MSTRG.17423.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.17423.3.p1
Unique NameMSTRG.17423.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000175_pilon:105120..132641-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.17423.3.p1 ID=MSTRG.17423.3.p1|Name=MSTRG.17423.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=27522bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000175_pilon:105120..132641- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCCTATTCAAAACATGTCATCCTCATACGTAATTATTAGAAAGGATGTT TATCTAAAGTGTGTGGCTGTTAACTTTCTGTTTATCAAATAATCAAAAAG GGAAAATTTATAATAAGATTTGCTGACTTCGGCAAATCTCTTTTTCGAAC GATCCAGGCTTCCTTCTTGAAGGGTGCTTTAGTACCAGTTATTCGTACTG TCGACGATAAAGAGAAACAGAAGTATGAAGATAATCTTTATCTTTCTTAC TACCCTGCTGACAGTCCAAAATGTTTTTTGTTGTAAGTATATTTTTGGAA TTGCTGTTGATACTTCATGTCCTAAACCTTTACATCCCTGTCTCAGTGAC CCAGTAGATTTTTGGTGCCCTTGGTAAAAGGGTAAAAGGATGAAAGAATT TGATACGGTGTTCTGCAAAAGCTTTCCTCTACTTCCAATAATTTTGTCAT CGAAGCCTTATGCTCTTATATAGTTTTTTCTTATTTATAAACAAATCCGA ATCTGAAAGCCCGGTTAACACCCTAATTTAACCTTCGGAGTACGTTTGTA ACATAATTCATAAAGACATGCAACTCCACTCCTTATTCTAGTCGATATGT GGAAAACTATTGAAGAGAGCAACAAAGAATTCCATAAAAAGCAAAAAGGA TTGAGTGGTAAGTTTTGTGGATTGTAAACTCGAACCCAGTCCCATTTGAC TGGTTCTGGTACGATCCGGGTCAAAATATTTGAGAAAAAAGGGAAATTCC TACAAGATCTTATACTCAAAAATGATTTGGAAGCGCTCTAAGCTAGGTTA GCAGGGTAGAGTTTTAACTCTCAGTTTTAACATTAGGCTTACGACCTAAA GATTTCACTTCAGGATCCAAAAGTTAAGAATGGTCCAATAAGGCTCAGAA TATAGCCTGGAAGTCGATGAACCCCTCCCAAATATTCGATAACATTTAGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000175_pilon:105120..132641-

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GAATTTAGCTCAAAAGTCGATATGTGGAAAACTATTGAAGAGAGCAACAA
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AATTCAGCGTTTAACAAAGGAGGCAATATAGGGAAGAATTGGCATTATGC
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AAGTGTTCCACTCAAATTTTGATAAAAATGTTCCTGGCCAAGAGAATTAT
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TGACAACGCAAGATTTCTTGGAGAATCGAAAGGTGTTATCAGCACCACCC
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TTGAAGCTGGCACCAAGCTGACAATTTGGACCAAAACTTTGATTCTGGCT
TTGGAGCTTGGACAGCAAAACCAAAACAATTTTTTGCCCGTAAGAACGGA
CGAGCATCATACCAATTACCTAAAGATGGACCCTCTAAAGATCATACGTC
TCAAGTAACTGGTAGAGCTGGTGACAAGGAGGCTGTAGATGGAGTTTGGA
GCAGATGGAGTGCTTTTACATCTTGTAGTGGAAAGTGTGGATGGGGCATT
CAACAAAGAACACGAAAATGTGATAATCCACCTCCACGTGGTAAAGGAAG
AAAATGTTTCGGAAATTCAATGGAACGAAAATTGTGTCGTAAACAAAGAT
GTAGCGCAGGACTTATGAGTGGGTGGAGTCAATGGGTTGGTTGGACCAGA
TGTATGGAGAACTGGCGAAAAGAATGCAGCAAAGCCAGATACCGGTTTTG
TGTGGATTCTGATAATTGTCCAGGTGGAAATAAATGGGGAACAGATGAAG
ATGTTATCGAATGTTCGCCCGCAGAATGCAAAGTGTTCCACTCAAATTTT
GATAAAAATGTTCCTGGCCAAGAGAATTATCATGGTACCCCTTATGATCT
TCGGTCTATCATGCAATACGGGAAGACTGGTTTCCGTAAGGGATCCGCAA
CTGGAAATACCATTGAATCAAAAGAAGACCCCGACGCACCGATCGGGAAC
AGTGATATGTCCGATTGGGATATAACGGAATTGAATCGGAGATATCAATG
TCAACATGTTGATGAAAATGGAAAGAAACATACAGCAAGATTTTCCCACG
