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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000196_pilon:427000..434814+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.18355.1.p1 ID=MSTRG.18355.1.p1|Name=MSTRG.18355.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7815bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000196_pilon:427000..434814+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TaccatttttgataaaaatttttttagccaTAATAATCAAGAGATACTAT
GTTTTCATATTACCATGAATGATAAAGGCTAAAATACTGAAATTGGTTGG
CTGATAAAGTTAAAATGTTGACCGTTggattgttgttttgttttatccAT
TCATCCAATGGCAATGAATGGGTTGAATCTATCAATAACGTTACCATCAG
TGTACAGCTCAAGTCTGGTGAGAAAATCAATtcttgtttcaataaaaaat
ctttgtcaTATGGCGTAATCTTACACTAATTTGTATCACTATCAGTCGAT
TATTTCATTAAATTATTTCAATAAACTCAactaaaaaatttgagaaaatc
tcTGTCCTCTATAAATTTTGGGGCaggcaaacttcaaaaatggtttaaTT
TAAGTGAACTTTCGGACTCACGATCCTTGTGTGAAACATTTGTAATATCT
GGTGGTATTTCTTGTTCTcttttttggggcctggggcaACTTTTTGCCCC
AAAACAAGTCTATAATCTTAAAAATCTTACTTATAAATTTTACAATACTA
CCAATAATTGACTCAAAAGACACTGAAGTCAGCCAATGGGTTTTGCACAT
TGGACAGCAAACAACCCAAGCAGTGAAGCTATCATTCATTcaataagaat
atttcaggtAAAATCGCATTTTCGAATGACCACAATCAATTGGAAATTAA
CTTTGGAAAGATATCAGAGATTGCGCTAGATGGTATTACACAAGTTGGCA
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GTTGCAATTCCTTTAGAAGAGGTTGGCGTATATGGACTTGATCGAATTCA
GGGTGTAGACAGAAATATCACAGCTATGAGGTAGAAGGTTAAAAATTCTT
TCGGTTTTTTATGAAGAGATTAGCCCTTTTCTCTTGCAGATAGGATCCTT
CTTCACTGAAAAAAGGCCAATCTCGTAATTTTAAGTTaggaaagcaaaaa
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TCGATGGCAGCGATTTACACTAGACGAATTTTCAAAACCTAACAAAGTCT
gataatttttagaaattctgATCTGaaggaatttcaaaattaatgacaaa
aacattttgacccTTCCGAGAGATGCTaatgtgttttgttttttccctTA
TTAAATCTCTGGTTTACTGAAACAGTTTTCTTACCAATTTAGAAAGATAT
TTCAAGTCAAGAAAAACTTGGTTGGCCCAGCTGCTTATTTTGCATTCGAG
ATCCTCTCCTATAACAATGACACTACCATTCAGAATGAAAGAACTGGTGA
GCGGTACCAAGTCTTCAATGGAACCATCAGACTCAATATCATTATTGGTC
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AACGAACGTGgtcaatttttagattttgagttAAATTTCAACGGAGATGA
ACAGCTTCGGGATCCGATTGTGAGGACTGGGTTGCGAGCAACAAGTTTTG
TACCAGGAGCCAAAAGACCATTGACTTATGATTATGGAGGAGTTGATGTC
ACTCCATCCTTCAAGGTTTGGTTCAGATTATCTTTACCCTCTCTGCAAAA
ATGCATatcaggcacgacgcaacgggtacggcaggtacggcggccgccgt
accagattttcacaaaaatacccgaagttttcctcttcgtcggtcaaatc
