MSTRG.17608.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.17608.1.p1
Unique NameMSTRG.17608.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000179_pilon:435749..451970+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.17608.1.p1 ID=MSTRG.17608.1.p1|Name=MSTRG.17608.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16222bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:435749..451970+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGTCGTTCTAGTTCGGGACAGTCCCGAGCGGGACTCAAGTTAAATTAGGC CATTATAACCAACCCGACTGCAGAACTAGTGACtttttttCTGACAGTGA CTGACTTGAACTGTGGTGTCTTGACTGGAACTTTTTGAAGAAGAGCTTGA AAGGGGTAAGAGCTTTGTTCATCATAACTGCTTCATGCATGTATCCGTAA CACctctttcattcattcattgtaCATTGGTGGACCTGTTTGTTTATCTA TTTTATGAGATTAGAGAAGACAGGAAGAAACGTTAGAAGAATACATCTTT CCCATAGCATAATTCACAAAACAGATGCACATGCATTATTTTGTTTCTCT CCACTGTTTGGCAGTCTAGCAGAAAGTTAattcttcttttagaaaaaaga caatcaattgtaaaaggggttacgcacgatacgaaaatctcaTGTTCGCa ggcgaaaggttttttacactacataccgtagccgtaggattgctaaactt ccttattcccagcgaaactttctgacagttacatcaatatgccttcttac ctgtctttaaaaatataaataaaagtaatcacggaaaaggacgcgaaaaa aaaatacataagtgtgagaacagagtaatcaaactcgttagaaaaagtac cattagaagtcataaaaaatcaacctgaataaaggcaatcgaaattccag agaacttcaaaattccccaaacaacattacattactatgtcaaactccca taacatgaattttacaattacgtcagagtagataacgctcgccaccgaag aggtttatttggaaagggtaattatattttattgttcgcttcttttttaa agattcgccgggttggaaaagtatgaatttctttgtacatattttaccta ccccaaatatttaggaggctgagttttaaacgaattgtcaagttgaaacg aacgataaatgtatcaaggtctgttttatttaccccctggtgacttaaca aaagggacttaactcgatgttacaatccaattattgaaagtttgtgtcGG CCTTTtcataatgagcgagacatacgttctctgattacgcaattttcata ttgacattttcgaggcattttgatgtaactgtctgattgctagtgtacaa cggaaaaggaccaaaacgccacaaaagtagatttaacaccgattttTGCC GGAGACGCCTAGAACATTAACAGTGtaatctcataaccgatcaccattgc taaggcatatgatgatctgaaaagtttCTCCAGCGGAATTTTACAAAACC GCGTTCGGCGGGGTCTGGGAAAAACTATGACACGTGACCAGATACCGGTA TCCGATTGGCCCGCagttttcaagatttatttatcattttataggaaaca attttttgtaagaaataaaGTAGCAAAAACctgtatcttttgaaaaattg aatattttccaaGAACTTTTTCAGATGATAACAGGCAATTGTACATGGAA CAATCTGAATCTTCACCTGTCaaaaatactaacttttttccTGTTGGAAT GCCCTTTGAGCACCTGAACATATCATGGctacaaaatcataaataatatc atttaatttggagttttgagaccttttcaagccagaaaataATTTCCAGA ACTTAGAGTTGGTATTTGTTTATCTTCCAAAtctattaaaaagttctcat gaaagttttttgaagtcTGATTGcaaaaagtatcaacccaaaaaactgat cattgaaaccgcttaaaaaagctcaacaaacataaaatttcaccaatatt ttatccaaaaagagTATCCAAATATCCAACAATACAAAGAGAGCCTAAAC TAGTCAACCTCTTAGTGtttgaatcaaattttttgtcGGTTGAATGCCTG ACAGACATTTCGCACACGTTAAGTTATAATTGTTCTGATAAAATGCTTCA TTCCTCCTAATAATCAAGCAGATAGCAAGAGAGAAGTAATCATTACATAA GAGAACATACCTGTAATAATTTGGTTGGTGTTTGAGCCTTCATCttgaac aaaaataagaaaacatccaagcaaaatcagttgtacaaaatacaactttc aaaacagtctTTCAAAGCTTTTAGGTCAATAAGTATGAGCAGCCACTTCT GTGGGTGTATTTCAGAGCTacactaaaataaataaacaacatttgaaaca ttgaactttcctttataagtctcaaaatccataaaaaattcaaaacattg accAAGAGCCAAAACGTAAATTTcaggcgccatcttggatttggtTCGGA GCAAGAAAGCCACGGTCGCAGTAGAATCGGTTTTGTTTAGCCCACGCATC CAAAGACGGCCCGAGCAAATCGATAAATTTTATGCGAATGCCGCGATTGA ATCGTGAAAAGTACTgtactctgaaatttcagagtgtcGGCCATCAAAGA AAACCCGAGAACCTTTGCAGGTCTTCTTGCAGAACCATTCCTTTTAGAGC GCATGTGTGGAATGAGTGGAGCACGAAGAGCTGCTTGGAGGTTAAgaaca gtgaggctggaacttcaatttttgaggattacgattttaccagcttttta gcgatttgtgcctcgctaacccaaatctcgcaacctctttacctttaagg