MSTRG.17729.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.17729.2.p1
Unique NameMSTRG.17729.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000182_pilon:295507..309534+

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.17729.2.p1 ID=MSTRG.17729.2.p1|Name=MSTRG.17729.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14028bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000182_pilon:295507..309534+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
taaaagaaaagaatataTTACATCGAACTTGGTTGACCTTGATTTCCTGG ATGACGCTGATTGGTTGTGCTGACAATAGAATGAGTTCACGTGTCTTAAA GGTAATAGGTGATTGATCTgtcatttattttaaaataattttaacatttt taattttggggggattatgctatatacatatgttttttataacaggcccg gtggaacaaccgtaaaagtggggtgGCTGAAGGCTCAGATGAGATAAAat tcatttgctcaaaagtggggaggctgaagtctcccccgTCTGCCcacttc cgccgggcctgtataAGCATAATGTTTATAAGCATGGTTATCGATCATGG GTTGTGTACTTAGGAaggttcatttttcttttccatttttttaatgaaaa aactttttttaggaaaaataagcatatcacAAAAGTAATTTGAGCTTGAT TCCAAAATATAGCCTAAGTATAACTGAGcctgttttccaaaaaaggtaTG CTATATTCGTCAATTGTGTCCAATCCAACTCGATTTGATGAATTGATCCC GGGGAGGCACTTGGgtaaaattgggtacggggacgtgccgctggtcaggg tcccttttttaaggCTCTGAAGATAACTGGCAAGGTCCAAAATTTACTAA TCTTCAAGCATGTGTGTCTGGCAAGGTTGGTTATTTTGGAAGAATTTAAG ggtgaaaattaaagaaattatcatttttggacctacctccgggtactccg gtggaggtcctataaattaaccaatgtccgtccgttcgttcgttcgtccg ttcgtccgttcgtccgtccgtctgttaccagcttttctcagtattggctc attagttttttctgacttttggcacaatgatgcaaaatggcaatgcccaa aatgtaacggagcccgaatttcgaaaaaaaagattttccggccgaaaatg 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aacactgtaaacatctccgccactgcttactccacccaaatttatcacgc ctctcctaaactattcccttttttagtgatcgataggatcgtctaagaca gactttaattgaatctttcaatcttcattttcttcagaaATCGTATTCGA CAAACACACTGACACGAGCTGATTCTaccgaagaagaaaatgaatgcAAA ACTTATGAAGGTTGGTTGTTTTCAGaggatatacacgttttttttgaatt agaataaattgtataagaacataaggctcgatggtcaaaataattGGAAC AAAACAAGATCATTCTAACCCTTCGAGcttcttcctatttttttactagg ggaagcatattgccccccccttaaaatctGAAGAACGACAAGtgctatga acttgaaattttgaccagtggtaGATATGGATTATTGGAGCTTTTTTAAC CAGGCATCGAGAATAGTTCGCCATTTGgctattaaattcaaaatttaatg aatctGCGATCATGtcagatttttataagaacaaactgttaGAAATGAAA TGCTCAGAAATGCTCAGAACtagctaagaacattttgaggcttagCGCAT TTTTAAACACCCAAGTTCTTTAATAGGCCCAGAAATACTCACAACATGGT Gaacataagaacattttaagaacattttaagcttaaagtttaaaagttac gaacattcgaaggctacaaaaattttggacgttcttatagaaaaaaatta tttacaagtTTCAAAAAGGGATCCTAACAAGTCAAGGCAAGTCCTTCGAC TTAAATTTTACTAGAGTCAGTCCCACCATTTGTGCGAGTTTAGAAACTGA TACAAATTGTCATACCGCGAACACCTTATTTTAGCTCCCTCTGAAATTTA ACCTGTGGCGACCTACTATtagaattttatcgcgcatgtctcAATTATAT 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catgctattttctattcaatttaaagGGGAAATTGCATGATGTGTGCAGA TTTCCCTtcgaaaaaaacattgaaaaaaattgatttccaTTATTTAAATG ACTTTGGGATTCATGAACTCTTCTCTATTGCTAACGTAGAAAAATATCAT GTTGAAATAGGCTAATATTGAAAATGGACTTTTTCTCCCCTCATAGGTAT CACATTATGCGTGTATCGTCTGGAACCAGAAATCACGAAAGAACAGTTGA AAGAAGTCTTCTCTAAATTCGGACACGTTTTAAAATGTACCGTAACAGAA GAATGTTCCGGACCTCTACCCTACCGCATCGGAAGCATCGCGTATTATTC CCCACTAGAAGCACAACAAGCTATTCGATATATGAACGGTAAAGCTATCA TTCAAAACAACATTTATGTTGGTTTACAGACACGGAAAAAAGAGAGGCGA CGATCATCAAGAACTAGCCCGCCACCTTCGGCATTGCTTCTCCCGCCCCC GAAAGAGGgcgttgaaattgaaaatcggACTGAAAGATCTTTTAGTGAAT CAGTAACGACAAGTGGTAGTGGTGGTCAGAGTGTGGGTGAAAAATTGATT CAATTTAAAAGACTTTGTCGCACGAGGTCGTTGAACACCAGTGCTTTGGA TACTCACTcttaattcaaatattttttaaacatacaGTGTGTCATGAAAA AGCGgacacatttttatataaagtaaaa