gctataaaatcgcttaaatttcctcattcgccgtaccagatataaaaagc
ttccgtcgtgcctgcatATTTATATTTAAGAGAGAGTTAAGTATTGGTTT
CACTATAACATTCATAAATTGTCGCGTTTTTTCGACTTTATTATAACCAA
AGAGCTCTAAATCCTATGGAATTTAAATGTTGATTGAAAAGTtaaatacc
gtattacttcgaataaacacccccttcttttaaacgcccctcctaaaagg
aaaattatttgataaacgcccccctcaaataaacgcccccttcgaatgaA
CGCTCCCTCtaggggaggggcgtttattagaaacttgtgactttaatact
tcaataccAGTGTTCATTGGGTtaaaaaaggaagattttagtcatttctt
gtaaccaggGCAGTTTTGGATGCAATTTTAGtcgttgaaccaaagaaatt
ttcgaaattttgcactaaaaaatcctgataaagaaccAAAACAAAGGGTA
TATTTGCTCAAAATATTCGACTTTATAAACGCcctcttcttttaaacgcc
ccctcgaataaacgcccctcctcaAATCGAAAAAGTTGtataaacgcccc
gggcgtttattcgaagtaatactgTAATGAACTTCAATTTTTAACGACTT
TTGCCTTTATGATTCTCAGACTGAAAGGTAACGAGGAATAAATACATTTT
CCGAATCTTTTATTATAATTGTTTTCTTCATGGGTCAATGATAACTTTCT
GCATCAAAAGTAAAAACATCCTTGTCCTGTCCATATAACGTTCTTATATC
GAAATCCTTtagattgaaatttaaaattaaattttaaatctgTCTTGCAA
ATCTTTCAACTTCTTTGCTCGATTGTTTCTATACACTGTTTCTTTATCTT
TCAGTACCAACAAAATATCACATGGCCTGTGTTCCCATCTCAATATCCAG
ACGTCAATGGAAATACCATGAAACTTCGATTTGCTCGATTCCCTTTCGAC
CAAACTGTCATTCACACTATGTATTTCAATGTTAGTACGAACGATTTTGT
CGCACCGAGTTCTTCTGTTATGCTAAAATGTCAGTATACTTTAATTTTGT
TATTGGGAGCATGGTTTATAATGCTTTCTGTAGCAtgaaaattttctcga
aatgtAACTTGCTTAAGGGCAGTTTCGTGGTCTTATgggattatttttat
tttggtggATAATAGAttttattaagttttttttacatagataattattt
catatcagatttttatattgtatattttggaataatttgattgatttctt
ttttaattttttaaattaaatagagcaaatattttatataattttatgta
tttaggttttagttttgattacgccatcatatttacattttGACTAGTCT
CATATATTATAACCTCTACAATAAAAATACTATTTTATTCATCCATTTCT
TAATAGATATATAAATTACTGCACCTATCACCGTATCAATTCAAGACAGG
CTTAAGTCCATTTTTCCAAACTTCAGATCAGAACAAACTCTCTGAAATCT
GCAAGTCAGTTTTCAAAAAGTCGCCCAAACAAACCAGCAAAACATGATAT
GtttttttaagtagtgtagtggttatcgttCTCAACTCTCACAAGGTGGT
GACGTTGCTCATGGATAAGCACTCGTGAGAGCAACAATCCTCCCACACTT
GCTCCAGTAATGTTGTAGATTCGCAAGCACAGGGTCAATGTTGTCTTGTA
AGCGCTATGATTTCCCTATCCTAGAATAGGTAACTATCCCGGGATAATGG
CCCCATGTCTTTTGCATCTGCGGGATCTTCCTTCCATATATAAAAGGTTT
ATATCAAGGACTTAAGGAATTGTTGactaaaaatgctaaaaatagacTTA
CTGATGTTTTGAAATGATATGGTGATTTATTTAATACATATATCACCCAC
TCACTCGACGTTTCAACTATAGTTACAGTGTCCATAAAACAGTGGAACAG
AGGTTTGCTGATGGAACAAGCATTCAGTATTATTATCAAAACATTAAAAC
CGAAACATTCTTTCATttaactcccccccccccttattttgATTTCtcat
actttaggcgtacaaactttcgcgaggacgaaaaatcgacTTATCTTTCA
ATATTATTCACTGGTAGGCGGTGATTCCactcttattttttttatctttc