AACAGAGTCGTACAGACAGAGATAGCTACGTTAACATTTACCTTTACAAA
GTGGACAAAGGTGTTATTCTGGGCTTGGTCGAAAATATTATTATGACTCA
AGATCAACGGACGTTTCTCTTGGCAACGGATGTGTGAACCAAGCCATTAT
TGTTCATGAAGTACTTCATTCTATCGACCGTCAAGAAATTCAAAAATCTT
TGAAATATATTGAAGACAGATCATGTTTGAGATTCAGTAATTCAAAAAGT
TCTTATGACAAACATTGGATTAGGTTTTACATTGGATCTGGATGATAACG
GTCATCGACTTGTTGGTGGAGACATCTTCATGACAACGCAAGATTTCTTG
GAGAATCGAAAGGTGTTATCAGCACCACCCCAAAATGCACCCGCCAAACA
AAAATTATCACCTGTTTTCGATTATCATAGAAAATATTGGAAAAGAAGAA
TTCCATATCAAATCGGAAATGAATTTAGCTCAAAAGTCGATATGTGGAAA
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TGATGAAGATAATCTTTATCTTTCTTACTACCCTGCTGACAGTCCAAAAT
GTTTTTTGTTACTTATGGTTTTTAAATTGTGACAAGGATAAACACGATTC
GGAGAAATGCAAAAAGTGGGCCAAAGAGAAATTCTGTACAAAGGATAAAA
ACAAAAAGTGGATGGCTCAAAATTGTTGCTTCTCTTGCAAGAAGAACCAG
CATGCACAGACAATGCATCTTATAAAGACAAATGTGATGGATGGGCATCA
AAAGAAATATCCGAATGCGCTGTTAATTCTTGGATGCCAAAGAACTGTTG
TGTTTCGTGCAAAACACCTCCGAAAACAACACCAAAGCCTACACTACCGC
CAGTAACAACCACCACAAAAACGCCAGAAACGAATACTTGTGTTGATATT
GAGGGTGATATGGCCCCTGGAGAAGTGACGTCAACAAAATGTGAGCAATG
GGCAAACAAAGGATATTGTGAAAAATATAAGAAATTCATGTTAGATCATT
GTTGTCGATCGTGTGAAAATTATTACAATCCTTCATTGAAGATCACTGGG
GAGACATGTCTCGATAACCCAACTTATGCCGGTAAATGTAAAGGATGGAC
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GTGTTTCTTGTAAATCTGCCACAAAATGCGCAGATGACCCCTCGTTCGAT
TGCAAGTCCAAAAAGAACATGTGTGTTTTTGACTGGCGAGTTATGATCCC
AAGATGTTGTCACACTTGCTCAGATTTACATTGAATTTCGATTTGAAGAA
TGGCGTGGGTCAGTTATTGCTGTTGATGATATTGTATTTGACAACAACGA
ATGCCCGAAATATCTTGATTGATATTATATTGCATCATTCACAGAGAAGG
GTTGGTATTACGATAATAAAAGAAAACGAATCATAGCGGACTTATCAGTC
ACCACTACCCAAACACACGCAAAAGCCTGCTTATCATTCCACTACATGTT
AAATGGTCTTAATATAATCTCCAAAAATGCAATAAGTGTCTATTGGAAAA
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GGGAAGAATTGGCATTATGCAACTGTTAACATGGGAAGAGTTGAAGCTGG
CACCAAGCTGACAATTTGGACCAAAACTTTGATTCTGGCTTTGGAGCTTG
GACAGCAAAACCAAAACAATTTTTTGCCCGTAAGAACGGACGAGCATCAT
ACCAATTACCTAAAGATGGACCCTCTAAAGATCATACGTCTCAAGTAACT
GGTAGAGCTGGTGACAAGGAGGCTGTAGATGGAGTTTGGAGCAGATGGAG
TGCTTTTACATCTTGTAGTGGAAAGTGTGGATGGGGCATTCAACAAAGAA
CACGAAAATGTGATAATCCACCTCCACGTGGTAAAGGAAGAAAATGTTTC
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GATAATTGTCCAGGTGGAAATAAATGGGGAACAGATGAAGATGTTATCGA
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CATTGAATCAAAAGAAGACCCCGACGCACCGATCGGGAACAGTGATATGT
CCGATTGGGATATAACGGAATTGAATCGGAGATATCAATGTCAACATGTT
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CAGATGACCCCTCGTTCGATTGCAAGTCCAAAAAGAACATGTGTGTTTTT
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GGAGTTTGGAGCAGATGGAGTGCTTTTACATCTTGTAGTGGAAAGTGTGG
ATGGGGCATTCAACAAAGAACACGAAAATGTGATAATCCACCTCCACGTG
GTAAAGGAAGAAAATGTTTCGGAAATTCAATGGAACGAAAATTGTGTCGT
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ACCGGTTTTGTGTGGATTCTGATAATTGTCCAGGTGGAAATAAATGGGGA
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GGATCCGCAACTGGAAATACCATTGAATCAAAAGAAGACCCCGACGCACC