aatatcgaaattagagtttttcagcgttccgaaaaaacgcaaagcaaaaa atttttcatcttcacatgatcgattctcaacaacaaaatacatcttttgg tctttgggtttgtttctgacgcttttccttcaaagaatatcgatcacttt ccttttcccctcaAGCgcgtgagaaaaaaatgattagctcacattctcgc gcgggcgaataaagatgaggcggcaatcttgcactgagggtgctacttag tttccgcccttttttgcgcccacaatagaatgatccaaatacgggggtat tccaaatgataaacgatgtcgttttgtaagtgtttattttctaagagata caaatagtatatattgaatattattaacttatttatttaagtatttttca gcccaaatttaaatatctggttaaataaaaaacaaatgatagcagttccg tttttcctcaaacccccggaaaaagtttttttgccgacttagctatttta caaatttcggaaaagaactcccataggaattccgatacataacccgattg gttcattgggctcttccagaaaaaatccgttcatggggggtggaggatat attatttttttcatgaattacccctggacattttgatttttaaccccctg gacacgggttatacccctggacaaacatcaaatcaaccccgtggacacaa aaaattacccctggacattggaatttaccccctggacattgcaatttttt ggtattttttcaatacccctggacaattcatcctccaccccccatgaacg gattttttctggaagagcccatttcggaacggcttcaagaaagtcataat ggcagatgattttaaaagtttctgaggaaatgtgtggaatttatcgatgt tgatggattgttgattctttaaagaaaaaagataacaggtatagcttttt ctaatcctggaatatcgtggttccagctacactgtagAAGCGAAAAGATC CCGGAGATGGGGCAGGTATgtttcccgggaatgagaaagttagccatttt atgatacaattttaaaaacttatacCTAGCTgtttgcgtgatgcgtgatt ggGAAATAATTTgaggcatgatttgggctattttcacGATACTTGCatgg tgaacaaaccttttttggtaattttcatgatcatcacgagagcaaggaaa atttctatcaatgcattttaaacatgtacaaactctggtgaaccaaaaga aagttgatattctattttcaaaacaaactgcttttttgaagtttttttta actcaaatatcttaaaatttcgacctaaaataagaacataataaggattt tttggtataaaaaatgtCTTATGATACTTTGCGCAAAGTAACAGAATTTC GTTccgtctttttctcttttctcgttttcttaaatcagggggtaatggta tatatacaaaaattgatcttgttcatcaaaaattgagaatattttacaat aagaaaaccaaaggaaaatttatattttcaaagtagatgaaatattttgc atatactttcatatataaaatattggaaaaaaggtttaatatataaaata ttgcttggagaaaaggtaaaatatataaaatattgaaaaaaaggtaaaaa attatagcatccaaaagttatattttttgaaatgcatgtcaaaaagttaa aaactttcaaaacagggaaacaaattcataatttcaaacatacacttttt ttaatataagaacaatttataagaacaacgaggctcaaaatcgccaaaaa ataagaacaatgtaagaacaatgctgagcctgaaactactcaatttcaag cattttaggggtcaaagtaatgaaaattgggtataatgcctaaaatacca aattcacagcaaaaatttccacgttttaaaagcacgtggaagaaaatgtc caaattcacagcaaaaatttccacgttttaaacgcatgtggaagaaaatg tccaaattcacaaccaaaggttttccacgtttaaaatgcataTGGAAgga aatgtccaaattcacagcaaaagtttccatgttttaaacgcacgtgcagc aagaaaatgtccaaattcacaaccaaaagttttccacgttgcatttttaa aacaccaagggaaattcaaccattaatcagtaaattttgctctgagttta aatttttacactaaagctaaccagttcatatccaGCCGCAACCATTTCCT TGGGTGCCGCAACCagtgttgtttatttttgccgccatctttgttttgac tgttataaagcagtatggtccgatcaacaatacgcttccgaaccgggcga cgtttcccgatcgagaaggatacttatattttccccggacgtttctcgaa gaaatgacgtcttcattGTCGTATAAAAACATATTACTTTGAACTTACCA TTTTTACCCCCTGCTTTTAGATTGCGTCTTCTGTGGGCGTGAAATCAGGC GGAGACTCAGCGCTCTCATTATAAGTTTCTAAGGTTGTCCTATTGTTTGc atgctaaatccatacacaatgacgtcaatgtttggcggcatacctgaaaa taaacaaaaagattaccATCATATTTCATTTGCATAAATTACACTACCTT ATAAAAATTATACCAAACAAAAGCGAGTTTAGGCCGCCCGTCTAGAGAGC GTGAGCCCTGATATTTTTGTCTCGCgatcgatattcttcgaaggaagaat TAGCCaaaaaaaCCCATTGACAAAAAGACGTCTTGCGAGACtgggaatgg atcctgcgaagatgaaaaaattttaacaaggcATTTTTTGGCAAACCCAT gaactctaatttttttcttccatcaagctaaaaaatttggtttggttaat cgaggcaaaaattagcaaaaagctggtgttttccgtaaatctgagaatca tgataagatcctcactgtcaaatcaaaaaagtgaacaaacaagcttcgta agaaaaaacactttaactaccattcataaaaatacttgtccaaaatGACG AGTATGTTAGAAAGTATTTCCATAAAAATCAGCGTGATACAGTTTCCTTC ctctgaaatattgataaaaaagttgatgcaatcagttttgaaattagtcg