MSTRG.15984.1.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.15984.1.p1
Unique Name	MSTRG.15984.1.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000147_pilon:9228..202088+
coding sequence from alignment at sc0000147_pilon:9228..202088+

mRNA from alignment at sc0000147_pilon:9228..202088+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.15984.1.p1 ID=MSTRG.15984.1.p1|Name=MSTRG.15984.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=192861bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000147_pilon:9228..202088+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGATATATTGAAGTAGATTTTGCAAAACTTTCATATATTTCAAACAATGT
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TgatattcttgaaaaaaaatgctgAATTCTACGAAAGTGCCTCATAGAAA
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AGTGAGTCACATTTGACAGTAGTCGGGTAAACAGTTCGAAGTTCAAAGTT
CGATGAAAAAAGCTGTCTCAAAATATATtcacagaaaaagaaaaggctgt
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ATTTTGCCAAAGATTTCGACAGGTCACCATATAAAAGCAATTTCACATTT
TACAGAACTATGGCATTCCTGACAATATCATTGGTATCAAACGTGGCCAT
TGTTGTCATATTTGAAAATTCCTAAGACCGATAGAATTCACTTTACAAAT
ATTTCATGGCATCAACACAAAACCAATTTACGTAACATAATACAATTCAG
CCTCCACCATAACCCAAACCGGCGCGGGGAAGACGAATCTATTCAAGTTA
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gtttgagttaaggagacattcgagtcatagaggttcgagttaaagagaat
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TGGTAATTATGAAGACATTCTCCGCTAATCAAATTTACCAAAACTCTGAT
AgatcaaaacattaatttttacCTGTTTCCTCCCTCGGGTAGATCGTGTG
TATTACTAGCCACCGCACCATAGGCTCGAGAAATCTCCTCAAATGTTCCC
AAAGTGCACTCGAAGGACTTTTGTAAGATTAGTTTTGCTGAATCAGAATC
ACTGATCCCTAACGGCTTTGGCTGTAACGGCCCTTACAAAGAAAGTGTAT
CTAATCTAAGAGCCGAATGGTACAGAATACATGGTTGAGAATCCCGGCAt
ttgaaatgtttcaaaattcgAAGCGTGTTTGAAAATCTTACTTTTGGTCG
GTCGCTAAAAATCTAGTcagaatcgcagacctctacaaataTACTTAGAT
GCAAGAAACTCTTTTCGTTAGGCAGAAGCCTTCAAAAAACTGAACACACG
CCAATCATTAGAACTTTGATAGGCTGCTGGTATGCACTAACGGGTTCGTT
CTCCTTCCTTATATACTACCTGCAGTTTTGTAGAGATCTGAGATTCAGAC
TTACATGTAAAAGCACAAACCATTCACAGCAATTTAACGGGGACGTTAGA
AAGAAATAACAAGGAAGAAAGATTAATAGCAAGGTACGTCACTGACGTCA
CCACGCCCGAAACGAGAAAAGCCGAGCTTTAACCAGCTAAGATAAGCTTT
TCACTGTATCTTTTGGAATTTCAACAAATATTGTCACTTGACGTAAGGGT
ATTTTTTAATCATCAATAGATGCCGAGCTGCATAAAAGTGCCTCTTCATG
GAAACAAGGaatcaaacattttttgctgacgtcatctaCATTTTTCTCCA
ACTGATAGGCGCAGTATGATTATCAGCTGATTAAATTCCTTTCGGTTGAA
GGGGTATTTTTTATTGTCTCgaattctttataagaacaactttttaagaa
caattttaaggaTAAACGGGTCATTTTTAAGCATGGGTTTCATGCAATAC
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GCATTAAACGTCAGCTGGAGGGACCATGTCACAAATAAAGTTCTGTACGG
TTCAGTTCAAAGGTCACCACCAAAATTAGAGAGCAAAGAATGAGACTGAC
TGGCCACTACAAGCGATACGATGAAGAAATGACATCCAAATTGGTGTTTT
GGCAACCAGAAAGAGGTAGAGCCAATAAAGGTAGAATATGAATCACACTT
ATTGACACGTTGTTCAATGACATTGGCTGCAGTACAACACAAGAACTAAG
CACTGCAATGGTGGACCACGAGCCCGGCATAGACTTATTCAATTTAAGAA
TTAATTAATTAAGAGTTTTAAGATTGAAACTGTCGATTATAAAGCTAACT
GCGAGTCAAAGTAATAGAAATCTTATTTTGATGATAAAGTATTCGTTACA
CGATGAGAACAAGCCTGTGATTATAGTTGTTCTTAGATGTTCTTAGATGT
TCGAGGGAGTTGTAGATTCTGTAAGGTATGCTGCACCTGATAGACAACAT
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AAGGTGCCAATGACATCATGTTATGATAGTTGACCCGATTTTTATAGCCC
TGTACCGATAGACCAGAACCCAGGAGTACTGTGACCCATGCTACTCTATT
TTAGAGtagatattttacgtggatagcccagtaatctaggtcttttagac
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GTTTAAGACGCTTATGCCTTTGATCACTTGGCCATCGTTCCGTAATTCCG
AGTCAAAAGAATTGGTGCGTGTACATGTACGCACAttagaaaaaatcgaa
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ATATTTTAAAGTGTTGCTGTGAACTTGAAATCTGAGAGAGTGAGTTCCGG
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GGACTGTCATATTGCAGGACATGTGTAACGGTCCAAGTATCTTTTATAAC
AAGCttgatatttcaatatacttttataattttataaagttttttttagt
aaggtaaatatattttttaagtaACGAAAACTGtttcttttccaaaatat
tttatccgAGC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000147_pilon:9228..202088+

