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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000148_pilon:713587..719738- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.16079.1.p1 ID=MSTRG.16079.1.p1|Name=MSTRG.16079.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6152bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000148_pilon:713587..719738- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATTATTGTATTGAAGTTAGAAGATGGATAATTCAAGTCCCCTTGAGGACC
CGGTATGTAATTTCTTGTTTGGTAATTCAATAATCTACAACTCTTTCATT
GCAAAAAAGTTTTGGAACTTATTAAATCGAGCATGAATTTTTTTTTTTTC
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GGCGTAATAAGGGCAGGAGTGAGGGATCAGATAATTAGAGCCGGTGTATA
AGGGGTAAAAGGGCCGATGAGGTATAAGCAATTAATACGCAATTTTTCAA
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GCGCTGCAATTGACGGCTACGGTTAGTGTATAATGGATGTACTGGAAGTG
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TAAAGAAAAATTACGTGGCAGCATTCTTTGGTATTACAGCCCTTGGTCTA
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TCATTTCTCTAATCATTTTTAGATCTCGACATATCGCACCGTTAGAGCCT
GTGAAAAAGGTAGAAGAATTTGGACGAGTTGACATTATGGATAATTTGAG
AGAGTTCGCTTTGTATAGTTTGATTGGATTGGCCGTCATACTGTTTGTTA
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ATCTCCGCTTGCCACTCTCACTTAATATTTTAGACTCGTATGCTCGTATT
TAGCCTATACTAGACGTCACGGCTTTCTACGGAGTGAAAGATCCCGGGTT
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TTTACTGAAAAGTGTGCCGTAGTTAGGTAGGAAATTCTACCTAAGTCTCG
TGACATTACAATAAAATTTCAGCGCTTGACCAATCAGAAGCAATAGCAAC
AATATTTTTTCCGATATCCACTTTTTTCCTGCGATGGCTTAAAGCACGAC
ATTTAGCCTTTCGAGCTTGATAAATCTATGGGTTGGAATCTGCATCATAA
CTTTTTGTTCTCCCCTATACTGAAGTCCTATTTTAGAAAATGTCACCGCT
CGCTGTCATGATTACTTCATAGAATGGCAAAATTTTCTCATTCCCGGTCA
ACTTTTCTATTGTCACATTAAAACCGAAAAGGCCGCCCCAAAGTTTTAGC
CTCGTTTTGGCGAAAAACTCGTCCCCAGGCCCCAAAAATCAAAATTTTGA
AAAAATGAAAAAAATACCCCCAGGGATTTGCCCAAGGATCAAGTGTGCAA
AATTTCAGCCAAATCGGACCATTTTTGAAGTCTCCAGCCTGCCCCAAAGT
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GGATTATTTTTGCCAATATATTCGCAAAAAAAAAACCAGCAAAACGATCC
CGAAAATGCGCCAAGAAATTTTGCCATCCGACGGTAGTTTGCTGTTTTAT
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AATAAAATATCATATGCTTTTCTCAAACGGCAAGGGGTGTTAGGAAATCG
TTCAAAGTCAAAATATTTTTGATAGTTTATATTCTCCTTATATAGATTAC
AAGACACACAACCAATGCCATCAACACCACTACCGTCATCACCGCCCGAA
ATTTCCTCTCCCTCACCAGAGCAGGAGATTCTATTTATGGTTGCGTTGCC
GACATCTTGTCTACTAATGTTATGGATTTTCACTGTTTATACAGAAATTA
TCATTCCTCTGATGACATGTCAGAAATGAATTCTCCGGTTTGGAGTTTTA
TGTACATTATATTAGACTTTTTTAATTTAATTTTAGATTTATAGCTTTTT
TTAGATATCGAAATATTATTATAAAGAAATATAAAAATCTCATCCAAAAA
