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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000156_pilon:406427..419448+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.16492.3.p1 ID=MSTRG.16492.3.p1|Name=MSTRG.16492.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13022bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000156_pilon:406427..419448+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAAAACCAGAACTTAAATACTTGCACATAAGACAAGCATTTAAAGATCT
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GTTGGCTTTAGGTCTACTTCTCTTGTTTGCTttgtgaaaaataatcaaag
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TTTATCTCATACAGGTTGATATTTTTCTTGTGCATGCACATTTTTATCTG
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TCATGTGCATGCACATTTTTATCTGAGAGTTGTGTATTTTTCATATATAT
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TTAATAGCTTTATTTAATTATAAACCttgatgattgaaaaattaaaattt
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ATATATTTGCAAATATATATCTAGGTTCGTCACACGCcttttaacttttg
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gacaaatcccgggggggggggctcgatCTCGAAACTACACCGTATGTTCG
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TGCTGAAAACCGACCCTGTCTGACAGTGCATTTTTCGGCCGTTTTCCCCC
AAGTTTtagcaaagattttaaaattttctcaaattaccTACCCCTGCCTT
ACAGTGCACCTGGGCGTACCTAGGCTTTGTCAGAacctcgaaaaacctac
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ACCAACCATCAGTACAgcagttttcgcgccaaaaaaTGAACTGCAGAACT
TTACTTTGTGGAGCTGATAATTTGCAGAATGAATAAAATCCCTAACTGAT
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tgaaagaatgcgaactaaaagagcgaacaaaaagagcaaaactaaaaaga
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GAGCGAACTAAACGAGCGAACAAACATTTAAAACGATACCAACTCATTTA
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ATAATACGAGACAACTTCCGCTgctttggcgttatttacggcgTTAGTGT
TATACAAAAACGACGGTCAACGTCGTAAATAGGCCTATATACAGGGCCAA
GATTTGACCAACTAGGTAAATACAGTAGAACAGATAATTATTCAAAGCAG
CAAATCATACTCTctgacaataaaaaaataatttcaaaaactagaaaaac
atttcaaattaaatttgaagccatttttaTGGAACGCCATAGCTGCCATA
AGTGCTCTTTTGTGCGCtcttttttcatgatattcGCTCTTTTAGTTCGC
TGAActctttcggttcgctcttttgttcgctcttttcattcgctcattcg
ctcttttcattcgctcattcgctcttttcattcgctcatttgccctttca
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TTCAATTCGCTCGTGCGCTCTTTTATTCgctctttttttttgctaaacgC
ATTCGGTttgctcttttcattcgctcattcgctcttttgaTGCGCTCTTT
TATTGCGCTCTTCAATTCGCTCTTTTCGTTCGCTCTTTGCATGCGCTCTC
TGTTCGGCAAATCATCAGTTCGGGATTTTATCCATTCTGCAAATTATCAG
TTCCGTAAATTTAGTGTTCTGTAAAGTAGCTTATTACGGCATGGAAACGG
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GATTGAGAATTAAATGTTGTTCATTTGGTGGTGAAAGTCCAGGTAAAGTT