tacttTGTTCTATTTTCAGTAAAGAAACACATCAGAAAAACATTAACAAA
CGAAATAGATTTGGTGTGTGGTGATGCCACGTCAAATTTTGAGAATATTG
GACGTTTATTGCAAATCATGTAATTTCTTACTGTTGAACTATCGGAAAGG
TGGTAAAGGACATCTCATTAAATGTCACCTTCACAAGATCATTAAAGATT
ACACTCAAGTCAAAGGAATTTGCCCAAACTGTGGCGTTCAGTGGGCCAGA
GAGACCATCATAAAAAATCGACCAGCGTTGAAAATTATTGGAGATCGCGT
GTTCTGGAAGTAAACATTTGTCTAGGTAAGATTTCATATGCATACtcttc
tctcttttttctttacctttttatttcttGATATGATTATAAGATGGGGT
ATTATTCCGAGGTGGAACCTCCAATTAGGCGACACCATCAGGGAATAGGG
TTGGTGTCCGCTATTTAGAAGTGTCCGCCCTTTAGAAACAATTGAGCAAT
TGGATTGTTTAAGAAATAAAAGTTTGGATAGATCAATCCTGTCTAttttt
ttAAGTCTGCCCAGTTTAACCGTCGATGTAATTAGAGAGGAAAAAGTAGG
GTTTCGGTCAGTTTTTGCAAAAAGCTTTGTCCGCTaccttaaagaaagaa
attttggcgggaatttaatttggcgtatcgttaaaaaagttttttcagag
ggaatttaatctGGCGGTTAacatttttgtgcaaaaaacgctgttaaaaa
aggaaaaaccctgaaatagcacacatttgggagaataaatagagcaattt
aaatttggcgggaattaaatttggcggattttggccaaatccgccaaatc
cgccaaattttcttccctccaaaatttttttctttaaggtAATTGAAGGA
ttcgctaattgagtgtccacCTTCAAGAAGCTTTTTTGTTACCTGAAACA
ATAATAAACCTGTAATTAGGACAAAACACCGCCTCGCTGCGCTCTATCAA
TGTGTCTAGTAAACAGGGTGTGGGGTTGGAATCGTACCTCTATTTATCAA
AAGTAACGTAAAATCAGTTATTTAGTGGAAGATAATCCGGAAACAAATAG
TTAACGtaacatacacgcttttttataagaacgtttgtctgaatcgcaga
ccctTATAGATACACTTCCTATGTAGGTGGGATTTTCATAAAAAGGAAAC
CATAATTCGTacaaaaaaggttttgaaaataaaaccactTATTATATTTT
GTTAGTTCACTGGCTCTTGTCTTGAAACTCATGCTGCAAACTGGTTAAAT
ATccaaaatctttcttttgaaCACTTTTACCATAAGAAAaattgttaaga
atattttatatgtccttagatttggaaaaaaaaattctatgaatACGTTA
CCCGGCTAAACCaaaaaaaCActaatcttataaaaaagcatgtactTAGA
TAGTGAAGCTCCcttcttattattattttcattgaagaaaaaatattctt
ctATCTTTTGTTATAGATAAGATTCTAAACTGGAAATGAGGAGTCACATT
GTGGTGGATTTTGGTGACAATGTTACATCACTCTTCTATTGGTTTGATGT
GGACTCTCTCTCCACCTTGaaagaaaaagttcaaaaacgtTATGAAATTC
ACATCACTGATCAAATTATTAAACATGGAAATACCGTTCTAAGTGAAGAA
TCTTTCCGAAAGCTTTATAAGAATCGCTTCAAAGAAGATGTAGATTTAAA
AGTTGATATTCCAGACCCGTCACTAATTCAAAGTGAGCGACGTAAGGTTT
TCAAACGTGGTTGTGAAGGTATAATCCATATTTCTTCTTATAAAGAACAA
GACGGACTGTGTCCCAATCTAACTTTCAAGCCGTCTAATTTATCCTGGAC
CATAAAAGACTTGAAAAGTTACATTAGTACCAAAACCAACATGTCGGTGG
AGCCAATGTGTCTTTTATTTAACAACATCATTCTATTGAGTGACGAAGAA
TTATGTGTTGATTATTTCCTTGATTTGAAAGGCTCTTCACGTCCGATTTC
TTTGAAGTTGAAGATGCTACCATCCGTTATTGCCAGTGATGAAATGTTTC
AGCACCGTTTATATTATGATTTGTGTTTGTCCCCGATACATGTAACGATA
CCAAGTTTCGGTGAAGTTGATGATTTCGTTCTATACCCGTTGGCTTCCAT
