|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000182_pilon:299914..309534+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.17729.3.p1 ID=MSTRG.17729.3.p1|Name=MSTRG.17729.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9621bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000182_pilon:299914..309534+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCGTTTAACGTGCAATACACGGCTAAGAAGTATTCATATGATTTTCAAT
AGTTCGGTTGAGAACTTCGATGGTGATTTTGTATTCTTAATTTTGAATAT
GCtgtaaatcaaatcaaatcattttaGTTTGATTAAGGTGtccataggcg
gttttagaccacgtcgaacttatcagaggaagagatttgtaattgtaatt
ccattgtcttttaacgagcgttgcactccttcgcatgtttccaacgcact
tgctctattgtcttaaattcGCTAGTGGTGACTGTTTAGAGCAAAGTCGA
TTTTGATTATAACATTTTGTTGTTGACACCAATCATTACAATTGACCGAA
ACGTCAGGTTAAGTTTATCTGACAATGGTTCCAATGACATTTTTATTTCC
ACCACATACTTGGCAAACACAAGTTCTCGATTCTTGTGGTGGTTTCAATG
GACAGAGAAAGGTATTATAAATCTCTTATCTTAAAGATACTTTCATAAGA
TAAATGTTGGGtgaaatttcgcggggacttatttatttatttattaaaga
attacagtccaggcacacgagggcctctaaaccgatcttgtacaaaaaat
cttttttaggtaCAGTTTGTCACGAGGACTTCCCCGCACCCTCCAATTAA
AGTCTTCATTCGACTTGGCTTTATTCATCTCGTCTGCTCTTCTTTTCCAT
TCTTTGATTTGCTCTCTCTCAATTTTCGTTAAATCGTCGGTGATGCTCAA
TTTTACGTACTTCTCGTGCTGTCTTAGTtcagtcaacttcttcatgaaGC
GGTACTTTATATGGCTGTCTTTGAAGGCGACTTTGATTGGACGCACATCA
TTTGATTGTTTTCCAACTCGAGAGACGAAGGTTGGTTGAGTTTTTACGTT
GACGTTGTTCAAAAGTTCGTTTACGAAATCgatatcttcttcattttctt
tttcacgcaCCCCGTGGATGATGATGTTTGCGTCAATTGACAGCTTTCTT
TGGTCTTCGATTTGTTCTTCGACTTTCTCCCTTCTGAGTAACTGCTTCAT
GTTGTTTAGGTTCAACGAACCATTTACTTTCGCAGCGTCGGCAAAacttt
ttggttctttagcCACTTGGACTTTCGAAATCTTAGCATTCACTGTCTCT
TCAATTTTAGTGGATAGCTTCTTTTCCAGGACGGAAAATTGGCTCTGGAT
TAGATCagttacatgatttttttcttttaggtaTTCCTGACATTTTGCCT
TTAAGTCCTTGACCACGGTGTTAAGTCTCTTTTCATTCTCACTTTTATGG
TGTATTATGGTTTCACAtgcatcaatttttttatagctATGTGTACAGCA
TTCTATTCTTTCTGCTTGATGATGGATTTTTATGCTGAGGTCTTTTGCCG
GAGAACAACAAGTTATGCATTGGTATTTTCTGTAACCtttattcaaaaac
atattCAGCTGGTATGGTGGTAGTCCAGTGCAGGCATAATGTAGCATTCT
TTGACATTTATGGCAttgaatcttcattttttcattatctttaaTGCAAT
TATGCTCCGTACAACGGTTGTTGTCAATCTCATCTTCATCAAGGGTCAGG
TTCTTGTCAGGTGATGCCAGtttttgtcgaatttttgttgttttttccat
tttttgaaattttattaaaagttctccatttttttgaaaaaacgaagaGC
