MSTRG.1761.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1761.1.p1
Unique NameMSTRG.1761.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000008_pilon:1480892..1544220-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1761.1.p1 ID=MSTRG.1761.1.p1|Name=MSTRG.1761.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=63329bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:1480892..1544220- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGAAAAATAAATGAAAAATCAAAAAGATCTAATTTGATTTTGGAAATTGG GGGTGCATGTTTGCTGCAGTTGGCTAAAATGCTGGATGGTAACGAGAATT CTGCAAATTTACCAATATTTCCTATGTAGAAAGGTATTTTTCATGTTTTA TTATGGTTAGCAATGTTTCCGACCTTAATCTTCTGGTGTACATTTCTGGA CCAATTTGTCATAAGCATAAGGTTAGATTAAAAACCATAAGCAAAAGCAT GATAACTTTATAGTATGTCATTTTCTCAACACTATGAAGATTCCTGTATA TTATAGCAAGATCTTCAGGCTTATCCAATTTTTACAAAAGCAGACCTTCT TTATGTGATGGTTATTATTAGCATTATACACTTAGGATTTTTCTCATAAA AATGTTGTATTTCAGGTATTTTCAAGGTTTTCCCAGGAATTTCCTAGAAA TTTCCTAGGAAAATCCTAGAACTGAGAGGTTCTCTTTTTTTAATAGAATC TCACACCCTAGAAAATCCCTAGAAATTTCCTAGAAATTGTTTAAATTTTT CAACAACATGGTCCTAGAAATTCCCTAGAAATTTCCTAGTAAATTCCTGG TAAATTTGCTCCCTAAAACTCTAGGGAATCCTGGGAAATTGAGTTTTTAT TTCACCAGGAATTTCCTAGGAATTCCCTAGAAATCTCTACCAGGGGGATC TTTGAAATTTTGTCAGCTTGGCACGTTGGTAAATCTATAGTACAAGTGCA ATATTTATGACATTATGACACAGCTGAGATTGACTGCATGCAGGATACTA TTTGCAGGGAATGTTCAATATGTTAATATGCTCACATTCATTGGGTAACA GATCACTGCTTTTTTCTATGGGTACAAGTTAAACCTGATAACCTTATCCC AGAGAATGTAACTCCGAAATGGTTACAGAAATCCTCAAAAATTAAGATGG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000008_pilon:1480892..1544220-

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AAGTTGTTCTCGACAACAATACGGAGAATGCATCTCCAGAAGATACGTTT
ACCCAAAATGTTGACCCTGCTAACCATGTTGCTTCCTCAAACACTTGTGA
AAGGGAAAAGAACTTTTGACGGCATACCGAACTTAATGACGAAAGTTGCT
CAAAGTGAACTTTCAAAGTTGAACAGGTCCATCACCAAATGCAGCGTCAC
ATATCTTCCACAGATTGATTTTGAAGAGTCAGCATTTTTACAACATTTTG
TGGTCAAGACGGGTGTCGATGAAGAGTTAGATGAAAACGATTTTCCATGC
GATCTGTATCGGTGACATTTGCAAAGGAATTTCCAAAGACTTGCACATTA
TCCAGGAAATCAACGAAACTTTCTCCAAAGAATTATTGAGTTTGGGAAAC
CTCATCAAACACATCAGGATTCTGGGTAAGATGAAATCTTGTGGAATTAA
CGTCCGGGATTGGCAACATCTTTATAAGATGGAAGCATTGAACACTCTTC
AAGATTGCTTGAAAAATACAAAAAATATTATGATTCAATGGTTTTTGGCA
AGAACCTGAACCGACAACTATGGATACCATCTTAGAATATTGCCAAGATG
CAATTGATTATGTAATCACCATGGTTACAATGCTGACTCAAAACGCGACT
GTTGCTTTCAGCTGGTTCTGGAAGCAACCAGAGCCAACCGCATACGAAAA
ATTTACGATTTTTTGGGAACAAGTTTTCATATGTATTGCAACGAACCTTC
AAATGCTGGCAAACCAAATAGCCGCCTAACGACGGGGAATATGAAGACGA
TGTTGTCGGTACAATCACGTATGCGACTCCTGTCATCAATATATTCATAT
CAGCAATTATTTCGATCGGATTGATATCGATCGCATTGTACACGCTGTTC
AATAGTTTCTGTCCAGATCTGCTAGTCAGAACTATATCCCCCAACAAGTT
