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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000159_pilon:723598..744711+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.16665.1.p2 ID=MSTRG.16665.1.p2|Name=MSTRG.16665.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21114bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:723598..744711+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ctttcactttctagATTTTTCTGAACGGGCAACATCATTTTCACAAGATC
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cgtctggtgtaaacaaaaaaataccaaagttgatttcgagcaaatttata
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ctttgtttacattttaagttagcatatttgttttgattttgacatgatga
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TCATGCCTCACTTTTTTGACCACCCACTTTTTGAGCATAGTCAGTTGACA
TCTGACATTGGTCAAGTCAGGATGTCACTACTCAAAcattaaatttgatt
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TATTTGATTCACTCACTTTCAGCAAGATTCCATATGGCCAGCTTTCTTGT
TTGCTTTTGCTTCTCATTCCTTTCGTTTTCATCCAGGTGTGTCTTTGCCT
CAAGTCACTTTAGGTTTAGGTCAGCACATGGTCCTGgcggccatcttgga
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ttcaatcaagccttattttttcaattagtttttgcttgatcaatcaatAT
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ACATATTATCTTGCCAAACTTCAATTCGACCACATTCAAACAGATATCAT
ATTCAAACCGACTTCTGTTCACCGCATGTATCACTGACGTTCCATGACAG
ACCGCCCAAGACGCAATATCCAGCGATTCGACTTTGCGATTTACGGATCA
GACGGTCGAAAGGTACCACCACCACTTGATGATAACATGTCCAGTCAGTC
ACAAAGTACATCAGACCAAACTATCAAGATGGAGCAACCTCCAGACAGAG
ATAGATTATCTACACCTCATTCAGTCGAAACCGACCAACAATTACTTACT
ACAACCGATTTAAACGCATCTCAAGAGGATGAATCTCCTGATTCTGCGTC
TCAAGCGTCTGCAACTCCTGATGAGACTAAAGACCTCCCCAAGGAACAAC
CACTGGCAGCGGACCCATCAACTCCATCTAGACGGATCAAACCATTGATG
GAGACACCACCGTCTGCCATGAGAGACATCAAACTTCAACTCAATCAAGT
ATACATACTACAATCTGATATTGAACTTTGTTTGGATGAGGTAACTGACT
TGATTGATGAACACTCAATCCATAATGCTTCAATCAAAGACACTGAAAGT
ATCCTTACTGAACTGAAAGAGCTACGAAAGGGACTCCGTGCGAATGTCAA
AACTTTCTCGAAATTAGCTCCCGACGAGTATAAATCAATTCAGCCGAGTA
TCCAAAATGTATTCGATCTCATCAAAGACTTCATTGTAGCAGCGAAAAGT
CACATCGACGAGGCCAACGCCACACTCTCAAACACTGTTGTTGAATCAAC
CAATTTTAAAAACGAACTAGAAGCAATGATGTTCTCCGCAAATGATATTG
TAGATCATATTAGTGAACTAAAATTGTCTCTTGATATTGACATCACCAAA
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CAAAAAGTTATCCACCATTGCTGACAGGTATGAGAGACTCATTAAATTTC
CTGTTATGAACatcgaactttcaaaattaattgCAAATATTGGTGTATCT
TACAAGAGTGTAAAAGCCAAGAAGTCTTCAatagcttcaaaaatcaaatc
agcAATCGAATCGAGAGAAGTAATGAAATTCAAATCTTTCGACGAAGCCA
AACTCGGAATCGACTTGCAAAAATTCTCTGGTTACGATTCCAACACAGAC
ATTTAGCTTCAGATCAGACTTTGAGAAGATCAACTTGCGCAACACTCCAA
AACTTCTACTTGCAGATCTTCTTATCAACAATTACCTATCCGAACCTGCA
CTGTCGCTGGTCAAGGGTATGACAGACATCAACTTAATTTGGAAACGACT
