MSTRG.17450.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.17450.1.p1
Unique NameMSTRG.17450.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000175_pilon:626784..638904-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.17450.1.p1 ID=MSTRG.17450.1.p1|Name=MSTRG.17450.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12121bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000175_pilon:626784..638904- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTATGTCGTGTGCACGTGTGAGCCTGCTGGCTGGAAGATCATCAAGAGAT CATCACTCCAATTTTAGTAGGTACTATAATGTGAAACAAAATTTCCTTTT TTTTATTTCGTGATTGCCCATTTTTACCCTGAAATACTGAAATAATATGA CATTTTGACGTAATAATGAAAATTTTAAGAACTTATGCTTATGTGATTGG GCTCTTCCAGAAAAAAATTGATATAGGGGGTGGATGACTGGAATTTTCAG ATAAAAAGAGCACTCGGAAATCCGGTCAATTTTTCAAAGTGCTTCGGAAA TTCTGCTCAATTTTTTATTTCCACCCTTGGAAATTCCACATAATTTGTCA AAGTTTTGAAAAAGGAGGATAGCGACCCTGCCGACGCACCGGACTTAACA AACACCGGACACGCGAAAGTCCGGTGTAAAATGAGAATTTTAACCATCTC TACACCAGACTAAAGGAAGTCGGTTGTCCGGTGTCGAAGAAGGATCCTTT TTCCACCGGACAATCAAAACATAAATGTCCGGCGGCCAGAATTCCCTGTA TGCAACACCGGATTGACGCCGGACTTATAGCGTCCGGTGTAGCGAAAGGA TACTTTCTGCCACTGGACAAATACACCGGACAGTCCGCTGCGTCGGCAGG GTCCTGAAAAAGGTATCGAAAATTCCAGATTTTTCCACCAAAAAATTGAT TTTGTATCGGAAATCCAGGACGCAGGAGTTTCAATTGCTTTTATATTGGG AATCCAGGAATTTCAAAAAAACATTTTGCCTCAGAATTCCGCTGTCGTGC ACCCCCCTATAACGGACTTTAACTGGAAGAGCCCATTGGAGTGATCCAAT TTAATTTACTGTAATCGCAATGAAACTCATCAAACATAATCGTAATCGAA CGGTCGAAATCAAAGATTAAGCAATTGTAATTGACATTCAATCGAACCAA 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AAATTTAGGCGATACTCAACAAAAAATAAGGTGGTTTTAAACAAATCTTT GACAAATTGGCGTTTCTTTTTGTTCTAATATATGCTAATCACGTCTAAAA AAGAATATGTTTCCGCCTTTACTTTCACTTTCGCTTTCGTGTTACGCGAT TCCAATCGGATGAATACCGCTAGCTAACAAATTCTGATTGGCTGTAAGTC TTTAGCTTCGGGATTCTGATTGGATCATTTCCTTCGTCCCGCGTCACGGT TGAATTTTGATTGGTTGAAAGTTTCTGAGCGTGAATTCTGAGTGGATAAA TACCTGAAAAGTAAACAATAATAGTATGTAAGTATTTTGCTTATCAAAAC CTACAGAATTCCAGGGGGTTTTATTTAATCTGCATGACGACAATTAAGCC TACAAAACACCAAGAAAAAAACCCAACATAGAACAGGTGTATTTTGTAAT TAATGTAGAATATGATAGCGTGAATATTTTTGAAATGTCAGGATTTTTTC TCAATGCTCCGTTACTATGCCCGGGGTACTACTTGCTAAGACCTTATGTT