAACCTGAAGAATGGTGTAATCGAGCATTAACACTATTGCATTCTCTG
GTCATATGTCGTATGATAGAATATAGTGCATATACAGATGGAAATCCGCT
CCACAGAATTGGTGGCACAAACACTGTTATGGAAGAAAAGATTTTAATGT
TTGCTTGCTCTTATTTCATTTTTGACACAATTTGGCTGCTCTTTGTTAAG
TCTGATGAAGATCCCCTGATGTTGGCACACCATGCTGTTGGAGTGTTAAT
GCTTCCTTTATCACATTGGTATGGATCAAGTGGTGCCGAGATTTGTGTGG
CGCTATGGGGAGGAGAGCTCACTAATCCTTTCCTCCAATATCGATTTTAT
TTGAAATACTACACCATGCAAGGAAGCAGGTTAGCTTTTTGGAATGATTT
TGTATTTGCTGTTGTGTTTTTGATCATTAGGGTGATCTTTTTTACTGTTC
TATGTTATCAATTTATGGTTGCACCTAAAACTCACACCCTCATCAAAGCA
TTTGGACTATTGTTTTATTTTGTTGGATTGTCATGGAGTTATAAAATTAT
TGGATTCATCCAAAGAAAATTGATGTAAACTTTTTAAAATGTTATTGAAT
TTACATATGGATTTATGTTCTATGAAATTGTTCCTTCTATTTCTTGTTTT
TGATTGGTAATTTATTATTCATGTTTTTAGAATTTTTTGGACCTGATTGA
GTTAAATGTATTTAATTAAATGAAGTATACTTTATTGACAACCATGACAT
TACTTTTATTTAACAGTGGATTAATCAGTACCAAACCAGGTTATAACTCT
CACCTAAGAACATTGCATTGTATTATGTCATCAATAGGCCATTTTAAAAA
CATCCAAAACAAACACAGATATAAACTTGCTACATGGTATAAATAATAAT
TATTGATGCTTTGAATTTGCATAGTTTGTCACATCAATTTTCCAGGTTTA
ATGCTAAATTGCTCATCATTTTGAAACTTGTTTTCTATGCAAAAAATATG
CAAAGATTGGGATGATAATTGACAACTTTGTGTGGTTTAATGATAAGATT
TGAAAAGTTTTTGTTGTATTTGTAAATAAATAGTATTAATTATAAAAAGC
CCGAGATTTTAGAGTAGATATTATATTTGTTCCCATTTTATTTTTATTTT
TATATATTTCTATATTGTTTCATTTTAATTGAATTTTGAATTCTGAATTT
TATTATAAAAACCAAAAATCTAGGTATTTTGAAATTGTAAGATGAGTATC
ATTCAAGGTGTTTAATGTCTTTATGATGATATTTTCTATCGTTACACAGT
AGTGTTGGTTTAGTTGGCTGAGACTCCACCTTTTTTCCTACTAGCAGTAT
GAAGGTTTGTGCTGTTTTCCACTGTTTATTAAATAATAGGATGACGATGG
TCTTTATACATGCCTGAAAAATGAATATTTTGTTGGTGTTAGTCTAGTTG
TAGATATTTTGATTCTTTAAGGAAATATGGATCAATCAAATATTTTGTTG
CCTGGCATCAGTCTTTACAAAAAAAATTATTCTACCATCTAATTTTCTCT
TTGGCCCGAAAATTCCCAAAGACTGTAATTATTGTCCCTAATTTGAAAGA
CGATGCTTTATTTGATTTAAAAGTTGTAGGTGTAGATTATACATTATTTC
AGATTTTATGTAGCAGCTAAGAAATATATTACATACATTTTGAAAATCTT
TGAGAATAATATGGTTTTTCAATATTTTTCCGGATAAGGCTCCTTTAACT
TTTTGTTTAAGAACCATGTAAGCAAAGTAGGATTTCTTTATGGACTGATC
TCGACTATTTTTTGAATTATTTTGATGAATTAAGGTATGATAGGCAGTTT
AAAGGTTTTGGTTTAAAAATCGTTTACATTGTTCATTTGCTTTTTGTTTA
TTTTTTGTTTCGTTTCTTCAGGAGAACACTAAAAATGATAGATTACATTT
TGCTAGGAATTGGAATTGTGCTCTGGTTTTTTATATTTAAACTGATTCAA
TGGAAATGGAGCCTTGCCACTACATCAACTTCGTATGCAGTTGCTTTCTT
ACATGGGTTGTTTGCAGCGCGCTCTTGTGAATATCTGATTGTGACCGAGC
AATTGTGGGATTTTAACCGGTTTGGAGGCCCTGTGTCACCCCTTCAAAAG
ACAGTGCTGACCATCAGTGCAGCTTACTTTTTATATGACACACTCATTTG
TTTTATCATCAAAGAATCTGTAATGATCAAAGCTCACCACTTGCTAGCAA
CAATTATTTTCCTTGGTACCACTTATGCAGGAACCTCAGGACCTGAAGTT
ATTATATGTGTGTGGTATGGTGAATTTACAAATATGTTTTGCAACTTGCG
GTACTTCTTCCAGCACAGTGAAAGATTTGCTGGGTCAATCATTGCTCTCA
