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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000145_pilon:348829..359369+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15913.1.p1 ID=MSTRG.15913.1.p1|Name=MSTRG.15913.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10541bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:348829..359369+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATTTGATTTAGCAATATCCCGTGATTCCGATCAAAACATCCAAAAGGAT
AGCCGAGCAGTGAATCCtgaatttttctcaatttttttcttgaatttatt
TCTCATTTGCTTCAATCATTCATTAGCGATGCTTAAACCAAAGGTTTTGT
CAGAAGTTTTGGGACAAGCAAACTCAGATGGTGTCATCAGTACAATGTGA
GTATTTCAGCTTTTAAATGTTCACCACCACAAAGCCAAAGAGCAAAAGct
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TTGACACTCGGATGTATGGCCTGAACTTTTTCAGGtcacttggaaatttt
gaacttaaaaAAGTCCCAAACATGACCTGAACTTGGCTTGCACATATTTG
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aaacaaaagtgatgtaatagcactgaataccccacgcaattgaaccgggt
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taaagttcccagttttcttccttttttcccattttcagtttgaagttcat
ttttattcattttcacgcttttagcctgagacgtcctatctcatatcatt
tacactgggtgacgaataccccatgcaaatgctcaccccgttcatttgcc
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ataacatgaaaaccagaatatgagtcttgcttcaatgggaatcaaaactt
taaattgcacttacaaacatcaatatgtcagatctaacaaaattaataac
ggcactgtcatcattgacagttttctgtcaagagccttgtaaacatattc
caacaacttccatcaaaatgatctatcacagctaagtctaccatttttag
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CGtacgggtgaaaaactttaatccgtcaatcattttctcaagcaaagagt
acgcaaagcgattATAGCTTTACGACAgagggggggtcaacatttataat
accaacccatagcccaaaaacccgacttttgaccttttgagctaagttaa
caccaccaccccaaaattggtatcgataccaacttgaaaatcataatttt
cagaaaaaggggggacccacccccttaatttggtatcgataccaacatga
ttttttgaatttgacagtggaggctaacatgcatagccctcaaatgaatg
acctggcaggtcattaaaatacaactacgcagcccTGCTCGCATatttac
tctaccattttatttttaatttaactttgtattttaatgaccagccaggt
ctttcatttgagggctatgcatgttagcctccactgatgcaagttaccca
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aaaggggacccatcccctcccacacaaacagggtactaagagaaacttca
aaaaaactcatttttgaaatactctttcttcaacacaacacaaaaaatgt
cattatactaaaatagaaaatgactgaaaactgacaatatgataaaaaca
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ACTTATACTACATCCTACTTGATcaagtttgttttggtgttAGAGTTTTA
