|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000147_pilon:137190..140050- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15993.1.p1 ID=MSTRG.15993.1.p1|Name=MSTRG.15993.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2861bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000147_pilon:137190..140050- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTCTATTTTAGATATACGGTGGCTAGATAATTAAAAAGAAAAACCAAA
AAATATGAGTTTCATATTTGATAGCTTTGTTGTTTTTGGATCAGAGCTTT
TATATTTCGCTTTTGGATGGATATTTTTTATGCGTAAGCTATTCAAGAAT
TATGAAGTACGTCATGTAGTAGTGCAGCTAATTTTTGCTGTTACATTCTC
CTTTTCCTGTATGATGTTCGAATTGGTCATTTTTGAAATCCTGGGCTATT
TGGATCCAAGCTCAAGGCTTTTCCACTGGAAGTTGTTAATCTACTCAATG
TTATTAGTACTTATATTTTTGATCCCACTTTACATTGGTTATTTCCTGGT
CTTGAATTTACAATGGGTACCGAGAGGATTAAAGAAAATTGTTGCATTAA
TTTACTGGTTTGCTTTTTTGTATGTGTTTTGGAAATTACGTAATCCTTTT
CCAATATTGAGTGCCAAACATGGTATTTTCTCTATTGAGCAAGGTATTAG
CCGTGTTGGTGTTATTGGAGTTACACTAATGGCGATTCTCTCAGGTTTTG
GTGCCGTGAATTGCCCATACACCTATATGTCTTATTTCATGAGGCATGTC
ACTGATGCAGATATTGCCACCGTTGAAAGGAGATTGATGCAAACAATGGA
ATTGATTATCGCTAAAAAGAAGAGAATCGCATTAGCTAAACGCAAGAGGT
TCGATAACCAAAAGAAGAACAATTCAAAAAGTGAGGATCTTTTTATTGAA
TAAGAATGACCAATTGGTGCCTTGGTTCTCCTTTAAATCTATCCATTTGG
TTGAAATAATTCATTACATCGTGATAATTGTGTACTTTTTTTATGCACAA
AAATTTTCAAACTGAACTAATACCTTTTAAATTTGAGTGTATTTCATGTC
AAATAATAATGTGCTCAACTCTAAAGTTGATACATTTACTTTATGCTTGT
ATACCAAGTTTATCGTTCTACATCTGCAATAGCATACTGCAGTAATTCTG
AGAATAGACATCAAAATTACAGTTTGTCTGAGTTTTAATCACATCGTCCT
TGGCATTAATTGTTTTTGTAAGTCAATTACAAAGTAATAACTATGACGTT
TGCATAGCCGTGTGCTATTGACCTTTTAGTTACTACTTGCTTGTTACAAA
TAATTGCCACTCTGCTTTCTTTCAAGGTCTTTGGAGTGTATTCAGTGGCA
TGGCATCAAGCAGTAACGAAGAAAACACCACCTTACTTGAAACTGAAGTC
CAATCAATGGAAGAATTAAGTCGCCAATTATATGTTGAAGTTATCGATCT
ACACAATACCAAGCAACGAATGATCCTCTCCAAGACTCTTCAAGGACGTT
ATTTTGATTTCATGGGTCATATTTTCTCTTTATACTGCATGTGGAAGATC
TTTATCTCATCTGTCAATATTATATTTGATCGTGTTGGTAAGAAAGACCC
TATCACCAAAGGATTTGAGATTCTATTCATGTTTTTGACCATTGATGTTG
ATGTTCAGTTCTGGTCACAGCAGCTGTCCTTCTTCCTGGTTGGTATCTTG
ATAGTAACATCAATACGTGGCTTACTGATAACATTGACCAAGTTTTTTTA
CGCTTTATCCAGCCATAAATCATCTAATATCATAGTGTTGGTGCTAGCTG
AAATCATGGGAATGTATTTCATATCGTCAGTATTACTCATGAGAATGAAC
ATGCCACCAAAGTATCGTGAAATAGTGACAGTTGTACTGGGAGATCTACA
ATTTCATTTCTACCATCGTTGGTTTGATGTGATTTTCCTGGTCAGTGCTT