ACAACCTTtctgattgacgtcaaatttttatatatcttgATTTTGCGAAT
GGTACTAttgggagacaatattttcacgattttatgccttttttattagg
gcttttttGATACCAGTAAACATCTATAACGTAgtttatttgtcattttt
tgagttttgttaaaaatagaagacctttccaaatttccagtggaacttaa
tttcgcggatggcatccagatccgcgaaatttaatcctcgcgaaatttta
tcccattaaagatAGGTGATTCGCAAAACCAGTCATAAAAATCAGTTAAA
GCCTAGAGTTTTCAGAAGTCAATTCGCCCAATCTCCAGTTTTTCTCTCTT
ATCTTCGTTTATAAATTGCTTTGgacattttcaagtttttctaaactttt
tcttgCCTTGTTGCGTTTTGGGCTTCAAGAAAAAATGTCTTAATGTAGTA
CTGTCATTTTACGCATTTATCACAGATTTTAGTCATTTACATTATTGAAA
CGTTTGTGAGATTTaagaaggttttatttttaaataccttatcggccctt
ttttcgccggccctaatttaacgccggcccttattacgtacgccacgagc
ccaaaaataacgccaataagggctgATAAGGTAAGTGTTTcggtttcata
tcagacacatatttcacatcaggacagtgtcttgctattgttatattatg
ctgatataagtaaaaaaatgtttttcctttcctctttctgaccgatcttg
ctccacatccgtgccaattcaatgcgaaaaagcttgtgaattaaaattga
ggagtaagcaaacgacatcactcttatttaaaaacaaaacctttaagaag
gTTTCTTCTAGCCTCAAGTGTTCGTGCACTTTGTGAAATTTGTTCTGGAA
GTGATAATGCCAAAGGGTGTTTATATAACATAAGTAtttttttGGACACT
GCACTCAAATGTCTCCAAAAAATTGGCAACCGTATTTCTCAAAGATATTA
GCAAATTTTTCTTCTTGTCACTTCTGATGCCTTAAGCATTAGAAAGCCCA
CCTTTTGACAGGTTTATTTTGGCAAACAACAAATAAAGTTTTTcgacact
tttttttattttagtctGACAGTAAGTACAACAATCTGGTGCAAAactta
ttttactttttaacaCTGGTTGACCAGAGATGataatttgttggtttttg
agCGAATAAATTGCGAAGAATTACGTTTTTCATCTGCTATGTGGCGacat
ttaaaaacttttgagattgatgagatagagcatgttgcattgcatcgACA
TAGAAAGATGGTATGTCATGATGCaaaaaaaGAGAGCATTTTTTAGGAAT
TTTGGTTGCTCTTATGCTTTCTAATGTATCTTGTTTCACCAATAATGTTA
TCCTCTGCATATATGGCCCCCATATAAGGAGATCGTAAATTTacttaaca
aacaaaaattaattacaCATTTTTAGGGGAAAAATGTGGGGTATGATTGG
GTCAGTATATTCTGTGTTGATCAAGTTTAACCGAAATCCCATCTCAACGT
GACGCCTTTTGGCCAATAATATTGCAGAATAACTTGGGAAGAAATTTCAG
TGAGAAGAAATCAATGTAAATTTTTTGGTCATTCGCCTAATTAATTATCG
CCAAatcattttaaattaattttaagttcaaatttatccttaaaaacacc
gttaggcaaaaataggtactgggtatgtgcggacggcaagattcggtttt
ttcaccttcgATAGTGTCTTTAAGGGTTACGAaaatttttcagtaaaaat
cagtccctcTAATAAGTGTctaatttctcaaaaagatTTCGCCTAATTGT
ATGTAAATGGACATATTTGACTCATTCACTAAAATTTCTTCTCactgaaa
tttcttcttttaaaataaTCGATGTGGGCTGATCTTCCCAGCTGgcccac
aacgttgtttcaacatttatctaatgttcataacgtccatataacgttag
atgaacgttgaaacaacgttgtgtgtcagctgggttgtACTATTTTGTAA