AAAAACGAAAGCGATTACGGCAAAAAGTAGCGATTTTCATAATACCTCAA ATATTGATACTTGACTGTACTGAAAGAACACATTGCTTTTCCCAGATTTT TTTCCGCATCTCCGCACCGGAAAATCAGCGAAAAATTTGATAAGGGCGGT GACGCGAATAGAACAATTTTTCGATGACCACCTTACTCAAACGCAATCAA ATATTTCCCAGGAATTGGCCATTATTTGGTTGCGTTCGATTAGGTTCAAT TGGTTCGATTGCGATTTTCTTTGGAGTTGTTCGATTGACACCGTTTGGTT ATGTAAACCAGACGGTAATAATCGAACGTTCGATTGTGATCGAAGTAATC AATAATGATCGATAATAATCGAAGGTGGTCAGTGACCACCTAATGATTTT ATCGGTGATTTGAATACTCACTCGACTCCTGATTATGGCATTTTCTTCGA CCATTTTTTATTTGTTCAATCATTTCGATTACTTTTCGATTATATACCTT GGATCATAATGAATACCTTTGATTGTATTTAGTACTTTCCAGCCTTTGAT TTTATCAAATATGTTTCCAGTAGCAGCGCGTCAAAATAATCTGAAACCAA GTTTACTTCGGCCAATTAAAACCTGCGATTCATGCGCGAAAACTACTTTC GTTTTCTCCGACCAATCAACTTGAGGAAACCCAGGGCGAAGGCTCACAAA ATTGCGGGGAAAATCACTGGGAAATAAGGGGTTAATCCTATGGCGGGGCT TCTTTTTGTGCTTTCGTTCTAGGTCAGTTTTTTTGGTTTTTCTAAAAGAT ATATCTTAGTAATTTGTTATTGAAGTAATCAAATGGTTATCGAAGTTGTC AAAGTTATCGCAAGCAATCAATAACAATCAAAGTACTCGAACGGTTATCG ACTCATCAAAGGGTTGCTTAGAAAGTGATCGAAAATACTCACAATTTTTT GAATTTTTGGTATCAACATTTGATTCTTAATCGATAAGTGGTTGTTCAAT TACTTCGATCATTATCGATTACTTTGACAATCGAACTTATCGATTAGTAC CGTCAGGTGTAAACAAAAAAATAGCAAAGTTGATTCGAGCCAATTTATAA TTGAAATTTATAAGATAAAAACATTCTATTTATTTTAAAGATAAAACATT CAAAAGGGTATCAGTAAAAGTCCCTTTGTTTGAGGAATGTTTTTTTATTC AATGTATTTTTATTTTTTTTAAACCTTTTTCTAATCTTGTTGCACTTGTT TTTTACTACATCAGCATCATCAGACCTTTCAATCAAAACAAAACCTTTAA TTTGTGTTATTGTTTTGATGCTGGAGCCTTATATTTTTATTACAATTTGA TTGAGTTATTGTTCAGTTCAGTTATTGTTGTCCGGGGGGGGGAGACTTGG GCAAGAAAGGCAAATAAAGGTCAGTGATAGGTAATCACCAGACACTTTTT GGTTTCCATCTGCTATTTTGAAGGATAAATTATACTTTTGTCCGATGAAA ACTTGAGATTGCTTATTTGTTGAAAAAATGTAACAAAGCACTTTTTGTCC CTGCTCTGTATATACAAAATTTTGTCGCCCCAAATTTTTTTTGAAAAATC ACTGGTTAAGTCACAATTCCCTATTTGCAACATTGCGGGGGATGTGTTGC CGTCCAGGGTACCTACAACCATAAGTCCAAGGTAGGGCCGCAAAAACACC CAAATAGAAAAATCAGTCCCATTATGGGAGACAGATTTTTTTATTTGAAA GTAGGATAGCATCATTGGTAAAAGATGACTCAAGCAGATTTTTGCAAAAA TTTTTTTTTGGCTAAAAAGCACATCTTTATCTATAAAAATCACTATTTAT AAGCATACATCGATGTTCTTAGCCAAATTACTCAATTTTTTGATGAGATA GATATTTTTTTGCTCATGAAGGCTTAATTTTGAAGAATATTTGTGTTTAG