CCTTTATACAAAAACGACCAAGATGATAAAGAAATACAGACTGTTTAATT
TTTtcggggtattttctagctataagggcaataattaggaaagttttgct
gtcattttgatatggataccaactttctgaatcatattatttaaaaaaag
gggtacccacccctattttggtatcaatgcCAACcgaggataactctttt
tttctaaaaaagggggacccacccccatcaataccaacttgacttttcag
acttttaaaggaaaaaaagacaccaccacccggctattgGTCTGGTGGTT
ATCATTATACTTTTATTTTGATTCCTAGaactttggaaaaaaaaaggaaa
aatagaaaagttgtatttttactGCTCTTTTCACATACTGTACTAAATAA
ATACGTGAAAGATCTTAAACTATGTCGTGtctttttgcaaacttcaaaaa
actgatttttgccctgcttttgcgggactttagcttaagtgcttgcgtgc
agcatagggtacaaagtccaaatatgcgtttccttACAGCATTGAGCTTA
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gtgtttttaaaagccaattATTTCCCATCAAGAATGTGCCTAGAATGCAC
CGCAATCATTACGATGGATTGTATATCTAgcagttcatttgttttttgag
gactgcatttttaaAGTTACTTCATCTCCCATCCAAGAGTCTCAAGTCTA
GCCCTCCAGGCTTTGAAGTCAATTTCTTACAGATACTCAACATGGATTTT
GCAAAAAGATATCATGCAAGACTCTTCAAACAATTTGATTCATTAACAAA
ATCCTTCACTTTTGTTCGATTGGATTAAGGTTACAGATAGGGCtcctttg
aagaaaatcttttttttacatcaaaaaatttttttctgctgTAAAAGATT
CAACATTTTACAGACCATCGAATGATGCATCTCcctaaacctaaaaatgt
atcaaaattgcaaaaaatgctaaaaacattATCGATGTATAATCCCTATT
GATTGAGCCTTTTATTCGAATTGTAAAAGAAAACTGTAAAGGGAAGCGAC
GATTATTTCGATATCCCTATTATAAAGTCTTACAATGGAATAatgcaggg
ctgcaaataaatatttttagtcaatcgaataggctaagtaagagacaagg
gtgtaagagatttattttcaactctcaagttaatggtttattcctttttt
cattcggacatcacgaccgacacaaaagattttcagtcggtcaaatagct
ttatcagtcggacattgaccgatgaccgacgcttatttgcagccctgata
atggtctttttacttttcaataaaagaggGGGAATTTTTCGGtaaagatg
aaaatattttaaattttgaaataactcagaatcacaatttcttcaaaaat
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GATATTTCAGAAACCTATGTCATTCTATTCAGAAAAGATTGAATAGCAAA
ACCCTGCCTCCGATTGTTAATTCGAGGTTTTGTTGTGGAGAAAATCGCTT
TAAACgtgaaaaacctgttttttaacaTCGCATAacatgaaaagtaaata
tcttttGAATAGGGCGTGTAAATGATAAAGCGGAGCATGGTTTTGTAGGG
GAGAACAAGGGCTTTCGAATACAAAaggtttcattgaaaaatattcagta
GATTTGAAGAGTAACTCGTCAAAGTTCAAAGTTTGTCTTTTGAAATTGCG
TCATAATtccaaattagaaaaatatgtcGAAAAAGTAATTACATATTTAG
AAAGCCATTGAATTGCACTTTAACCACTCCAGTCcaatttcatcaaagaa
agGATGCtaaacaattaatgattaaaaataatttaaaaaatgatttaaaa
ataatcaaattgacCTATCTGTAAccttaaatttttcttcaattaaAGAA
AACTAAGGCAACCTTTTTTCGTAGCATTATATACTGGGTGTGATTTGATA
TTGCAGGCAGTAGCAGAAGAATTTGTTTCGGAATtattcagaggaaagcc
taacttaaaatttggtgtattacttattaatttttcttcattggttcaaa