TTGACAAATGGTGcaccaaaatttttaattccTAAACAAGTACTTGAAAA
CTTTCTGGAAGATGGATGTTTAATTGAAGAAATAGCTAACATGCTGAATA
TTTCTGTACGCACTATTTACAGGCGAATGGAAGACTATGGTTTATCAAAA
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CTTGTTGAAGAATTCCCTCATTGTGGAGAGGTAATGCTAAGAGAATTATT
AAAGGAAAGAAGCATCAAAATTACCAGACAAACTTTGCGAGACAGCTTGA
ACCGGATTGACGAAAATGGTAGTCTAAAGATGAGGAAGAAAAAGAGTTTA
CACCGTAGAGTTTACAGTGTACAGGGACCAAATCATTTGTGGCATCTGGA
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ACGGTTTTAGTCGTTTACCTGTAGGTTTGTATTGCACCAATAACAACAAG
GCTTTAACTATTTTGAGTTGCTTTCAAGCTTCTGTTGAAGAGTATGGGTT
GCCCAGCAGAGTGCGTGCGGACAAAgggaaagaaaatgttttggtgGCTG
ATTATATGATCGAGAGAAGAGGGGTTGGTAGGAAAAGTATGATTACTGGA
AAGAGTACTCATAATCAGAGAGTTGAAAGATTGTGGCGCGATGTGTATAC
TGGTGTTCTCTCTtatttttctaacattttcaCTTACTTAGAGGATCAAG
ATGTCTTAGATTCAACTAATATCCTGCATCTCACTGCATTACATCATGTG
TATCTTCCTTTCATTACTGAAAAGCTCTGCAGATGGAGACAAGCATGGTC
CACACATCGCTTAAGAACAGTAAACTCAACTCCACAGCGACTTTGGGTGA
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TTTTATGGAGCTGAAGATAACGTAGTTTTGAATGAAGAAGAACAAGGAGA
CACTAGACCAATATTTGAATTTGATGGTTTATCTTTGAGTGAGGAATGCT
TAGTAGAACTTGAAAACATGTCACTTGATCAAAGAGAGGATTGTGGAATA
AGTCAATACTACGAAGCTGTTCGGATCATTGCACAGTTTCATCAAATTAA
CTGATCAATTTGATTATGTTAAAAAACTTCAATACAATGTGGTATACCAT
CATTCTTCTAATTTATTTGATGGCAAAACAcactttttggtactttttat
tttttttttctttcttttccagctccttgaaaaccttttctctcatttga
tcataaagtttttctttcatagatttaaaagttaatctcatggttgatcg
AAATTTGATTTACGTTTTTGTTTAcgttaatttgaaatttcccgctgttt
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ttgacgttcgattttcGAATGCGTTCTATAGAgaaacaaaaccaaaacaa
aacaaaacaaaacaaaaaaactctcAGCTCAGTAAGTAAAGAAGAAACAT
AATCATAATCAGATGATGGAAGATTCAATTTGATTGATTAGAATATATTA
TGCAGTTTTTATGCCTGGTGCTTCTTGAGCTATGTATAAGAGTTATTCAG
TATAATTGAAATCTTTTAATGCTTCATGATGAGTCGCCTTATTTCAATCT
TAACCatatgagattaaccaggaatcccatgcttgatTTCGTGAAATTCT
TCAAAGATTTTCAGGTGCCACTACATTCACTATTATTAGATGATTTTTGA
TAACCTTGCACCAATGGTTGTCTGCATCAGTTTTTAGAATTAggttccag
aaaaaaataaatgactaaAACGTAAAAGACAAGGTTTAGAAAAGCTCCTT
TCTTCTTTATcagtgaataaaaaaataagtaggtttaattaaaaaaaaaa
attgaggcAGGCAACCTTTGGTTGGCAACGTACTGTAATATTATTTAACT
TAAGATATTTCTTAAAGTCAAAGACTACTCTTATATGTTTGACGTTTTTA
AGTTTGACAAAATTGTAGACAATGAGCTCCCAGGTCTCTATAAACTATAT
TGTGATTATTTCCAGGAacgaaatataaaaatttatgCTAATGGAATTTT
TATATTatcattttttggttttggtaAAATTAGGGTCAGTCAGGTCAACA
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TGAGCAGCATGATGAAACTATTATTTACCAAGCTATTATGTCTGAGGAGA
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AAGTCAGGAACATGACgactttaaaaaaatccaagaggatTTTGACATCA
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TTATAATGGTTGACCGTGCCAATTTACTTGTAACAGGCTTCGATGAAATC