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GATATCAATGTCAACATGTTGATGAAAATGGAAAGAAACATACAGCAAGA
TTTTCCCACGAACAGAGTCGTACAGACAGAGATAGCTACGTTAACATTTA
CCTTTACAAAGTGGACAAAGGTGTTATTCTGGGCTTGGTCGAAAATATTA
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AAGCCATTATTGTTCATGAAGTACTTCATTCTATCGACCGTCAAGAAATT
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AAAAGAAGAATTCCATATCAAATCGGAAATGAATTTAGCTCAAAAGTCGA
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ATGGGCATCAAAAGAAATATCCGAATGCGCTGTTAATTCTTGGATGCCAA
AGAACTGTTGTGTTTCGTGCAAAACACCTCCGAAAACAACACCAAAGCCT
ACACTACCGCCAGTAACAACCACCACAAAAACGCCAGAAACGAATACTTG
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AAGGATGGACTGAAAAAGGGGAATGTGCTAAAAACAAAAATTGGATGGCA
AAACAATGCTGTGTTTCTTGTAAATCTGCCACAAAATGCGCAGATGACCC
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TTATGATCCCAAGATGTTGTCACACTTGCTCAGATTTACATTGAATTTCG
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TTGGAGCTTGGACAGCAAAACCAAAACAATTTTTTGCCCGTAAGAACGGA
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GCAGATGGAGTGCTTTTACATCTTGTAGTGGAAAGTGTGGATGGGGCATT
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TGTATGGAGAACTGGCGAAAAGAATGCAGCAAAGCCAGATACCGGTTTTG
TGTGGATTCTGATAATTGTCCAGGTGGAAATAAATGGGGAACAGATGAAG
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GATAAAAATGTTCCTGGCCAAGAGAATTATCATGGTACCCCTTATGATCT
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TCAACATGTTGATGAAAATGGAAAGAAACATACAGCAAGATTTTCCCACG
AACAGAGTCGTACAGACAGAGATAGCTACGTTAACATTTACCTTTACAAA
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TGTTCATGAAGTACTTCATTCTATCGACCGTCAAGAAATTCAAAAATCTT
TGAAATATATTGAAGACAGATCATGTTTGAGATTCAGTAATTCAAAAAGT
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GTCATCGACTTGTTGGTGGAGACATCTTCATGACAACGCAAGATTTCTTG
GAGAATCGAAAGGTGTTATCAGCACCACCCCAAAATGCACCCGCCAAACA
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GGAGAAATGCAAAAAGTGGGCCAAAGAGAAATTCTGTACAAAGGATAAAA
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GGCAAACAAAGGATATTGTGAAAAATATAAGAAATTCATGTTAGATCATT
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ACCAATTACCTAAAGATGGACCCTCTAAAGATCATACGTCTCAAGTAACT
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TGCTTTTACATCTTGTAGTGGAAAGTGTGGATGGGGCATTCAACAAAGAA
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GTGTTATTCTGGGCTTGGTCGAAAATATTATTATGACTCAAGATCAACGG
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TGTTGGTGGAGACATCTTCATGACAACGCAAGATTTCTTGGAGAATCGAA
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AAAAAGTGGGCCAAAGAGAAATTCTGTACAAAGGATAAAAACAAAAAGTG
GATGGCTCAAAATTGTTGCTTCTCTTGCAAGAAGAACCAGCATGCACAGA
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GGATATTGTGAAAAATATAAGAAATTCATGTTAGATCATTGTTGTCGATC
GTGTGAAAATTATTACAATCCTTCATTGAAGATCACTGGGGAGACATGTC
TCGATAACCCAACTTATGCCGGTAAATGTAAAGGATGGACTGAAAAAGGG
GAATGTGCTAAAAACAAAAATTGGATGGCAAAACAATGCTGTGTTTCTTG
