MSTRG.17622.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.17622.1.p1
Unique NameMSTRG.17622.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000179_pilon:658261..685380-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.17622.1.p1 ID=MSTRG.17622.1.p1|Name=MSTRG.17622.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=27120bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:658261..685380- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTGAACGAATATTATTACCTTATTATTGCAATTTTTTGGAATTTTGGAT GATGTAAGTGTTTGAAATTGATACTCCTGGATTTCTTGATAAATTTTACG TGTTTTGATTATTTTTTCTAGAAATTAGGACAATTTTTGATGAAGTATTT TATAAAAAATACGAGACTATTTTGATCATGCTTCAGAACTTTTTTGAAAG TTTTTGACTGATTTCTCTCAATATTAGATTGTTCATCTGGTCAAATGCTG GTTGTATTTTAATGCTATGATAGGAGGAATTCTTTGGACTGTATTTCTGT AAATTAAGAGGTTTTCAGTTAATTTTTCCAGTGTTTACAACATAATTTGC TTTGATTTCCCTTTTTGTTGTCGTGCTCTGCTATTTGATACTTTTTGCTG ATCATGACTGGTAAAGTCAAAATTAATTATGTTAGCTTCTGTCTTCCCAT TTTGACCTTGAAGTCTGTATTCACACTGAATGATGCTGAGTTGAGAGGGA GCCAGTTTTTTCATGCATGCACTGACACTGTACAATGGCGATAATGTACG GCTCAAGCAAATGATCAATGTTATCATAATCAGCTCAGTAAATCGAGATG TTTTACCTTACATTTGCGCATACAGTAGTTATTAATGTAATACTTCGCAG CTTTACCGATGGATAATTTCGCAGCCCTGGCCTATGGACCAAAACCGGGG TCGCAGGGCATGGACCAGGGTCCCAAATAATGTGCATTTTGAAGAACAAC CCAAAAGGAAACTTTTCACCCTAGCATTTTAATTTCCTACCTAGCGATTA TTCACAATCATTCTTGGAAGAAATACTACTTTGTTAAAATACACCAGCCA GATTTTGCCTAATTTTGCTTCTATTTGTGAAAATTGGTCGTCATATTTGG TGTTCATAATCGCACACTTCCATTGGGAACGTTGCGAAAAATTGCAGCAC 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AAAAATTCATATGGGTCATCGGGTATTTTTTAGAGTAGTCGAAAACGCTA TCTACGACCTATAGTAAAGCAAAAATTGTAAAAGTTTAAAATTGAAAAAC TTCCTCATTGTTCTTCGTTCTTCTCACCCTATAATCAACTCAATAGTTTT TATGAGAAGAAAGAGCGAAATGGAAAATGTCAAAAAACATTTCCAGCTGA TCTGATTTTAATATTTCTACCGCTGACCTCAAAAAAACGACTTCCATCGA AAGCTTTATAATATATATAGCCCAATTAACGTCACTACGAGGAATCTTAT TTTTATCTCCCTTTACGGTTTACCATGTTCCTCCTACCACACAATTAATA CAAGAGGTCACAGTCTTTTAAAAGAATCGTTTAATTTATAATTAATAAAA TAAAAACATTTCCTGGGTATTTATAAAAAGTCATGTCTATTGGTTATAAC ATTAACAATTCTTCTTTATCAACTTAGCTGAAATACGGTCCTTCGGACGG TAAAATTGTGCAAGGGTTTCAAATATCGAAACACGCGAATCGCAAAGAAA TTTACAAAAGAAATAATTGAATCATTATTAAGTGTTTTACGGTTTTAGAA GATGATGGATTTAAGAATAGATATGAAACAGCGAAATGTAAACAATGTTT ACAGCTCTCGCTGCTTAAAATATCATATCTTACACGATCTTACAGTATTG GGATTTTTGGAACATTTTGGACCCACGGGAAAATTTGGACCCACGAGCGA TTTTGACCCACGAACCCACGAACCCACGAGCAATTTCAACCCACGTGATT CTTTTTTGGACCCACGAACCCACGAACCCACGAACCCACGAGATATTTTG ACCCACGAACCCACGAACCCACGAGACATTTTAACCCACGAACACCCACG AGGGCACGGACCCACGAACCCACGAACCCACGACACGCACGTAACCCACG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000179_pilon:658261..685380-

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TGCATCCATACCACGTCCTTCGTCCGATCCGACAGCGGGTGGGATGGGAT
ACCGGTCCTCAGCATCCATGGATTGTGAAAACGACAGCCCGCAAGGACCA
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GGACGTAGCGCAACTCGAACACAGTAGTCGTCCGCCGGGTGATGAACAAG
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CCGCTCGGTGCTTCTACAAGGACGTCTAAAAAATCGACTAATGAGTCGTC
GGAAGTTGCTCCGGTCAGCAACATGCAATATTTTAATAACATATCGAACA
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GTTTGTATCAATATATTCAGTCGAGATTTTATCGGTCACCAGAAGTGCTA
CTTGGTCTACCCTACGACCTTGCTATCGATATGTGGAGTTTGGGTTGCAT
ACTCGTTGAGATGCATACCGGCGAACCGTTGTTCAGCGGCTCAGACGAGT
AAAACTAAAGAGTCATTTCACCTGGCGTAACCACTTATGTCTGGTCATGG
AACTTCTTTCATACAACCTCTACGATCTACTACGGAACACAAATTTTCAT
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AAGGTTCTTTTGGGCAGATGACTCTTTTATCTTATGAAACCATTGTTGAC
TATAAAAACAAAAAAAGCGATATGGCAAAAACAAATTCAAATGATGAAAA
ATATGCACCATATCCAACAGCTCCAAGAACGACCAGCAGTCAGGAATCAT
CCTATGATTACTATGTACGGAAGATACCAACTACTTTTCGTGACCATCAA
CAGGCACCTTTACGAAAACTCTCAACAGACCTGATCAAAACTTACAAACA
CATTAACGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17622MSTRG.17622Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17622.1.p1MSTRG.17622.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.17622.1.p1.exon2MSTRG.17622.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17622.1.p1.exon1MSTRG.17622.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000179_pilongenomesc0000179_pilon:658261..685380 -