tataagaaaataagaaaagaagaagactctacattgcgatcaaaacattt gagacaCAGGGAAGAAAGAAGACCTTgcattgcgatcaaaacatcCGATG GACAAAGTTTCTAGCTCAGGTTTGAAATAACAAAGTAAACCAGTATATTG AATCTCCGGATGGATGTAAAAAGTTCCCGTATTTTTCTCAACTGAAAACC ACACCATAGACgacaactttcaaaacaaaacataaacaaactttagaaaa aaaggggaagaaaagaaaattcctgaaaaaacatgctgtagggaaaaact aaatcatgaaaTGGCTAACATCCTGGTAAACTAAGTAGAATTATAGAATT ATAAAAAAGGGGGATTTTTGTTTATCAGTTGAtatgttgttttatttttt ttactgttATTTTCTAGGTGCTACTAACATCATGGCTGGGTTAGTCAAAC CAGATTCTATTTCAACTCTTGGATTCggtatggatttttttcatttcaat aagatttgataattttttggacctacctcagaGGTTCTTtaagttcgttc gttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgt tcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttc gttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgt tcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttc gttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgt tcgttcgttcgttttgtCTTGAAAAATATCGAACAGGACTGGTAAAGAGA AAAACCTTCACAATTTATGCCAAAATGTAATGACCTAACTGGattgactt tttttgaattgttttaaatacacaggttgcaaaaataaagtttgaagtTA AATCATGCTTTTACTCGAATTTTCATGTGCTTATTACACGACCTtcattt ctgattggttcgaattcaTTAATACGAATAAAGTAATTAAATGTGAGTTG TATACCAAGTAACaagggaataaaatcacgtgaacattttcgagtaatca catgttttggcTGCACAATTCTATAATTTTGCGTGTGTTGCTTTGAGAAT TGATACTGATACTGATGTAAACAAGAAATTCCTATCTAACTTTTAAGTTA TTCCAaactttcatttaaaaatacgATTATTTATATAAGGATACGTTCCA GTTTTTTGGGATAATCTGATTATAAACTTATGTTAGggctttatttttca gtttgaatatCTAACGACAGCTAACgatgaaaagttatttttagCAAATG CAAGTGCTTCCAAGTTGATGATGATAGCAACTGGGATAGGATCAGTTAGC GTATATTTCTTGCCAACCAAATATTATCAGAGGTTGACGTTAAATCTAAC AGATATTATCAATCAGGGACAGGTGAGTTTTCATTTCTAAAATCTTTGAA TAGCTTTACAGAGGCCCCGGTGCTTGATAGCTTCTTTCTGTCGTTTTTGA CAAAATACACTCAATCATTTTTTCAGGATGggattttttaagaattctgt gactagcgaggttaagcaagaagctatctattacgtgcggaatctattac gtgagtttttaGACTGGATCCGAGGTGTTTTAGCCTGATTCCTAAAGCTT CACGGCATAGAGAAAAAAGAGGTTAAGCAAAAAAGGCGATCTATTACGTA TGACGTAATGTCGATTTTTCCATATTTCACTTTCGGCCCCTACTTCTGAA ATTTTCTacctctttttttcttttccagttttcTTGTTGGGAGTTTGGTC TATAAAATCCCCTTACTTTCAATCTTAATCTACTTAGTTTTTCCCCAAGA CAaatgttttcacaaaaattaaaactagGAAAGCATAGTCAGAGTTTTCT CTATAttacttttactatttttattcaacatttttataaacaaaaaatat gtctCTGACTTATCATTTCAATGAATTCTTAACATtgcaataaaaatata taatttcataatttcattccTAGTTTACATAGGTACCAATAAAAAATTAC tgctttatttataaacaaaaaataatctgtaAGAGCATAGACATAGTGTA CAGTATGTCATAGTATGTCATCCTTATTTAGCTGAATTTCTATATGAATG CTTCACCATTACCAATAAAAACACTGTTATAAAAAGTGTGCAAACCTGGT CTCGTGTTTCATATCTGGCAGGTGttccttcttctgcttctttaCATTTC AAGGTACCGATATCACCTTTTTAGGAAGGGAGATGTCTCTTTAGAATCCA ACCAATCAAACCAAACGTTATAACGTTATAATGTTGAAGAAGTTGAAGGA TGACCAGTCAGttaaaatttttcagcaaaggaTTGAGAACTTGAAGCAGT AGCGGTGTCCAGAATAAAGAGCTTTATATAATTTTGGGGAACGGTTTGAA GTTCAGCGGTTGTGTGACATCAGGTTTTTAGCAGGCTAATTTGTACGTAC AATATTAGTCAGATAGTTGATGATGAATGAAGAGCAGGAATTGAAACTCG TTACTTAATTCATAGTTGTAGcagttgaaattggaaaaatatataaagat ttcttttgttttgcttCGGGTGGAGGGGTAAATTTCTTTGAGCTTGGCAG AGTGTCTTTTTCGTGTTTGTTGTTTTGGGTGGGTGACATTATAACTTTGG CTTCTTCGCACTTGATGGGCTGGCACCACAGTCAGAAACactaaaaaaca tgaaaaagaaatatggttacATGCTGTTCATTGTAAAGGTTACTTTGGAT GTATTTGGACTTTGAGAGCATataaaaagcaagataaaaaagagaagaaa aacgaacagaaaaaagaaccagaagaaactttctgtttgttttggtttga taaaaaagtcaGCAAAGGTTATTTAATTACACTTACATCTTGACCTTCTT TTGAGCAATAAATTCTTTCACTTTGTTTGTATGCATCATAGTTTGTTTCC