MSTRG.16658.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.16658.1.p1
Unique NameMSTRG.16658.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000159_pilon:634411..649786-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.16658.1.p1 ID=MSTRG.16658.1.p1|Name=MSTRG.16658.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15376bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:634411..649786- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAACCGTTCCTCCATTACATATTATAAACACTTTGTAAGTTAAGGATTTT TTATTTTAAAACACAGAGATGAATATAGATCATCATTAATGACGGAGACA ATAGCGTCATCCTTCCAGCTGCGGATTTCTTATACTATTTGGTATCTTTG TAACCCTTAGATAGATAGATTCTTGAGGTTTGACCAATGAAGTAAAAGCC CGAAAGGCTAGAAGTGAATCTCCTACGTAGGATTTGAAGCCATTATAGCC TACATAAGCTGCGCGGCCTTGAGCGCACTTTTTCTTGCCTCGGAAAGGTT AATGATTCGCTTCTAGCCCTTCGGGCTTTTACTTTATTGGGTGTGACATT TTTGTGCTCTATATTCAATGATCAGTATTCCGAAATTCATATTTTTCTAG TTCAGGGGAACACGAAGACGGACCAGTCCGAAATATTCCGAAAAAGAGAT AACGAGTCTGGTAGATTGACCGAAAGATTCTAATGGTGAGCTTCGTGTAT TGCTTTAGAAGATTATTTTTTTTTGTGAGATGTTATTACTCGTTGATCCA GAGAAATGGAAAGGAATTGAAAAGCGCTTCTCGAAAACAATGGAAACACG GCTCGTCATATACCAAGTCCTTTGCCCTTAAGGGAGTTCGTTTCGAGTTA ATGGATTTCTTTTGTTATCGCTCTAAAAACTTTGTATATTTAGCGTAATG TGACGAAATTCGTTTGTTTCAATTCAAATTATGCGAGAACTTTAGAGGCT TATAGTTTGGGGACACCTTTTATACCAGAAGTCCCATGTCCATGATCTTA TTCAAATTTACACATGAGCTGCATTGTAGTATCCATTAACAAATTCCAGA ATCAGTTTACTTGGAAAAATTTTGTGTCAAGTTTGTAAAATATAAATTTC AATCCATCTTGAAAATAACTATGTTTTCACTTCATCTCGCAACCAAAAAT AAAAGAAATTTGACTCTGTTACTAAACTCCATCCCATATGAGACAGCCTA AATATCACGCGGGTAGACGAGACAAAAAACAGGCGGTCGGGTGGTTGGGT GTTGTTTAGCCTGGATTCGTAAACTTATTGCGCTCACAGGCCCCGACAAT GCCAAAAACTTTTCGACCAGTTGCTTTTTAAAGGCCCACTTGCGCTGCGC GACTGAGCCAATAAAAATACCGATCCACTTTTATAAATATATAGAAACCA ACACTCTTCGCATGCCGAGCCGTTTTTTTCTGAACCCTTTCTAATTACCT AATTAAAGCCAAAACAAAGGAGTTCTCAATGGGAACGGTCAGAACACTTT GGGTAATCAGAGAAGCGCTTTTTCTGTTCCTTTCCATTTCTCTGGTTGAT ATTTCACTCACGAGATCCAAGCTACCATAGTTGTCAAAGATTGAATCAAA CATATCCCGATACAATTTGTTTACTTCCAAGCCTATTCCTTTAGTGTGTT CAAAGAACCTTTTAAAATCGATGTCTTAATGGAATGTTATTCTTATTTGC TGAATGGTCAAATAGCCATCCATGTTTGGACTTTTTCTTGTTGACTTGAA CCAAAATACTAACATGTACTAAACCTTCGCAGAAAAGGCAGTACCGTTCG TTACGGTAAAATTTAGCGGTTACCTGAAAACCTTGGTCATTCCCTTTTTA TTTGATGCTGTCGCGACCTTTTTAGCGGCAACGGATCCTTAAATCTAATT AGATGTATGCACCTTACCCAATTTCTATGATATCATTCTTTCTTTTCCAG