AA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000148_pilon:713587..719738- >MSTRG.16079.1.p1 ID=MSTRG.16079.1.p1|Name=MSTRG.16079.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=11004bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000148_pilon:713587..719738- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATTACAAGACACACAACCAATGCCATCAACACCACTACCGTCATCACCGC CCGAAATTTCCTCTCCCTCACCAGAGCAGGAGATTCTATTTATGGTTGCG TTGCCGACATCTTGTCTACTAATGTTATGGATTTTCACTGTTTATACAGA AATTATCATTCCTCTGATGACATGTCAGAAATGAATCTCGACATATCGCA CCGTTAGAGCCTGTGAAAAAGGTAGAAGAATTTGGACGAGTTGACATTAT GGATAATTTGAGAGAGTTCGCTTTGTATAGTTTGATTGGATTGGCCGTCA TACTGTTTGTTATTGCCTTTGAAAAGGTTGTAATGGTATTTGGGCAAAGG ATTTCGTTGACAAATTTAATGCTACACACCTACCAGAAAATTAAGATTTC GATACTAGCGTTATACGCAACTTTGAAGATCTTTATTGATAAGCTTTTGG AAAAATATGAGGGAAGCATCAACCGTAAAATTTTCTTTGCATTGAAATTG ATATTGAGGGTAACCGTATTTTTAAGGATTTTGAATGAAAAGAGTCAAAA GCTCTTAAAGAAAGGAGCATCTGTGTTGATGGGTTTTATTACCACTGTCG TATGTTATGGAAAAACGATCTTCGGGACAATCTTACAAATAGTTTCTTCA AAAAGAATATTGTTTCTTGTTACTTTCGCTGCTATGGTTGTTATTGCATC TGGATGGTGCTTCAACGATGCTGTTGATATGCCAGTGTTAGCAGATTTTG TTGCACTTTTAACCCCAGCAAAACCAGCACCACCACCTGTCCCTAAAGGA TTCTTTACAGAAATTTTGATGAACTATTTGCGTCAAATGGTGCTGTTAGT TGGCTTGCCAATGGTGCTTGGATTTTTAGCACAAAGAAAAATCTTCCATC AATTAAAGAAAAATTACGTGGCAGCATTCTTTGGTATTACAGCCCTTGGT CTAGCAATTTGTTATTATACTGGATATGATTGTGGAGTATTTGACTATGA CCGCCGAGAAAAACAGACGAATGAATTGATCGAACGAAAGAGAAAACTGA AGAATTCTCTCATTGTCTCAAGTACTGTTGTCTTTTCGTCGGCTGCCGTC TACATCTACAGATCATACCGGTATCCTCCAAAGATAAAGGAATCGAGCTG GTACATGACCATTCAGAATCTCATCCACGGACCGCCGGAGATAACAACAG TCAATGTCTTGAATGAATTGTACGCCCTATGGGCGTTTTACGCCGTCTAC TTTTTCATCGTGTATGTTGTGAACAGTAGATTATCAAAGTTATCGACCTG CCAAAGTCAGTCTGTGGACTTGACAATAAGTTAAGCCAACGACCTGATGA AAACTATGAGATCGAAAGTAACGTTCCAAGCACTGTGGAAATGGGGATAG ATAATGACCCAAAAATCATTTTCTCGGATGAAAATTTTTATCCTACCCAC CGTTGCCACAATTTCAACATCTACTTAATATGCGCAACGTCATTGGTATG GATAATTGGAACTATTGTTCCAAAAGAAATCCATAATTATCTATGGATAA TTCAAGTCCCCTTGAGGACCCGATTACAAGACACACAACCAATGCCATCA ACACCACTACCGTCATCACCGCCCGAAATTTCCTCTCCCTCACCAGAGCA GGAGATTCTATTTATGGTTGCGTTGCCGACATCTTGTCTACTAATGTTAT GGATTTTCACTGTTTATACAGAAATTATCATTCCTCTGATGACATGTCAG AAATGAATCTCGACATATCGCACCGTTAGAGCCTGTGAAAAAGGTAGAAG AATTTGGACGAGTTGACATTATGGATAATTTGAGAGAGTTCGCTTTGTAT AGTTTGATTGGATTGGCCGTCATACTGTTTGTTATTGCCTTTGAAAAGGT TGTAATGGTATTTGGGCAAAGGATTTCGTTGACAAATTTAATGCTACACA CCTACCAGAAAATTAAGATTTCGATACTAGCGTTATACGCAACTTTGAAG ATCTTTATTGATAAGCTTTTGGAAAAATATGAGGGAAGCATCAACCGTAA AATTTTCTTTGCATTGAAATTGATATTGAGGGTAACCGTATTTTTAAGGA TTTTGAATGAAAAGAGTCAAAAGCTCTTAAAGAAAGGAGCATCTGTGTTG