ACAGATgagattcaaaaactttcttctgTCAGCTCAAACTTGTCAgaaca gtcaaaaaaaatctaccaaagtttcttttctgtttacatttttttcgggt gatttttttttCCTAAACGATTCAGCCCAATCTCCGTAAGGTAAATTTCC CTGGatcatgcttatatcctaatcgaaatctattacgtgagattGGAGAA TTTCGCGCAATAGATCCACTCTTCAAACTATGACGTACAGGTCAAATTTC ACGGGACAGAGTTAGCCTTGAAATTTGGGCGCTAGCCTGCgaaaaactca cgtaatagattccgtacgtaatagatagcttcttgcttaacctcgctact ATTCAagcttttttgttaaaatatcccGGCGATACCGCCAACCCAATTAA ACAATTAGACTTgagaatgaaaaatatattgtagttaAATGTGATTTCAA GTCAATAGAGTTACTCtttttttcatcctttttattttatttttatttat tctttatttaaagtTGGGTAAAAACCTgctagaaaatacaaaagtaaATT CTAATTAAGTCCAACtgttgtaaaaatattatataaaagctattaaaata aaatcctaagaaaaagaaaacgaaaaactatttagagcaaaataaggggc cttctctatgacagctgaaaatattcttagagattaataaacgggggggt cctaataaggtccggggggggttggaaaattttcaagcgggggggggggc gtttatttggaacctaagagtacgcgGCCCAAGGCCCTGCGTAGATTTAA AAACTTCAGTGATGAGGGGTTTAAGATTTCGTGCATGAATATCTACAGAG TTGCAATCAGTTAATAAAGTACCATAGTTCgagattgatttatttttcag agCACAAAGTGCTCTGTGATGGCATTTCTCAATCAGGCTATTTTCCCCTT TCCACAGAACATCCAAACAAGTGGGCAATAATTAAAGggataaaaaaata taagagtTAACGAGAAGCTTTGCTTTGTCTTCCGATAAGAAATTTCTTAC CCTTCTTAATGCCCGGAGTTTTGGTTTGATTTCTTACATAACTCGGTGAT ATGAGGAATGAATGACAGTCTGCTGTCAATTTTTATGCCCAAAAGCTTAA CAACATCAACgcttttgatgttatttttaaTTCTATcggaagaaagaaaa aagaaagaagaaagatttagGTTGAAGGTGCCAGGATATATGAGTTGAAA CTTTGAGGGGTTTGCAACCATTGAGTTATGCTTAAACCAATCAAGAACTA TGCGTAGTTGACGCAAAAGTTTTAAATTCACATCGTCTATGCTGGGGCCA GACGATTATAAGGTAttatcatctgcaaaatttgatatttcttttataat ataaaatagtAAATTCTCGGCTAATTTTTCTTAGGAGTGGTATACACAGA GACAAAAATGTCAGTGTAGGACTTATTTAGTTGTATTTTGTCATATGATT GAAATCCCACCTTGAACATGGCCATTTAGAAAGTCTGTTTTTTGAGAGTC TGAAAGGACTATTTACtagggggtgattttttttctgaaagacaGATGAT TGATATCCACAACCTAAAAACACGGCTTTATTAGGCACCTCCCTAAAAGT ACTTAAAATTCGCATTAAATTCCTAAGAAATAATTAGAAAGATGTAGCCT TAAGGATTTAATATTCTTACAGTCAGGTCAGGTTAAAAGATTTTTCCTAc tctcaaatttttaattttagaacagTTTTTGTTTAGTACATAATACTTGA AGGGATATTGTTTTAAATTCTCTTTAGGTTTGGCGACTGTTGAGCTCACA ATTCATGGGAGAATATTTGTTGACAGATACAGTATCCACTTTGTTTCTGA TCTATCACTTCCGTATACTGGAACGAAGATGGGGTACTTCTAAATTTATG GtaattaattttgtattttatctCTCACTTATCATTTTATTTATATGTCA TAATTTGACGTACTGTAAATACTGGAACATGTTTTGATAACTTAAACCAG ACCACAGGGTTTGTGTGGATAATATTTTGCTGCtcttcaaaacatatttt tcttttgtgtaTTTAGTCACACCTTCTATCTAGCTGGTCGCTGTCACTAT CACTTTACTATGCTATTTACAAAAGCAGATTACTTGAACACACTGGGCTG GATTTACAAAATGTCCCTTCTGGACTGTATCTTTTTCGTTcattagtttt tgaaattatCTTTAATAAAAATTCCAATCCATTTTTGACGATTGGATAAA TCTTTCAAAAGCTATCCAGTAGcaagtttacacgtttttttatgagaaca tcattttagttttttaatggaaGATAAGTTTTAAAATATCGATACAAAAG CATCCAAATTTTTGAatcgggtgttcttaactttttttgttttaagccta aaaatgttcttaacatattttcattttttgagcgtttttgtcaatttccc taagaaattgggtgttttagagtctgcaaagtcttgcaatgttcttagct tgttcttaactttttgatcatcgaagccttatgttcttatatattttatt cttattaaaaaaacgtgtatctgtgTTATTCTGCGACGGAGACAGTAAGC TTCTGATATTTCTAAATCAATCTAAATTGACTGAGGACGACAGTTAATCT GCACTTTTACTGTCTTCGATTTTGCAGGTCAAAATTGCAAGTTATTCCAA AACGCTTCAGTTACTCCGCCGTAGTCAAAAATGCTAATACATAAAAATTT GCTAGTATTTTTGAAAGAGGCTTGTCAAGAAATTTGTTGTTCACCATTAA GTACTTTATTAGAGTCGCTAGACATTAAAAACTCAATCGTGCTAAGTGTT ATTTTCCTACATGTCCACCCTTATTTCATTCAGGAACTAATAATTCATCC AAAAACCTTTCACATATTTTACCTTAATCAAATAAGTAACATACATGAAA ACAGATATGGCCCATTATTTGCAACCTTCGTTCACTTTCTATTGGACATT CCACCTTCATCGGATGCACGAGCAACAAACACAAACAGATTGTCCCTTCC