CATTCACGCGTACGGCAACACAAAGGTTCTACTCACCAAGAAACTCAAGG
AACTTAAAAGCCTCGACTCTGTCTCCAAATCTAAGGATCCAACAAAGATT
ATGTCGTTCATCACTCAACTTATCAACACCATCAAGGACTTGGTCAGCTT
GGCCAAGACTCACGATATAGAAAACAACCTCTATTTTGGTGATGGCTTGA
ACAACATCTACGCTCTACTCGGTGACGCAAGATGCACACGATGGTTTTCC
TCAGTCTGCGACCTCGAcctgaatgaaaaacaacaatgGAGTCATCTCAT
CGACTTCCTTGAAAAGGAGGTCAAAGTCCAACAGCAACGCGCATTGGTCA
ATCTTCAAGAGGACAAGCCACCAAAGAAACCATCTCTTCCACGAGGGAGT
GGAGGATATCACACACCATCACCAAATCCTccaccatcaactggaccatc
aactggaccatcaactggaccatcaactggaccatcaactggatcatcTC
AATCAAAATGCTACTTCTGTGATGGCAATTGTAAAGACCAACACGTGCCA
ACCAAGGGGCCAGGAGGTTCCATGGTGATCCAATACTTTGCTTGTAAAGA
TTTCACAGACAAAACTCCAGCTGAACGGTTATCAACACTTTGGAAGAAAG
GACTTTGTCACCAATGCCTCCTACCAGGGGCAAAACGTCAAGACTTGAAG
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TCAGCAATATACCGTGAAACACCATGTGCTTGTATGTGAGGAGCACAAAG
CAACACAAGAAAACGAAGAGCTTCTCAACAAGTTCAAATCCAGATTCATT
AACCGGAATCCTTCACTACAAAGCTTCTCACGTGACATTCAACTATCATT
CTTCACAGCCAATGGCGCCGAGCAGCCAAGCGTGGTTGGTATTTATCTAC
TTCAACAAATCACTGTCAACAATCAAACCTTTACCATCTTCTTCGACAAT
GGCTGCAGCGATTTTGTAATCACGAAAGATGCTGTCGAAAGACTTGGACA
ACATGCAACCAAGGTTGGTGATGGAAGCTTTCAGATCAGTGGTATCGGAG
GAGCAACAACATCGTCCAACCATGGCGTCTACACAGTCAACATCCCACTT
GCAAATGGTCAGCTCGCAACAATGACAGGAGTTTGTCTCGACAAACTGAC
ACAAACGTTCCCTACGTATCAACTTGGCGAAGCGGAATCAACAATTCGTC
AAGCATTCCATGAAAATCCATCATACCTACCCAGACTTCCAAAATCAGTT
GGAGGTGATGTTGACATGATGATAGGTATGGAGTATTTTAAATTTCACCC
ACACATCATCTTCAGACTGGCAAATGGTCTATCAATCTTTGAATCCGTCT
TCAAGGGTGCTGACGGTAGTCTCGGCATCATTGGGGGACCACATCAGTCA
TTTGCTGAAAGTCACAAACAACATTTTGGGCAATTCAACACCTCGacatt
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TCCATATCAACTCAATGAAGAACTTTGAAGCTTCAGAGAACGTTGGATCA
GAAATTACTTACAGATGTGTCACATGTCGTGACTGCAAGGCATGTAAGAG
CCATATCGAAGACATCAGCATCAAAGAGGAAGTGGAgcaagatcttatca
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CCGTTCATCCACGAGCCATCAATCAAGCTATCGTCAAACGAAGACAAAGC
GCTCAAAATTTACTATCAACAACTTCGAAAGCTAAACAAGGCAGAAAACT
TAACCGACAAACAAGACATCACTCTATCCGAAAAGAAGATGCAAGACCTT
GGGTATGTAGATTATGTCGAAAATCTCCCAGAATCAGTCCAACAATCATT
GTCAACTCAACTTCATCACTTCATACCTTGGAGAGCAGTATGGAAACCAA
ACTCTGTCAGCACTCCTTGTCGAGTTGTGTTTGACGCATCAAGTCCAACT
CCAACTGGCAATTCACTGAATGACATCTTAGCAAAGGGCATCAACAGTTT
GAACCGATTACAAGACATTGCTCTTCGCTGGAGGATCCATGCTTCCGCAT
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CACTGGCAATATCAACGCTACTTATGGcaagaaaatttatcttttGACGA
ACGTCCAAAACAAAAGGTAATCAAGACCTTAATATATGGAGTACGATCAA
GCGGCAACCAAGCGGAATATGCACTCCGAGAAGTCGCAAAATTATCATCC
AACCAGTTTCCAGAAGCTGCTGAAATTGTCCACAATGATATGTATGTGGA
TGATTGTGTCAGCGGTGAGTCGTCCAAGAAACTCGCCATTCAGCGTACAC