TCAGACGAAAGGAACTAAAAGCGTCGCAGCGCCCTCTGCCAATCATCAGT TGTATATTTTGAGTAAATAAATATCTACGCTCATGGTATCATACATGAAG TTTAGAGCTCGATGATTACATACTGCTGACGGTATTTATCAGGTAAATAA CTTTGTGATAATATTATATTTCAACAATAACCTACTAACGTGTGGTTACT GGAGAGTGATCGAATTGAAACCCCGACGTTGTCCCCACGAACCAGTGTAG ACTTGATAGCCCAGTCGGCAGTGCAGTTGAACTACTAATGCGAAAGTAGT GAAATTCCACCCTTTTTGGCAAACATCTAAATGCGAGATTAAATTTCAAG GCAACTTCATTTCTCCTCTTTAAAAGGATTTTAGGTACCTTACAAAGGCT GTATTTTTGTATAATAGACCTAATTCGAAAATGGCAAAAAATTATTGAAG ATGAAAATGAAGACTTTCTTAAAATACCTGAAGGCTCAAAATTTTTCATT TTAAATCACCAAATCTTTCTTTTGATACAGGGTGATTCAAAATTGGTAAT CAATACATAACTCCAAGCAATCGTCAAGCTGCCATTTGGGATGCTCTTCC TCGATCTTGGAATGATCTCTAACAGGTTAGATTGGGTTTATTTGTCTATG GAGCTGCGATTATCCAGACTCTTACCAAGAGCAGCCACTGGCAGAATTTT TTGAAATATCTGTTCTCTTTATCCAGGAGAGTAAATTTTATGGATAAATC TAGGAGAGACTTTCCTCAAAACACCCAGGTAAAATCCAGGGGTCGCCTTA AAGACATCTGTTCTTAAAATCCAGGAGCGCATTTTACGGAAAAACACATA CAATTTTCCAGCGGACAATCTGTTCAAAAAATCCAGGAGCTATATTGTGG AAAACGCAACCAGATGCCAAATTTTTTTTCCAGGGAGCTTCATAATTTTC TTAAAAGGTCTCATTTTCTAGGAGCATTTTAACTTTCTTAGAGAATAGCC GTTATACTTTTCCAGGACCATAATATTTCAATAAAATTTCAAGAGAACAG ATCTACATTTTTCAGTAGTCTCATTTTTTCCCAGAACAGATGATATAATC CAGGAGAGCCCAGGATACAGAACAGATTGTTTTTTTTCCAATAGAAAGGG ACCTCAAGAACAGATATTTCACACTTCCTAGCCGGTGGCTGCTCTTGTCT TACCATCTATTATATGTTCACTTTAGTACATCTAATAATATGATACTAAT GATGTTAGAAGTAAAGAGAAAATAAACAATATTATTATAGTCGAAGGCTT TAACAATAACCTTAATCAAACGGCCGTTACGAAATGCTGTAATTCTCGTT TTATTGGATTCTAAAGCCACGATGCTTGTTCAATTTCCACTCTCGATTTT CTCAATCAGATCTTCTATTGTGAATGATAGTAGAATCGAATCCCACATTG ATTTGGTAAATTGTTAATTTGAGTTTAATAACGAGTCGTTCAAATTTTTA TATTCTCTCTATCCTTTATTCCAGGATACGAATTTGTGGCATGAGAATCC CTTCAACAACCTGGATTTGATTGGTGGATAAAATTTGTGATAATGATGGA ATTGTTTTGACATATCTGATGGATGTTGTCTTCTCCGTAGATGCAGTTAC TTGCTTGGTGATTGTTGCGAACCATAGGTGCATTTATAAGAGTATTCAAT GCAATTGTTGAAGTATGATATGCTGATGGATGGATTATCTAGAAGTGATT TCTTTGGTTGAATATAGCAGTGTATTCATCGATTTGAAAGATGACCTCTT TTAGCCCAGTCATCAACCGTGGCCAATGATGCTTGATCTATCTAAATCGT CATTTGAAGAGCGATTGTTAAATGAAGTTGTCTCGATATCAATTCTGTAA TTGGTTACCAAATCTTGCCAATTAAATCTTTAGTCCTTTTTGCCTATACA CCGTTTAGGAGTCTCGTTATTTCACGGTACTCCATTGCAGAGGCCCGGTA AAAATGGTAGGTAAAAATGCGCACTTTAGTACTGTGAAAGGCTAGAGGAA TGTAAACATTGTGAATTTTTTTCTCTCCTTTAAAGAGAATGATTTAGATA TTTGAACATGATATCAATGATAATTTTATAAGTCTCTCCTGAAAATTTCA CAAAAATTCATCAAGAGGAAAAGAAGTTATGATTAAAAGGAGTTCTTTAC CTACCGTTTTTCTGCTATGTTTCCTTATGAGAACCAGATGTTTACCTACC