AGCCAGCTTGATTTCAAGTTTATGTGCCTGCGTGTCCAATTTTATTGTGA
GGTTagtataatttatgaaaaaatatgccataagttttttgattttcatc
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TTGTTAAAGTGCAGATGTGTTTCTAGTTAATCAAAAACTTGCAAAGCTCC
tttttttGtgagaagaaaaatattatttgataaatttatgGGCTGCAAAA
GTTAATTTAATTATTGAGATGATTAAATTTTGTGAGTTTGCCTGTTTTTA
TGGAACactgtactttaatgggataaagtTTTGTGGATTTTGGCCCAATC
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ATATAAGTAGGTAAGTACTGCCATAAGAGCTCATTTTGCGAAGATTTCAT
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ACTTCAGCTTCAGGGACGCAAAGAGAACATGTTCTTGATGGTCTCCTAAA
GCCTCACTCTGAGGTCTTTTAGAAGAGACTATTGGGTGGTTATTGCAATT
AGATATCCCAAGTAGATCAACATGTTCCTGTTTAGAATATTGACCCTGTT
ATACAGGTTGACTTTTCAAGGTGTCGTttttaaacataatttttttttga
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AATCAACAAATACTATAATGCTGGCACAGTTATGGGTAAGCTCAAATACA
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ATGtattgtttttgtcaatttctatattttgtaatttggaaACTTGGAAA
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TTTAcaggtaatttttttccatattCTAATTGGTTTATAAAATTGTTGGC
TTTAGGTCTACTTCTCTTTGTTTGCTttgtgaaaaataatcaaagaatgc
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ggctgacttttttcaaaaatactgggggctagcttTCTAgggggggCTAA
GTTTTAGTTAATTGAACTGGGGGCTGGGtttataattttatgttttcaaC
GAATTCGAAAAATCAGCTTTGCAAAGTTTGATATTTGTTAATAGGAAAAC
CTTATTTAGATGACCTTTATTTCTTAAGAACTCTCATGTCAagcacaatt
tttttgagtttccGTTTCATGAAGGTGGGGGCTACATTCTCAAAATTTAG
CTGGGGGCTTTTTTcattagccccccccctgaaaattactgggggctgga
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CAATTGTCTGTAATGGTTGATTGTGATTTTGTTGTGATCtgtattttctt
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ATCTTGTACTATATGCCATAAAAATATACTTATTGATTGCATGAAAACTT
CTCATATCTCATATTTTTCATTCCATTGATtcttccaatcttgttccagg
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AGAAGAAGGTTCAAATGCAAAAATGCGACAGAAGAAATTGTATGCAATTT
TCCTCAAATATTTGAGGCTGGTGCATGGTAAGTTTTCTATTTTCAACATT
ACTCTTCGCTATGTTGTTAATGTTGAGCAATAAATAATGGAATGTGGTCT
GTGACTGAAAAATTTTGTAACAGCTACCCAATTTTCATAAGGACCCATTT
AATAAGAGTTCTCAAATACGTAAAAatacatccaaaatattttgtgACTT
TAATTAACTTAAAGGTACTAATTTTCGCTatattaattttcgcgcatcaa
gaaaaaatatttttagcgcATAACAATTTTCACGCACCAGCCAGTTGTCT
GCAAATTATCGGTATTAAATTTCGCTCATTTTTGGGCCTTTGCGCGAAAT
TGCGCGAAAATTAGCACGCATGAAAATAAGTACCTTTAAGGTATCCGACT
TTTCTTTTGCTAAACTTATCTAATATACATATTTATCTCTTTACCATTCA
ACACAATTAAAGGTGGTAAACGATCTGTTGTATTAGCAGACATCTTACGA
TTCACTACTGGTTCTGAAGAGGAACCTCTCCTGGGATATGGAATTCATCC
CACACTGAAGATTTTGCCTGTTTTGAGTAGCTTTCTTCCCACTTCGAACA
CTTGCATTAACCAGTTGCAGCTATACACAGAGACAATGACCATTCCTCTG
CTAAAAGAGAACGAACTATTTTCCAAGTTTGACGTGTCCTTCTTGCATCG