AGGAATTGGAAACAATCAGCAACGGAGGAGGCTTCATGCTCAAAGGAGTT
GTCATTTCAGGTGAAGACCCACCAACATCAATGAGTGACGATGGCAGCTC
AGTCTTTGTGGCTGGTATGAAATGGTGGCCCAAGGAAGATCAGCTATCCA
TCCATATTCCTCCAATGAATTTCTCAGCCAAGAAGAGGGGTAAGAAATCA
ACATTACGTCTCAATCAGATTCCAGACAAGCTCACCCGAAGGCATTGTGT
ATCACGCACCGGTGAAGTCTTTGATCTACTCGGATTACTCTGTCCAATCA
CTGCATCACTGAAGCTTGACTTACACCAACTCGTCACAAGAAAGCTGGAT
TGGGATGATCAAATCCCAGACGACCTTCATCCACTTTGGATTAGTAACTT
TGAGATGATGGAAGAGCTCAACTCACTCAGATTCAACAGAACCATCGTCC
CGGAAGATGCAACAAACCTCGATCTCACCACTGTTGACTTCGCTGATGCT
AGCAAATCTTTGATATGTGTATCTATCTACGCTCGTTTCAAAAGGCGATG
TGGTTCATACTCAAGTCAATTGGTCTTCTCTCGTTCCAAATTGGTACCAG
AAGGAACCTCTCAACCACGTGCTGAACTGCTTGCAGCCCTACTCAATGCA
CACACAAGTGAAATTGTTAGAAGATCCTTCAAAAAATGGCACCAATCATC
AACAAAGCTGACTGACAGTCAAATCACACTCTACTGGATCAGCAATGAAA
CCAAATCACTGAAGCAATATGTTCGTAGCCGTGTCATTGAGATCCTCAGA
TTCACCAACCGAAATGATTGGTACCACATCAAAGGTGAAGATATGCTTGC
AGATATCGGCACAAGACGAGGCACTTCAATCAATGAGATCAACAACAAAT
CAGAATGGTTTAATGGATCAGCTTTCCTCTCGCTAGAGCTGGACAAAATG
CCaatcaaaactgtatcagaaaTCAAGATGACAGCAGCTGAAGAGAAGGA
GGCACAACTTGAAACATACAACATCTCGACTGCAACTTCATACGTCGTTT
ATTCACCTACTTCTTCATCAAAGATTGCCGAAGAGGTTCAAATCAGGCTA
CAATTCAGCAATTACATCATCAATCCAAACAAGTATCGTTTCAACAAAGT
CGTACGTATTCTAGCACTGATGATCAAATTCATACATCAACTCAGATTGT
CTCACAAAGGATTCATAAAATTTCACTCCAACTCAAGTCTGAAGGACGTT
CTACCAACAGAAGAAGAGATCAGACAAGCCAAGCTTtacttcttcaaaaa
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CTCCCACGAAAAGGATGGTATCATCTACCATACAGAACGAGTACTCAACA
TGAATGACACCACCATCGTTGGTCGATTCAATCAAAGCATCAAGGATCTC
ACTTCAACATCATTTGTCGTTCCAATGTTGGAAAAGTTTTCACCAGTTGG
AATCGCCATCATCAATGAGGTTCATTGGAATCATCCTTCCGCAAATCATT
CTGGTGTCGAAACATCACTTCGATACGTCAATAAAGAAGCATACATCCTC
GAAGGACGATCAATTGTCAAACTTATCAGAAAGTTATGTCAACGTTGTCG
TTACATTCTCAAAAAGACGCTTGACGTTGTCATGGGACCTGTTTCGAAAC
ACGTTCTCAACATTGCACCACCCTTCTACACCACACAAGTGGATTTGTGT
GGACCCTTCGATTGTTACTCGCATCACCATAAAAGAACCACCATCAAAAT
TTGGTTTCTGGTATTCTGCTGCTCCACAACTACAACAACGAGTATCAAAA
TCATGGAAGATTACAGCACCCAATCATTCGTCCAATCGTTCATTCGCTTC
TCATGCGACGTTGGATATCCCAAAACGCTTCTTATTGATGCTGGTAGTCA
ATTGATATGTGGCTGCGAAAACATGAAGTTCGACTTCCATGATGCCAAGT
ATCAGCTTCACACCAATCAGTCTGTTGACTTCAAGGTTTGCCCGGTTGGT
GGACACAACGAGCACGGAAGAGTGGAAAGAAAAATCAAGGAGATCAAGTT
GTCACTCGAAAAGATATTCGTCAAGAGCAAGCTGTCAATTATGCAATGGG
AGACAGTTGCTGCATCAATCAGCAATAGCATCAACGACATGCCAATTGTC
ATTGGCAGCACAACCTCAGATCTTGAAAACCTTGACATCATCACTCCAAA
CCGTCTCAAACTTGGTAGAAACAACGCAAGGAGCCCTACTGAGCCACTAC
TAATCGAGTCAAATCCAAGCAAAATCATTGACGACAATCGTAAAATCTTT
CAGTCATGGTTCGAGAACTGGTTACTTTCGCACGTGCCCAAACTGATTAA
TCAGCAAAAATGGTTTCGAACGGATGACGCTCTCAACGTTGGAGATATTG
TTTTGTTCTTAAAGAACGATTCTGTTCTTTGTTCGACTTATCAGTATGGT