GTTTTTTTACGGAGGAGAGTGAATTTTCCGTGGTCGCTAAAATCCAAACA ATGGAAAATTAGATTGACGCGTGCGCAGTCGATACTCCTAAACGGTGTAT TGATTCAACTATTTTGATGGGTTAACTTATTAGAGTTCGAAATGAATAGT TTACCTTTTCCTTCTAACCAATGATTTGTGTAGAATTTAAACACCCCAAA AGCCTTATAAAATGTAGGATCACTGGATTTTGTTGTGGTTTCAGTGTTTT TCCCAAGCTTTCAATCAATTTGTGTGAAAGGAGAAATATTTTCAAAGAAC TTTAATCATTTATCACAAATAGTGTTTTCACAAATGTAAATAATTATTTG TGGTCTGAAAGGGACTTTTCTTAAAATCGAACTTTTTTTGGACTTTTCAC TGCCATGAAATTCGAGTTTTGTGATATTATAACTAAATTATAGTGAAGTT TTTCTCTGTCAGAATTGTTTTTTATCAGCGTCTTACATCTAAAGAGCATT TAGTAATGGGCCATTTCATTTATATCCATACATGGGATTGGACGAATATT TCAAGGGAGGCCCCCAAAGAAAAAATTCCAGGGGGTCCAAAGAAACTTTA GCACTTTTTCAGAGAGTTGTTTTTTCCCAAGGGTTGGATGACCAAGCATC TATATTTCCTTTTTGTAGGGATGGAATAATAGGCTCGTTTGTTTTCTAAT TATTTAAAGTTTTGGAATTTCCAGCAACCTAATTTGATTTTCCAGGAGGG GATTAAATTTTTTTTTAAATTTCCAAGGGGTAAAAGATTGATTTCAGTTC GTCCTCTCACAATGTCTTGTTTAAAGAAGGATTTTTCGATGGACAATACG GTAGAATCCTTTTTTTTCCAGATTTTTGCAAATTTTGTCATTATTTCAGG AAATATATGTACAATTTCATTAGTTCATTAATTCTTTTGGCTTGAAAAGA TTCGTCATTCGTCCCTGTATGGATATCAAATGGATAGCTCAATGGTCTAT TTTTCTTTGATTTCGTTCATTTTCTCAGTCTGGTAAAGCCCTTTCGTTAG GAGTTAGGAAATCAAGCAATCTTTATATTTTTACCAACAAGGCACTCTAT CCAATCTGCCAATGAGAGGTGAAAGAGCTGCTCTGATTACGAAGCTAAAT CCTAGTGACATTCTAAATGGGCTGGGTACAAGGGAAGGGAAATGGTAGAA GTGAACCCGCCATTTTCTCAATGGCTAATACTTGAATATTTGACTATTGT TTTTTAGCTTTTGTTTTTGCTTTTCATCTAGTAGCCGTTTAGACCTCAAT TTTCTATTTTGATCCAATACCCTTGACAGACAAAACTCGAAAAATTATTA TGAATTTCCTGGTCAAAAAAAGTTTTTGGGGTGGAAGTTCTGTCTGTTAA GGGAGCATAACAAACGTTACTTAGCTGAATAGTTCGGACGGTATTTTGGG AATTTTCTTCGTGAATCTTCCTCCGCAATTTTAAGGTTCAGAAACTTTCA GGAAGTGTTGGTTTCTGATGATTTTGTGATGGGACCGGGGAAAGGATGTA CATATTGAATACAAATCCATTGGATGGAATTTTCACCAACGTTTGAACTT TCTCTGTGACCATTTACTTTATGCACAGGTGTTTATTTCCTTCATCAAAC TTCATCATCGCTCAAAAGGTATTAACTAAAAGTTAGCTCTTCCCATTATC GCAAAAAAGCGTTTCATCTAGTAAGTTGTACAGAGCACTTTGCTTCCTAA TTTAAGCGATTTATCACGAAATTCACGAAAGCCTTATTCATGTCTGTTAG CGTCCGTTGCTTTCCCCTCCTACAGATTTTTGAAAACTTTTTTTGAAACC CTCCCCTTTTGGGAATTGTTAAAGTCAATGAACCCAAATATCAACAATTT AAAAGCCGTTTATCGAATTATATTTTGCCGAGTCTTTCTGAATCTTTTTC ATATATTTCCCCAGAGATCTTATATTTTCATATGGTTTTTTCAAAAACAT TGTTTAATGGACTCTCACTAATTCGAGCTTTTATAATTCAAATGCTGCTT AATAATTTAGCTCCCGTTCGTAAATCCTCTTAATTTGCACCTCTTTACAG ACTACTATTCGAGTTCGAATTAGCGGGAGTTTGTTTTGGAGAATAGAATT ATGGCCGATTTTTACAATTCCAATCAAAATTTTTCCTACTCACGGGTACC