TCATCCTTTAAAAACACGTCATGGACgaccaaagtttgaaaaataatcCA
TATGGATCCCACATCGGATTGATCTATATTGAACCCATTTCTCACTAGCA
CACTAATTCAAGTGTTAAATTTCGATTACACTATCTCGTACAATTCATTT
GTTGAAGCGTTGGCTCCAAAAGCGTGAACTCCAACATTCGTGAAAGAAGT
TATTACAAAAATATGACACCCTGCTCAATGATTTTCAAGACTGTTAATCA
GATTGTGACATTTTAAAcccaatttctatttttcaggGGTACTACTAACA
TGATGTTTGAATCGATTTAGGCTAGTGAGACAGGATCTTAAATCGCTAGT
CAAATTCACATGACTTCactcattttcttttataagaacaacttataaga
acaatgaggctcataATTGCCAGATACAAGAATAATTTATGAACAATGCT
GGGCccgaaattactcaatttcaagcaatttaggggtcaaagtagtaaaa
attgggtaaaaagcctgaatataaataagaacaggataagaacaatttga
ttcTCAAAGTGCCAAAACATTAAGAACTTTTActggttctcataaaaaag
aaagagtgtATTTGAGGTTTTGTTTCCTTTGGCCCATATAGTCAAATTCA
CTCTCTGTGAAATGCGGCTTCTTTTGGTAAGTCATTCAGTCGTGATTTTA
TGTATGTTAGACTTATCACCTTAATCTTTGAAGTCTGTCCTGTGAAAGTA
ATATCCTCTGGTGTCGAGTGCTTAGATATCCTTATATGATTAAATATTTG
GTCCTTTGAGTTTGTTTAGAAAGATTTCACCATTTACGGACCTTCCAATT
AAAGAATTAACACTTTATTTTAGGGACTTTAAATGTGTCTGATAAACGCC
TGTgagtttttgaatttgtttaaaCTTTTGCCAAAACCTTTTCTAACTTT
ATCTTTAAGCAACCGTTTCTTCGGGATGGTGACTTAGAGATCTTCTCGAC
ATCTTAAATACAATTCATTATCGCCTAGTCGTTTCCCAGGCGTTAAATTT
TAGTTCAGTTTTTGTTTGGCTGCTTCAAAATTCAGAATTTTCTACTATTC
GTTTATGAAAATATGGACTACAGCACCATccgttttttgtattttcttaa
aaaattttaaattcaaaatcgtTTACAGGCTCATACTTACTTCctctttg
ttttctctgagATAACTGGACTTTATTACAAGCTCGTGATTCTATTGGAT
AATCAACAAACAGAATCTGAATCTTTCCAAGCACAAGAGACCTTAGAGAA
AGGTTCTGAGTAAACAGTCTTGAAacacaaaatcttttaaaagaaccCGA
ACtgttaaaatgattttatttatgCATTTCTGGGGATTGGAGAACTAGAA
TGGAAAGAATAGCAGAACTTTACGAATTTATAGATATAATTGGAGGTGGA
AAACAGAGTTCAAAGACTAAACGCAAAGCAAGTTTGTTAATAAAGTCAAG
TCCATCCATAACTTGAACGCGCAcgttgggggtccttcaaagttcctcag
aGTGCCGTCAAAAACCGGCAAAAATTGCCAGAAATGACCTCCTCAATTGG
GAACACAAACttgtttgaattaaggaaattttgagttatggagtaggCTC
ACAAggcatttttaagaaaaattattcgaGTTATCGAGCCATTCGAATTA
ACTGGTTAATTAATTGGTTTTGCAACAAAAGGCGCGTCATAACAGAGGCT
CGAAtaatggagactccactgtaacagaaatctaaaatcttacaaaactt
actacattattttttgaattttgtatgTATTTAGGTGACCCAaccctttt
tgttttttaaacagTTTAGACAGAGGCTTGCTGTTAAAACTGACATAACA
TGCATAATTAACTGAAGTCTGATAAAAGTTCCTTAAAAAGTAGGCCTAAA
ACGGCCAAAAGTGACTAAAAACAATGCTGTAATTTTTTATCGAACTatac
gaaaaatctgaacacagatttgaaatcagcaaggttcacagtagaaaaaa