ATGGTTTCAGAATTGGAAATGTCAAATGATGGTATTGTTAGACGTGTAAT
TGTTAAGtacaaaaattcaaatgaaaagGTATTTCGTGAAACGAAACGCT
CAATTAGAACTTTGATTGTGATCAATAGATCCAATGAAATGAACTTTAtt
aatgaaattcaaaactaaaattttttcaaaaaaaaaaaaatatttttcag
ttattttcaTTCCATGGGGGGAGTGTAAGATaaattcaatatattttctc
agaattttcattttatattataattttcatatttcgtAGGTTTGGtaact
ttgtttacattttaagttagcatatttgttttgattttgacatgatgaca
tcatcacttTTTGGTGCACATTTGGTGACTTTTCACACCAGACCACAGTC
ATGCCTCACTTTTTTGACCACCCACTTTTTGAGCATAGTCAGTTGACATC
TGACATTGGTCAAGTCAGGATGTCACTACTCAAAcattaaatttgattta
catgtcaaagaattcttttgaaTGTTCACTCAGCTTTCAGTATAGCCATA
TTTGATTCACTCACTTTCAGCAAGATTCCATATGGCAGCTGGTAAGCTTT
CTTGTTTGCTTTTGCTTCTCATTCCTTTCGTTTTCATCCAGGTGTGTCTT
TGCCTCAAGTCACTTTAGGTTTAGGTCAGCACATGGTCCTGgcggccatc
ttggattttttcattttttagtttttagttactcaaactttttcaatttc
aattattcaatcaagccttattttttcaattagtttttgcttgatcaatc
aatATGAACTCAATActtagtcaatttttcatacttagtcattttcacgc
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AACTCACATATTATCTTGCCAAACTTCAATTCGACCACaaaggggtgggt
gggttagagtctttgacgctaagaaattttaccagaaatatcgattttta
atatgtttattcagtgacaaatgttactttccatatttcttttcctcctt
tcaCATACCTAAATATTCGTTCGCTTCgctattttacagaaattttaacc
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CCGCACGGCTCTTGAATTTCGCCGACAGTCggtctttttttgtgaaatgc
ggcttttctgttgattatgattatggagataattaattccggcaactttc
tgaaaaaagtttagaaattatctccattattttttaaatgtaaactgCCT
GAGCAAGCAGtagcgaaattaaagatggctgacaaaacaacgatgaaagt
taaggagaaaattttcatcgatttttgataatttttgatggtgggggtgg
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ttGGCCAAAAAGGCAAATAACGGCCTGTGATAGGTGATCACCAGACACTT
TTTGGTTTCCACCTGCCATTTTGAAGGATAAATGATACTTTTGTCCAGTG
AAAACTTGAGAttgctttttgttgaaaaattgtaacaaaGCACTTTTTGT
CCCTGCTCCGTACAAAATTTTGTcaccccaaaattttttgaaaaatcaat
ggTTATGTCACAATTCCTTAATTGCAACATTGCGGGGGATCTGTTGCCGT
CCAGGGTACCTTCACCCGTAAGTCCCAGGCAGGGCAGCAAAAACAcccaa
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gcatacatcgatgttcttagccaaattacccaattttttgatgagataga
tatcTCTTTGCTCATGAAGGcttaattttgaagaatagttgtgtttagac
atgaaattttggctgctaGACGtctttatttagaaaaattggccaaattc
aatattttttataagcacaatatTACCAATTACTAACTTagcttattggt
atatattttcgcgtgttacaaattttcgcgggtacttaatttcgcgagtt
ttttggtcaattttcgcgaaatttaatactgtttaaatttttcaaaatta
caaaatcgcgaaattaaataccaCTTTTAGGCTGATTTTAGATTTACACC
CACTTATTTGGGGAGGGGCGGAGCCATGGTgacagaaataaaaatttttc
ccaaGTTGGGTTGAACCAGCAAGCGTTGAAACCCTTGATTTTACTATTGC
TTTAATCCTGACATGAGTTACCACATTAGCTTGCAACGAGAAAATCGAAG
GGGGAAAAATCTCCTAATCTGTCTGATTTTGCACTGATACAAAAGATTCA
AAGAATTCTGCCACAACAGCTGGAGCTGGCTCGATCTGAATCTGATCCAA
CTTTAATAGGCAATGCTATAAAAGAAAGGGCAATTTCATAGACAGTAACG
TTTAAAGCTTGTGCAGCGCTGAAAGgaactttcttcttttgttgaaaatg