CACTGGCAACACCTGGCTTGTCTGCCTGATCATGTTAAAGGTAATCTTTA TAATGATTATTTTGGTAGAGGTTTTTACAGTGGCTTTATTGATGCCTTGA AAAGGGGGTCTGGAAACATTTTAAAGCAATTCCAAATTGATTATTTCTTG TCATTGAAGCTTTCCTtctaatgaatttaaaaaagatcaaGTGATATTTA GAGATGTCTTATTATTACATTGTCAACCCAACTATAATTATAATTATATA TAATCTACTGATTTTGTTTTGGTTGTATACTATGTTGTTGCATTTAGATG CTGATTTCACTTGATAGTCCGAAGGTACCACTCCTATCGCTATGTGGAAT TGTAAGTTGCCctctttttggataaaatgGAAATACAGGACCCGTTTCAT TCTAAACCGAATCCTTTTTAAATAAGTCTCGTTTGATAGATTAGTAATAG TAATAATATGACATTTTTCACGAAATGCCATATCATTCCTGGttaattat atgactgattttgttattttttaaagagCTATCCGAAATGAGGTCTCCAG AAGTAAGACAAAAAATTTATGATGTATTTCTATAGGGCTCTATAGAGATA TGATGAGTTGCTTCAAAACACAAATCATTCCATATCACTTTCAAATTGTT GCAGATAtttaataaatataatatcaaacaataaaactaattaagcagat attcggtaagaaaaatcggatatcgaaaattattcagtcgagcttgatga tatttagccagtaccttcccacaaaccaaattttttctttgttttttaaa tcgcgataaaaaagcggttttcgtctaacaggctagatGATATTCGACGA AGCGAAGCTGAGTCTGGCTGAGTCGAATATCATTAAAGCGAGACTGAAta atttcgatatccgatttttcacgttgaatatatggtttatcGTTCACCAA TGAGCAGAAatgtattttacttttttgtcccattattattttgtcattca cagtctttctctctttttataacattttcgaacgttttactacacgcttt tttttttataagaatacactttataagaatgtccatgatgaaaatggcca aaaaattaagaatatgctaagaatatcaccatcatcgAATTTTGCTGTTC AAacaaagaatgtcatttttagagcattctaaatcataaattgccaatta cccccaagtaataagaatgctgtaagaatattttaggatgattttcccaa aaaagttaagaatatccatgatgaaatggatttacaccattcttataaaa aagaaagcgtGTATCTTATTTAAGGATGTCAATTTCAtggtttttttctc ttttgttaaaaagcacttcctttttatctgttttatttatgtgacattta aatatttatttgatcaaaaaactattttctttatgctcgctgctacagaa gagatattttgctatcggatatctaaaaatattggaCAGTGCGTTTTGTT TAGAGGTGGACGATAATCCAAAATAATCCACAATACAAACATTCAAACAA TAGCATTGGGAGGAAGATTCttcataaaaattgtattttcggCTCCTTTG CAAAGACGCCTGCATTATCATCAGCGAGTCAGGTTTATAATAATCATAGT GCTATATTCTTCTTTTGTATCTCCATTCAAAATGGTCGTAAATGAAGTGT TCAAATTATATCCAGTCTTCGAAAGTTCGTCCATTTTTGAAAGCATTTAT CGAAATGTTtgtgtttttaaagttttgccaTAATAAAAGAATAACATCAT CATCCAACAGCTCGAATTTTTCGTCTCCTTTGACCGGACAGCTACTCAAA ATATTTGCATTAGTTTTTTAAAACCTGTCTACTTTTGTGATCGAATGTTG cccaaaaataattaaatgtttTGGAAACTCGAACACTTACGTGGCGCGTG AAATTATGTTAGGAGAAAACAGctttgatcaaaaatatttcttctaaAAT TGAAACGTAGAATTTTAATTTCTCCTGAATGGTTCAACAGTTTTGTTGTT TACCCGTTGTAAACACTGCGTCTTGTTTGTGGCGGGACGGCGGAAAAGTG GGCGTATCATTATTTTTGGCATTACAAAATAATACCCCGTGGTAGGATAA AAGTGTGCAACCTAAATAAAATCATTCATATAATTACATCTTTAAACAAA TGAAATAGTTTGTGCGGTTGATTCATCCAAAGTTTCTTCACTTCTACAAT ATGTGTTGTTTTAACTTTTCATTAAAATGGTTCTTCGTTTTTTGATACCG GTAGGCGTAGAATAATTTCTGTTTCTTTATCATTATAGGTAGCTGGCATA CTGCAAAGATCCAATTTCCTTGGTGTTCAAAGTTGgtttaaaataccaaa atggtTATCACGCACAAGCAGCAAGGTATTCGGTTTTCTGGGTTTAGTTG ACAATTCGGAGGAGTTTTCATCGCGCTCAGTATTGATGGGAGCCACGCCA GAGATTCACGAGGACATGCTTTATGATTACGCGATGCAGAGGGGGAGAAT GATGCCAAGAAGATTTGGACCTTCAAATGATAATGTAAGTTGTCTTGTAC CAAAACAGTATGAAAGCTATCTGTTGTTGTTATTATACCTTTTCGCTTAA ACATTatcatttgttgaaaaatgattCTAACGttgtaaaaaaagttattt tgttttttttacttttatcttgattcttttttAGTCTATCTTACATTAGA ATTCCCCAAAAATTAATCTCAAAGTACACTAAACGCTAACACAAtctttt ttatcttaaaaaactGTGTTTACTGATATTTTCTCTTTAGAATCGTGAAC AGATTGGTCAAGGTTATGCCGAAGTGATGAACCCCTCTTCCCCTTTCAAT TTCATACGAcacccatccccaccgccaccgccaccgccacgcatcccttc accgcccacgccacccgAGAATCCTCAGCCTCCACAAGCTGAAATTTCAA GCCCACAAACTGATAATGTGCCAGAAGAAAAGGTACTAGGATACTTCAAA TCTGAAAATGTTTAACCCAGTGATTCTTTGCatataaaaacgaaaatttg aGACTTTCGATGATGTCAATTTTTGCGCAATGGTAaaggtttattttgac