MSTRG.16632.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.16632.1.p1
Unique NameMSTRG.16632.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000159_pilon:221269..231413+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.16632.1.p1 ID=MSTRG.16632.1.p1|Name=MSTRG.16632.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10145bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:221269..231413+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
agaaaaaacaacaattgaAATAATTTGACTGCAATGTCATCAGGTAAAAT CCTACCAAGAATGAACAAGGTGAGTTATATTCATTTTTCGTGGTTCCTAA ATTAATATTGAATTCCCACCGCGTTTCATTATGATCATTATAAAATGGCT GGTTATACagttatacagggtgtccggaaaaaaagcaTCGAGCCGTACCA CTTCTagtctttttaatcataaacaattattgtgttggtatatattttct tacattttgttaaacacatgcaacaaccttctactcagaatcatgttcga actcgatattttttttcggacatccTGTAATGCACCTATCAATTTTTAGA GCTAGAAGAGACCGGTTGTAatattgacgtcaaaatgtttgaagtcGTTA CATTGACATtctcgaaaacaaagaattgACACCATTTCCTTGTATATTCA TAGGCAaagcaaagcgtaatgggtaatcaggaccaatGCGTGCTAATGAg tacttactattggtccaaagttttgagaaattttgaagatttttgcgtct agctaACCGGAAGCTGTTACTAGAGCGCaaccagtcctgattacccatga ttcatttcaactgtgaaatggcctattccCAGTCCTCTCAAAAGCCAAAA ACGCGGTTAAAGGTTGATATGTGGTTTCCAGAGTATACTTCCCCGCTTAC gaaattagaaaataaagaaattggtTTCACCTGGATCATCTTCAATCTCA TGAAGAAATTCTATCTTACTTTcgcttcaaaaattaaaagctACACGGGG CGCTTATTCCTCGTGGTTCAGTAGTTGCTAACTTGATTTCTCTCTTCACA TATTTAAAACATTTGTGAGAAATTTGTGAGGATGCTCATAATCCCGtacc aattttttcattttttcatacaAAGATAACACGATAttcttttaggaaaa 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aatggggctgaaattctagggtttTTCCCCATCGGGGACGAATTTTTTGC CCAACTTTCCTGTGGGGCTGGGGTACCGGGTCTGTGTCACAGGGGTGGGG ATTGAGAACTACATTGACTTATTATAAAAAGCATTCAactaaaagaaatt tgaattatagtCTGCTGTTACTTAAACATGATAATAAAATCTGTTTCCAT TCTTTCTCGGTACAGATTCTTGTTGTTGGGACAGATACAACAAACACAAA GAAGCCAATTTTAAGCTCAGCTCAACAAACGAAGATGTAGTCGATGAAGT GGAACAACAATCGATGTTATCGGATATCGAATCCCAATTCATCGAACATG AACGTTTTCAAACGTTTATCGATCCATTAGGTGATACAGAGCAGTGGATG TTTGTATcacttttcgagaaaattaaaCGAAAGTATAAATCAACTATTTG GAACATCCTCGAAGAACCTAATTCATGCAAAACTGCTAAGGTACGACTTT TTCAACGTTTAGAGTCACCACTCTAAGTATATTtcatggaaaaataattt tcttagatttttaaactgataaaaattaactatttgatatttttaccGAA TCTTTTTATTGGTTCTTAATAATGCCAACGGGTAAAATAATTTCACTGCG TGGCCAGTGTTATATGGAAAATagtgttcttaagatttttttccTAGAGG TGTTTGATACTGGAAAAAGGTCCATGCTCCATGGGGCTTGCGTCTGTGAC CCTTGGtttttttAAACGTATTTTGTTCAAGAGCTCCTGCTCATTTAAGA CTGTTTTTCTCTCGATCATATACAAAATGTATGAATCCCTCCGTCCCAAA CCAAACGATGGGGAAATCATAATCTAAATATGGCACTAGAAAAGCTCATC GAAAGTGCAACTATCAAATCAAAGAAGTAGAAACTTGCTAAACTTTAAAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000159_pilon:221269..231413+

>MSTRG.16632.1.p1 ID=MSTRG.16632.1.p1|Name=MSTRG.16632.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=12015bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:221269..231413+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATCAGGTAAAATCCTACCAAGAATGAACAAGAGACGACAACGAAG
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TCTACGGCTACTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.16632MSTRG.16632Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.16632.1.p1MSTRG.16632.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.16632.1.p1.exon1MSTRG.16632.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.16632.1.p1.exon2MSTRG.16632.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.16632.1.p1.exon3MSTRG.16632.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.16632.1.p1.exon4MSTRG.16632.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.16632.1.p1.exon5MSTRG.16632.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000159_pilongenomesc0000159_pilon:221269..231413 +