ACATGAAATTTTGGCTGCTGCACGTCTTTTTTTAGAAAAATTAGCCAAAT TCAATATTTTTTTATAAGCACATTATTACCAATTACTTAGTTATTAGCTT TTCTCGTGATTGGCTCATTCATTCTTTCTGATTTTCTGCACAAAGATGCA TAACTATAAACCCTTGAATGTGAAGGAGCCCGATTTCGGAAAAGATTTAT TAAGGGGCAAATTCCAACCAAAAAACGGCTAAAAAAAGTGCTTTTTGGAT TTTGTGAAATATTTTATCATTAATAATTTTACCAAAAGTTTGAATCAATA AACTGTTTAAGGTATGTGTACACCTTTTTTCCGATTTTTTGTCAAAGAAA ATTTTTTCAGTCAAAGGGGAAGAAAAGTTACTGGATTTCATTTTGGTAAA ATCGCGATCTTAACATCTTTTTTTGATCCAGAGTTATAACCATTTAAATT TCAAAACAAAGTTCGTCTTACGACTGCTTACGATGGATTATTTACTCAAA TAATCGTCTCTTTTGGAAACAACAAAGACAAAAGAGAGAATTCAGCTGAT GTTTATTCTCACCTCTATTGAATAGTAATATTTTTGACACATTTCACTGA TTACTCAAATAAACAGCAATCAACCTGTTAAAAATTTCAAATTGATGTAG AAAAAAAAGAAATTTTACCACACCATACTACTTTTAACGAAGTTAAAGTC ACCCATAGCATTTAGATATCGACTTCATTCTTTTTTTATGAGATTCCCAA AAGATCAAACTTAAAAATTGTCTTAGGATTTTATTTCTAACTGAGTTGTT TTTCCTCAATTTACAGATAACTGAAAAAATCACATTTAAATTTACTTTTT TATCGATATTTTTACAGAATTTAGGATTAAAAGAGTTAAAGTCAATTCCA AAAAAAATCTTAAGACCCTTTTTTAGTTCAATCTATTGGGAACATAATAT CGAAATTATTTTTTCAAAATTCAAAAGCTACGGGTGACTTTAACTTCTTT GAAGTAGGTAAGGTTAAAATTCTTAAGATTTTAATTATATCCTGCCCAGT TTTTTAAATTCGGCTGAAACTTTTACCATTAGAAAGAGAATATTATTGGC TTTCAGAAAATACTTTTGGTATATAAAAATTTGTTGTTCTAAAGATATGA TCAATTAAAGAGAATGTGTCAAGAAAGGTGAACACATACCTTAAGTTCAA AGAAATTTTTTTTAAATTTATTATATGAAATTGTTTATTGGGCAATTACT TTTTTATTTTCTGGTTTACGGAATCGCCGACGTTTTTTTTGCAAAAATAA AATAAAAATAAAGTTGGGTTTTACAAATATTTTATTTATTTATGCTCTTC CAACCTTGTACTGAACAGCCATGAAAAGGAAACTTTATAGAAAATTACAT TTTATAAAAGCGAGAAGGGCAAGTGTCCAGGTCTTTTAATAACTTAAAAC ACAATTTCCCTACTAAAAACGTTCTTTAATGTATATATGTAAGTTTTCTC AAAACATATTTTTTTAATTTTCTCCAACATTAAAGTTTGAAAAGAGCAAT TTTATTTTTATTTTTTTCCATCCTCCGGTCCAAAAAATCATCTTTGAATG TCCGTAAACCAGAAAATAAAAAAGTAATTGCCTTGATACTATTTTTCGGT GAAAATTTGAAGTGATTTTGGGGTCAAGTTGAACATTTTACAAGAATTTT TGTCATTGGATTGGTCGTTAACTATTCAAACAAAAACTTTTATTATATTT TTCTAAAGAACGCGTCATCTCTATTGTTTTGAATAACCAATTATGTGAGC ATCTTATAAAAACTTCAACACAACTGTGATTTTGATGAGTATTTCTCGAG ATATTCAATTTTTAATTTTTATGAAGTCATCGTTATGACGTCAAAAACCA TGTTTTTGGGTAATAACTTTTTTTGTTGCAAAAATTAATTCCAACACAGC AATTTTGTTAATGTACGTTGGAATACGCTTCTTTTGATGTATGAATGAGT