tattattatgttcaaaaacctaaaatgtcaattttaaaaaatgtcaaaaa
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CAAAACATTAAAGTACAATGTCTTGCTCCTTGTAACactctttatttttt
ctttatctcttgtctttttttacttctgtttttCCCTTGGGCATAAACAA
GATGCCGAATGCTTCAAACCCCACagaattttcaacatcttcccaagagt
ttccaaaagtttttctgTGTGTGCACCATCGTTGAGAAAGGTggagattt
ttgagaaaaatgcttCATTTGAACTATTGCAGCTCATCTCGACTCACAGA
TGATGGAATGTATTTACAGGGATGCATAATCTTGTAAATAAGTGCTTTTT
ACATaatgaaaatacattttgtGATGCATAAAATCATTTTGGGCCATTTA
TCACAATCAATTTAATACTCTCGCttttcgcctttttctgccatttttta
aaattgatattttaggtttttgaacataacttttgaactaatgaagtaaa
attaaaaagtaacacaccaaattttaagttaggcttaactttcctctgaa
tgattccgaaatAATCTTTGAgaaatctcttttctactgcctacaatatc
aaatcaaagagggtaacttattagTGGTAAACCCGGTAGAATCTCTTGAA
AAGTAAGTTTTTAGGCAAGAGGTAACTCTGAACGTGATGTATCCCAAATA
TTTCAAGATAGATTGtatctttttatcattttgagcATGGTATTTCCAAC
CACTGAAGTAAGGTTTAAAAAAGCTTTGAGAAAGTACCAAAATAAATATT
CCAAGGATGAAGACAGACAGTCCTTAATAAAGAAGAACCTAACCTAACCT
TAGTTAATCTATGCTAACACTCATCCCTATGACTCAATTTTTAACTTAAC
ATCATCTCATTGAATGATTTTATCAAGTGCTCCTCAGCTGCTACAATGGA
AACTATTATTAAAGATGAATCAAGAACTTCAAAATCTCTCAATGTAGAAG
TCAAAACCTGAAACTTGTAgcttgaaatatgaaaaaaatactttagaAGT
TGAGAtattgtttttagaaaaaatgtgACTCTGTTGCACACATTCTGTTT
TACTTTGATTGACTTCAGCTGTTTGACATATTACTTTCTTGTGTTCTGAT
CACTTCTTTTGTAATATTATTATCCAAAGCTCTCACCTGATTCAATTCat
ttattgattttaatattataaaatatgtactagttatcgcatgatttcga
gtgcaatacgagaaatattttacgagttccgagatttttccgtaatattt
ttccgagcctttaggcgaggaaaaatatcggtaaaatctcggaacgagta
aaatatcgagtattgcacgagaagtcatgtgataactaatttattgtcga
ctcaaaaaaaatgtcctctttttgtttcaaaacttacttccgccttcttc
tgcttctgtgtagtttggaatgtttttattcgaaattctaattcgaacgt
tagattcaaacaaaaacatttgataacttcccgctgaaaatattcacaca
aaaacaaaacttttcgatcattttcgatccagAagttttGttttgAaaag
ttgcagatttttcagagatgtatttgaaagtttctagattgataattcaa
aatgcagatgataCAGTATTGGTTTCGGAGAAGAAACCCTCCATCATTGG
ATTCATCGATTGATAacatcagtctttttctatttttttgtttcgatgac
atATGGCATGGGAAagatagcagaggaaaggagtcccacgatggaaatgt
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ttgccaaaagttgaaaatatttgggtggtgtcaagtagttttataatttc
ttagttcatcagatttgattttagtgtcttttatggaagaactccaaagt
aaaagttaatctgaacatatttttgttgcgttttaacATAATTTGTTGAC
ATAATTTTGGCTTGtacttaatttggcagatggccaaaatatgatttttg
gcgggtatttaatttggcaatGATAGAATTTGTATAATTTGGTCGGAATT