TAGCGAGTATGGGGTTCTTATATGTGGCACACAAACAGGCACCAGAAAAA
CAGATTCATGGTTATTCTGCCAATGCTTCTTGATCGAGCATGGTTGTATT
GTATGAATTGGAGGAGATTGATTACAATTGATGAATTCTCTTTTAAACAA
TCTGGTCATTATACAGTTTAGTGGGATGGTAAATTTGAAACAGAGAGTTA
CGTTTTCTTTTAAATACCGTAAGTTGGTCTAATATCGATATCTCTCGTCT
AATTCCGACACCCTTCTTTAGAGACAGAAGTAATATGGAGAGTTTGAATC
ATTCATTGAAAAAGGATTATTCCTCCCTGACCACTAAGCAAAGAAAAATA
GCCTTTACCTTTCTATCAATTTCAGCTGATAAAAAGGGTGTCGAAATGGT
CGGAGTGGTATTGTTTTATAAATGCAGTAGACAAATTCAATAAGCATTAG
TCCTTTATAGTAACCAGGTCTTTAAAACTCAATAGACTTATGAAGATGAT
GGCATGCTGAGGCAACGATAACCAATAACTTCAACAATCAATTTAAAACT
TTTTCTTTGACTTAGGAATACTAAAAATGTATATCGTTGCCTCAGCATAT
CATCTTCATAAAAGTCTATTGAGTGTAAAGACCTGGTTACTATAAAGGAC
TAATGCTTATTGAATTTGAATGGAATGCTCTTACAATGTAACTTGGTTTG
GAACTAAAGGTGTGTAGTTAAATTATGATTATCAAAGAAACCCTTGTACA
AATACAGTCTGAACACACAGAAGTGAACCACCTTTCCTGTACACGATATT
TTATGATTATATTTACAATTATTCTGTTTGTAATAGTCTAAATTACTATA
CCTTTTCCTTGTTTGTTCTTTCAAAAAAAAAAATCTTTTAGGTATTTTAT
TTTCATTTTGTACTCTGTTGTTGTAGTAGTAGTTTTCTAATTTATTATTT
GCTAAAATTTGTAGATTTGGTAACTTAAATATAGAATTTTCTTTGAATAA
GTTTGATCCATGTCTCCTGGGTAAGTTAATGCTGTTTTTGACACCACCCT
TTCTAAAGCCA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000147_pilon:137190..140050- >MSTRG.15993.1.p1 ID=MSTRG.15993.1.p1|Name=MSTRG.15993.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2766bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000147_pilon:137190..140050- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCTTTGGAGTGTATTCAGTGGCATGGCATCAAGCAGTAACGAAGAAAAC
ACCACCTTACTTGAAACTGAAGTCCAATCAATGGAAGAATTAAGTCGCCA
ATTATATGTTGAAGTTATCGATCTACACAATACCAAGCAACGAATGATCC
TCTCCAAGACTCTTCAAGGACGTTATTTTGATTTCATGGGTCATATTTTC
TCTTTATACTGCATGTGGAAGATCTTTATCTCATCTGTCAATATTATATT
TGATCGTGTTGGTAAGAAAGACCCTATCACCAAAGGATTTGAGATTCTAT
TCATGTTTTTGACCATTGATGTTGATGTTCAGTTCTGGTCACAGCAGCTG
TCCTTCTTCCTGGTTGGTATCTTGATAGTAACATCAATACGTGGCTTACT
GATAACATTGACCAAGTTTTTTTACGCTTTATCCAGCCATAAATCATCTA
ATATCATAGTGTTGGTGCTAGCTGAAATCATGGGAATGTATTTCATATCG
TCAGTATTACTCATGAGAATGAACATGCCACCAAAGTATCGTGAAATAGT
GACAGTTGTACTGGGAGATCTACAATTTCATTTCTACCATCGTTGGTTTG
ATGTGATTTTCCTGGTCAGTGCTTTAGCGAGTATGGGGTTCTTATATGTG
GCACACAAACAGGCACCAGAAAAACAGATTCATGGTTATTCTGCCAATGC
TTCTTGAATGAGTTTCATATTTGATAGCTTTGTTGTTTTTGGATCAGAGC
