MSTRG.15931.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15931.1.p1
Unique NameMSTRG.15931.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000145_pilon:654909..677299-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15931.1.p1 ID=MSTRG.15931.1.p1|Name=MSTRG.15931.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=22391bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:654909..677299- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATCAGTCAATACGTCACTAAAAACCAATCAGCTGTTGAGTCCGTTGAAG ACATTGCAGCACCATTGCAATGTCTTCAACGGACTATATATTCCCATATC ATGGGAATGTACAAAACAATATTGCGCGTTTCTTTTATGTATTTGCTCAA TTCATCTTCTAAAAATCTGTGAGAGCCAACAAGATGACAGGTTCTTTATA ACGATCCCTTATCAGGCTCATCCAACTGTATAATAGTAATAAGATGAGAT CTGAAACCAAGATTGTTCTTTATTTGCTCTTACAGTAGGTTTTTTGCGAA AAATGAGTTTTTTTAACATAGGATCCAACAGAAAGATAAAAGAACTGATT AAATTGATTTGGTCTAATAAGGGTTTTTCGGTAAATTATTCAAATTTCAT TCTATTTTCACTTTCAGCCATTTTGACAGCTTATAAACCAGAGAAATATG CTTTCATGGCAGACGAGGCTGTACAAAGTGTTTTATCTGGCAAGATCGAT TACACACTCAAATATTACTTGAAATTCCTGGACGAGGTTCGGTTGAAAGC AAAACAATTGTCAGCGACAGGTAAAAATAATACTCAGATCGAATTAATTT TTCACGTTTAGTTAAGGTGCGTCCCCAATTTATACACCCTTTTACAACCT TTGCACACCCAATGTCAATTTACAGCTAACTCTGGCTATTCGAATTCGAA CTCGAGCGGGGATTTTAATTTGTTCGAATTAGAAAAAGATTCGAATAATA GAAGTTCGAATTAGCGAGAGTCCACTGTTTACATCAAGAGAAGCTTATAA TGCATAATATGTAGGACATTTTATGGAAATGGCTGTGTCGTAATTATTTA ACTTTTTGACTGAAGGCAATGATTAGTATATGTAATCACATGATAACGAG TGCTATTCGAGAATAATTGCACGAGTGATTTTTTTGTTATTAATTTTCCG AATCCGATAGGACGAGGCAAATTCGAAACAAAAAAATCACGAGTGCAATT TTCGAATTGTATGAGTTATTATGTGATTACGAGCTAATCGCACAATGGGT TTCACTAGTTTTTCCCAGTTAGCAAAGGTAAATTACAGAAATTACACTGA ACGTTTGATATTTTTTCTCTTCTCTTTATGTTTGTTTTTCTTTAATTGTT GTTTATAGATTTTCTTTTTCACAAAATAAATTTCGAATGCAATTGAAACG TTCGATGAAAAAAAATGAAAGAAAAAAACATTAAAATCAATTTTGTAAAC ATTGGCGCGGCATCAAAGAGTGCGATTAACGATTAATTGCTCTCTTTGAA GTCGCGCCAAATAAGAAAATATAACACATTTGAGAGTGAGAAATACAGTA GACTCTCTCCGATCTTCAAGGGTACAAAATCTTCGAATTATAGAAAGATT CGGATTACGGGGAGTATTTTACCACTTTCTAGCTGAGATGACCAATATTT TAGTTCGAATTATAGAAAGTTTGAATAAGAGAAAGTTTACTGTATTCTCC TTTTTCCCGCAACAGATGATACCACATGGACACCTCATCAGATCGAGATT TGTTTATGGACCGCTGCCATGGCAACTAAACTAGATGTCAATATGTCGAA CGAAGTCAAAGAAGAGAAGCCTGGTAGCAAACGTAAATCAACCGACCAAT TGGAAACGTCTAAAAAAGCAAAAAAAGTGAAATCTAAAAATTGAAGCTTC TGGATTGGAAACTGTAAGGTTTTCCTTCTTCTTGTGGTATAAGAGAATAT TTGTTTTTTAAGTGGACTTACTAGAGTTCAAGTTTCAAGTACCTTATCGG GGAAAACTTCGTCGGGAAAAATTTTCGTTGGTGAAAATTCTCGTCGGGGA AAAATTCGTCACTTTCTGGTAGTTGGTAAACGCATTAAGGCCGGGGAAAA