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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000145_pilon:446031..456345+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15918.8.p2 ID=MSTRG.15918.8.p2|Name=MSTRG.15918.8.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10315bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:446031..456345+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGGCGTCTTGGGTTGTTAAAAAGACGTTCCTCTTCAATCTCAAGTAACAA
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TATCGGCTATCAGCTATTTTTTCTGGATTCTGTTTCAGAACGTAATAAAT
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AAgtcattgaaaatgtttcattctcagatataaaagtaaaataaagaaaa
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GGAAAAAGCGTTTCGTGTATTGTTCCTAATTTTACCACTATAGCTTACAG
ATTAATTTTTCTATGTGAGTTTTAATTATGGATTATTAACCGAAAAGTCG
GTCTCTCTGAGGAAATATTGACCGAGGGCACGTGTGCCCGAGGTCAATAT
TTTCCAGAGAGACAGGCTTACTGaggttaataatccatttatagccctgc
aaaataaagtaataataaagtaataaaagtaattaacaagtgtattctat
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GTCACTATGGGGAAATATTAAACGGCCACGTGACATCAATTATCCAATCA
GTTTTCTCAAAGatgattgacagttgtattgcagggctataaGTTATCAT
ACTGTTTTCTTCGAATTCAACTATAGGTGAAGCCTGAGAGTTGATTtcga
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AAGCCCTATATTGCTTTGTTTTTTAAGATGACTTTTGAAGAATCTTATTT
TAAAGTTTCACTTGCTATTCGATTTTAACATTTGAACCGTTGGGCACAAT
ATTCAGTTCAAATCGTACCTGCAACGATACGATGtctttaaactcatttt
ttataaaaaccagtaaattctttttcatcttttttcgttcttcattttcc
ttcaacttacattaaattttcaatctttttcagcATTGTTAAAAAGCAGA
AAGTTGTTGAACACAAGTTGATGTGTCGTGATGTTCGGTTGAATGATCCT
CAACATTGAGTAGTTTGTTTGCACAAGAtgatttcttaagaatattGTAA
CACTCCTTTCTCAAAGAAGCGGTGGGGCCCCtcccactggaaagattggc
caaaatatcgtctccattgaaaaattaaactccagttttcgtccccactg
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CCcgacttgaaaacaattgaattcTAATCCCCAGACATGATATATCAGTT
CCCaacgagtttcagtccgttttttttAATCCGCTGTatggaaaaatcct
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TAATCACAAGGTTGAGATCCTGCAACTCTTCACAAGGTTGTCAAATGCAA
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CCTTAAACTGGCAAAATTAGGAAATGGTCGAAAGTGGATCTGGGTTCTAC
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GTAAATGTGTTTTCGTACAAAATGTACTTCTGagcattatttttttatct
ttatgaGATAAATATCCTACATTCTTTTTAATAGGAAAATCACTCGTGTG
ATTGAGAAATGTGGCTCGTCAAAAGAACGCCCAAAAAAGTAAGTTGaact
aatttatttttttttctatttggttgagttacAGAAGGTTCTGAGGCCAA
TTTTAACAACTTTAAACGCTTTCAACGAACTGAACTACCTTGAATCGACT
ACCCTATCCCTAACATGACACGGGTTGATCCAGGTGAACTACTGCATAGT
GTTAGCATAAACCGTACCGATCCGTTTCAAATTTTCCAGACTGGAGTACC
ACTtaaacctcagtcgcctgtgcagcaaccaaggttaatgaccactatac
cTACCACAGGGCCATTCATATTATACCCTTTTTTGTACGGCTCAAATTCA