TTGTTTGCAAGATGGGGAAATTTTAGGCACTTGTAAATCAAAACTTATTg
gtattttaacattttttacttcaaaatgctttcatagaatttctatctta
aaaagatttttttttcaaatttggggGTATTCAATTTGGCTGATTTACCA
AAAACCGCCAAACCTGCCAGATTTAATCCCCaccaaaattaatacactta
aagtttttaaataatattgATATTAGTGATCGAGGCTAAGGTACCAGTTt
atatattcaaaatatatattatattcttTTTGTTAGGCTTTTAAACAATG
AAGGATCTTTGTTGGCGTATGCTGGCTCTAATGTGAACAAGGACTCAAAG
ATTACAGCTGCTGTTGCTTCCAATATCTGGGGTGCTTATGAGAAAGGAGG
AAAAATGGCATTTAATAATGAAGGCTTAAGAGTTATGTTTATGGATTGTG
AGGTTTGTTTTTCTACTTTTGATACAAGTTTTTGAGGTTTGGTTCACTTA
TATACATTCCCAGGATGCAGAGGATATTTTCCCATAATCTACCCAGGACA
TTTCTATCTTTCACCCGACATGTCTTTTAACCCTGGAAAAGTATCAAATG
GCCCCTTAGATTAAAAATGCTTCTGGATATTGCAAATTTACCCGGTGGAT
ATGATGGTTTTTCAAAGTATTttccctggacaatatatccccCAACTCCT
ATgtacggttttttttttggaattagcCCAATGCTGAATCAACTAATGTG
taatattaatatttttgtttggatttaTTTCTAGGAAGGAAAAGTTGCTG
TTACGAAAATTTCTGCTGTTTTATTATGTATGTATGCTCAACCGACCGTC
GGCTTGGGGATGTTAAAGTTTAAGGTGAGCAAACGTATTATACCCAGTCA
AAGTAGCAAATCAGTTCTTTGAGGATTCATAATACATTGAAAATTTAGCA
CGCTAAAGATATGTAAGTGGATGGAAATATTGCTAGTAAAATAAATGTTT
CTATCTGTTACTTTCCTCTTGTTGGTCTCGAGATGTTGCCTCTTGGGAAA
ACTATTCTCTATTACATCATGCATTGCAGTGTTTAAATATGCCTTACACT
AACGCGTAACATCTGACAACATGTTGTCGTGAGTAACATCAAGAActatt
ctgataaaaaaaaagtatacaattATTACATCTATGatgcagatgagatg
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CAaagttgttttattactggttaacgaccaaccaaatcaaataagagctt
gtaaaagctccaTCTCGTCCCCTGTGATgtgacatacacgtttttttata
agagcatccaattttttaaagccatcggatgttcctaactttttgagtct
taagcctaaaaatgttcttaacatgttctaattttcaccattttcctaaa
aatggggtgttttagagtccgcaaagccttaaatgttcttaactttttct
taatattttgggcatcgaagccttatgttcttataaaaaaacatttttgt
gaaTATTCTTTCTTCTTGATTTTCAGATGGAAAAATTGGCTGAATATCTA
CACGAACCATTGAACAACTCTTTAGCTTAACAAACCATTCATCACATTAC
AATTAGTCTCACTATTaaaaaaaGGTATGTGTATGTTTCAAACTCACCAA
AGATTctgtaattttgaaattattgtgtgtcccaaaaaaaagcgGGCAAA
TTtctatataaagtaaaatctttaTTTAAACTGGGTTTAGAATGATTAAA
ATAAGATCCCAATTCTCTGTTCAAACAATAGATATTCAATGCCtaagatg
attgaataggttttgagattgaaatattaagtaaGCAAGTCAATTTCcgc
ttttttttgggacacattgTACATTCTAGCCTTACTACAAGGCGGTCACA
GCATCGGTCAAAAAGTACTGATTACCCTGCTTAGTATGTTATGTGACGTC
CAAAAAGGTACTTTACAAAGGAGGGACACCAAAATCGTAAGGTTTTATTT
AATACGTAAAACAGCCAATCCATCCTAAAgcgatactttaatgggataaa
atttcgtggATTTCGCAGATTAAGGTGTCATCCGCGAAATTAAGTCCCAA