tcttaattttttaaaaacttctaTCTATTCGGTTATTCTTCTTggtaata
tctttccaacggtgtatagcTTTTTTGTACGTATAGAATGAATACCTACt
gcaaaattgttaaaaagtaaaatgtccacatacttttgagacaggcttag
acgatgctatcgtccgtttaaaggtcagtaaacgcgggaaaaagttcggg
cgtcagggcggtttacgggaaaaaagtggcggtagagttttggaacactg
taaacatctccgccactgcttactccacccaaatttatcacgcctctcct
aaactattcccttttttagtgatcgataggatcgtctaagacagacttta
attgaatctttcaatcttcattttcttcagaaATCGTATTCGACAAACAC
ACTGACACGAGCTGATTCTaccgaagaagaaaatgaatgcAAAACTTATG
AAGGTTGGTTGTTTTCAGaggatatacacgttttttttgaattagaataa
attgtataagaacataaggctcgatggtcaaaataattGGAACAAAACAA
GATCATTCTAACCCTTCGAGcttcttcctatttttttactaggggaagca
tattgccccccccttaaaatctGAAGAACGACAAGtgctatgaacttgaa
attttgaccagtggtaGATATGGATTATTGGAGCTTTTTTAACCAGGCAT
CGAGAATAGTTCGCCATTTGgctattaaattcaaaatttaatgaatctGC
GATCATGtcagatttttataagaacaaactgttaGAAATGAAATGCTCAG
AAATGCTCAGAACtagctaagaacattttgaggcttagCGCATTTTTAAA
CACCCAAGTTCTTTAATAGGCCCAGAAATACTCACAACATGGTGaacata
agaacattttaagaacattttaagcttaaagtttaaaagttacgaacatt
cgaaggctacaaaaattttggacgttcttatagaaaaaaattatttacaa
gtTTCAAAAAGGGATCCTAACAAGTCAAGGCAAGTCCTTCGACTTAAATT
TTACTAGAGTCAGTCCCACCATTTGTGCGAGTTTAGAAACTGATACAAAT
TGTCATACCGCGAACACCTTATTTTAGCTCCCTCTGAAATTTAACCTGTG
GCGACCTACTATtagaattttatcgcgcatgtctcAATTATATTGCTTTT
TAGCCTCGATTTCCAGACCATTATTCTTATTACGCAAAATAGGGGCAATG
TCTGCCATaaaaaaaaCCGCGCGAGAGagtgttttgaatattttttcctc
ttttgaagAGCCCACTTCTTTTTTGCAGTACGGTGTACCTTTTAGTGTTT
GATAATTAGGTGAAGCTGATTATTGACCTGGAATTATAAATTATTAGTCT
AGATCTAGACTAATTACTATTCAAAAATTCGAAGGTGGAGAGTATATCCA
TGTTAAGCTTGAACGacttccggggggggggtactaggtttgcaatGTCc
gagtcaaaatttgaaaatcgaccCATAGAGAGACAGAATTTTTccacaaa
atttcagccaaaatttgtaaattgtaGACCAATTTTCAAGAacttatgac
cctttgagggagtcgaTTTTTGATCAGAGACtgaattgctttttaatgat
tttcgtACCCCTTTGAgtgtgtgaaaaagggacccttatttCCCGGAACG
ACTTAAACAGACTATATGTAATTACATATTTCCAGTTTTAAAATTCTTCT
GGGACTTATATCAGTGAAATGAAATCTCCTTTCTATCAGCCAAAATTTAC
GTGACAATGATTACCAATTCATTATCAAATTATCAATTCCCCGAAGTTAC
TTTAATATCGATTCCTAATTATGTTTTGAGCTAGTTGTCTTTCATTGAAT
CTTTTCTACGTTTCTAACTCGTGATTTGATTGGTAAGGCTTCATTCAAGA
TTCTGGCTAATTGCCATGACTACTAAGAAcatctttttgagtttttagcc
taaaaatgttcttatcgtgttcttattttcaccattttgtaagaattttt