TTTTCGTCGGGGAAAATATTCGTCACTTGTCCAAAATTTCGTCACTTTTC CCCCACGAAGTTTTCCCCCATAAGGTATATTGTCATTGGTTTTAATTGAT AACTTTGGCATTGATACCAGATGGGAACACATAAAGACAACTTGGTTTTG AAAATCACATTGAACAATTTTAAAAACTACAAAGACTCAACAAAAAAACC TTCTACGAAAATTTTTTGATGAAGAATTGGAACTTCAAATCTTCGAAAGT TGCAAAGATATTTTACAACAAGATTAAACTAAGATGGATTATGTGTTGTA TATGGAAATTGTTTAAAATTATTATTGTATTCGTACTTCCTAGTTCGTTC ATAGAGCCAAGGAACGCCCTACCGATGTAAGTAATAATTGAGTACAATTT GTAAATAATACTCATTCATTCAAATAGTACTCAAGTACTGTATAATTGTT GTCAATTTTAGAAGAATCTTCAATAATGTGAAAACTCTTCACGCAGCTCA GGCTGAAATAAAGAATCATTTTGATTAAATCAAGTCACGGAACGGTTATT GGAAAGGGTTTTGTTATTTTTCGTTTTGTTGATCAAGAAACCGTTTTGTT GAAAATTTTTCACGGATCCATCTTTTTGGTGCAATCTTGGGTTTTTTTTC TTTGGTTTGTTCCATAACTTATTTATTTCAAGGGATAATAAGATGGTTTG AGATATTTGACCTGTCATATAAACCTTCTTCGGTTTTTCTTCAGTGATTT CAGACTTTTCAGATTTTCTACTACAATTCCTAAAAAATTTAAATTAAAAG ACAACTTTGCTTTAATGAAAGAGATTTCTTAATAAAACGAACTTCTTCAA TCACTAAAGGCAATAAGTCCTTCTTTCACCCTCTCTTTCTCTATTGACTT TTTTTAATTCCTAAATTTGAACATAAGAAAAATCTTTAATTTTGGGAGTT TGAGAGACTTCATTTTGAATATAATATATATAGTTTTTTGAAGATCTCCC GGATAATCGGGACTTAATGAGATTATTTGTTTGAATGAACCTACGAATCA AACTTTTTACCCTTTTTTGCCCTTTTTTTGCCTCTTCTTACTCCTGTGGT TTTCAATAATATGTTTGTCCTTACATTTCATCTGAGATTTTTTTAATCAA TATTTTGGCTGAAGTCCAAGAGTGATATCGTTTGCTTACTCGTCAATTTT AATTCACAGGCTTTTTCGCATTGGATTGACACAGATGTGGAGCAAGGTTG GTCAGAAAGATGAAAAGAAAATCATTTTTTGCTTAAATCAGAAAAATATG ACAATAAGCAGACACTGTCCTGATATGAAATATGTGTCTGATATGAAACG GGAACACTTATGTAAAAATATAATTTTTAAACTAACATGACGGACGGAGA GTGTTTCTTTTGCAATTGTAAAAAAGGGCTTATTTTAATGAACTCTAAAA TGAAGGTTGTTTTTCTCTATAATCGCACGATGGGTTATTTTTTCTTATTT GGCACGCCCTCAAAGAGAGCAATTAATCGTTAATTGCATCCTGTAGAGAG CAATTAATCGTTAATCACACTTTCCAATGCCGCGCCAATGTTTACAAAAT TGATTTTAATGTTTTTTCTTACATTTTTTTTGCATCGAACGTTTTAATTG CATTCGAAATTTATTTTGTGAGAAAAAAATCAATAAACAACAATAAAAGA AAGACATAAAGAGAAGAGAAAAATATAAAACTCTCAGTGTAATTTCTGTA ATTTACTTTCCTAACTGGGAAAAAGTAGTGAAAGCCATTGTGCGATTAGT TCGTAATCACATAATAACTCGTACAATTCGAAAATTGCACTCGTGATTTT TGGACCTACCTTGGAGGTCCTATAAATTAACCAATGTCCGTCCGTCCGTT CGTTCGTTCGTTCGTCCGTCCGTCTGTTACCAGCTTTTCTCGAGATTGGC TCATTAGTTTTTTCTGATTTTTGGCACAATGATGCAAAATGGTAATGCCC AAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAATCATTTCCGGCCGAAAA TGCCGGAAATATGCCGGAAAAACCGGTTTTTTGGCATTTTCTCGAGATTT CATCATTAGTTTTTTCAGATTTTTTGCACAAAGATGCGTATTAGCAATGC CCAAAACATGGCAGAGTCCGATTTTTGAGAAAAATTCTTTTCCGGCCGAA AATGCCGGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTCATCGGAC TTTTTCCTTATAATTGGTTGTTTTTTCACTCAAAAACATTGTTAATAGCA ATGTCCACGATCAAGCATGGTTCAATTGTCAATAAAACTGATTTTTGAAG CCGGAACTTTCTAAAAATCGCCGGAATAGCCGATTTTCGCCGGAAAAACG GTATTTCTTGAATTTCTCGAGCTGTACTTTATATTTTTTTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000145_pilon:654909..677299-