>MSTRG.15984.1.p1 ID=MSTRG.15984.1.p1|Name=MSTRG.15984.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=139128bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000147_pilon:9228..202088+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgGCACTGCAGCCGCGAACGGCTTTCATATCTGCACTggtgatattttt
tgttgttggaGCTCAAGCACGCATCAAAATCCGCAAAATCAAATTACCTC
CTCTACCCAAGAAGCCAGTTTACTTGGTGACCATACCACGAGTGGTATTC
CCTGGTGAAATTACCACAGCCACTTTCAGTATCCCACCTTTGAAGAAAGG
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GATTATTATGATAAAGATAACGAAGCAACTCAAATGTATAAGGTTGGCGA
TTGTCCGGAGATTAACACTGTTTCTTAA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.15984	MSTRG.15984	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.15984.1.p1	MSTRG.15984.1.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.15984.1.p1.exon1	MSTRG.15984.1.p1.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon2	MSTRG.15984.1.p1.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon3	MSTRG.15984.1.p1.exon3	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon4	MSTRG.15984.1.p1.exon4	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon5	MSTRG.15984.1.p1.exon5	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon6	MSTRG.15984.1.p1.exon6	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon7	MSTRG.15984.1.p1.exon7	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon8	MSTRG.15984.1.p1.exon8	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon9	MSTRG.15984.1.p1.exon9	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon10	MSTRG.15984.1.p1.exon10	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon11	MSTRG.15984.1.p1.exon11	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon12	MSTRG.15984.1.p1.exon12	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon13	MSTRG.15984.1.p1.exon13	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon14	MSTRG.15984.1.p1.exon14	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon15	MSTRG.15984.1.p1.exon15	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon16	MSTRG.15984.1.p1.exon16	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon17	MSTRG.15984.1.p1.exon17	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon18	MSTRG.15984.1.p1.exon18	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon19	MSTRG.15984.1.p1.exon19	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon20	MSTRG.15984.1.p1.exon20	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon21	MSTRG.15984.1.p1.exon21	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon22	MSTRG.15984.1.p1.exon22	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon23	MSTRG.15984.1.p1.exon23	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon24	MSTRG.15984.1.p1.exon24	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon25	MSTRG.15984.1.p1.exon25	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon26	MSTRG.15984.1.p1.exon26	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon27	MSTRG.15984.1.p1.exon27	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon28	MSTRG.15984.1.p1.exon28	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon29	MSTRG.15984.1.p1.exon29	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon30	MSTRG.15984.1.p1.exon30	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon31	MSTRG.15984.1.p1.exon31	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15984.1.p1.exon32	MSTRG.15984.1.p1.exon32	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000147_pilon	genome	sc0000147_pilon:9228..202088 +

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MSTRG.15984.1.p1 (mRNA) -