ATGGGTTTTATTACCACTGTCGTATGTTATGGAAAAACGATCTTCGGGAC AATCTTACAAATAGTTTCTTCAAAAAGAATATTGTTTCTTGTTACTTTCG CTGCTATGGTTGTTATTGCATCTGGATGGTGCTTCAACGATGCTGTTGAT ATGCCAGTGTTAGCAGATTTTGTTGCACTTTTAACCCCAGCAAAACCAGC ACCACCACCTGTCCCTAAAGGATTCTTTACAGAAATTTTGATGAACTATT TGCGTCAAATGGTGCTGTTAGTTGGCTTGCCAATGGTGCTTGGATTTTTA GCACAAAGAAAAATCTTCCATCAATTAAAGAAAAATTACGTGGCAGCATT CTTTGGTATTACAGCCCTTGGTCTAGCAATTTGTTATTATACTGGATATG ATTGTGGAGTATTTGACTATGACCGCCGAGAAAAACAGACGAATGAATTG ATCGAACGAAAGAGAAAACTGAAGAATTCTCTCATTGTCTCAAGTACTGT TGTCTTTTCGTCGGCTGCCGTCTACATCTACAGATCATACCGGTATCCTC CAAAGATAAAGGAATCGAGCTGGTACATGACCATTCAGAATCTCATCCAC GGACCGCCGGAGATAACAACAGTCAATGTCTTGAATGAATTGTACGCCCT ATGGGCGTTTTACGCCGTCTACTTTTTCATCGTGTATGTTGTGAACAGTA GATTATCAAAGTTATCGACCTGCCAAAGTCAGTCTGTGGACTTGACAATA AGTTAAGCCAACGACCTGATGAAAACTATGAGATCGAAAGTAACGTTCCA AGCACTGTGGAAATGGGGATAGATAATGACCCAAAAATCATTTTCTCGGA TGAAAATTTTTATCCTACCCACCGTTGCCACAATTTCAACATCTACTTAA TATGCGCAACGTCATTGGTATGGATAATTGGAACTATTGTTCCAAAAGAA ATCCATAATTATCTATGGATAATTCAAGTCCCCTTGAGGACCCGATTACA AGACACACAACCAATGCCATCAACACCACTACCGTCATCACCGCCCGAAA TTTCCTCTCCCTCACCAGAGCAGGAGATTCTATTTATGGTTGCGTTGCCG ACATCTTGTCTACTAATGTTATGGATTTTCACTGTTTATACAGAAATTAT CATTCCTCTGATGACATGTCAGAAATGAATCTCGACATATCGCACCGTTA GAGCCTGTGAAAAAGGTAGAAGAATTTGGACGAGTTGACATTATGGATAA TTTGAGAGAGTTCGCTTTGTATAGTTTGATTGGATTGGCCGTCATACTGT TTGTTATTGCCTTTGAAAAGGTTGTAATGGTATTTGGGCAAAGGATTTCG TTGACAAATTTAATGCTACACACCTACCAGAAAATTAAGATTTCGATACT AGCGTTATACGCAACTTTGAAGATCTTTATTGATAAGCTTTTGGAAAAAT ATGAGGGAAGCATCAACCGTAAAATTTTCTTTGCATTGAAATTGATATTG AGGGTAACCGTATTTTTAAGGATTTTGAATGAAAAGAGTCAAAAGCTCTT AAAGAAAGGAGCATCTGTGTTGATGGGTTTTATTACCACTGTCGTATGTT ATGGAAAAACGATCTTCGGGACAATCTTACAAATAGTTTCTTCAAAAAGA ATATTGTTTCTTGTTACTTTCGCTGCTATGGTTGTTATTGCATCTGGATG GTGCTTCAACGATGCTGTTGATATGCCAGTGTTAGCAGATTTTGTTGCAC TTTTAACCCCAGCAAAACCAGCACCACCACCTGTCCCTAAAGGATTCTTT ACAGAAATTTTGATGAACTATTTGCGTCAAATGGTGCTGTTAGTTGGCTT GCCAATGGTGCTTGGATTTTTAGCACAAAGAAAAATCTTCCATCAATTAA AGAAAAATTACGTGGCAGCATTCTTTGGTATTACAGCCCTTGGTCTAGCA ATTTGTTATTATACTGGATATGATTGTGGAGTATTTGACTATGACCGCCG AGAAAAACAGACGAATGAATTGATCGAACGAAAGAGAAAACTGAAGAATT CTCTCATTGTCTCAAGTACTGTTGTCTTTTCGTCGGCTGCCGTCTACATC TACAGATCATACCGGTATCCTCCAAAGATAAAGGAATCGAGCTGGTACAT GACCATTCAGAATCTCATCCACGGACCGCCGGAGATAACAACAGTCAATG TCTTGAATGAATTGTACGCCCTATGGGCGTTTTACGCCGTCTACTTTTTC ATCGTGTATGTTGTGAACAGTAGATTATCAAAGTTATCGACCTGCCAAAG 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000148_pilon | genome | sc0000148_pilon:713587..719738 - |
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