GGAGTTTGGATTGGCTTGAAGTTGACTAATGActgattttagttttgatt
ttacttCTTCCAATCGGTTACCTTATATTAGTGGATGTAGATTAATTTCA
ATCAAGTTTAAGGGTTCcagtcagggaaaacctggaagaTGGATTGTTTT
TCGGAAGATTTGGTCTCAAGCCCTTGTAAGTGATGCAAAAGGACGTGTCA
AACTTGAAAAACAGTTCTTCCTCTTTTGGCTGGGGGATAGTAAACAATCT
ATAAAAGACCTatataaattattaaatttttctagggaatttgggcaaaa
atcatgaaataaaacattttacaagaatttaattttgcaaaattggaaaa
aaattctcaaaaccacaaaaattaatccatttaagggctctgaccatgaC
TTTTCGTCAGTTTTTGACTCATAATCTTCAGTCATAACTTTTCACGCATT
TGAAGAGAAAAATTTTCTGCAAAAGTTTAAGTAGCACAACTATTTGTAAG
TACTTTAGAAAAGATACGTCGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000156_pilon:406427..419448+ >MSTRG.16492.3.p1 ID=MSTRG.16492.3.p1|Name=MSTRG.16492.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1494bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000156_pilon:406427..419448+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAAAACCAGAACTTAAATACTTGCACATAAGACAAGCATTTAAAGATCT
TGGAATTTTAcaggTTTTCCAACATTTTCCGATGATGCTTCATCTTTTAA
GACCATCGCCACAATACAATCTAACATTCCGGAAAGTAGTCGAACTTCTT
CAACCTCTCTGGGAAGAAGAAGGTTCAAATGCAAAAATGCGACAGAAGAA
ATTGTATGCAATTTTCCTCAAATATTTGAGGCTGGTGCATGGTGGTAAAC
GATCTGTTGTATTAGCAGACATCTTACGATTCACTACTGGTTCTGAAGAG
GAACCTCTCCTGGGATATGGAATTCATCCCACACTGAAGATTTTGCCTGT
TTTGAGTAGCTTTCTTCCCACTTCGAACACTTGCATTAACCAGTTGCAGC
TATACACAGAGACAATGACCATTCCTCTGCTAAAAGAGAACGAACTATTT
TCCAAGTTTGACGTGTCCTTCTTGCATCGGGAGTTTGGATTGGCTTGAGA
AAAACCAGAACTTAAATACTTGCACATAAGACAAGCATTTAAAGATCTTG
GAATTTTAcaggTTTTCCAACATTTTCCGATGATGCTTCATCTTTTAAGA
CCATCGCCACAATACAATCTAACATTCCGGAAAGTAGTCGAACTTCTTCA
ACCTCTCTGGGAAGAAGAAGGTTCAAATGCAAAAATGCGACAGAAGAAAT
TGTATGCAATTTTCCTCAAATATTTGAGGCTGGTGCATGGTGGTAAACGA
TCTGTTGTATTAGCAGACATCTTACGATTCACTACTGGTTCTGAAGAGGA
ACCTCTCCTGGGATATGGAATTCATCCCACACTGAAGATTTTGCCTGTTT
TGAGTAGCTTTCTTCCCACTTCGAACACTTGCATTAACCAGTTGCAGCTA
TACACAGAGACAATGACCATTCCTCTGCTAAAAGAGAACGAACTATTTTC
CAAGTTTGACGTGTCCTTCTTGCATCGGGAGTTTGGATTGGCTTGAGAAA
AACCAGAACTTAAATACTTGCACATAAGACAAGCATTTAAAGATCTTGGA
ATTTTAcaggTTTTCCAACATTTTCCGATGATGCTTCATCTTTTAAGACC
ATCGCCACAATACAATCTAACATTCCGGAAAGTAGTCGAACTTCTTCAAC
CTCTCTGGGAAGAAGAAGGTTCAAATGCAAAAATGCGACAGAAGAAATTG
TATGCAATTTTCCTCAAATATTTGAGGCTGGTGCATGGTGGTAAACGATC
TGTTGTATTAGCAGACATCTTACGATTCACTACTGGTTCTGAAGAGGAAC
CTCTCCTGGGATATGGAATTCATCCCACACTGAAGATTTTGCCTGTTTTG
AGTAGCTTTCTTCCCACTTCGAACACTTGCATTAACCAGTTGCAGCTATA
CACAGAGACAATGACCATTCCTCTGCTAAAAGAGAACGAACTATTTTCCA
AGTTTGACGTGTCCTTCTTGCATCGGGAGTTTGGATTGGCTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000156_pilon | genome | sc0000156_pilon:406427..419448 + |
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