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000182_pilon:295507..309534+

>MSTRG.17729.2.p1 ID=MSTRG.17729.2.p1|Name=MSTRG.17729.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1917bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000182_pilon:295507..309534+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aaagaaaagaatataTTACATCGAACTTGGTTGACCTTGATTTCCTGGAT
GACGCTGATTGGTTGTGCTGACAATAGAATGAGTTCACGTGTCTTAAAGa
aATCGTATTCGACAAACACACTGACACGAGCTGATTCTaccgaagaagaa
aatgaatgcAAAACTTATGAAGGTATCACATTATGCGTGTATCGTCTGGA
ACCAGAAATCACGAAAGAACAGTTGAAAGAAGTCTTCTCTAAATTCGGAC
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CGCATCGGAAGCATCGCGTATTATTCCCCACTAGAAGCACAACAAGCTAT
TCGATATATGAACGGTAAAGCTATCATTCAAAACAACATTTATGTTGGTT
TACAGACACGGAAAAAAGAGAGGCGACGATCATCAAGAACTAGCCCGCCA
CCTTCGGCATTGCTTCTCCCGCCCCCGAAAGAGGgcgttgaaattgaaaa
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AGGTCGTTGAACACCAGTGCTTTGGATACTCACTcttaaaaagaaaagaa
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GATCTTTTAGTGAATCAGTAACGACAAGTGGTAGTGGTGGTCAGAGTGTG
GGTGAAAAATTGATTCAATTTAAAAGACTTTGTCGCACGAGGTCGTTGAA
CACCAGTGCTTTGGATACTCACTcttaaaaagaaaagaatataTTACATC
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GACACGAGCTGATTCTaccgaagaagaaaatgaatgcAAAACTTATGAAG
GTATCACATTATGCGTGTATCGTCTGGAACCAGAAATCACGAAAGAACAG
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ATTCCCCACTAGAAGCACAACAAGCTATTCGATATATGAACGGTAAAGCT
ATCATTCAAAACAACATTTATGTTGGTTTACAGACACGGAAAAAAGAGAG
GCGACGATCATCAAGAACTAGCCCGCCACCTTCGGCATTGCTTCTCCCGC
CCCCGAAAGAGGgcgttgaaattgaaaatcggACTGAAAGATCTTTTAGT
GAATCAGTAACGACAAGTGGTAGTGGTGGTCAGAGTGTGGGTGAAAAATT
GATTCAATTTAAAAGACTTTGTCGCACGAGGTCGTTGAACACCAGTGCTT
TGGATACTCACTcttaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17729MSTRG.17729Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17729.2.p1.exon1MSTRG.17729.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17729.2.p1.exon2MSTRG.17729.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17729.2.p1.exon3MSTRG.17729.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17729.2.p1MSTRG.17729.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000182_pilongenomesc0000182_pilon:295507..309534 +