>MSTRG.15931.1.p1 ID=MSTRG.15931.1.p1|Name=MSTRG.15931.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3645bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:654909..677299- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATACCACATGGACACCTCATCAGATCGAGATTTGTTTATGGACCGCT
GCCATGGCAACTAAACTAGATGTCAATATGTCGAACGAAGTCAAAGAAGA
GAAGCCTGGTAGCAAACGTAAATCAACCGACCAATTGGAAACGTCTAAAA
AAGCAAAAAAAGTGAAATCTAAAAATTGACCATTTTGACAGCTTATAAAC
CAGAGAAATATGCTTTCATGGCAGACGAGGCTGTACAAAGTGTTTTATCT
GGCAAGATCGATTACACACTCAAATATTACTTGAAATTCCTGGACGAGGT
TCGGTTGAAAGCAAAACAATTGTCAGCGACAGAGGGGGAAGTTTCGACCA
AGACTGACGCAGATGATTGCTGAAAACAAGGAGGAAGACATCCGAACTTA
TTCAGAAGAAGCGTTCAAGAATATTGACGACCCCAAGAAATGTATTGAAA
GATTGTGTAAATTGAGAGCTGTCGGTCCTGCTACTGCTTCAGGTTTCAAA
ATGAGTTTGGCAAGGAAATACATGAAAGAAATCCTCATCATTTGGTAAAA
GAAGATTTGAAGAAATTGATGGAATGGAAATTAACAATGGCGGGAAAAAA
AGCAGTGAAATTCAGTTTTTTGATCGAAGACCCCAAAATTTGGAAACAAT
ACAAAGAATCGTACGCTGTTGTCTTCCAAAAATTCTGTCTCAACCCGAAA
AAGAGGATCTTGAAAGGTTTGGACGAATGATGATACCACATGGACACCTC
ATCAGATCGAGATTTGTTTATGGACCGCTGCCATGGCAACTAAACTAGAT
GTCAATATGTCGAACGAAGTCAAAGAAGAGAAGCCTGGTAGCAAACGTAA
ATCAACCGACCAATTGGAAACGTCTAAAAAAGCAAAAAAAGTGAAATCTA
AAAATTGACCATTTTGACAGCTTATAAACCAGAGAAATATGCTTTCATGG
CAGACGAGGCTGTACAAAGTGTTTTATCTGGCAAGATCGATTACACACTC
AAATATTACTTGAAATTCCTGGACGAGGTTCGGTTGAAAGCAAAACAATT
GTCAGCGACAGAGGGGGAAGTTTCGACCAAGACTGACGCAGATGATTGCT
GAAAACAAGGAGGAAGACATCCGAACTTATTCAGAAGAAGCGTTCAAGAA
TATTGACGACCCCAAGAAATGTATTGAAAGATTGTGTAAATTGAGAGCTG
TCGGTCCTGCTACTGCTTCAGGTTTCAAAATGAGTTTGGCAAGGAAATAC
ATGAAAGAAATCCTCATCATTTGGTAAAAGAAGATTTGAAGAAATTGATG
GAATGGAAATTAACAATGGCGGGAAAAAAAGCAGTGAAATTCAGTTTTTT
GATCGAAGACCCCAAAATTTGGAAACAATACAAAGAATCGTACGCTGTTG
TCTTCCAAAAATTCTGTCTCAACCCGAAAAAGAGGATCTTGAAAGGTTTG
GACGAATGATGATACCACATGGACACCTCATCAGATCGAGATTTGTTTAT
GGACCGCTGCCATGGCAACTAAACTAGATGTCAATATGTCGAACGAAGTC
AAAGAAGAGAAGCCTGGTAGCAAACGTAAATCAACCGACCAATTGGAAAC
GTCTAAAAAAGCAAAAAAAGTGAAATCTAAAAATTGACCATTTTGACAGC
TTATAAACCAGAGAAATATGCTTTCATGGCAGACGAGGCTGTACAAAGTG
TTTTATCTGGCAAGATCGATTACACACTCAAATATTACTTGAAATTCCTG
GACGAGGTTCGGTTGAAAGCAAAACAATTGTCAGCGACAGAGGGGGAAGT
TTCGACCAAGACTGACGCAGATGATTGCTGAAAACAAGGAGGAAGACATC
CGAACTTATTCAGAAGAAGCGTTCAAGAATATTGACGACCCCAAGAAATG
TATTGAAAGATTGTGTAAATTGAGAGCTGTCGGTCCTGCTACTGCTTCAG
GTTTCAAAATGAGTTTGGCAAGGAAATACATGAAAGAAATCCTCATCATT