ACCCTAAAATGAGTGCTATTGGTTTGTATTGGAGTTGGACACATTGTAAC TCGCCTGAGTAGTAGAGAAATTATTTTCCTTATTCAACAAATATACGAAC AATATGAAAAAAAAACAAGAGTGATCAAATCACCATCAAATCAAAATTAA AACATTTTAAAGTGCTTTACTCGCAACAATAGAATGTCAACAAAGCAAAA CATGGAATCGCTTCGCAACAATGGAATGTTTTCTTTTTGTGGTGTGTGTA CCACCCCCTCTCGCACGCAGATAAAAATAAAACGGTAGAATATTTAAAAA CAGAACATTAAAACCAAACCTGAACTTTAGTGCAGCCCTTCAGGTCTCCC CACTTTTTTAGGCCCCCCCTGAGTTTAAAAAATGAGTCCAGCTCCCACCC ACTTTTAGGCCGATTTTAGATTTACACCCCCCTACACCCCCAAATAAGTG GGGGGGAGCAGAGCCATGGTGACAGAAATAAAAATTTTACCCAAGTTGGA TTGAACCAGCAAGCGTTGAAACCCTTGATTTGACTATTGCTTTAATCCTG ACATGAGTTACCACAACAGCTTGCTACGAGAAAATCTCCCAATTCTGTCT GAATTGCACTGATACAAAAGCTTCAAAGAATTCTGCTAAAACAGCTGGAG CTGGCTAACCTGATAACAGCTGTTCATAATTTTCTTACGTGCACGGTAAA CCTCTGAAGGCACTTGAAAATCATACATCTGAGGAAAATAGTCCTCCCGC GGAAAATTTTACAACAAGAATCTCTTGTTGTGCGCCAGAAAGTCAAAAAC TGATATGGCGCCCATTTTGTAAACACAATCACGCAACTTTGTTGTCATCC CCAGTCCTTTTAGACGAACGCGGTCCATACCGATTTTATGATAGCATATT CGTCAGATTGTATGTTTTCACCCATCCCTTTAGAGCTTCAGCGTGGTGGA CAACCACAATCTGATCTCAGGTTAGAGCTGGCTCGATCTGAATCTGATCC AATTTAATAGGCAATATAAAAGAAAAAGAAAGGGCAGTTTCATAGACAGT AACGTTTAAAGCTTGTGCAGCGCTGGAAGGAACTTTCTTATTTTGTTGAA AATGCTCTGTAAGAAAATGATATTTAATAACAAGTTAAATTATATCTTTC AACTTTAATTTCAAGGCTTGAGACTCGAACATGGATAGAGATTCACCAGT TGGTGCCAAACAATCTACTGTTTCTTTAAAGACGACCGATATTATTCCAA TCAAATACTTTGTCAATTTCTCTGACTACCAGACAGAAAGCTTCTTCCCA CTTGACGAGTTTGGTATAATTGGTTGGCCCATTAAGGGAGTTGTCCCTGG TCTGAGTGCGTTTGTTTACGCCCACTTTGATTATGGTTTTCATTATCGAA GCAAAGTCGATGACAGCGAATTTCAAATCCGCATGCGATTGGATAAGATC AGTGGGAAAATTGAGCACGACATTGACGATCCGTCAGCGGTCTTTTTTAA ACTGACACCTCAGTCTCTGTAAAGTGAAAAAGTATTTCAGAGTCATCATG TCTAAAGGAAAAACAACTAAAGGATATCCCTCGGGAAAAGTGACCAATAT CCATGCGAAGGCAATAACTGATTGTACTCAATTTGCTTTGAAGACGGTAC AATTAATCAAGTACATCATGGAATTGATTTTGATGCCAAGGAAGAGTACC TTATAATGGTAAGATAATTACCTGTGTTGTTATTTCAAATCAATAATCTG CTTACTCTCCAGGTGATTTTTTAAAGGCAGGTTCTTTCCGGTCAAAATTC TTTCAACGTTACAAATCATTTTCGTAAGCTCATTTTGGGCTCAAAAAAAA GGGTATAACTAAGTAGAATATGATTCAGTCAAGGCAGATGTTTTATGATT TAGAAATTTTGCGTAATTTGCTAAAAACCTCAATTTTGCGCTATTTTGAT GAAAAAACTCTTTACAATCATGATGACATCAGCATTTTTTAAGTGATTCA