TAATAAATGGGGGTTCGGAATAAGCGGGATGGGTAGAGAAATTCTCAAAA CTCATTGTCCTGCTAGTTTGAAAATTTTTGAAAAGGAGGCCAAGACAGCA GAATTAGGACAAATAAGGAAACTCTCCAAAACATTTTCCTAAAAATTAAT AAGCGGGGGGGGGGGGTATGGAATAAGAATGGAAAGTTTTCGAAAAATTA ATTAGTGGGGGACGCATATTAATTAGATACCCGGGAGGGAATAGCTGCAC AGAACTTTGTTTCAAGTCAACGTTCATCTTTACGTCTTATGGACATTATA GACGCTAGATGAACGTTGAAACAAAGTTGTGGCAGGGTTATCAATGGCAA AGTTTTCAAAAGACGAAACTTAGTCGTTTCAAGCTCCTTTATTTTTTAAA AAAAAAGGTTCATGTTAGAAGATCATTCCACTAAATTTAAAAAATCATTC AAATATAGCGCTTTTGATTCTCTAAAACAAGCAAAAGACATTTCCATAAT TATATTTGACTATAAAAAGTTACAGGCATTCTTGTTTCCACTGCCAATTA TATCTGGACAGACTTTGATTTAAAAATATCATTTGACCTTCCCTGTGATT AACGCTTAAAACGCTGCTCTGTACAACTACAGTGAACTCTCGCTAATTCG ATAGTTTTTATGATTCGAGCTTATCCTCAGTTACTTGGAAAAACCTTCGT GGAATGCCTTCTACAATTACAATGTACTTCAAATAAATTTGGTTCTCCTT TCGAGCTCGAATTAGCAAGAGTCGACTGTACAATTCGCTAATTTATCAAA AGTGCGCGTTGTTTGAACTGGGTGGTGCTATCAATTCTTCGTCAGGGTGT GCAATTCACCTTAATTTCAAAACATTAAATGAGAAGTTTAAGCTTTCATG CCATAGTCATTAGCCATCGCAATAAATTCAACAGTATTCAAAAATAAACC CTTTCCAAACAAAATTGACTACTTCAAAAACACTTCTAGACAGCAAATAT TTTTGTGACTGAAATGCTATTACATTATTACTGTAAATTGTGTTCTCCTT TTGTAATCATTACCAATTTGTCATTCATATCCTTTTTGTCAAGTGATTTT ATCTCATCTTTTAATACCAAACCAAACATTAATATTTTCAGAGATTTTGA GCTCAATTGAAGCAAACTTATTCAAAATTTCTATTTCTAACAATTTGAGT CTAGGCTGTCGGTCAAATCCAATTCAACGCCTTTTAAAATTCCCCTGAAA ACTACGAGGACATAATTGTGAAAGTGTAGTTCAAAACCCAGAACTTTGAT TTTAACCGTATCATTTTTAAATTTGGAGTTTCGAAGAATTTCGTATGAAT TTAATTTTTGGCTTTAAAAGTGGTTATTTTTAGCCCCATACAATTATCTA GAAGAGTTTGCGTCAAAAAAGTTTTGAGTGTATTAATTTCAAAAGTCAAT TACAAAACTCAATCACTGTTGAATTATTTTGCCAAAAAATGTTTTTTGAC CCTAAACGTTTCATTCAAACATTTAATTAACAAGGGATAAGCACAACGAA AATTTTTTTATGAGCACTTCGAAAACCTCTCCTGAATAAATGTGTCTTCA GCAACCAGTATGCATGGTTGCAATTTCATCCCTCAATTTGGTCCCCGCGG AATGTTATCCCCAAAAATACGTTTATGTAAATCGCGAAATCTCTCAATTA AGTCGCACCCTACGCTGCGAAGTACTGCGAGGATATTAGTCATGTTCGGT AAAACCTTTTGAACGATTTTGTAGTTGATGAAGGAAATAAATTTCTGTGA AGTTACAGTAAATGGTCACGTGATAGAATTAAAACCGCTTTCTCTTCCGA CATTTCATCAGATAAGTTACTTCCCGTTGAATAAGAGAAAGTTCGAATCT TGGTGAGAATTCTACACAATGGGTTTGTAAGTCAAATAGTGCCATGTGCC TGGCCCCGCTATCTCTGAGACGAAATCATCAAAAACCGGTCCTTTTTTCT AAAAGTCTTTGAATCGGAATATTTCCGAGGTTTGAGATCGAAGAATTTCT TGAAATACTTAACCAAGCTATTCGGCAATTTATGCGATCCATGAAGTCAT TTTGAAATCAGAAAAATAATTTTGAAAGCCCTCAGATTTTTTAGTTTTTT TTCGCTGTCAAAATGACGTCATAGATCTCATGAAAAGTAACGTTTGTTGT GCTAATTTGGTCAGGAATGGAATATCGAAAATTAAACGGCTACAGTGATG