TGGTCAGATTGGTCGACCAGCCGTAATGAAATCTTTAATTGAATCTCTAT
ATCGAATCCCTTATGGAGAACAAGAATTGTTTTATGAAGGACAAGCATTA
AGTGATAACCGCTACCCACaaaaaaaTGTTGGTAATGTCCTTGAGCCAAT
TTATTACAAACTTGTTGTTTTTTCAAGACGAAGCAAAGAGCTGGCATTGG
TTTACGAACAAAATAACATTAGGCCTTTACATCCAATTCATATAGCAAGT
TTCGAATGTGACCATATTTGGGAGTATAATTATCAAGGGAAATCAGAGGA
AAGTATTGTTCAGTTCATTGAGGATTCTATGAAAATCCCACAAagtaaac
aatatttttttctggatgGTAGTGTAGTTAGTATTAGTGAATTGATTGAG
GAAAATACACGAGCTATTGAAACATTGAAAGTCAAACTAGCTGTTCAAGT
CGATGACGACGAGCTAGAATTATTAAAAGTTGTACAAGAGCTGCAAATCA
GTCGAGTTCGTTCAATTGTTCTGAAACATCCAAACAACGGTACCATTATT
tgtgaaatttcattttctgagattcatcaaagaatgaaaatttcagaatt
ggAATATCTTATATTCAGAAAACATTGTGTTGGTTTATCGAAAAATACTT
GCGTCCTTCTCCATGACGATAAAGAGCTTACTTTCGCTGATGATCTTTAC
GGTTTGTTGGTAACAGAAAATGGGAATTCCTTAGAATCGAACCTGGTTCT
AACATTATTTGTTTATGTCGAGGATAAAACCCTTTTTGAAGAAGCAGATa
ccttttgtttgaaatatgaCATGAAACTTTTGAAACGAGTAAATATCAGT
TTTCTTACCGGTCAATTCTcatttgatattttacagaaccATATCAAAGA
CATTCGtgatgtaaaatttcaaattgatagAGAGAAAGGAATTCCACCTC
ATTTGCAGAGtttgttttatgaaaacaaGGAACTTAAAGATGAAGCAGAA
TTAATCTACATGAACCCAAAGATGCTTTATGAGTCTTTAACATTCAATCT
CGTCATAAAACCTGCAAATGAAGTTGAATTATTTGTCGATGGTAATGTCC
TGGACGAATCGATAACAATAAATATACTCGAAACGACCAGTGTTGGTAAG
CTCAAGGAAATGATCAGTGAACGATCAGGAGTCCCTCAATCTCTTATCAT
CCTAGGAACAAGACATCAACCATATATTGTCGATGGTGAAAATGATAGGA
TCTACGAATGTCACTTTCAAGATAATATCGTAATAGTGAGTAAAAAGGTA
TTTGTATCGCTCATAAAAGTTCACGAAGATGTCATTGTGAAAGAGAATTA
TTTTATACGAGATTTTGAACACGATAACGTCAAAACACTTCTTGAGGACA
TGAAATATCGATATTTTGATCAAGGGATTGTCTCTATGAAAAAGAACGAA
TGGAAATTGAGTACTTTGTTAAAGAACGTTGGTGAATCTGAGTTTGTTTT
GGTGTTGAAACCCAAAACTGAATGCAATATTCTTTGAACGTATCAATTAA
TTTATATATAATTGATAAGGTGAGGCCAGTATAATTTGGTGTTTTACGGC
CCAAGcaacccaaaaaagagggtcagtTGGTCGGTGAAAAATTAAagata
aaagtagaattttac Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000196_pilon:427000..434814+ >MSTRG.18355.1.p1 ID=MSTRG.18355.1.p1|Name=MSTRG.18355.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2202bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000196_pilon:427000..434814+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGGAGTCACATTGTGGTGGATTTTGGTGACAATGTTACATCACTCTT
CTATTGGTTTGATGTGGACTCTCTCTCCACCTTGaaagaaaaagttcaaa
aacgtTATGAAATTCACATCACTGATCAAATTATTAAACATGGAAATACC
GTTCTAAGTGAAGAATCTTTCCGAAAGCTTTATAAGAATCGCTTCAAAGA