gtcccacttcctaagaaattgggttaTTTAGAGTACGTAAAGCCTTGTGG
TCAATATTTCGGTCATCgaatccttatgttcttatatagtttgatcTTAT
AGATAAAACGTGTAGAATAGAATCCTTATTTGTCGTCACAGTGTAATATT
CATACACTGTGACACTCCTCACTAGTAGCCTGGTAGacaaaaaccgcttt
tttatcgtgatttaaaacaaagaaaaatttggtttgtgggaaggcactGG
CTAACTCACTAGTGAATCTACTTTTacgtaaagtttttttacaacCGTCT
TTTCCTTGGCAAGATCCCGTAAAACTTGACCTGCTACAATCATATGTGTG
TTCTTGTACAGAAATTCGATATTCTGATGAAAACTCCTTGAAAAAACACT
CTAGAAATCAAACAAACTTACCAATATCAGAATCACAAGAGGTCTAGATC
AATAATGTCATTTTTTGGCCGAAGGGCCAACaaaaaaaaGCTCATTACAA
TTTTCAGACAGAGAGGTTGAACAAGAATTTGTCATAATCATAGTTTTGGA
GTTGAAGTTTGTGTTTGGTAATATCGGATTTccggatttttctttttttc
ttagaatCGTTTTTTGTGGTTCGAGAATTTTTATACCTCGTGATAATCGT
ATCACttgccaaaatttcttattaACCTAGGGTGTATTCACTTGAAGTTT
GCTTAAAATACAATCACGTGATCGTGCAAACTTAGACAATAAGAGACAAA
GGTGAAGTTTGTGCAATTCTTTGTTCccatattttcaaaacttcaaGCAA
CAGTGTACACCCCTATTTCAGAAGGtgttattttcgatttttcgattttc
tcctgtgttgctgttgtttttgttgagaaatgaaattatttttttcaaaa
aaacgtaAGCGTGTAGCCCATCTTTTTTCAGCCGCAATTTATATGAATAG
TTTTAGGCTATTCAGCGTTATACATTAATCCTATTAATCCTGTTAACCTA
AGCCgtcagtggaaaaacacccaTAGGATTCGTGTATCTGttacatgcta
ttttctattcaatttaaagGGGAAATTGCATGATGTGTGCAGATTTCCCT
tcgaaaaaaacattgaaaaaaattgatttccaTTATTTAAATGACTTTGG
GATTCATGAACTCTTCTCTATTGCTAACGTAGAAAAATATCATGTTGAAA
TAGGCTAATATTGAAAATGGACTTTTTCTCCCCTCATAGGTATCACATTA
TGCGTGTATCGTCTGGAACCAGAAATCACGAAAGAACAGTTGAAAGAAGT
CTTCTCTAAATTCGGACACGTTTTAAAATGTACCGTAACAGAAGAATGTT
CCGGACCTCTACCCTACCGCATCGGAAGCATCGCGTATTATTCCCCACTA
GAAGCACAACAAGCTATTCGATATATGAACGGTAAAGCTATCATTCAAAA
CAACATTTATGTTGGTTTACAGACACGGAAAAAAGAGAGGCGACGATCAT
CAAGAACTAGCCCGCCACCTTCGGCATTGCTTCTCCCGCCCCCGAAAGAG
GgcgttgaaattgaaaatcggACTGAAAGATCTTTTAGTGAATCAGTAAC
GACAAGTGGTAGTGGTGGTCAGAGTGTGGGTGAAAAATTGATTCAATTTA
AAAGACTTTGTCGCACGAGGTCGTTGAACACCAGTGCTTTGGATACTCAC
TcttaattcaaatattttttaaacatacaGTGTGTCATGAAAAAGCGgac
acatttttatataaagtaaaa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000182_pilon:299914..309534+ >MSTRG.17729.3.p1 ID=MSTRG.17729.3.p1|Name=MSTRG.17729.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1881bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000182_pilon:299914..309534+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTCCAATGACATTTTTATTTCCACCACATACTTGGCAAACACAAGT