ctCTGTAAGAAAATGATAGTTAATAACAAGTTAAATCATATCTTTCAACT
TTAATTTCAAGGCTTGAGACTCGAACATGGATAGAGATTCACCAGTTGGT
GCCAAACAATCTACTGTTTCTTTAAAGACGACCAATATTATTCCAATCAA
ATACCTTGTCAATACCTCTGACTACCAGACAGAAAGCTTCTTCCCACCTG
ACGAGTTTGGTATAATTGGTTGGCCCATTAAGGGAGTTGCCCTGGTCTGG
GGGCGTCTGTTTTTGCCCACTTTGATTATGGTTTTCATTATCGAAGCAAA
GTCGATGACAACGAATATCAAATCCGCATGCGATTGGATAAGATTAGTGG
GAAAATTGAGCACAACATTGACGAACCGTCAGCGGTCTTTTTTAAACTGA
CACCTCAGTCTCTGTAAAGTGAAAAAGTATTTCAGAGTCATTGTGTCTAA
AGGAAGCACAACTAAAGGATATCCCCCGGGAAAAGTGACCATCGTCCATG
CGAAGGCAATAACCGATTGTACTCAATTTGCTTTGAAGACGGTACAATTA
ATCAAGTACATCATGGAATTGATTTTGATGCCAAGGAAGAGTACCTTATG
ATGGTAAGATAATTACTTGTGTACTGTTATTTCACATCAATAATCTGCTT
ACTCTCCAGGTGATTAAGGCAGGTTCTTTCCGGTCCAAATTCTttcaacg
ttacaaatcattttcgtAGGCTCATTTTGGGCTAAAGAAAAAGGGTATAA
TTAAgtagaataagattcagtcAAGGCAGATGTTTTATGATTTagaaatt
ttggataatttattcaaaacctcaattttgctctattttgatgaaaatct
ttACAATCATGATGGcatcagcattttttaaggatttcaGTTTTTCAGCT
GAAAAGTGATGACatgatcaaattaaaaaaaaaattgtattctgatggtc
aaaatttcaatttatttcattaattatttatgccggcaattctgtagcaa
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TAGTTCAATTCAATCCCTCATATTTGTTCAATCCcgatatttgtttcaat
cccgatatttgtttcaatcccgatatttgtttcaatcccgatatttgttt
caatccaatccttcatattcaaattcaatacttcatattcaaatttcatc
cttcatattcaaattcaataCTCCCTGttcaaatttaatcaatctttttc
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ttcaatttcaatcttttccattcaaattcaatctttcaaattcaatcttt
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CCCAGCCGCGTactttatgttttgttttttttggagaTAATAATAACTGA
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GAAGGATTGGATTGAACCAAATATCGGGATTGAACCAAATATGAGGTTTT
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GATCAAAAGATTGAATTGAACTAAATATTCAAAAGATTGAATATTGCTAC
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gatatatcaaaaaatggtctgatatatcaaaaaatggtctgatatatcaa
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TACAAATAATTTAAataatactgaagttgagcaagtgcggttagcacgta
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TATTGATGGGCCTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000159_pilon:723598..744711+ >MSTRG.16665.1.p2 ID=MSTRG.16665.1.p2|Name=MSTRG.16665.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=324bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:723598..744711+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATAGAGATTCACCAGTTGGTGCCAAACAATCTACTGTTTCTTTAAA
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CATGCGATTGGATAAGATTAGTGGGAAAATTGAGCACAACATTGACGAAC
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000159_pilon | genome | sc0000159_pilon:723598..744711 + |
|