CATTATAGTTTTCCAGTTTAATATCTCCATATCCTTAAAGCATACAATAT
TGAAAATTTGTCCTTTCAGGTTTAACAAGCAAAATAATGCTGTAGTTCCA
TCGATAGCATGTCGAGATTACAGATTGAATGACCCAAAGCAGTAAGTTTA
TTGAATAATATAGACAAAATAATAATGTCTTAAATGTGTTAATATTAAAG
GACAGGTCAATACTAATACTAATAAGAAACATATTAATTCGAAGTTTTGA
AATTGTAAATGATAACAGCACTGCagtagggtagatcgtcaactaccatt
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tccagcattccccaggggggtctttgattcgcactaaagcgaaaaatgag
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ggctgattttctccaattctgggtagcaaaatacATGAAAGcggcatttt
tgaggacccgcaacttttaaactttttaaggtacacacttgaaattttca
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gctaaatgccaatatttcaagctaaaacttggttttctcaggctaaaatc
tcaaaaatggtttcaaatggtgtcctgaaatctttgggtgttgaaagtat
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aagtccgccattatggaattgcatttccaCTTAAAAGGCGATGTTTAGAG
TTAAAGTCAGTTGAATTCACCCAAAAAGCCACCGTGATTTATTTTACCTT
AAGAGAACTGACTTATTTTGGCCACAAATTGAGTAAGTTGCCTTGCTTca
gaccactgacctttatataccctggaccaagcttctcaatcccagccaag
caaaatctttgatcgaagttttttgaaaaatggtaccctaatggcggcac
tactcgatagcggtgtaaatgcaccGAGAGcactaggtctacttttcctc
gaattcttttgatgatgttgcGGCGTTacacgttaatttttaacattgca
atggcttctcctcgggtaccaattccaaaaaaactccaatcaaagatggc
agatattgcttggtccagggttatataaaggtcagtgattcaGACgagtt
aattttcttttttactcgATATATAACATAAAAGACTTGTAAATAAACAA
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AGATCTGATAGACTTTTACGCTGTTTCCcagtatttttcaaattgaatac
tGCAGACAATCCTCATTTCCGTTTTCCATTTTCAACCTTGTTCAAATcca
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TCATGGCAAAATTTTAAAGCAACCTTAATAATTTGGGGTACCAGGTACCA
GGCTTCGTTGAAGTGGGCTGAGACCATCACTCCACgattgtttcattgtt
ttaaaaGTTTGCTCGTATTTAACAACTCTAAACCCATTTAACCTTAGACG
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GTATCTTCTCATACCGGCTTCGTTCCTTCCTCACATGCCGTAAGttaaaa
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TGAACAAACCACTTACCCCTCTAACCAACCAAACTACTTAAATCGTTTTA
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TCTGTAGCCAGTTCCGCCCATCATGACTTCAGACTTAACAAGTAAGTATT
CGTGGACAAGGAGTTTAAATACTTTTAGCTTTGAGGTATATAAGTCTTGT
ATTTTctgtttgcaaaattttcaaatattaataaATACCAGGCCCTTTAC
CGACCCTTCATTATATCAAAAGCTCTGGAATCACttcatttcatttgaaa
ttattttatttgagaaagccaatttcaatttttagaacCTGACAAAAAAT
GCTGAGACTTGTGTGCCCAATCAATTATCTGTTTGAGGTTTACATGATTT
ATACTAAAAACGGTATTAAGTCATCATTTGTGATGTATTcttaatttaac
ttttttgttttttctttcagagGTGCCTCCAAACAAACAATCAACAAAAT
GGTCGTTAATCCCAAAGGTAAGAATAAAGAAACCATTGTTCATTAAATTC
CACGTCCCCAGGAGAGTAATTACCCCAATTTTGCCAAAACGTCTGGTCAC
ATAATATGTCACTCTGATAAAGTCTGATTTTCGTAAAACTGAGTTGTTGA
GCTTAAAAAGTTATATCACATGCAATATTATATTACTATGCTATACCTGA
AAGAGgacaatatttaaaaaacagttGATTTAACTATAAACTGTTTATTA
TTATGCTGTatcattaattgttttttttattctcagATGAGTATGAACAT