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AAAAGAACATGTGTGTTTTTGACTGGCGAGTTATGATCCCAAGATGTTGT
CACACTTGCTCAGATTTACATTGAATTTCGATTTGAAGAATGGCGTGGGT
CAGTTATTGCTGTTGATGATATTGTATTTGACAACAACGAATGCCCGAAA
TATCTTGATTGATATTATATTGCATCATTCACAGAGAAGGGTTGGTATTA
CGATAATAAAAGAAAACGAATCATAGCGGACTTATCAGTCACCACTACCC
AAACACACGCAAAAGCCTGCTTATCATTCCACTACATGTTAAATGGTCTT
AATATAATCTCCAAAAATGCAATAAGTGTCTATTGGAAAACACCGAAAGG
AGAATATATCAATTCAGCGTTTAACAAAGGAGGCAATATAGGGAAGAATT
GGCATTATGCAACTGTTAACATGGGAAGAGTTGAAGCTGGCACCAAGCTG
ACAATTTGGACCAAAACTTTGATTCTGGCTTTGGAGCTTGGACAGCAAAA
CCAAAACAATTTTTTGCCCGTAAGAACGGACGAGCATCATACCAATTACC
TAAAGATGGACCCTCTAAAGATCATACGTCTCAAGTAACTGGTAGAGCTG
GTGACAAGGAGGCTGTAGATGGAGTTTGGAGCAGATGGAGTGCTTTTACA
TCTTGTAGTGGAAAGTGTGGATGGGGCATTCAACAAAGAACACGAAAATG
TGATAATCCACCTCCACGTGGTAAAGGAAGAAAATGTTTCGGAAATTCAA
TGGAACGAAAATTGTGTCGTAAACAAAGATGTAGCGCAGGACTTATGAGT
GGGTGGAGTCAATGGGTTGGTTGGACCAGATGTATGGAGAACTGGCGAAA
AGAATGCAGCAAAGCCAGATACCGGTTTTGTGTGGATTCTGATAATTGTC
CAGGTGGAAATAAATGGGGAACAGATGAAGATGTTATCGAATGTTCGCCC
GCAGAATGCAAAGTGTTCCACTCAAATTTTGATAAAAATGTTCCTGGCCA
AGAGAATTATCATGGTACCCCTTATGATCTTCGGTCTATCATGCAATACG
GGAAGACTGGTTTCCGTAAGGGATCCGCAACTGGAAATACCATTGAATCA
AAAGAAGACCCCGACGCACCGATCGGGAACAGTGATATGTCCGATTGGGA
TATAACGGAATTGAATCGGAGATATCAATGTCAACATGTTGATGAAAATG
GAAAGAAACATACAGCAAGATTTTCCCACGAACAGAGTCGTACAGACAGA
GATAGCTACGTTAACATTTACCTTTACAAAGTGGACAAAGGTGTTATTCT
GGGCTTGGTCGAAAATATTATTATGACTCAAGATCAACGGACGTTTCTCT
TGGCAACGGATGTGTGAACCAAGCCATTATTGTTCATGAAGTACTTCATT
CTATCGACCGTCAAGAAATTCAAAAATCTTTGAAATATATTGAAGACAGA
TCATGTTTGAGATTCAGTAATTCAAAAAGTTCTTATGACAAACATTGGAT
TAGGTTTTACATTGGATCTGGATGATAACGGTCATCGACTTGTTGGTGGA
GACATCTTCATGACAACGCAAGATTTCTTGGAGAATCGAAAGGTGTTATC
AGCACCACCCCAAAATGCACCCGCCAAACAAAAATTATCACCTGTTTTCG
ATTATCATAGAAAATATTGGAAAAGAAGAATTCCATATCAAATCGGAAAT
GAATTTAGCTCAAAAGTCGATATGTGGAAAACTATTGAAGAGAGCAACAA
AGAATTCCATAAAAAGCAAAAAGGATTGAGTGATGAAGATAATCTTTATC
TTTCTTACTACCCTGCTGACAGTCCAAAATGTTTTTTGTTACTTATGGTT
TTTAAATTGTGACAAGGATAAACACGATTCGGAGAAATGCAAAAAGTGGG
CCAAAGAGAAATTCTGTACAAAGGATAAAAACAAAAAGTGGATGGCTCAA
AATTGTTGCTTCTCTTGCAAGAAGAACCAGCATGCACAGACAATGCATCT
TATAAAGACAAATGTGATGGATGGGCATCAAAAGAAATATCCGAATGCGC
TGTTAATTCTTGGATGCCAAAGAACTGTTGTGTTTCGTGCAAAACACCTC
CGAAAACAACACCAAAGCCTACACTACCGCCAGTAACAACCACCACAAAA
ACGCCAGAAACGAATACTTGTGTTGATATTGAGGGTGATATGGCCCCTGG
AGAAGTGACGTCAACAAAATGTGAGCAATGGGCAAACAAAGGATATTGTG
AAAAATATAAGAAATTCATGTTAGATCATTGTTGTCGATCGTGTGAAAAT
TATTACAATCCTTCATTGAAGATCACTGGGGAGACATGTCTCGATAACCC
AACTTATGCCGGTAAATGTAAAGGATGGACTGAAAAAGGGGAATGTGCTA
AAAACAAAAATTGGATGGCAAAACAATGCTGTGTTTCTTGTAAATCTGCC
ACAAAATGCGCAGATGACCCCTCGTTCGATTGCAAGTCCAAAAAGAACAT
GTGTGTTTTTGACTGGCGAGTTATGATCCCAAGATGTTGTCACACTTGCT
CAGATTTACATTGAATTTCGATTTGAAGAATGGCGTGGGTCAGTTATTGC
TGTTGATGATATTGTATTTGACAACAACGAATGCCCGAAATATCTTGATT
GATATTATATTGCATCATTCACAGAGAAGGGTTGGTATTACGATAATAAA
AGAAAACGAATCATAGCGGACTTATCAGTCACCACTACCCAAACACACGC