TCAACGACATACTCTTCTTTGTGTTTTTCTTATCCTTGAGATTCATATTC
GGTACATACGTCATTTATCACATTTTCATGATTGGTCGCAGTTTGTTGGT
GGTGCGACTTGGTGCCATTTCTTTCACTTTCGTCAATGTTGCGATGGGGA
AAATGATGATCGAGGGAGCACTCGGCTTCTTGTATCCTCCCTCTAATGCT
AAAGGTGATAAGCAGAAATGATGACACACCTTGGAGGTCCTTTCTTAATC
CAGCCCTTTCCAGTGCTTTTTCGCGCGTGTTGCAATTTTTTGAAGGGTTT
TAAAGAAGGAAAAAAGTAATTAAAAAAAGATTTTTAATGGAATTTTCAAC
CTTTTTTGTACTATCAAAAATGATATTTATATTAAAATTTAGTTACTACT
TACAAAGTTAAAAACATCCCCTTCTCACAGACCCACTGGGACCCCTTCCC
ACTGGGAAAATTGTACAAAATATCGTCCCCTGTGGAAAATATTATCCTCC
AATTTTTGTTCTCACTGAAAATAATCAAATAAACCAATCCTCACTTCAAA
ATATTACGCTACTTCTCCCAACCCCACTAAATTTTCTGACTCGAAAATAA
AATAATATCTCCATCAAATCTTTTGTTCATAGTCTATTTTATATTTATTC
AAAAAAAATGTTATCAGTTTATGTTTAGAACTTTTTTTAGAATTGATTGT
TAAATTTCTCCTTACCCTTGAAACTTGATTTTAGTTTCGACTCAGCAACT
TCTGAAAGATTTGAACGCGCTTTATTCCATTCGTAGGCTAGAAAAATGGA
AAGCTCTTTATTCTCTATTATTTATGTTTACTACTAATTGATAATTAGAA
GAAAACTGTTTGCTAATGCCTCGCTCGTCTATCAAAATTATACCTTGACA
TTCCAGTATTGGCTTGGATAAAAATTGAACAAGCTTCTTCTTCAGAAGCT
TGATTAAGAAAATGACTGGATGTCTCAAGGGACTTGAATCACCTTGGCAA
TCGTTTCAATACGAGGCAGAGGTTTTACGTGACCTAATTTATAAAATAGG
CTGATTGAATCTACTTCCATCAATCTACTTCCTGACATTCAGAATTAATA
TTTGAATTATTCAAGTAAGTACCCAATTAGTGGCATTTTGAAAGGGCTTC
GAATTGCTTTTTTTTATTTCGATTTGTTGTAACTTGGAGATTTGTAAAGT
TAAAATGTTTATAAGTGGTAATATTTTTATGCATTGTACCGTAGTATTTT
TTTGAAAACAAATATTTTTATCTTGAACTTTTTCTTGCATTTGAGAATAG
ATTTTTACGAATTTGGTCTGCGGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000196_pilon:566989..571312- >MSTRG.18370.1.p2 ID=MSTRG.18370.1.p2|Name=MSTRG.18370.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=648bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000196_pilon:566989..571312- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTTTTGAGATCACTGTCTTATCCTTTCTATGGTTCACATTATATTT
GATGCTAAGAGTTTTATCTGGCAAACCTGAAGAATGGTGTAATCGAGCAT
TAACACTATTGCATTCTCTGGTCATATGTCGTATGATAGAATATAGTGCA
TATACAGATGGAAATCCGCTCCACAGAATTGGTGGCACAAACACTGTTAT
GGAAGAAAAGATTTTAATGTTTGCTTGCTCTTATTTCATTTTTGACACAA
TTTGGCTGCTCTTTGTTAAGTCTGATGAAGATCCCCTGATGTTGGCACAC
CATGCTGTTGGAGTGTTAATGCTTCCTTTATCACATTGGTATGGATCAAG
TGGTGCCGAGATTTGTGTGGCGCTATGGGGAGGAGAGCTCACTAATCCTT
TCCTCCAATATCGATTTTATTTGAAATACTACACCATGCAAGGAAGCAGG
TTAGCTTTTTGGAATGATTTTGTATTTGCTGTTGTGTTTTTGATCATTAG
GGTGATCTTTTTTACTGTTCTATGTTATCAATTTATGGTTGCACCTAAAA
CTCACACCCTCATCAAAGCATTTGGACTATTGTTTTATTTTGTTGGATTG
TCATGGAGTTATAAAATTATTGGATTCATCCAAAGAAAATTGATGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000196_pilon | genome | sc0000196_pilon:566989..571312 - |
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