CAATTGACCACCACCAATGTTGCTGAATGTCCTTTCGATATCAACGATAG
TCATCACTCAAAATCTGCTGTTCAATGGGGCGATTTTGAGtaagttttat
tatttttatctttttaaatgatcaaaagtCTGTCTCAACATACCTGCAGC
TGAggcaaaaaaggctgtaacctTCGATGTCATATGAATAACATTTTGTG
CTCGTCGaaaaaaaTTGTCAGGAAAAGaagataataaaataaaaagagag
GTTGTATCTGTTTCTTTGAATCTTTGAAGGGTACCACAAtgagtttcttt
tttttatcaacAAATTATATTATTAGCAACTTGTATACTATtccactttc
attttttttagataCAACAATGATGAGAAAGTAAACTTTCAAGAAATCTT
GGAATTTAAAGATTTCTAACTTGTCTTAATAAATTATTCTTGtatatatg
ttttgtaaatattttttaaactttagtattcaattttttatacaaataaa
atttctaaaaagcaA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000145_pilon:446031..456345+ >MSTRG.15918.8.p2 ID=MSTRG.15918.8.p2|Name=MSTRG.15918.8.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1590bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:446031..456345+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATGGGTATCTTCTCATACCGGCTTCGTTCCTTCCTCACATGCCAGG
GTGGTCTCATGACGAGGTTTCTGTAGCCAGTTCCGCCCATCATGACTTCA
GACTTAACAAagGTGCCTCCAAACAAACAATCAACAAAATGGTCGTTAAT
CCCAAAGATGAGTATGAACATCAATTGACCACCACCAATGTTGCTGAATG
TCCTTTCGATATCAACGATAGTCATCACTCAAAATCTGCTGTTCAATGGG
GCGATTTTGAataCAACAATGATGAGAAAGTAAACTTTCAAGAAATCTTG
GAATTTAAAGATTTCTAAATGAATGGGTATCTTCTCATACCGGCTTCGTT
CCTTCCTCACATGCCAGGGTGGTCTCATGACGAGGTTTCTGTAGCCAGTT
CCGCCCATCATGACTTCAGACTTAACAAagGTGCCTCCAAACAAACAATC
AACAAAATGGTCGTTAATCCCAAAGATGAGTATGAACATCAATTGACCAC
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AATCTGCTGTTCAATGGGGCGATTTTGAataCAACAATGATGAGAAAGTA
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TCTCATACCGGCTTCGTTCCTTCCTCACATGCCAGGGTGGTCTCATGACG
AGGTTTCTGTAGCCAGTTCCGCCCATCATGACTTCAGACTTAACAAagGT
GCCTCCAAACAAACAATCAACAAAATGGTCGTTAATCCCAAAGATGAGTA
TGAACATCAATTGACCACCACCAATGTTGCTGAATGTCCTTTCGATATCA
ACGATAGTCATCACTCAAAATCTGCTGTTCAATGGGGCGATTTTGAataC
AACAATGATGAGAAAGTAAACTTTCAAGAAATCTTGGAATTTAAAGATTT
CTAAATGAATGGGTATCTTCTCATACCGGCTTCGTTCCTTCCTCACATGC
CAGGGTGGTCTCATGACGAGGTTTCTGTAGCCAGTTCCGCCCATCATGAC
TTCAGACTTAACAAagGTGCCTCCAAACAAACAATCAACAAAATGGTCGT
TAATCCCAAAGATGAGTATGAACATCAATTGACCACCACCAATGTTGCTG
AATGTCCTTTCGATATCAACGATAGTCATCACTCAAAATCTGCTGTTCAA
TGGGGCGATTTTGAataCAACAATGATGAGAAAGTAAACTTTCAAGAAAT
CTTGGAATTTAAAGATTTCTAAATGAATGGGTATCTTCTCATACCGGCTT
CGTTCCTTCCTCACATGCCAGGGTGGTCTCATGACGAGGTTTCTGTAGCC
AGTTCCGCCCATCATGACTTCAGACTTAACAAagGTGCCTCCAAACAAAC
AATCAACAAAATGGTCGTTAATCCCAAAGATGAGTATGAACATCAATTGA
CCACCACCAATGTTGCTGAATGTCCTTTCGATATCAACGATAGTCATCAC
TCAAAATCTGCTGTTCAATGGGGCGATTTTGAataCAACAATGATGAGAA
AGTAAACTTTCAAGAAATCTTGGAATTTAAAGATTTCTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000145_pilon | genome | sc0000145_pilon:446031..456345 + |
|