TCTCGATTCTTGTGGTGGTTTCAATGGACAGAGAAAGaaATCGTATTCGA
CAAACACACTGACACGAGCTGATTCTaccgaagaagaaaatgaatgcAAA
ACTTATGAAGGTATCACATTATGCGTGTATCGTCTGGAACCAGAAATCAC
GAAAGAACAGTTGAAAGAAGTCTTCTCTAAATTCGGACACGTTTTAAAAT
GTACCGTAACAGAAGAATGTTCCGGACCTCTACCCTACCGCATCGGAAGC
ATCGCGTATTATTCCCCACTAGAAGCACAACAAGCTATTCGATATATGAA
CGGTAAAGCTATCATTCAAAACAACATTTATGTTGGTTTACAGACACGGA
AAAAAGAGAGGCGACGATCATCAAGAACTAGCCCGCCACCTTCGGCATTG
CTTCTCCCGCCCCCGAAAGAGGgcgttgaaattgaaaatcggACTGAAAG
ATCTTTTAGTGAATCAGTAACGACAAGTGGTAGTGGTGGTCAGAGTGTGG
GTGAAAAATTGATTCAATTTAAAAGACTTTGTCGCACGAGGTCGTTGAAC
ACCAGTGCTTTGGATACTCACTcttaaATGGTTCCAATGACATTTTTATT
TCCACCACATACTTGGCAAACACAAGTTCTCGATTCTTGTGGTGGTTTCA
ATGGACAGAGAAAGaaATCGTATTCGACAAACACACTGACACGAGCTGAT
TCTaccgaagaagaaaatgaatgcAAAACTTATGAAGGTATCACATTATG
CGTGTATCGTCTGGAACCAGAAATCACGAAAGAACAGTTGAAAGAAGTCT
TCTCTAAATTCGGACACGTTTTAAAATGTACCGTAACAGAAGAATGTTCC
GGACCTCTACCCTACCGCATCGGAAGCATCGCGTATTATTCCCCACTAGA
AGCACAACAAGCTATTCGATATATGAACGGTAAAGCTATCATTCAAAACA
ACATTTATGTTGGTTTACAGACACGGAAAAAAGAGAGGCGACGATCATCA
AGAACTAGCCCGCCACCTTCGGCATTGCTTCTCCCGCCCCCGAAAGAGGg
cgttgaaattgaaaatcggACTGAAAGATCTTTTAGTGAATCAGTAACGA
CAAGTGGTAGTGGTGGTCAGAGTGTGGGTGAAAAATTGATTCAATTTAAA
AGACTTTGTCGCACGAGGTCGTTGAACACCAGTGCTTTGGATACTCACTc
ttaaATGGTTCCAATGACATTTTTATTTCCACCACATACTTGGCAAACAC
AAGTTCTCGATTCTTGTGGTGGTTTCAATGGACAGAGAAAGaaATCGTAT
TCGACAAACACACTGACACGAGCTGATTCTaccgaagaagaaaatgaatg
cAAAACTTATGAAGGTATCACATTATGCGTGTATCGTCTGGAACCAGAAA
TCACGAAAGAACAGTTGAAAGAAGTCTTCTCTAAATTCGGACACGTTTTA
AAATGTACCGTAACAGAAGAATGTTCCGGACCTCTACCCTACCGCATCGG
AAGCATCGCGTATTATTCCCCACTAGAAGCACAACAAGCTATTCGATATA
TGAACGGTAAAGCTATCATTCAAAACAACATTTATGTTGGTTTACAGACA
CGGAAAAAAGAGAGGCGACGATCATCAAGAACTAGCCCGCCACCTTCGGC
ATTGCTTCTCCCGCCCCCGAAAGAGGgcgttgaaattgaaaatcggACTG
AAAGATCTTTTAGTGAATCAGTAACGACAAGTGGTAGTGGTGGTCAGAGT
GTGGGTGAAAAATTGATTCAATTTAAAAGACTTTGTCGCACGAGGTCGTT
GAACACCAGTGCTTTGGATACTCACTcttaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000182_pilon | genome | sc0000182_pilon:299914..309534 + |
|