TGGTAAAAGAAGATTTGAAGAAATTGATGGAATGGAAATTAACAATGGCG
GGAAAAAAAGCAGTGAAATTCAGTTTTTTGATCGAAGACCCCAAAATTTG
GAAACAATACAAAGAATCGTACGCTGTTGTCTTCCAAAAATTCTGTCTCA
ACCCGAAAAAGAGGATCTTGAAAGGTTTGGACGAATGATGATACCACATG
GACACCTCATCAGATCGAGATTTGTTTATGGACCGCTGCCATGGCAACTA
AACTAGATGTCAATATGTCGAACGAAGTCAAAGAAGAGAAGCCTGGTAGC
AAACGTAAATCAACCGACCAATTGGAAACGTCTAAAAAAGCAAAAAAAGT
GAAATCTAAAAATTGACCATTTTGACAGCTTATAAACCAGAGAAATATGC
TTTCATGGCAGACGAGGCTGTACAAAGTGTTTTATCTGGCAAGATCGATT
ACACACTCAAATATTACTTGAAATTCCTGGACGAGGTTCGGTTGAAAGCA
AAACAATTGTCAGCGACAGAGGGGGAAGTTTCGACCAAGACTGACGCAGA
TGATTGCTGAAAACAAGGAGGAAGACATCCGAACTTATTCAGAAGAAGCG
TTCAAGAATATTGACGACCCCAAGAAATGTATTGAAAGATTGTGTAAATT
GAGAGCTGTCGGTCCTGCTACTGCTTCAGGTTTCAAAATGAGTTTGGCAA
GGAAATACATGAAAGAAATCCTCATCATTTGGTAAAAGAAGATTTGAAGA
AATTGATGGAATGGAAATTAACAATGGCGGGAAAAAAAGCAGTGAAATTC
AGTTTTTTGATCGAAGACCCCAAAATTTGGAAACAATACAAAGAATCGTA
CGCTGTTGTCTTCCAAAAATTCTGTCTCAACCCGAAAAAGAGGATCTTGA
AAGGTTTGGACGAATGATGATACCACATGGACACCTCATCAGATCGAGAT
TTGTTTATGGACCGCTGCCATGGCAACTAAACTAGATGTCAATATGTCGA
ACGAAGTCAAAGAAGAGAAGCCTGGTAGCAAACGTAAATCAACCGACCAA
TTGGAAACGTCTAAAAAAGCAAAAAAAGTGAAATCTAAAAATTGACCATT
TTGACAGCTTATAAACCAGAGAAATATGCTTTCATGGCAGACGAGGCTGT
ACAAAGTGTTTTATCTGGCAAGATCGATTACACACTCAAATATTACTTGA
AATTCCTGGACGAGGTTCGGTTGAAAGCAAAACAATTGTCAGCGACAGAG
GGGGAAGTTTCGACCAAGACTGACGCAGATGATTGCTGAAAACAAGGAGG
AAGACATCCGAACTTATTCAGAAGAAGCGTTCAAGAATATTGACGACCCC
AAGAAATGTATTGAAAGATTGTGTAAATTGAGAGCTGTCGGTCCTGCTAC
TGCTTCAGGTTTCAAAATGAGTTTGGCAAGGAAATACATGAAAGAAATCC
TCATCATTTGGTAAAAGAAGATTTGAAGAAATTGATGGAATGGAAATTAA
CAATGGCGGGAAAAAAAGCAGTGAAATTCAGTTTTTTGATCGAAGACCCC
AAAATTTGGAAACAATACAAAGAATCGTACGCTGTTGTCTTCCAAAAATT
CTGTCTCAACCCGAAAAAGAGGATCTTGAAAGGTTTGGACGAATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15931MSTRG.15931Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15931.1.p1MSTRG.15931.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15931.1.p1.exon6MSTRG.15931.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15931.1.p1.exon5MSTRG.15931.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15931.1.p1.exon4MSTRG.15931.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15931.1.p1.exon3MSTRG.15931.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15931.1.p1.exon2MSTRG.15931.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15931.1.p1.exon1MSTRG.15931.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000145_pilongenomesc0000145_pilon:654909..677299 -