AAAAGCCTGCTTATCATTCCACTACATGTTAAATGGTCTTAATATAATCT
CCAAAAATGCAATAAGTGTCTATTGGAAAACACCGAAAGGAGAATATATC
AATTCAGCGTTTAACAAAGGAGGCAATATAGGGAAGAATTGGCATTATGC
AACTGTTAACATGGGAAGAGTTGAAGCTGGCACCAAGCTGACAATTTGGA
CCAAAACTTTGATTCTGGCTTTGGAGCTTGGACAGCAAAACCAAAACAAT
TTTTTGCCCGTAAGAACGGACGAGCATCATACCAATTACCTAAAGATGGA
CCCTCTAAAGATCATACGTCTCAAGTAACTGGTAGAGCTGGTGACAAGGA
GGCTGTAGATGGAGTTTGGAGCAGATGGAGTGCTTTTACATCTTGTAGTG
GAAAGTGTGGATGGGGCATTCAACAAAGAACACGAAAATGTGATAATCCA
CCTCCACGTGGTAAAGGAAGAAAATGTTTCGGAAATTCAATGGAACGAAA
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AATGGGTTGGTTGGACCAGATGTATGGAGAACTGGCGAAAAGAATGCAGC
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CATGGTACCCCTTATGATCTTCGGTCTATCATGCAATACGGGAAGACTGG
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CCGACGCACCGATCGGGAACAGTGATATGTCCGATTGGGATATAACGGAA
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TACAGCAAGATTTTCCCACGAACAGAGTCGTACAGACAGAGATAGCTACG
TTAACATTTACCTTTACAAAGTGGACAAAGGTGTTATTCTGGGCTTGGTC
GAAAATATTATTATGACTCAAGATCAACGGACGTTTCTCTTGGCAACGGA
TGTGTGAACCAAGCCATTATTGTTCATGAAGTACTTCATTCTATCGACCG
TCAAGAAATTCAAAAATCTTTGAAATATATTGAAGACAGATCATGTTTGA
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CAAAAGTCGATATGTGGAAAACTATTGAAGAGAGCAACAAAGAATTCCAT
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TGCATCATTCACAGAGAAGGGTTGGTATTACGATAATAAAAGAAAACGAA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17423MSTRG.17423Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17423.3.p1MSTRG.17423.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.17423.3.p1.exon18MSTRG.17423.3.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.17423.3.p1.exon16MSTRG.17423.3.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon15MSTRG.17423.3.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon14MSTRG.17423.3.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon13MSTRG.17423.3.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon12MSTRG.17423.3.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon11MSTRG.17423.3.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon10MSTRG.17423.3.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon9MSTRG.17423.3.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon8MSTRG.17423.3.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon7MSTRG.17423.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon6MSTRG.17423.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon5MSTRG.17423.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon4MSTRG.17423.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon3MSTRG.17423.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon2MSTRG.17423.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.17423.3.p1.exon1MSTRG.17423.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000175_pilongenomesc0000175_pilon:105120..132641 -