cgtttccgtttgacgtcatttttaccCGCGGTCAGCtatttttcttataa ctttataaaTGGTAAGAAAACATGTACATGGGGATTAAGTCACGCCTTGC TTTAGCTCAAAGTTATTTCCCATTCCTTTCGGGTAAGgtttttgttgttc gttcttgtttgttcttgttttgtGGGTGAAATTCAAATCAGTTAGGAACA GCAGCCTGCTTGAGTTTTGGTTGAAGATTTCCTTAACCGAATTTTGTGAG ATCGGTCTAAAGCTATCACATTAGaatagaaatttgaatttcgTCTTCTA TTTTAATATAGGTTCAAACGTTGGTTGATATGGGATTTGATCGTGATGCA GTGCTGAATGCTTTGGCAAGTACAGAAAATGATGTCAACCAAGCCACTGC CATTCTCCTCTCTGCTTCATGATCTCTAAGCGGTACCCAGTAATTTAGGG TGGAACAGACAGAAGCTGGTGTGGAAAACCATTCACATAGACACAGTGTG TAACGCTTTGGCTGGGTACAATTTCTCTACTATCAAGTTGATCAGCCAGT GAGCAGTCCACAGTGATTGACTGTTCTGGAAGATCTTTGAGGTTTCCTTT TGCACGCACCGGACAAAATTCAGAATTTTCCTCGATAAATAAACAAAGTC GAACGTGGATTATTTTGTTGGGAACAGAGATTTAAGTTAATTTGATTATT ATTTGCTTGCATTTCTTGCCAAAGCGTAGTGCCTTGTAAAATTGAAATCA CATGATTGATATTATGCCTTTGCACACTTTATTTGGCAATTTTGAAGCTA ATTGGTTTTGTACATTTTTcaagtattaaagaatttgTTGAATAGCAATA AACAATCGATAAAATTTCTGgttgctgttgaaaaaatattcCCAGGCAAT AGATGATTGTGTCAAGGATTATCTTGGTTGACTTAGGATgctttttatgg gtttttataatagatatattctgttattgatttgtgtatataattatttg gattatattttataGAACACTTGTAAGAAATTGTAAATATttcattctct tttttttgaattcataaaaataccgAAAACTTTGATGGATCGGATAAAAC TGATTCCATGACAAGACCTAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000179_pilon:435749..451970+

>MSTRG.17608.1.p1 ID=MSTRG.17608.1.p1|Name=MSTRG.17608.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6993bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:435749..451970+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGATAGCAACTGGGATAGGATCAGTTAGCGTATATTTCTTGCCAAC
CAAATATTATCAGAGGTTGACGTTAAATCTAACAGATATTATCAATCAGG
GACAGGTTTGGCGACTGTTGAGCTCACAATTCATGGGAGAATATTTGTTG
ACAGATACAGTATCCACTTTGTTTCTGATCTATCACTTCCGTATACTGGA
ACGAAGATGGGGTACTTCTAAATTTATGTCACACCTTCTATCTAGCTGGT
CGCTGTCACTATCACTTTACTATGCTATTTACAAAAGCAGATTACTTGAA
CACACTGGGCTGGATTTACAAAATGTCCCTTCTGGACTATATGGCCCATT
ATTTGCAACCTTCGTTCACTTTCTATTGGACATTCCACCTTCATCGGATG
CACGAGCAACAAACACAAACAGATTGTCCCTTCCCACTGGCAACACCTGG
CTTGTCTGCCTGATCATGTTAAAGATGCTGATTTCACTTGATAGTCCGAA
GGTACCACTCCTATCGCTATGTGGAATTGTAGCTGGCATACTGCAAAGAT
CCAATTTCCTTGGTGTTCAAAGTTGgtttaaaataccaaaatggtTATCA
CGCACAAGCAGCAAGGTATTCGGTTTTCTGGGTTTAGTTGACAATTCGGA
GGAGTTTTCATCGCGCTCAGTATTGATGGGAGCCACGCCAGAGATTCACG
AGGACATGCTTTATGATTACGCGATGCAGAGGGGGAGAATGATGCCAAGA
AGATTTGGACCTTCAAATGATAATAATCGTGAACAGATTGGTCAAGGTTA
TGCCGAAGTGATGAACCCCTCTTCCCCTTTCAATTTCATACGAcacccat
ccccaccgccaccgccaccgccacgcatcccttcaccgcccacgccaccc
gAGAATCCTCAGCCTCCACAAGCTGAAATTTCAAGCCCACAAACTGATAA
TGTGCCAGAAGAAAAGGTACTAGGATACTTCAAATCTGAAAATGTTTAAA
TGATGATAGCAACTGGGATAGGATCAGTTAGCGTATATTTCTTGCCAACC
AAATATTATCAGAGGTTGACGTTAAATCTAACAGATATTATCAATCAGGG
ACAGGTTTGGCGACTGTTGAGCTCACAATTCATGGGAGAATATTTGTTGA
CAGATACAGTATCCACTTTGTTTCTGATCTATCACTTCCGTATACTGGAA
CGAAGATGGGGTACTTCTAAATTTATGTCACACCTTCTATCTAGCTGGTC
GCTGTCACTATCACTTTACTATGCTATTTACAAAAGCAGATTACTTGAAC
ACACTGGGCTGGATTTACAAAATGTCCCTTCTGGACTATATGGCCCATTA
TTTGCAACCTTCGTTCACTTTCTATTGGACATTCCACCTTCATCGGATGC
ACGAGCAACAAACACAAACAGATTGTCCCTTCCCACTGGCAACACCTGGC
TTGTCTGCCTGATCATGTTAAAGATGCTGATTTCACTTGATAGTCCGAAG
GTACCACTCCTATCGCTATGTGGAATTGTAGCTGGCATACTGCAAAGATC
CAATTTCCTTGGTGTTCAAAGTTGgtttaaaataccaaaatggtTATCAC
GCACAAGCAGCAAGGTATTCGGTTTTCTGGGTTTAGTTGACAATTCGGAG
GAGTTTTCATCGCGCTCAGTATTGATGGGAGCCACGCCAGAGATTCACGA