AGATGTAGATTTAAAAGTTGATATTCCAGACCCGTCACTAATTCAAAGTG
AGCGACGTAAGGTTTTCAAACGTGGTTGTGAAGGTATAATCCATATTTCT
TCTTATAAAGAACAAGACGGACTGTGTCCCAATCTAACTTTCAAGCCGTC
TAATTTATCCTGGACCATAAAAGACTTGAAAAGTTACATTAGTACCAAAA
CCAACATGTCGGTGGAGCCAATGTGTCTTTTATTTAACAACATCATTCTA
TTGAGTGACGAAGAATTATGTGTTGATTATTTCCTTGATTTGAAAGGCTC
TTCACGTCCGATTTCTTTGAAGTTGAAGATGCTACCATCCGTTATTGCCA
GTGATGAAATGTTTCAGCACCGTTTATATTATGATTTGTGTTTGTCCCCG
ATACATGTAACGATACCAAGTTTCGGTGAAGTTGATGATTTCGTTCTATA
CCCGTTGGCTTCCATTGGTCAGATTGGTCGACCAGCCGTAATGAAATCTT
TAATTGAATCTCTATATCGAATCCCTTATGGAGAACAAGAATTGTTTTAT
GAAGGACAAGCATTAAGTGATAACCGCTACCCACaaaaaaaTGTTGGTAA
TGTCCTTGAGCCAATTTATTACAAACTTGTTGTTTTTTCAAGACGAAGCA
AAGAGCTGGCATTGGTTTACGAACAAAATAACATTAGGCCTTTACATCCA
ATTCATATAGCAAGTTTCGAATGTGACCATATTTGGGAGTATAATTATCA
AGGGAAATCAGAGGAAAGTATTGTTCAGTTCATTGAGGATTCTATGAAAA
TCCCACAAagtaaacaatatttttttctggatgGTAGTGTAGTTAGTATT
AGTGAATTGATTGAGGAAAATACACGAGCTATTGAAACATTGAAAGTCAA
ACTAGCTGTTCAAGTCGATGACGACGAGCTAGAATTATTAAAAGTTGTAC
AAGAGCTGCAAATCAGTCGAGTTCGTTCAATTGTTCTGAAACATCCAAAC
AACGGTACCATTATTtgtgaaatttcattttctgagattcatcaaagaat
gaaaatttcagaattggAATATCTTATATTCAGAAAACATTGTGTTGGTT
TATCGAAAAATACTTGCGTCCTTCTCCATGACGATAAAGAGCTTACTTTC
GCTGATGATCTTTACGGTTTGTTGGTAACAGAAAATGGGAATTCCTTAGA
ATCGAACCTGGTTCTAACATTATTTGTTTATGTCGAGGATAAAACCCTTT
TTGAAGAAGCAGATaccttttgtttgaaatatgaCATGAAACTTTTGAAA
CGAGTAAATATCAGTTTTCTTACCGGTCAATTCTcatttgatattttaca
gaaccATATCAAAGACATTCGtgatgtaaaatttcaaattgatagAGAGA
AAGGAATTCCACCTCATTTGCAGAGtttgttttatgaaaacaaGGAACTT
AAAGATGAAGCAGAATTAATCTACATGAACCCAAAGATGCTTTATGAGTC
TTTAACATTCAATCTCGTCATAAAACCTGCAAATGAAGTTGAATTATTTG
TCGATGGTAATGTCCTGGACGAATCGATAACAATAAATATACTCGAAACG
ACCAGTGTTGGTAAGCTCAAGGAAATGATCAGTGAACGATCAGGAGTCCC
TCAATCTCTTATCATCCTAGGAACAAGACATCAACCATATATTGTCGATG
GTGAAAATGATAGGATCTACGAATGTCACTTTCAAGATAATATCGTAATA
GTGAGTAAAAAGGTATTTGTATCGCTCATAAAAGTTCACGAAGATGTCAT
TGTGAAAGAGAATTATTTTATACGAGATTTTGAACACGATAACGTCAAAA
CACTTCTTGAGGACATGAAATATCGATATTTTGATCAAGGGATTGTCTCT
ATGAAAAAGAACGAATGGAAATTGAGTACTTTGTTAAAGAACGTTGGTGA
ATCTGAGTTTGTTTTGGTGTTGAAACCCAAAACTGAATGCAATATTCTTT
GA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000196_pilon | genome | sc0000196_pilon:427000..434814 + |
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