TGGAAATTTGGAAAGGCCTTTATTTTTAAACAAAACTATGaatttccaaa
taaacTACTTTTAAAATTACTGGTATCAAAGAAGTGCTTATAGcgcgtat
ttcaacaaccaatatgcatgatttggtAGAAGAAGGCACAAAATCGTCAA
CATATTATCTCCAAATAGGGCCATCcgtgaaattaagtccccgcgaaatc
ttaaatggcctatttgtttcacttACTATAAATGCTGTAGATGCTATCTG
CTAATAGTGTGAAAATGCTAGCAAATATTGCAAGTTTTGTTGTCTGCCTT
GATGATCCCTGATTGTACtatgaattttaaaaagtataTATGGATCCATT
TTTTATTCTCAACTGTGTGGCCACTCTCCCGCCATTATGAAAGTAACTGC
TATTTTGAATCAGATATAGACCTGTGCGTGGAGCAAGCTACAGTTTCAGC
TCTTCACTTCTTTAATTTAATTAGTTCAAAATCGGCAATCAGGCTAATAA
AATATCATCCAGTCTGATTTTAgatgcaatttttactgtgaAGAAATAGC
GATTTTGCTTTGCTTGCAGAAGGTTGaagtttttactatttttgctgATA
GGGAGTTTGCATGTTTATTTACAAGAAGTGCAACAGATTTGGACAGACAA
AATTGAAATGAGAGCACTTACAGTAAATGTagcaaaaatagtgatgaaac
aaataggcccaAAACTTCGCAGATGAgattgcgaaatttaattcccgtGA
AATGTATAGCACTTTTAGGTCGGCAAAAGCCAAAGTTACCGAATGCCGAC
GCGAATTAGAATGGCTGCTTATTGTGTCTTACTTatgattttattaaatt
ttgtttttaagtcactCACAGCAAACACCAAACGAAAACCCTTTGAACCA
TGCACGATGAATGTTACTTACGAGATTCCATAGGAAATGGTGTAAACGAG
GACAACTCGTTGATATTCTAAGGAACCAACGAAATGTCATCGAGAATTGG
CAAAACAGAACTTTGTAGTAGACATCACTATCAAAGAATGGATAGTATTA
GACTGATTGACTACCTACAAAATGCATTTTTAATATTACTTGTATGTAAG
TAAATGGCGCTAAAATGATGTTTTGgcgttttgtttcgagagtatTTCCT
ATCCTCAATTATGATGATGTATTAAGCTTCccacatgtttttttttataa
gtaagtgtctgtccctatgtcaggctcgcattatgcttagcattctattg
ttctcaaacaatagagccattgtttgggtaccaaaaactgagcctgcata
tgcttattttaaacgttatgcttatacaagaaaaaacatgtattaggTTA
TAGAAAATACAGTTAAATCTCCATAATTCGACTCCTcaaactcgaatgtc
tccttaactcgaataagttTTATGATTCCTTCAGCTAACAATACcctata
aaccttactccataaatcgaacaaatttgtgtttcccgtACGCGTTCGAG
TTATGTGGAGACTCCACCGATACTTAACAATTGCAACTATTTGATAATGG
TATTATGCTATTGATTGCGATAAATTTGGGGTCATTCCATCGTGACCAAC
CAATTTTTAGACTATTATACTATCGGAAAGTATTCGAATTCCCCTCTCAA
ATTAAAACCttatttttgacaaataaaCATACCTTTTAGTCAAGATGACG
ACATCCTCTTGTTTGTGTTCAGGAAGAAACAATATTTGGTATATTCTAAT
ggctataaattttgaaaaagtatttttcaagaattttttttaattaatta
attttatagtTATTTCATTTCTTAGAAATTGTTAATTGTCTTCATcagtt
catttgtttttcaataCGATACGTAATATAATTTATAACAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000145_pilon:348829..359369+ >MSTRG.15913.1.p1 ID=MSTRG.15913.1.p1|Name=MSTRG.15913.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2016bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:348829..359369+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTGATTTAGCAATATCCCGTGATTCCGATCAAAACATCCAAAAGGATAG