GGACATGCTTTATGATTACGCGATGCAGAGGGGGAGAATGATGCCAAGAA
GATTTGGACCTTCAAATGATAATAATCGTGAACAGATTGGTCAAGGTTAT
GCCGAAGTGATGAACCCCTCTTCCCCTTTCAATTTCATACGAcacccatc
cccaccgccaccgccaccgccacgcatcccttcaccgcccacgccacccg
AGAATCCTCAGCCTCCACAAGCTGAAATTTCAAGCCCACAAACTGATAAT
GTGCCAGAAGAAAAGGTACTAGGATACTTCAAATCTGAAAATGTTTAAAT
GATGATAGCAACTGGGATAGGATCAGTTAGCGTATATTTCTTGCCAACCA
AATATTATCAGAGGTTGACGTTAAATCTAACAGATATTATCAATCAGGGA
CAGGTTTGGCGACTGTTGAGCTCACAATTCATGGGAGAATATTTGTTGAC
AGATACAGTATCCACTTTGTTTCTGATCTATCACTTCCGTATACTGGAAC
GAAGATGGGGTACTTCTAAATTTATGTCACACCTTCTATCTAGCTGGTCG
CTGTCACTATCACTTTACTATGCTATTTACAAAAGCAGATTACTTGAACA
CACTGGGCTGGATTTACAAAATGTCCCTTCTGGACTATATGGCCCATTAT
TTGCAACCTTCGTTCACTTTCTATTGGACATTCCACCTTCATCGGATGCA
CGAGCAACAAACACAAACAGATTGTCCCTTCCCACTGGCAACACCTGGCT
TGTCTGCCTGATCATGTTAAAGATGCTGATTTCACTTGATAGTCCGAAGG
TACCACTCCTATCGCTATGTGGAATTGTAGCTGGCATACTGCAAAGATCC
AATTTCCTTGGTGTTCAAAGTTGgtttaaaataccaaaatggtTATCACG
CACAAGCAGCAAGGTATTCGGTTTTCTGGGTTTAGTTGACAATTCGGAGG
AGTTTTCATCGCGCTCAGTATTGATGGGAGCCACGCCAGAGATTCACGAG
GACATGCTTTATGATTACGCGATGCAGAGGGGGAGAATGATGCCAAGAAG
ATTTGGACCTTCAAATGATAATAATCGTGAACAGATTGGTCAAGGTTATG
CCGAAGTGATGAACCCCTCTTCCCCTTTCAATTTCATACGAcacccatcc
ccaccgccaccgccaccgccacgcatcccttcaccgcccacgccacccgA
GAATCCTCAGCCTCCACAAGCTGAAATTTCAAGCCCACAAACTGATAATG
TGCCAGAAGAAAAGGTACTAGGATACTTCAAATCTGAAAATGTTTAAATG
ATGATAGCAACTGGGATAGGATCAGTTAGCGTATATTTCTTGCCAACCAA
ATATTATCAGAGGTTGACGTTAAATCTAACAGATATTATCAATCAGGGAC
AGGTTTGGCGACTGTTGAGCTCACAATTCATGGGAGAATATTTGTTGACA
GATACAGTATCCACTTTGTTTCTGATCTATCACTTCCGTATACTGGAACG
AAGATGGGGTACTTCTAAATTTATGTCACACCTTCTATCTAGCTGGTCGC
TGTCACTATCACTTTACTATGCTATTTACAAAAGCAGATTACTTGAACAC
ACTGGGCTGGATTTACAAAATGTCCCTTCTGGACTATATGGCCCATTATT
TGCAACCTTCGTTCACTTTCTATTGGACATTCCACCTTCATCGGATGCAC
GAGCAACAAACACAAACAGATTGTCCCTTCCCACTGGCAACACCTGGCTT
GTCTGCCTGATCATGTTAAAGATGCTGATTTCACTTGATAGTCCGAAGGT
ACCACTCCTATCGCTATGTGGAATTGTAGCTGGCATACTGCAAAGATCCA
ATTTCCTTGGTGTTCAAAGTTGgtttaaaataccaaaatggtTATCACGC
ACAAGCAGCAAGGTATTCGGTTTTCTGGGTTTAGTTGACAATTCGGAGGA
GTTTTCATCGCGCTCAGTATTGATGGGAGCCACGCCAGAGATTCACGAGG
ACATGCTTTATGATTACGCGATGCAGAGGGGGAGAATGATGCCAAGAAGA
TTTGGACCTTCAAATGATAATAATCGTGAACAGATTGGTCAAGGTTATGC
CGAAGTGATGAACCCCTCTTCCCCTTTCAATTTCATACGAcacccatccc
caccgccaccgccaccgccacgcatcccttcaccgcccacgccacccgAG
AATCCTCAGCCTCCACAAGCTGAAATTTCAAGCCCACAAACTGATAATGT
GCCAGAAGAAAAGGTACTAGGATACTTCAAATCTGAAAATGTTTAAATGA
TGATAGCAACTGGGATAGGATCAGTTAGCGTATATTTCTTGCCAACCAAA
TATTATCAGAGGTTGACGTTAAATCTAACAGATATTATCAATCAGGGACA
GGTTTGGCGACTGTTGAGCTCACAATTCATGGGAGAATATTTGTTGACAG
ATACAGTATCCACTTTGTTTCTGATCTATCACTTCCGTATACTGGAACGA
AGATGGGGTACTTCTAAATTTATGTCACACCTTCTATCTAGCTGGTCGCT
GTCACTATCACTTTACTATGCTATTTACAAAAGCAGATTACTTGAACACA
CTGGGCTGGATTTACAAAATGTCCCTTCTGGACTATATGGCCCATTATTT
GCAACCTTCGTTCACTTTCTATTGGACATTCCACCTTCATCGGATGCACG
AGCAACAAACACAAACAGATTGTCCCTTCCCACTGGCAACACCTGGCTTG
TCTGCCTGATCATGTTAAAGATGCTGATTTCACTTGATAGTCCGAAGGTA
CCACTCCTATCGCTATGTGGAATTGTAGCTGGCATACTGCAAAGATCCAA
TTTCCTTGGTGTTCAAAGTTGgtttaaaataccaaaatggtTATCACGCA
CAAGCAGCAAGGTATTCGGTTTTCTGGGTTTAGTTGACAATTCGGAGGAG
TTTTCATCGCGCTCAGTATTGATGGGAGCCACGCCAGAGATTCACGAGGA
CATGCTTTATGATTACGCGATGCAGAGGGGGAGAATGATGCCAAGAAGAT
TTGGACCTTCAAATGATAATAATCGTGAACAGATTGGTCAAGGTTATGCC
