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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000179_pilon:331281..339016+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.17600.1.p1 ID=MSTRG.17600.1.p1|Name=MSTRG.17600.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7736bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:331281..339016+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TAAACGATACATATCAGTTTACGCTGTTATTGTATGATTGATAGTCCATC
AGTATACGCTGCTCCTCACTGCTTTGAGAGCAAGCGGTAACTGATACTAT
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GGTCTTTTACAGAGTTTCAGTTCCCTCCATCTGAGTTCTTTAAATCCCCA
ATCCCCCCTCGCACTAACAGTTTCCTTTGGGATTCCctccccaggcttgg
ccccctaaaATAAGTGAAATGtttattgaaaatgctcttGTACTGTATTG
TCAAATTGTTTACTCGTTAAAAACAATGATGAATCTATGCATTTCATCCA
TTCTTTTTTGTAGGACAATACATCGACAAATGATGACACAACTGGTACAC
CAGAAGAGAAAGATGATGAAGTTGAAGATGAAGTAATTTCTTAGTTTCTA
GTTCtttttttAAAGGTCTTTCCAATTTTCAACAGTTACAAGTAGTTTTC
GTTACGCTctgttcaaaaaaaaaagggaaagatttttactttacaaaatt
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TTCtatttagtgaaattttttttgggttttatgAAATCCTGATAAAACGA
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GACAGTGTCAGAAGATTGCATTGTAAAGAACGGAAGCAATTTTTACAAAG
CTGCATCTTCTAAAGACTGCCATTGTtggaaatttaaattaaaacttCAA
TCTTTGCTTATTTGTATAGGTATTACACCAGCCCCGCAAAAAGTTCAAGT
GGACAATACAGGATGATAGTGGGCGAAAGCTCTCAAATgcgaaaaatcaa
attaaatggTTAGAACATGTCAATAAACAGAAAGATCAAGAAatcaacat
tttgaaagaaaagaatgCATCTTTGTATTTGCGAAATGCACAGTTTACTA
AGCTCAAAATTATTGATCAAATTGGACAAACCAGATCAACTCTCATGGTT
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TTGTTGGTGAACACGCAAATATTGTCAGTACAATTGGATTGGTGCATTCT
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ATGCATTGGAGACAAGATTACATACTATTTCagacttttgtttgaaaaaa
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TCATATTCATGATagtattcatagaattatattttgcaggtctattgacc
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GTTTTCGACAGGATTTGGATGCCAAAATATTTACTCGGTTTTATCAGGCT
AAGGCTCTTGCTTCTAGGATTTCCTCTTAGACGCCAGATGAAGGAGTGCT
TCAAGATTTTGTATAATTCGTTTTGGACCTACAGTAAGATTTAAAGTATT
ATTTATTATCGTAGTTTTATCTCACGCATATATTTTACTTTGTTACTGAG
TCTGGGGGTACCTAAGGAAATGGAGAGAACGTCCCCCTTGTAAGGTTGTC
TTTTTGGACACTGAAGATCTCGCTAGGTTCcttaaaaatcatgaaatcta
attcttctcccttaaaaattattaaaaactaaaaaccctgataaaGCTCC
CAATTTTTCGAGCAGTATCTAGCCGTCATCTCTGCCTGTAAATCGAGTGA
GTATTCCTCTAGGATTATTTGTCATCGGCTGTCATCACTGTCTTAATGTG
tctttaataatatttttcattttgttctttGTTAGTGGCTAGTTAGATTG
TGGAATAAGTTTTGACctttttccaatgttttgacTCATGTCTTCTTGAA
GAAAGAACGTGAAACCATCACAGAATGATatgaaaaagctaaagagaaaA
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AATATACTTCtataatatattataaattTTGGGCCCAAAAAgaggttttt
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TATACATTCTCTTCTGAGTAATACTAAGTACTAGTTTATTGTATAAATTA
AATGGCAATAAAGGGGGATCCTTCAAAATGGGTCGGGATCAACATGAAGC
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TAACAGTGTGCTGTTTGAGTGCTAGGTGATCAAATGGCTCGATTTTTTCT
AGGGTTGAAAACTGCCAAACTTTGGAGACCCAAGGGTGGAGGAGGGTGCC
AAAGAAGGGGATTTTACCCCAGCTTCTCAATATGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000179_pilon:331281..339016+ >MSTRG.17600.1.p1 ID=MSTRG.17600.1.p1|Name=MSTRG.17600.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=825bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:331281..339016+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTGATGCATCGCTTTTTACAAATGCATTTCACGCTGGTGATTTTTT
AATGCAACAGCAACAGTCAACTCTACTTGATCCAGCAAACTTTGCAGACA
TTCAGACAACTTTCCTTTGCAAAGgatctttttttaaaacagatttgata
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GTTATCCACAACCATTTGGTTGCAGATAACATTATATTAAATGGAAACTG
TCCTAAGATCATTGGCTTTGCATTCGCGTGTCGCGCTGAGAGCGCTAAGC
TTAACGTCGTTGACGTAATCACCAAGTTTGAGTGTCAATCTCATTTTGCA
CCCGAGCTGTTCAAATCATCCAAGGTCAGCTACTCTTCAGATGTTTATTC
GTTTGGTACATtgttgaaaattgttcttaaacgAAAGATCACTTTCGATT
TGGATGATGCATTGGAGACAAGATTACATACTATTTCagacttttgtttg
aaaaaaaagcctGGGGAAAGGCCTGCtcataaatttcttttaaatcgaAT
TAATTCTATTCTCGACGCATCGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000179_pilon | genome | sc0000179_pilon:331281..339016 + |
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