TTTTATATTTCGCTTTTGGATGGATATTTTTTATGCGTAAGCTATTCAAG
AATTATGAAGTACGTCATGTAGTAGTGCAGCTAATTTTTGCTGTTACATT
CTCCTTTTCCTGTATGATGTTCGAATTGGTCATTTTTGAAATCCTGGGCT
ATTTGGATCCAAGCTCAAGGCTTTTCCACTGGAAGTTGTTAATCTACTCA
ATGTTATTAGTACTTATATTTTTGATCCCACTTTACATTGGTTATTTCCT
GGTCTTGAATTTACAATGGGTACCGAGAGGATTAAAGAAAATTGTTGCAT
TAATTTACTGGTTTGCTTTTTTGTATGTGTTTTGGAAATTACGTAATCCT
TTTCCAATATTGAGTGCCAAACATGGTATTTTCTCTATTGAGCAAGGTAT
TAGCCGTGTTGGTGTTATTGGAGTTACACTAATGGCGATTCTCTCAGGTT
TTGGTGCCGTGAATTGCCCATACACCTATATGTCTTATTTCATGAGGCAT
GTCACTGATGCAGATATTGCCACCGTTGAAAGGAGATTGATGCAAACAAT
GGAATTGATTATCGCTAAAAAGAAGAGAATCGCATTAGCTAAACGCAAGA
GGTTCGATAACCAAAAGAAGAACAATTCAAAAAGTCTTTGGAGTGTATTC
AGTGGCATGGCATCAAGCAGTAACGAAGAAAACACCACCTTACTTGAAAC
TGAAGTCCAATCAATGGAAGAATTAAGTCGCCAATTATATGTTGAAGTTA
TCGATCTACACAATACCAAGCAACGAATGATCCTCTCCAAGACTCTTCAA
GGACGTTATTTTGATTTCATGGGTCATATTTTCTCTTTATACTGCATGTG
GAAGATCTTTATCTCATCTGTCAATATTATATTTGATCGTGTTGGTAAGA
AAGACCCTATCACCAAAGGATTTGAGATTCTATTCATGTTTTTGACCATT
GATGTTGATGTTCAGTTCTGGTCACAGCAGCTGTCCTTCTTCCTGGTTGG
TATCTTGATAGTAACATCAATACGTGGCTTACTGATAACATTGACCAAGT
TTTTTTACGCTTTATCCAGCCATAAATCATCTAATATCATAGTGTTGGTG
CTAGCTGAAATCATGGGAATGTATTTCATATCGTCAGTATTACTCATGAG
AATGAACATGCCACCAAAGTATCGTGAAATAGTGACAGTTGTACTGGGAG
ATCTACAATTTCATTTCTACCATCGTTGGTTTGATGTGATTTTCCTGGTC
AGTGCTTTAGCGAGTATGGGGTTCTTATATGTGGCACACAAACAGGCACC
AGAAAAACAGATTCATGGTTATTCTGCCAATGCTTCTTGAATGAGTTTCA
TATTTGATAGCTTTGTTGTTTTTGGATCAGAGCTTTTATATTTCGCTTTT
GGATGGATATTTTTTATGCGTAAGCTATTCAAGAATTATGAAGTACGTCA
TGTAGTAGTGCAGCTAATTTTTGCTGTTACATTCTCCTTTTCCTGTATGA
TGTTCGAATTGGTCATTTTTGAAATCCTGGGCTATTTGGATCCAAGCTCA
AGGCTTTTCCACTGGAAGTTGTTAATCTACTCAATGTTATTAGTACTTAT
ATTTTTGATCCCACTTTACATTGGTTATTTCCTGGTCTTGAATTTACAAT
GGGTACCGAGAGGATTAAAGAAAATTGTTGCATTAATTTACTGGTTTGCT
TTTTTGTATGTGTTTTGGAAATTACGTAATCCTTTTCCAATATTGAGTGC
CAAACATGGTATTTTCTCTATTGAGCAAGGTATTAGCCGTGTTGGTGTTA
TTGGAGTTACACTAATGGCGATTCTCTCAGGTTTTGGTGCCGTGAATTGC
CCATACACCTATATGTCTTATTTCATGAGGCATGTCACTGATGCAGATAT
TGCCACCGTTGAAAGGAGATTGATGCAAACAATGGAATTGATTATCGCTA
AAAAGAAGAGAATCGCATTAGCTAAACGCAAGAGGTTCGATAACCAAAAG
AAGAACAATTCAAAAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000147_pilon | genome | sc0000147_pilon:137190..140050 - |
|