GAAGTGATGAACCCCTCTTCCCCTTTCAATTTCATACGAcacccatcccc
accgccaccgccaccgccacgcatcccttcaccgcccacgccacccgAGA
ATCCTCAGCCTCCACAAGCTGAAATTTCAAGCCCACAAACTGATAATGTG
CCAGAAGAAAAGGTACTAGGATACTTCAAATCTGAAAATGTTTAAATGAT
GATAGCAACTGGGATAGGATCAGTTAGCGTATATTTCTTGCCAACCAAAT
ATTATCAGAGGTTGACGTTAAATCTAACAGATATTATCAATCAGGGACAG
GTTTGGCGACTGTTGAGCTCACAATTCATGGGAGAATATTTGTTGACAGA
TACAGTATCCACTTTGTTTCTGATCTATCACTTCCGTATACTGGAACGAA
GATGGGGTACTTCTAAATTTATGTCACACCTTCTATCTAGCTGGTCGCTG
TCACTATCACTTTACTATGCTATTTACAAAAGCAGATTACTTGAACACAC
TGGGCTGGATTTACAAAATGTCCCTTCTGGACTATATGGCCCATTATTTG
CAACCTTCGTTCACTTTCTATTGGACATTCCACCTTCATCGGATGCACGA
GCAACAAACACAAACAGATTGTCCCTTCCCACTGGCAACACCTGGCTTGT
CTGCCTGATCATGTTAAAGATGCTGATTTCACTTGATAGTCCGAAGGTAC
CACTCCTATCGCTATGTGGAATTGTAGCTGGCATACTGCAAAGATCCAAT
TTCCTTGGTGTTCAAAGTTGgtttaaaataccaaaatggtTATCACGCAC
AAGCAGCAAGGTATTCGGTTTTCTGGGTTTAGTTGACAATTCGGAGGAGT
TTTCATCGCGCTCAGTATTGATGGGAGCCACGCCAGAGATTCACGAGGAC
ATGCTTTATGATTACGCGATGCAGAGGGGGAGAATGATGCCAAGAAGATT
TGGACCTTCAAATGATAATAATCGTGAACAGATTGGTCAAGGTTATGCCG
AAGTGATGAACCCCTCTTCCCCTTTCAATTTCATACGAcacccatcccca
ccgccaccgccaccgccacgcatcccttcaccgcccacgccacccgAGAA
TCCTCAGCCTCCACAAGCTGAAATTTCAAGCCCACAAACTGATAATGTGC
CAGAAGAAAAGGTACTAGGATACTTCAAATCTGAAAATGTTTAAATGATG
ATAGCAACTGGGATAGGATCAGTTAGCGTATATTTCTTGCCAACCAAATA
TTATCAGAGGTTGACGTTAAATCTAACAGATATTATCAATCAGGGACAGG
TTTGGCGACTGTTGAGCTCACAATTCATGGGAGAATATTTGTTGACAGAT
ACAGTATCCACTTTGTTTCTGATCTATCACTTCCGTATACTGGAACGAAG
ATGGGGTACTTCTAAATTTATGTCACACCTTCTATCTAGCTGGTCGCTGT
CACTATCACTTTACTATGCTATTTACAAAAGCAGATTACTTGAACACACT
GGGCTGGATTTACAAAATGTCCCTTCTGGACTATATGGCCCATTATTTGC
AACCTTCGTTCACTTTCTATTGGACATTCCACCTTCATCGGATGCACGAG
CAACAAACACAAACAGATTGTCCCTTCCCACTGGCAACACCTGGCTTGTC
TGCCTGATCATGTTAAAGATGCTGATTTCACTTGATAGTCCGAAGGTACC
ACTCCTATCGCTATGTGGAATTGTAGCTGGCATACTGCAAAGATCCAATT
TCCTTGGTGTTCAAAGTTGgtttaaaataccaaaatggtTATCACGCACA
AGCAGCAAGGTATTCGGTTTTCTGGGTTTAGTTGACAATTCGGAGGAGTT
TTCATCGCGCTCAGTATTGATGGGAGCCACGCCAGAGATTCACGAGGACA
TGCTTTATGATTACGCGATGCAGAGGGGGAGAATGATGCCAAGAAGATTT
GGACCTTCAAATGATAATAATCGTGAACAGATTGGTCAAGGTTATGCCGA
AGTGATGAACCCCTCTTCCCCTTTCAATTTCATACGAcacccatccccac
cgccaccgccaccgccacgcatcccttcaccgcccacgccacccgAGAAT
CCTCAGCCTCCACAAGCTGAAATTTCAAGCCCACAAACTGATAATGTGCC
AGAAGAAAAGGTACTAGGATACTTCAAATCTGAAAATGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17608MSTRG.17608Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17608.1.p1.exon1MSTRG.17608.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.1.p1.exon2MSTRG.17608.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.1.p1.exon3MSTRG.17608.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.1.p1.exon4MSTRG.17608.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.1.p1.exon5MSTRG.17608.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.1.p1.exon6MSTRG.17608.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.1.p1.exon7MSTRG.17608.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.1.p1.exon8MSTRG.17608.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17608.1.p1.exon9MSTRG.17608.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17608.1.p1MSTRG.17608.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000179_pilongenomesc0000179_pilon:435749..451970 +