AAAAGTAAAGATAAGGGTGTAAAAATAATGACTTGCGAAATTTACATATT CAAGTATTAGTTCATCGGGAAAATGGCGGTGGCATTTCTGCTTTTCCTTT CCTTTGTCTCAGTCTAAGAATGTTCACTAGCGATCGAATCGCTTTGTTTT CGGAGTGCTCAAGTAGCTTCTCAGGCGGATAGGATAGAGTGCCTTTATAT TTTTTTTAATTTTTTTTTTGTATTTTTTTTGTCATAATTTTCTCGGCAAA TATAACAACATGCCTTGCACTTCTTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000159_pilon:634411..649786-

>MSTRG.16658.1.p1 ID=MSTRG.16658.1.p1|Name=MSTRG.16658.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=918bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:634411..649786- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCAGGGGAACACGAAGACGGACCAGTCCGAAATATTCCGAAAAAGAGAT
AATACTCGGGATGATATTCTCAATGGAATGAATTTGGTGACCATGGAAAA
AGTTGTTGCAACGGTTTGCGAAAGACAACCTGACCAAGAATACACTGATA
GTCAAAGAGAAAAGAAGATTATCCTTAACTATCTCTTGTTGAGCAGATGC
TTTCAACGAATGGCAGTCTTCAATCACACTTCCGCTATCGCGCGTTAAAG
AAATGTTTGGGGGACGTTTCGAAACAGAATTATAGTTGCGTCCAAAGAAA
TACCAGTTCAGGGGAACACGAAGACGGACCAGTCCGAAATATTCCGAAAA
AGAGATAATACTCGGGATGATATTCTCAATGGAATGAATTTGGTGACCAT
GGAAAAAGTTGTTGCAACGGTTTGCGAAAGACAACCTGACCAAGAATACA
CTGATAGTCAAAGAGAAAAGAAGATTATCCTTAACTATCTCTTGTTGAGC
AGATGCTTTCAACGAATGGCAGTCTTCAATCACACTTCCGCTATCGCGCG
TTAAAGAAATGTTTGGGGGACGTTTCGAAACAGAATTATAGTTGCGTCCA
AAGAAATACCAGTTCAGGGGAACACGAAGACGGACCAGTCCGAAATATTC
CGAAAAAGAGATAATACTCGGGATGATATTCTCAATGGAATGAATTTGGT
GACCATGGAAAAAGTTGTTGCAACGGTTTGCGAAAGACAACCTGACCAAG
AATACACTGATAGTCAAAGAGAAAAGAAGATTATCCTTAACTATCTCTTG
TTGAGCAGATGCTTTCAACGAATGGCAGTCTTCAATCACACTTCCGCTAT
CGCGCGTTAAAGAAATGTTTGGGGGACGTTTCGAAACAGAATTATAGTTG
CGTCCAAAGAAATACCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.16658MSTRG.16658Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.16658.1.p1MSTRG.16658.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.16658.1.p1.exon6MSTRG.16658.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.16658.1.p1.exon5MSTRG.16658.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.16658.1.p1.exon4MSTRG.16658.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.16658.1.p1.exon3MSTRG.16658.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.16658.1.p1.exon2MSTRG.16658.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.16658.1.p1.exon1MSTRG.16658.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000159_pilongenomesc0000159_pilon:634411..649786 -