ACCAATCACAATGAATCTAATAAAGTTGTTCTCGACAACAATACGGAGAA
TGCATCTCCAGAAGATACGTTTACCCAAAATGTTGACCCTGCTAACCATG
TTGCTTCCTCAAACACTTGTGAAAGGGAAAAGAACTTTTGACGGCATACC
GAACTTAATGACGAAAGTTGCTCAAAGTGAACTTTCAAAGTTGAACAGGT
CCATCACCAAATGCAGCGTCACATATCTTCCACAGATTGATTTTGAAGAG
TCAGCATTTTTACAACATTTTGTGGTCAAGACGGGTGTCGATGAAGAGTT
AGATGAAAACGATTTTCCATGCGATCTGTATCGGTGACATTTGCAAAGGA
ATTTCCAAAGACTTGCACATTATCCAGGAAATCAACGAAACTTTCTCCAA
AGAATTATTGAGTTTGGGAAACCTCATCAAACACATCAGGATTCTGGGTA
AGATGAAATCTTGTGGAATTAACGTCCGGGATTGGCAACATCTTTATAAG
ATGGAAGCATTGAACACTCTTCAAGATTGCTTGAAAAATACAAAAAATAT
TATGATTCAATGGTTTTTGGCAAGAACCTGAACCGACAACTATGGATACC
ATCTTAGAATATTGCCAAGATGCAATTGATTATGTAATCACCATGGTTAC
AATGCTGACTCAAAACGCGACTGTTGCTTTCAGCTGGTTCTGGAAGCAAC
CAGAGCCAACCGCATACGAAAAATTTACGATTTTTTGGGAACAAGTTTTC
ATATGTATTGCAACGAACCTTCAAATGCTGGCAAACCAAATAGCCGCCTA
ACGACGGGGAATATGAAGACGATGTTGTCGGTACAATCACGTATGCGACT
CCTGTCATCAATATATTCATATCAGCAATTATTTCGATCGGATTGATATC
GATCGCATTGTACACGCTGTTCAATAGTTTCTGTCCAGATCTGCTAGTCA
GAACTATATCCCCCAACAAGTTACCAATCACAATGAATCTAATAAAGTTG
TTCTCGACAACAATACGGAGAATGCATCTCCAGAAGATACGTTTACCCAA
AATGTTGACCCTGCTAACCATGTTGCTTCCTCAAACACTTGTGAAAGGGA
AAAGAACTTTTGACGGCATACCGAACTTAATGACGAAAGTTGCTCAAAGT
GAACTTTCAAAGTTGAACAGGTCCATCACCAAATGCAGCGTCACATATCT
TCCACAGATTGATTTTGAAGAGTCAGCATTTTTACAACATTTTGTGGTCA
AGACGGGTGTCGATGAAGAGTTAGATGAAAACGATTTTCCATGCGATCTG
TATCGGTGACATTTGCAAAGGAATTTCCAAAGACTTGCACATTATCCAGG
AAATCAACGAAACTTTCTCCAAAGAATTATTGAGTTTGGGAAACCTCATC
AAACACATCAGGATTCTGGGTAAGATGAAATCTTGTGGAATTAACGTCCG
GGATTGGCAACATCTTTATAAGATGGAAGCATTGAACACTCTTCAAGATT
GCTTGAAAAATACAAAAAATATTATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1761MSTRG.1761Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1761.1.p1MSTRG.1761.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1761.1.p1.exon9MSTRG.1761.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1761.1.p1.exon8MSTRG.1761.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1761.1.p1.exon7MSTRG.1761.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1761.1.p1.exon6MSTRG.1761.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1761.1.p1.exon5MSTRG.1761.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1761.1.p1.exon4MSTRG.1761.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1761.1.p1.exon3MSTRG.1761.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1761.1.p1.exon2MSTRG.1761.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1761.1.p1.exon1MSTRG.1761.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000008_pilongenomesc0000008_pilon:1480892..1544220 -