MSTRG.17608.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.17608.3.p1
Unique NameMSTRG.17608.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000179_pilon:439162..451970+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.17608.3.p1 ID=MSTRG.17608.3.p1|Name=MSTRG.17608.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12809bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:439162..451970+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tacccctggacaattcatcctccaccccccatgaacggattttttctgga agagcccatttcggaacggcttcaagaaagtcataatggcagatgatttt aaaagtttctgaggaaatgtgtggaatttatcgatgttgatggattgttg attctttaaagaaaaaagataacaggtatagctttttctaatcctggaat atcgtggttccagctacactgtagAAGCGAAAAGATCCCGGAGATGGGGC AGGTATgtttcccgggaatgagaaagttagccattttatgatacaatttt aaaaacttatacCTAGCTgtttgcgtgatgcgtgattggGAAATAATTTg aggcatgatttgggctattttcacGATACTTGCatggtgaacaaaccttt tttggtaattttcatgatcatcacgagagcaaggaaaatttctatcaatg cattttaaacatgtacaaactctggtgaaccaaaagaaagttgatattct attttcaaaacaaactgcttttttgaagttttttttaactcaaatatctt aaaatttcgacctaaaataagaacataataaggattttttggtataaaaa atgtCTTATGATACTTTGCGCAAAGTAACAGAATTTCGTTccgtcttttt ctcttttctcgttttcttaaatcagggggtaatggtatatatacaaaaat tgatcttgttcatcaaaaattgagaatattttacaataagaaaaccaaag gaaaatttatattttcaaagtagatgaaatattttgcatatactttcata tataaaatattggaaaaaaggtttaatatataaaatattgcttggagaaa aggtaaaatatataaaatattgaaaaaaaggtaaaaaattatagcatcca aaagttatattttttgaaatgcatgtcaaaaagttaaaaactttcaaaac 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000179_pilon:439162..451970+

>MSTRG.17608.3.p1 ID=MSTRG.17608.3.p1|Name=MSTRG.17608.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=10314bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:439162..451970+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGGGTTAGTCAAACCAGATTCTATTTCAACTCTTGGATTCgCAAA
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TCATGTTAAAGATGCTGATTTCACTTGATAGTCCGAAGGTACCACTCCTA
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TGATTACGCGATGCAGAGGGGGAGAATGATGCCAAGAAGATTTGGACCTT
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AAGGTTCAAACGTTGGTTGATATGGGATTTGATCGTGATGCAGTGCTGAA
TGCTTTGGCAAGTACAGAAAATGATGTCAACCAAGCCACTGCCATTCTCC
TCTCTGCTTCATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17608MSTRG.17608Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17608.3.p1.exon1MSTRG.17608.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.3.p1.exon2MSTRG.17608.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.3.p1.exon3MSTRG.17608.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.3.p1.exon4MSTRG.17608.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.3.p1.exon5MSTRG.17608.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.3.p1.exon6MSTRG.17608.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.3.p1.exon7MSTRG.17608.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.3.p1.exon8MSTRG.17608.3.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.3.p1.exon9MSTRG.17608.3.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.3.p1.exon10MSTRG.17608.3.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17608.3.p1MSTRG.17608.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000179_pilongenomesc0000179_pilon:439162..451970 +