CCGAGCAGTGAATCCtgaatttttctcaatttttttcttgaatttattTC
TCATTTGCTTCAATCATTCATTAGCGATGCTTAAACCAAAGGTTTTGTCA
GAAGTTTTGGGACAAGCAAACTCAGATGGTGTCATCAGTACAATGCTTTT
AAACAATGAAGGATCTTTGTTGGCGTATGCTGGCTCTAATGTGAACAAGG
ACTCAAAGATTACAGCTGCTGTTGCTTCCAATATCTGGGGTGCTTATGAG
AAAGGAGGAAAAATGGCATTTAATAATGAAGGCTTAAGAGTTATGTTTAT
GGATTGTGAGGAAGGAAAAGTTGCTGTTACGAAAATTTCTGCTGTTTTAT
TATGTATGTATGCTCAACCGACCGTCGGCTTGGGGATGTTAAAGTTTAAG
ATGGAAAAATTGGCTGAATATCTACACGAACCATTGAACAACTCTTTAGC
TTAATTTGATTTAGCAATATCCCGTGATTCCGATCAAAACATCCAAAAGG
ATAGCCGAGCAGTGAATCCtgaatttttctcaatttttttcttgaattta
ttTCTCATTTGCTTCAATCATTCATTAGCGATGCTTAAACCAAAGGTTTT
GTCAGAAGTTTTGGGACAAGCAAACTCAGATGGTGTCATCAGTACAATGC
TTTTAAACAATGAAGGATCTTTGTTGGCGTATGCTGGCTCTAATGTGAAC
AAGGACTCAAAGATTACAGCTGCTGTTGCTTCCAATATCTGGGGTGCTTA
TGAGAAAGGAGGAAAAATGGCATTTAATAATGAAGGCTTAAGAGTTATGT
TTATGGATTGTGAGGAAGGAAAAGTTGCTGTTACGAAAATTTCTGCTGTT
TTATTATGTATGTATGCTCAACCGACCGTCGGCTTGGGGATGTTAAAGTT
TAAGATGGAAAAATTGGCTGAATATCTACACGAACCATTGAACAACTCTT
TAGCTTAATTTGATTTAGCAATATCCCGTGATTCCGATCAAAACATCCAA
AAGGATAGCCGAGCAGTGAATCCtgaatttttctcaatttttttcttgaa
tttattTCTCATTTGCTTCAATCATTCATTAGCGATGCTTAAACCAAAGG
TTTTGTCAGAAGTTTTGGGACAAGCAAACTCAGATGGTGTCATCAGTACA
ATGCTTTTAAACAATGAAGGATCTTTGTTGGCGTATGCTGGCTCTAATGT
GAACAAGGACTCAAAGATTACAGCTGCTGTTGCTTCCAATATCTGGGGTG
CTTATGAGAAAGGAGGAAAAATGGCATTTAATAATGAAGGCTTAAGAGTT
ATGTTTATGGATTGTGAGGAAGGAAAAGTTGCTGTTACGAAAATTTCTGC
TGTTTTATTATGTATGTATGCTCAACCGACCGTCGGCTTGGGGATGTTAA
AGTTTAAGATGGAAAAATTGGCTGAATATCTACACGAACCATTGAACAAC
TCTTTAGCTTAATTTGATTTAGCAATATCCCGTGATTCCGATCAAAACAT
CCAAAAGGATAGCCGAGCAGTGAATCCtgaatttttctcaatttttttct
tgaatttattTCTCATTTGCTTCAATCATTCATTAGCGATGCTTAAACCA
AAGGTTTTGTCAGAAGTTTTGGGACAAGCAAACTCAGATGGTGTCATCAG
TACAATGCTTTTAAACAATGAAGGATCTTTGTTGGCGTATGCTGGCTCTA
ATGTGAACAAGGACTCAAAGATTACAGCTGCTGTTGCTTCCAATATCTGG
GGTGCTTATGAGAAAGGAGGAAAAATGGCATTTAATAATGAAGGCTTAAG
AGTTATGTTTATGGATTGTGAGGAAGGAAAAGTTGCTGTTACGAAAATTT
CTGCTGTTTTATTATGTATGTATGCTCAACCGACCGTCGGCTTGGGGATG
TTAAAGTTTAAGATGGAAAAATTGGCTGAATATCTACACGAACCATTGAA
CAACTCTTTAGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000145_pilon | genome | sc0000145_pilon:348829..359369 + |
|