GCTGAAAAGTGATGACATGATCAAATTAAAAAAAAAATTGTATTCTGATG GTCAAAATTTCAATTTATTTCATTAATTATATCAAAATTTAGTTTCAATT TTTATGATCATCAAAATAGCAAAAATCTATGCAAAATCAGATTTTCATTT CAACCGTAATATTTCGAGATGAATAGAAAATACCACCTCTCGGGTAAGTT ATGGCATGTCTGAAAATTACCATAATTTTTAGATCGCATTAGCCGACAGA AAGTGACCAAACAAATGACTGAACATGATGGGTACTATGATGTAGTTTCC AACCTGATGTGTAACCTAATTGTTTTTTCACTGATTTTTGCGAAAAACCG CAAAAACTGATTATTACGTCATAATCGATGACGTCATCAAAACTAAAAAT TGAATTTCTCAAGAATGGTTCATCCAATTGTCTTCAAACTTTTATCAAAC ATTTTCTTTTGGTGTTTACAATTGGGCCTACAAATAATTTAAAAGATACT GAAGTTGAGCAAGTGCGGTTAGCACGTAGGACGTTTTTATACTCAGAATT CAACTCAGCTCACTTTACTTTATTTTTTAAAAAGAAAATCATGTGATTAG TTGGTTCATCTGCTTTGGGCTTTTTATAAAAATTTAAATGGAATGGGTGT TTTCAGTGTAGCTGACAGAGTGACCAATCTTCTACAATGTATAATTGAAA TTACGAACCTCTTGGTATGTTTTTATTACAGGACACAAGGCGAGCAGATA TCTAGTGGAGTTTACGGACAGATCCAAGAGGAGGTTGGCATCCAGCTGTT TCCATATCCTTTCATAATGCGAAAGTTCAGAAGTGAGTGAAAAAATGCTG TTGTCATGAAAACAAGACAGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000175_pilon:626784..638904-

>MSTRG.17450.1.p1 ID=MSTRG.17450.1.p1|Name=MSTRG.17450.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=342bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000175_pilon:626784..638904- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATAGAGATTCACCAGTTGGTGCCAAACAATCTACTGTTTCTTTAAA
GACGACCGATATTATTCCAATCAAATACTTTGTCAATTTCTCTGACTACC
AGACAGAAAGCTTCTTCCCACTTGACGAGTTTGGTATAATTGGTTGGCCC
ATTAAGGGAGTTGTCCCTGGTCTGAGTGCGTTTGTTTACGCCCACTTTGA
TTATGGTTTTCATTATCGAAGCAAAGTCGATGACAGCGAATTTCAAATCC
GCATGCGATTGGATAAGATCAGTGGGAAAATTGAGCACGACATTGACGAT
CCGTCAGCGGTCTTTTTTAAACTGACACCTCAGTCTCTGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17450MSTRG.17450Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17450.1.p1MSTRG.17450.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17450.1.p1.exon3MSTRG.17450.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17450.1.p1.exon2MSTRG.17450.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17450.1.p1.exon1MSTRG.17450.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000175_pilongenomesc0000175_pilon:626784..638904 -